Difference between revisions of "BGIOSGA029845"
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Revision as of 17:20, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA029845 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA029845, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_31198 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA029845-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA029845-PA |
| Length |
28294 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:11447713..11476006 |
| Sequence Coding Region |
11475904..11476006,11475111..11475374,11473504..11473569,11469778..11470444,11462888..11462937 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome09:11447713..11476006 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:11447713..11476006 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCTTCAGGGGTTGGAAAGGAGGTTGTAGATGCCTCCTCGGTGGTTACTAAGGGTGATATGAAAGATTTGCTAGAGAATTTGTTGAAGATGGGCATGATAGAGCGGAAGCGACCGATGACTGAATTTGATCAGTATTTGGAAGATCCATGTCTCTCAAATGATGGAACCAGTGTTCTCAAATGGTGGAAGGAACATAGTATGATATATCCTACAATCGCTCGGATAGCACGTGACATATTGGCAATACCTTACCGTACTGATTGTAAGGTAGCAACAAGGACCACAAGAGTTGCAATTGCTAAGTCAGATGGTAACCACTATGTTGAAGAGCGCGTATGTACTCAGGATTGGCTCAGATCAGGCGGCATGGAACAAGATTGTGATGATGCTGCAAACCAAGTCGGCGCAGGAGAGGAAAGGATACTGAACGGAATGGGAGATAATGTTGACAATGCCAATGACATGGCTGAACAAGAGGAAAGCTCAGGCAGCACGCCTAGCCCATTGTTCTTGGGCACAAGGCCGAAAAGGCTCCGATCAAAGGCGTGGGATGACTTCACACCCATCTACATCGATGGGAAGGTTGCAAAGGCTGAGTGCATGCACTGCCACCAAGTTTTTGTCAGCAACAGCACCAGTGGCACTAGTAGCCTGCTAAAGCACCAGTCTAAGTGCAACCCCCATGCCCAGAAAAGGGCAATGCAGCAGAAGCTTCCATTTCTGCCATCCAGCCAGAAGAATCTGACGACACTCAATTCTGATCCGAGACAGAAGAAGCTCCTATTCTTGCCAATCAGCCAAAAGAAATGCTCTGACACAGCAGATGTGATGCCTCACAAGAAGGATCCTGCCTTGCCTAACAGTATGAATGACACAAATCGGAAGAGTCAGGAGGTCGACAAGAGTGGGTCTCGTGAGGAACTCGCAACACCTGAACAGAAGAATCTTACCTTGCGTCATGTACCCACGAATAATAATGACCAATCTCATGATGAACATCCAGTGCCTGAACAGAAGAACAATCCTACCGGCACGAATATGAAGAATCCTGAGACTGATCAGAACGGGTCAAATGGACTTATCCAGACAATGGCAATACTAAACCCTTGGACGGCCACCGGAGCACCTGGTCTAGCAGTGCACACTGGTATGGATGATCAGGAGTGTGACTGTCCAAGCGGCGTCGGCAAACAAGGGGATAAAGAACTGAATGGTATGAAAAATGAGGTTGACGATGCCAATGACATGGTTGAACAAGAGGAAAGCTCAGGCAGCGCGCCAAGCCCATTGTTCTTAGGCACACGGCCGAAAAGGCTCCAGTCAAAGGTTTGGGATGACTTCACACCCATCTTCATCGATGGGAAGGTTGCGAGGGCTGAGTGTATGCATTGCCATCGAGTCTTTAACAGTGGCACAAGCAACCTGCTTAAGCACCAGGCCAAGTGCAGCCCCCAGGCACAGAAGAGGCCCATGCAACAGAAGCTTCCCATATCGCTCTCAATTGAGAATAAGTCTGCCGAGGAACATGGTGCACCTGTGCAGGACACTCCCACAGACACAAATACAAAGAACCTGCAGGTTGATCAGAATGTGACTGATAAGCTCGTTAGGATATTGCTAATGCACGGGTACGTTCCGTCGATGAGGAACCATGATGAATTCAGTGAGTTTGTTGCTTCCTTGAACCCCAAGGTCGAGCTGCCATCTGATGTTGACCTGTATTTGTACTTCACGAGGCTGTTTGAGGAAGAAAAGGCCAATCTTAAGAAGCAGTTTGAATCTTCGAATAGTCGGGTCTCCCTGAGTGTTTATGTTTGGCACTATGATACACACTCACCGTATTTGTGCTTGAGTGTTCATTACATCGATGATCAGTGGGAGAGTAAGCGAAAGATCATTGCATTCCGGGCTGTGGATTCTTCTTGCAATGCAAAAGAATTGATTAAAGTCATATTGATAGCTATTAAAGATTGGGGTCTTCTTGGCAAGGTTTTCAGCATTGCACTGGATGACACATTCATTGACAATTCAGTGGCTTCAGATGTCAAGGACATCCTCCAAAAATGGAACTTGCGGCATGCAGATCAAAGCTTATCTGGAAACCAGAGCTTGTTTGTGGTTATTCAGGTGGGGCTCAACGAGCTTGACAAGATCATGGAAAAATCAAGGAAGTTCTCTAAACTTGACAAATTCATGGAGAAGTCGAGAAAGTTTTCTTCATATCCAAAGGGCCCCGCTCCTTTAGCATTACAGTATCCAAATCATAGATATGCACCATCATCGGAAGACTGGGTTAAGGCAGAGAATATTTGTGAGATATTGGATGATTTTCATAAACAAAAGGACGAAATACCCAAACATCACAGTCCACTTAAACTCTTTGACACGATCTGGCATGTGAAGAATGTTGTGCACCGTAAACTTCTTTACCATGATGACAAAGAGACTACCTATGTGTGGGAAAAGATGCAAGAACAATTCAAAGAACAATGGAAAGTCTGTTGCTTACATATCTGCATGCCTATGATCATAGATCCTAAATACCGCCTGGAAATCATCAAGTCACATATTCCGCTTGATTTGGACAATGACATGATAGATTATATTGAAGAAGTAAATGACATATTACTCAGGCTCTTCCATGAATATTCTGGTCAGGTTGAAGACCCTAACTGCACTTCTAGTTCTGAAACTAGTGGCGGGCATTCTTTGTATCCAGATGACAAGTTGGTATTTCATTACCTTGGTTCTGAATTTCCACAGTGGTGGCGACCGATGACTGAACTTGATCAGTATTTGCAAGATCCATGTCTCTCAAACGATAGGATCGATGTTCTGCGATGGTGGAAGGAACATAGTATGATATATCCTACAATCTCTCGGATAGCACGTGACATATTGGCAATACCTTACGGTGCTGATTATGAGGTAGCAACAAGGACTGCAAAACTCGCACTTGTTGAGTCAGATGGTAGCCACTTTGTTGAAGAGCTTGTCTGTACTCAGGATTTGCTCAGATCAGGCGGCCGAGAAGGGGTGATAGAACCGAAATCCCAGCGACGGCGGTGGCGGTGGGGAATCCAGTCCCTACCGGCTACCGATCCGCCGCGTCCGATCGGCCTCTCCATACTGGGATCGCAAATATTGGGCATGGATCAAGATTGCGATGGCGCAAACCATGGCGGCACAGAAGAGGAAAGGGCACTGAATGGTATGGCAGATAAACTTGAGAATGCTGATGACATGGTTGAACAAGAGGAAAGCTCAGGCAGCGCGCCAAGCCCATTATTCTTAGGCACAAGGCCGAAAAGGCTGCGATCAAAGGTGTGGGATGACTTCACACCCATCTACATCGACGGGAAGCTTGCGAGGGCTGAGTGCATGCACTGCCACCAAGTTTTCAACAGCAACAGCACCAATGGCACTAGTAGGCTGCTAAAGCACCAGGCCAAGTGCAGCCCCCATCCCCAGAAAAGGCCAATGCAACAGAAGCTTCCGTTTCCGCCATCCAGCCAGAAGAGTCTCATGGAACCCAGTTCTGATCCGACACAGAAGAAGCTCCCATTCTTGCCGATCAGCCAAAAGAGATGCTCAGGTACAGACGATGCGATGCCTCACAGGAAGGATCCTGCCTTGCCTAACACCCTGAATGACATAAACCGGAGGAGTCAAGAGATTGGCAAGAGTTTAGCTCGTAAGAAACTCGCAACACGTGAGCAGAAGAATCCTACCTCGCCTGACATCACTAATAATGATCAGAAGGATCAATGGGATAATGAACACCCAGTGCTTAAACAGAAGTGCACTCCTGCTGGCACGAATCTGAAGAATCCTGAGGTTGATCAGAATGGACTCATCCAGACATTGGCAATGTGCGGGTACCTTCCATTGATGATGCACAATGATAGTTTTAGGAAGTGTGTTCCTTGCTTCGATTCTATGGGGAAGATGCCAGCGAACACTAACATTGGTGGTGGCTTTCTGCAACTGTTTGACAAAGAAAAGGCTAAGTTGCCATGTTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSSGVGKEVVDASSVVTKGDMKDLLENLLKMGMIERKRPMTEFDQYLEDPCLSNDGTSVLKWWKEHSMIYPTIARIARDILAIPYRTDCKVATRTTRVAIAKSDGNHYVEERVCTQDWLRSGGMEQDCDDAANQVGAGEERILNGMGDNVDNANDMAEQEESSGSTPSPLFLGTRPKRLRSKAWDDFTPIYIDGKVAKAECMHCHQVFVSNSTSGTSSLLKHQSKCNPHAQKRAMQQKLPFLPSSQKNLTTLNSDPRQKKLLFLPISQKKCSDTADVMPHKKDPALPNSMNDTNRKSQEVDKSGSREELATPEQKNLTLRHVPTNNNDQSHDEHPVPEQKNNPTGTNMKNPETDQNGSNGLIQTMAILNPWTATGAPGLAVHTGMDDQECDCPSGVGKQGDKELNGMKNEVDDANDMVEQEESSGSAPSPLFLGTRPKRLQSKVWDDFTPIFIDGKVARAECMHCHRVFNSGTSNLLKHQAKCSPQAQKRPMQQKLPISLSIENKSAEEHGAPVQDTPTDTNTKNLQVDQNVTDKLVRILLMHGYVPSMRNHDEFSEFVASLNPKVELPSDVDLYLYFTRLFEEEKANLKKQFESSNSRVSLSVYVWHYDTHSPYLCLSVHYIDDQWESKRKIIAFRAVDSSCNAKELIKVILIAIKDWGLLGKVFSIALDDTFIDNSVASDVKDILQKWNLRHADQSLSGNQSLFVVIQVGLNELDKIMEKSRKFSKLDKFMEKSRKFSSYPKGPAPLALQYPNHRYAPSSEDWVKAENICEILDDFHKQKDEIPKHHSPLKLFDTIWHVKNVVHRKLLYHDDKETTYVWEKMQEQFKEQWKVCCLHICMPMIIDPKYRLEIIKSHIPLDLDNDMIDYIEEVNDILLRLFHEYSGQVEDPNCTSSSETSGGHSLYPDDKLVFHYLGSEFPQWWRPMTELDQYLQDPCLSNDRIDVLRWWKEHSMIYPTISRIARDILAIPYGADYEVATRTAKLALVESDGSHFVEELVCTQDLLRSGGREGVIEPKSQRRRWRWGIQSLPATDPPRPIGLSILGSQILGMDQDCDGANHGGTEEERALNGMADKLENADDMVEQEESSGSAPSPLFLGTRPKRLRSKVWDDFTPIYIDGKLARAECMHCHQVFNSNSTNGTSRLLKHQAKCSPHPQKRPMQQKLPFPPSSQKSLMEPSSDPTQKKLPFLPISQKRCSGTDDAMPHRKDPALPNTLNDINRRSQEIGKSLARKKLATREQKNPTSPDITNNDQKDQWDNEHPVLKQKCTPAGTNLKNPEVDQNGLIQTLAMCGYLPLMMHNDSFRKCVPCFDSMGKMPANTNIGGGFLQLFDKEKAKLPC</aaseq> |
| Gene Sequence |
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