Difference between revisions of "BGIOSGA026675"
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Revision as of 17:03, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA026675 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA026675, complete gene. |
| LocusTag |
OS08G0517200 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA026675-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA026675-PA |
| Length |
10018 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:27391871..27401888 |
| Sequence Coding Region |
27401739..27401888,27400911..27401027,27400788..27400830,27400544..27400659,27400342..27400473 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:27391871..27401888 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:27391871..27401888 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGCTCGGGAGGTCGTCGCCGCCGGCGCCGGAGATCCGGTCGCCGGAACTGGACGGCGCGGAGGATACGGATGTCGAGGAGAAGTTCGACGACGCGTTCGATATTCCACATAAGAACGCCTCCCACGATCGCTTGCGGCGATGGAGGCAAGCTGCTCTTGTGCTTAATGCCTCACGCCGCTTCAGATATACTCTAGACCTTAAAAAGGAGGAAGAGAAAGAGATGATAAGAAGAAAAATCCGAGCACATGCACAAGTGATACGGGCAGCATTTCTTTTCAAAGAAGCTGGGGAAAAAGATCTCAGAGAAGCTTATACTGGTATAAAACTTGAAACGGCCTCTCGCAGTTTTCCAATTGAACTGGAAAAGCTTACAGCATTGAATAGGGATCATGATAGTGTTTTGCTTCAGGAAGTCGGAGGAGTTAAGGGGCTGTCAGATTTATTGAAGAGTAATTTAGAGAAGGGAATTTCTCTAAATGCGGATGACTTGTTGCAAAGGAGGGGTATTTTTGGAGCAAACACATATCCACGCAAGAAAAGGAAAAGCATACTGCGTTTCATATTTGAAGCATGCAAAGATTTAACTCTTATCATTTTAATGGTGGCTGCTGCCATATCACTTACATTGGGCATGACCACAGAGGGCGCAGATGAAGGATGGTATGATGGTGGAAGTATTTTCTTAGCTGTTTTTCTTGTGATACTTGTTACAGCTATCAGTGATTACAGACAGTCTCTTCAGTTTCGACATCTAAATGAGGAGAAACAGAACATACAAGTGGAGGTTGTTAGAGGTGGTAAAAGATGTGGAACTTCAATATTTGACCTTGTTGTTGGCGATGTGGTTCCTCTTAAAATTGGTGACCAAGTTCCTGCCGATGGTGTCCTGATATCTGGCCATTCTCTTGCAATTGATGAATCAAGTATGACTGGGGAATCAAAAACTGTTCACAAGGATAAAAAGGAACCCTTCTTGATGTCTGGCTGCAAAGTTGCAGATGGCTATGGTTCTATGTTGGTAACAGGTGTAGGCACCAATACTGAATGGGGTCAGTTGATGGCTAACCTTTCCGAAGATAATGGTGAAGAAACCCCGTTGCAGGTGCGCTTGAATGGCGTTGCAACTTTTATTGGTATGGTGGGTTTGACAGTGGCTGGTGCTGTACTTGTAGTCCTTTGGATAAGATATTTTACTGGACATACCAAGGATCCGGATGGCACTACTCAATTTGTGGCTGGAACTACTCGGGCAAAAAAAGGATTTATGGGGGCAATCAGAATTTTGACAATTGCTGTTACTATTGTGGTTGTTGCTGTGCCTGAGGGACTCCCATTAGCAGTAACATTAACACTTGCATACTCAATGAGAAAGATGATGCGAGACAAGGCACTGGTGAGACGTCTCTCATCCTGCGAAACAATGGGATCTGCAACTACAATATGCAGTGATAAAACAGGGACACTTACCTTGAATAAGATGACAGTTGTTCAAGCATATTTTGGTGGAACAATGTTGGATCCTTGTGATGATATTAGGGCAGTGTCATGTGGGGCAACAGAACTTCTTATTGAAGGAATAGCACAAAACACAACTGGAACTATTTTTGTGCCAGAGGATGGGGGAGATGCTGAACTTTCAGGATCGCCAACTGAAAAGGCTATTCTTTCTTGGGGCCTTAAGATAGGAATGGATTTCAATGATGCACGGTCAAAATCTCAAATTCTTCATGTCTTTCCATTTAATTCGGAGAAGAAGCGTGGTGGGGTTGCAGTACAGTCAGATGCTGGTGTTCATGTCCATTGGAAAGGTGCAGCTGAGCTTGTGTTATCATCTTGCAAAAGCTGGCTTGCCCTGGATGGTTCAGTTCAGCCCATGAGTGCTGAGAAGTATAATGAATGCAAGAAATCAATTGAAGACATGGCAACGAGTTCATTACGATGCGTTGCTTTTGCATATTGTCCTTGTGAAATTGAAAGAATCCCAAAGGAAGACATAGCTGATTGGAAGTTACCTGAGGATGACCTGACTCTGCTTTGTATTGTGGGTATAAAGGATCCTTGTCGCCCAGGAGTGAAGAGTGCTGTACAATTATGCACCAATGCTGGTGTAAAGGTGCGCATGGTCACTGGAGATAACATTGAAACAGCTAAAGCCATAGCTTTGGAGTGTGGAATATTAGATGCAAATGGAGCTTTTGTGGAGCCATTTGTAATAGAGGGAAAAGTGTTTCGCGAGATGTCTGAAGCTGCTAGAGGAGATATTGTTGACAAAATAACAGTGATGGGAAGATCATCTCCAAATGACAAACTTTTGCTTGTCCAAGCTTTGAAAAGAAAGGGTCATGTTGTGGCTGTTACTGGTGATGGCACAAATGATGCTCCTGCATTGCATGAGGCCGATATAGGTCTCTCAATGGGCATTTCAGGGACAGAAGTTGCCAAAGAAAGTTCTGACATTATAATCTTGGATGACAACTTCACATCAGTTGTGAAGGTTGTTCGCTGGGGAAGGTCTGTCTATGCAAATATTCAGAAATTCATCCAGTTTCAGCTTACTGTTAATGTTGCCGCACTCGTGATTAATGTTGTTGCAGCTGTGTCCTCTGGTGACGTGCCTCTAAATGCTGTTGAGCTTCTCTGGGTAAATCTAATCATGGATACACTGGGAGCTCTGGCTTTAGCAACTGAACCACCGACGGATAACCTTATGAAGAGACAGCCTGTTGGTCGAAGGCATGCCATTTACCAAATAGCGATCCTTCTTATCTTTGATTTTTCTGGAAGAAGCATACTGCGGTTACAGAATGATAGTCGGGAGGATGCTGAGAAAACACAAAAACCTTTATCTTCAACACCTTTGTCTTTTGCCAGGTGGATCTTCAACGAGTTCAATGCACGCAAGCCCGAGGAGAGGAATGTCTTCAAAGGAATAACGAAAAACCATCTCTTCATGGGAATAATTGCTATAACTACTGTATTTCAGATACTAATTATTGAGTTCCTGGGAAAGTTCTTCAAAACTGTGAGACTTAATTGGAGATTATGGTTGGTCTCAGTTGCTATTGGCATTATAAGTTGGCCTCTGGCATATCTGGGGAAATTCATTCCTGTGCCTGTAAGACCTCTCCAGGATTATTTCAAGCCTACTTGTTGGAGAAGAGCTTCACGGCGAGATGAAGAGGAGAGTGGACAGAGCTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MALGRSSPPAPEIRSPELDGAEDTDVEEKFDDAFDIPHKNASHDRLRRWRQAALVLNASRRFRYTLDLKKEEEKEMIRRKIRAHAQVIRAAFLFKEAGEKDLREAYTGIKLETASRSFPIELEKLTALNRDHDSVLLQEVGGVKGLSDLLKSNLEKGISLNADDLLQRRGIFGANTYPRKKRKSILRFIFEACKDLTLIILMVAAAISLTLGMTTEGADEGWYDGGSIFLAVFLVILVTAISDYRQSLQFRHLNEEKQNIQVEVVRGGKRCGTSIFDLVVGDVVPLKIGDQVPADGVLISGHSLAIDESSMTGESKTVHKDKKEPFLMSGCKVADGYGSMLVTGVGTNTEWGQLMANLSEDNGEETPLQVRLNGVATFIGMVGLTVAGAVLVVLWIRYFTGHTKDPDGTTQFVAGTTRAKKGFMGAIRILTIAVTIVVVAVPEGLPLAVTLTLAYSMRKMMRDKALVRRLSSCETMGSATTICSDKTGTLTLNKMTVVQAYFGGTMLDPCDDIRAVSCGATELLIEGIAQNTTGTIFVPEDGGDAELSGSPTEKAILSWGLKIGMDFNDARSKSQILHVFPFNSEKKRGGVAVQSDAGVHVHWKGAAELVLSSCKSWLALDGSVQPMSAEKYNECKKSIEDMATSSLRCVAFAYCPCEIERIPKEDIADWKLPEDDLTLLCIVGIKDPCRPGVKSAVQLCTNAGVKVRMVTGDNIETAKAIALECGILDANGAFVEPFVIEGKVFREMSEAARGDIVDKITVMGRSSPNDKLLLVQALKRKGHVVAVTGDGTNDAPALHEADIGLSMGISGTEVAKESSDIIILDDNFTSVVKVVRWGRSVYANIQKFIQFQLTVNVAALVINVVAAVSSGDVPLNAVELLWVNLIMDTLGALALATEPPTDNLMKRQPVGRRHAIYQIAILLIFDFSGRSILRLQNDSREDAEKTQKPLSSTPLSFARWIFNEFNARKPEERNVFKGITKNHLFMGIIAITTVFQILIIEFLGKFFKTVRLNWRLWLVSVAIGIISWPLAYLGKFIPVPVRPLQDYFKPTCWRRASRRDEEESGQS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..150#862..978#1059..1101#1230..1345#1416..1547#1644..1733#1883..1952#2086..2156#2248..2331#2414..2491#2594..2665#2838..2921#3022..3104#3168..3276#3372..3427#3538..3580#3662..3745#4054..4191#4517..4582#4733..4828#5302..5412#5489..5653#6034..6093#6438..6602#6853..6969#7085..7183#7960..8097#8296..8400#8702..8839#9154..9261#9347..9438#9811..9908#9993..10018#ATGGCGCTCGGGAGGTCGTCGCCGCCGGCGCCGGAGATCCGGTCGCCGGAACTGGACGGCGCGGAGGATACGGATGTCGAGGAGAAGTTCGACGACGCGTTCGATATTCCACATAAGAACGCCTCCCACGATCGCTTGCGGCGATGGAGGGTATGTGATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGTGTCCTGTGATTTTGTGATCGATGACGCCGGTTCATTCGAATCAGGTCGGTAATGCCCGGGGGATAGGGGTTTGATCACTGATCAGTGTGTTTGGCGAATGCTCAAAATATGGCAATTCCGGAATGGCGAGTCTGGATCACCCATTTTAGTGTGTACATAGAGCATTGGCAATTTATGCAGTGTCAGTCCCTTGCATGGAGATTATCCACTCTGAAATGTTGTGAAATGGATGCACTACTGATTACAGTTGTTCAGTCACCCTCATTTCTTGTTCTGATGATTGGCATATTACATGCATCTTGTGCCTAGTCCTGGGAACAATTTGATCCTTTGCAGCAGCATTCATTTTGCATTATTACATGCATTACCTGACATTCCCACAGCCGAGATAGATGTTTATCTGTAGCTAAAGTTTACCCAGTCCATATATCGGGGTAAAAACGAAGAGAGCATTACCAATTTAACCTTCTTACTTGAGCTAGTGAGATACTAATTATACTTAGTTGTTGTATGTTGGGGCCATGAGAAACTTGTTGTGTTAGTAGGTGAAAAGCCTTTGGGGGAAGACAGGTTTCAATGGACACTGGAGAAATGCTCTTCCATCTATTCTTGAGTTCTGACAAATCCGGTTACTCTCCATTTCAGCAAGCTGCTCTTGTGCTTAATGCCTCACGCCGCTTCAGATATACTCTAGACCTTAAAAAGGAGGAAGAGAAAGAGATGATAAGAAGAAAAATCCGAGCACATGCACAAGTGATACGGGTAATGTGCCATTTTTTTCAGCAGATATATCCTATCGGCTGGCTGTATTTGTTTGTCGATTCTAAAATTGGGTTCTTCAGGCAGCATTTCTTTTCAAAGAAGCTGGGGAAAAAGATCTCAGAGGTACAATCTCAGAGTTACTGCTACCTTTTCAGTTTATGTCTATATTAAAAAATCTACCCTTTCCTATCGCTCTTTTCACACATATAATTTATATCCTTGTGTATTTTTAATGTCCTTTATCTGAACAGAAGCTTATACTGGTATAAAACTTGAAACGGCCTCTCGCAGTTTTCCAATTGAACTGGAAAAGCTTACAGCATTGAATAGGGATCATGATAGTGTTTTGCTTCAGGAAGTCGGAGGAGTAAGTTCATACTGAGCTAGATTTATATTCTCATTTACAGTCGCTTGTCTCAACTACTCTTTTTGTTCAGGTTAAGGGGCTGTCAGATTTATTGAAGAGTAATTTAGAGAAGGGAATTTCTCTAAATGCGGATGACTTGTTGCAAAGGAGGGGTATTTTTGGAGCAAACACATATCCACGCAAGAAAAGGAAAAGCATACTGGTATATGCTTTTACATCATTTTTAAATGAACCCAAAAGTTCTATGTGCTTAACATTTTAGTTGCAAAACTTAATAATATTAATGTCTGATATGCAGCGTTTCATATTTGAAGCATGCAAAGATTTAACTCTTATCATTTTAATGGTGGCTGCTGCCATATCACTTACATTGGGCATGACCACAGAGGTATTTTGGTTACCTCTTCTAATTATTTCATACATGGTGTTCTTACTTTTTGTCATGCTCCTTGGTTGTGGTAGATTTGAACTAAAACGAATTTTCATGCTGTAAGTACAGATATGATCAAGATTTTTCTTTAATTTCTTTTATTTTAGGGCGCAGATGAAGGATGGTATGATGGTGGAAGTATTTTCTTAGCTGTTTTTCTTGTGATACTTGTTACAGGTAATGGAGTCATGTTTGTAAATTACTTGATCTTTTAGTTACCTTTAAGTATTTCAGTCTAATAATTCAGCTCTATTTATTTATTTTTTGGCAAGAAGTCAGGTTCTAATTTGTCTCCTTATGATATATTTAGCTATCAGTGATTACAGACAGTCTCTTCAGTTTCGACATCTAAATGAGGAGAAACAGAACATACAAGTGGAGGTTGGTGTGGTTATGTGTGACCATTTTCCACTATAGTAGCATTAAGTGTCACTCTTTGGCTGTATTCTGATTTACTTTCTCTTTTTATTAGGTTGTTAGAGGTGGTAAAAGATGTGGAACTTCAATATTTGACCTTGTTGTTGGCGATGTGGTTCCTCTTAAAATTGGTGACCAAGTAAGATGGTATATCATTTATCGACTCCATGTTTGTTTTTTCCATTGGAACAATTTACTTACATTTATTCTTGTACCATCAGGTTCCTGCCGATGGTGTCCTGATATCTGGCCATTCTCTTGCAATTGATGAATCAAGTATGACTGGGGAATCAAAAACTGTGAGTTTCTATGGCAAATCTCTTGGTTGCTCAGTTTCTATGGCAAATCTCTTGGTTGTTTCATACTTACCTTTGCTGATGATTCATGGATATTACTTTTAGGTTCACAAGGATAAAAAGGAACCCTTCTTGATGTCTGGCTGCAAAGTTGCAGATGGCTATGGTTCTATGTTGGTGAGTGTGCTATCTTGAGTGGTTTTACAACATATGGAGTTGAGCATTGCTGTTTTTCTGTCACCGTTCAGAACATTGTTTTCATTATTTATTCTGTCTACCATTTGTCCTTCTTTTCATGTTTAAAATGACCTGACTTCATACTTATGTATTTCACCTTTCAAATACAAAGGTAACAGGTGTAGGCACCAATACTGAATGGGGTCAGTTGATGGCTAACCTTTCCGAAGATAATGGTGAAGAAACCCCGTTGCAGGTTAACTTTTGTTCATGATTGTGTTTATTCTTAGATGAATGGAATTCTGACATCTTGATTTATTTTTATGGCTGTCGCCCTTCCTACAACTATGGAGTAGGTGCGCTTGAATGGCGTTGCAACTTTTATTGGTATGGTGGGTTTGACAGTGGCTGGTGCTGTACTTGTAGTCCTTTGGATAAGGTAAGTAAACTTGATAATTTAGCGAGCACAAATGTACTCTTTATAACCATTTTTCATCTACAGATATTTTACTGGACATACCAAGGATCCGGATGGCACTACTCAATTTGTGGCTGGAACTACTCGGGCAAAAAAAGGATTTATGGGGGCAATCAGAATTTTGACAATTGCTGTATGTAATTCTAATCTACATATAGTATGACTAATATTAATATCATGATTGTATCTCTTTTGTTATCACTGATTCTATCTCTTATTTATCCGTAGGTTACTATTGTGGTTGTTGCTGTGCCTGAGGGACTCCCATTAGCAGTAACATTAACGTACGAGTCACCTACTTATTAAACAAATTCATCATAAATTTTAGTTACATGACTATTCATATCCCTTGGAATTCTCGGTCACATAACTGTTGGCACTATTTTGGTTTCAGACTTGCATACTCAATGAGAAAGATGATGCGAGACAAGGCACTGGTAAAAGAAAATTCTATTCTTATGCAATTCTAGAAAGATGATGCATGTTCTGAAAATTGACATTGCTCCATTTCTGTCTAGGTGAGACGTCTCTCATCCTGCGAAACAATGGGATCTGCAACTACAATATGCAGTGATAAAACAGGGACACTTACCTTGAATAAGGTTTGTGAAGTTAATTGCTGGTGCACTTCATGAAAATTGCTATTTGAAGTTGTATCCTGATAAATTCCCAATATATTGCCCTGGCGGCTGCATGCTAGTAGTCTCTGTTTGATCAAAATCTTGGAACATACACCCTCCGATTGGAAACACTTGACATGGCGGTTGCACGATGTCAAGTATTCCTGACTGGAGGGAGTACCGATTTTCTTTTCTATCAATTACAACGATCAATGTTTCAATATTTGCAATTCTTCGAAATTTCCGGCATCGTACCTTGTTTGCTGACCAGTGTGTCATTGATCTTCTAGATGACAGTTGTTCAAGCATATTTTGGTGGAACAATGTTGGATCCTTGTGATGATATTAGGGCAGTGTCATGTGGGGCAACAGAACTTCTTATTGAAGGAATAGCACAAAACACAACTGGAACTATTTTTGTGCCAGAGGTATAGAAGGCTTTTAATTCTATATGATGTATTGATACTCATACGGTTACATTCTGCACACATTATCCCTTGTCTGGGTAAAAGCTACGCCCTACTGGTTACAAACAGTTAATTAAATGGATCGGCAACTTTTTAGTTTTTAGGGTTATAAATTCCCACTTATCCTTAAAAGGAAAACTATAATTATTTATTATCTGATGGAAAAGGAGGAATTGGATGCAGTCTATGTCTCTAGGGAGAATATTGATAGTCCTCCATGAAATTTGGATACATTAGTTGTTATATTCTCTAGTCACAATTATAACCATTATTTTTCTATCTCTAGGATGGGGGAGATGCTGAACTTTCAGGATCGCCAACTGAAAAGGCTATTCTTTCTTGGGGCCTTAAGGTATTAACCCTTTATCTGGCTTCCATACTCAAGTGGTTCCTTCAAT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