Difference between revisions of "BGIOSGA028814"
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Revision as of 17:14, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA028814 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA028814, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_29523 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA028814-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA028814-PA |
| Length |
19198 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:24358758..24377955 |
| Sequence Coding Region |
24358758..24358879,24359005..24359218,24361338..24361454,24362817..24362909,24365449..24365718 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome08:24358758..24377955 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome08:24358758..24377955 source=RiceIndica08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAAGCGTTTTGTCTACATAAATGATGAATCTTACCAGAATGACTATTGTGATAACCGGATTTCTAACACAAAGTACACCTTACTAAATTTCCTGCCAAAAAATCTATGGGAGCAATTCAGGCGTTTCATGAATCAATATTTCTTGCTGATAGCATGCCTCCAACTGTGGTCACTTATCACTCCTGTAAATCCTGCAAGCACATGGGGCCCGCTTATTTTTATATTTGCCGTTTCAGCAACCAAAGAAGCCTGGGATGACTACAATAGGTATATTTCAGACAAGCAAGCAAATGAAAAAGAAGTGTGGATTGTAAAGAATGGTACCCGGAAACATATCCAAGCACAAGATATTCGTGTTGGTAATATAGTATGGATTCGAGAAAATGAGGAAGTACCATGTGACCTTGTTCTGATAGGAACTTCCGACTCGCAAGGCATTTGCCATGTTGAGACAGCTGCTCTTGATGGGGAAATTGATTTGAAGACGAGAGTAATCCCATTGACATGTGTAGGACTGGACTCTGAACAGTTGCACAAAATTAAGGTGAAACAAATTGCTATCCAAGTTTATCCTAACTTGATCTACAAGGCTAAGACTGAGGTCGAGTTTACAAAAGGGCTGATTATTGTCAATTTCAACTTTTCAGGCAATGAGACTAAGTTGGGAATGAGTAGGGGTGTCCCAGAGCCCAAGCTTACCGCCATGGATGCAATGATTGATAAGCTTACTGGTGCAATATTCTTATTTCAAATAGCTGTTGTTGTCGTTCTTGGATCTGCAGGCAATGTGTGGAAGGACACTGAGGCCCGTAAGCAATGGTATGTCAAGTACGATGATGATGAACCATGGTATCAGATTTTGGTTATCCCCCTGCGGTTTGAACTGTTGTGCTCCATTATGATTCCCATTTCAATAAAGGTTTCTCTAGACTTTGTTAAAAGTCTCTATGCAAAGTTCATAGACTGGGATGAGGAGATGTATGACCATGAAACAGATACACCTGCTCATGCTGCAAACACAGCAATTAGTGAAGACTTGGGTCAAGTTGAATATATTTTAACAGACAAAACTGGGACCCTGACTGAGAACAAGATGATCTTCAGGAGGTGCTGTATTGGTGGCACCTTTTATGGGAATGAGAGCGGAGATGCACTTAGAGATGTCGAACTCCTCAATGCTGTTGCCAATAATTCTCCTCATGTCATCAAGTTTTTGACAGTCATGACCCTTTGCAATACTGTCATTCCTATAAAAAGTTCTAGCGGAGCAATTTTATATAAAGCTCAGTCCCAGGATGAGGATGCTCTTGTTAATGCAGCCTCTAATTTGCATATGGTGCTTGTCAACAAAAATGGAAACACTGCTGGACAGCGGATAAAGACATTTGTTGATGCGGTCGACAAATATGCTCAACTGGGATTACGGACACTCTGTTTGGGATGGCGTGAACTGGAATCGGAGGAGTACCTAGAATGGTCTCGATCATTCAAGGAAGCCAACAGTGCATTAATTGATAGGGAGTGGAAAGTTGCTGAGGTGTGCCAGAAACTAGAGCACAGCTTAGAGATTCTTGGTGTCAGTGCTATAGAGGACCGCCTCCAGGCTGGTGTACCAGAAACTATTGAAATACTGAGGCAGTCAGGAATAAACTTTTGGATGTTAACTGGCGATAAACAAAGCACTGCTATTCAAATCGCGCTTTTGTGCAATCTCATTTCTTCAGAGCCCAAGGGGCAACTCTTGTATATCAATGGAAGAACTGTGGATGAAGTTGCTAGAAGCTTCGAAAGAGTTCTACTTACTATGCGGATAACTACTTCTGAACCTAAGGAGCTAGCTTTTGTTGTGGATGGTTGGGCTCTTGAAATCATCCTGTCACGCTACAATGAAGCCTTTACTGAATTAGCAGTTCTTTCAAAAACAGCAATATGCTGCCGGGTTACACCGTCTCAGAAAGCACAGCTTGTAAAGCTTCTAAAATCATGTGACTATCGAACTTTGGCTATTGGAGATGGTGGGAATGATGTCAGGATGATACAACAGGCTGATATTGGTGTAGGAATTAGTGGCAGAGAAGGTCTTCAAGCAGCAAGGGCTGCTGACTATAGCGTTGGCAAGTTCAGATTTTTGAAAAGGCTGATTCTTGTCCATGGGCGATACTCATACAACCGTACAGCTTTTCTTTCTCAGTATTCTTTCTACAAGTCATTGTTAATTTGCTTTATCCAGATACTTTTTTCTTTTCTTTCTGGTATTGCTGGAACAAGTCTATTCAACTCGGTTAGTTTGATGGCTTATAACGTCTTCTACACAAGCATTCCTGTTCTAACTACTGTCCTGGATAAGGACTTATCTGAAAAGACAGTGATGCAAAATCCAGAGATATTGCTCTACTGCCAGGCTGGAAGGCTTTTAAATCCAAGTACATTTGCTGGTTGGTTTGGTCGATCATTGTATCATGCGATTGTTGTTTTCTTGATTACCGTTCATGCTTATGCTAATGAGAAGAGTGAGATGGAGGAGCTGTCAATGGTTGCCCTCTCAGGAAGCATTTGGTTGCAAGCATTTGTTGTGACATTGGAGATGAATTCTTTCACGTTCGTGCAATTTCTAGCCATATGGGGAAACTTCATCGCGTTCTACATCATAAATTTCTTCATCAGCAGTATACCATCTGCTGGGATGTACACTATCATGTTCCGGCTTTGCAGACAGCCAACATATTGGGTAACACTGCTGCTAATCAGTGGAGTTGGCATGGGCCCTGTATTAGCTCTGAAATATTTCAGATATACATACAGACCTAGTGCTATTAACATTCTTCAGAAGGCTGAGCGATCACGTGGGCCAATGTACACACTGATATGCCCGAGTGTGTTTTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MKRFVYINDESYQNDYCDNRISNTKYTLLNFLPKNLWEQFRRFMNQYFLLIACLQLWSLITPVNPASTWGPLIFIFAVSATKEAWDDYNRYISDKQANEKEVWIVKNGTRKHIQAQDIRVGNIVWIRENEEVPCDLVLIGTSDSQGICHVETAALDGEIDLKTRVIPLTCVGLDSEQLHKIKVKQIAIQVYPNLIYKAKTEVEFTKGLIIVNFNFSGNETKLGMSRGVPEPKLTAMDAMIDKLTGAIFLFQIAVVVVLGSAGNVWKDTEARKQWYVKYDDDEPWYQILVIPLRFELLCSIMIPISIKVSLDFVKSLYAKFIDWDEEMYDHETDTPAHAANTAISEDLGQVEYILTDKTGTLTENKMIFRRCCIGGTFYGNESGDALRDVELLNAVANNSPHVIKFLTVMTLCNTVIPIKSSSGAILYKAQSQDEDALVNAASNLHMVLVNKNGNTAGQRIKTFVDAVDKYAQLGLRTLCLGWRELESEEYLEWSRSFKEANSALIDREWKVAEVCQKLEHSLEILGVSAIEDRLQAGVPETIEILRQSGINFWMLTGDKQSTAIQIALLCNLISSEPKGQLLYINGRTVDEVARSFERVLLTMRITTSEPKELAFVVDGWALEIILSRYNEAFTELAVLSKTAICCRVTPSQKAQLVKLLKSCDYRTLAIGDGGNDVRMIQQADIGVGISGREGLQAARAADYSVGKFRFLKRLILVHGRYSYNRTAFLSQYSFYKSLLICFIQILFSFLSGIAGTSLFNSVSLMAYNVFYTSIPVLTTVLDKDLSEKTVMQNPEILLYCQAGRLLNPSTFAGWFGRSLYHAIVVFLITVHAYANEKSEMEELSMVALSGSIWLQAFVVTLEMNSFTFVQFLAIWGNFIAFYIINFFISSIPSAGMYTIMFRLCRQPTYWVTLLLISGVGMGPVLALKYFRYTYRPSAINILQKAERSRGPMYTLICPSVF</aaseq> |
| Gene Sequence |
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