Difference between revisions of "BGIOSGA029925"

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA029925

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA029925, complete gene.

LocusTag

OsI_31015

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA029925-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA029925-PA

Length

9358

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:9642356..9651713

Sequence Coding Region

9651130..9651713,9648845..9649332),complement(9645430..9645568,9645263..9645334),complement(9644365..9644442
,9644059..9644216),complement(9643702..9643967,9643458..9643584),complement(9643158..9643226
,9642830..9643019),complement(9642356..9642746

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome09:9642356..9651713 source=RiceIndica09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGATGCAGATGGCTTCCTCAGCATTGACTGCGGGCTGGAGGGAGACAAAAATGGCTACACGGACAACAGCAATGGCATCGTTTACACCCCCGACGGCGCCCCGTACGTCGACACCGGGGTGACTAACAATGTGTCCGCCCAGTATGTGAACACATGGGATCGTGCTCTCAACACGCTCCGGAGCTTCCCGCTGACGTTATTCGGCGAGCGGAACTGCTACGCGCTGCCCACCGTCCCCGGGGCCATCTATCTGGTGCGCCTGCGGTTCGCTTACGGCAACTACGATAACATGAACAGCGAGTCTGTTCAGTTCAGTCTGCTCCTCGGGGTGAACCACTGGGACGAAGTGTACATCGCTAATGAAGGCAAGGACTACAGCTCAGAGGCCATGTTTGTGGCGTGGGCGAGCTGGGCGTCGGTGTGCCTTGTGAACACCAACCAAGGCACGCCGTTCGTGAACACGGTGGAGCTGAGGCAGCTCGACAGCATGTTACATTTCCGGAAAATCATGGGCAACAGTTCCATCTACTTGTATGAACGGCGCAACATGGGACCTAGCAGTAGAGATAATCCAATTATAAGGTATCCTAATGATACATATGACCGCTTTTGGTATCCTTGGGGATCGGAAGATGACCCAACGTACTCCAACCTTTCCGCGCCATCGACGCTGATCATTCCTCCTAGCCCCTCGTACGCAGTCCCGTCGCTTGTCCTCGAGACGGCCGTCGTGCCAGCCGACAACAACAAAAGCGTTCTATCCATCATACAAACGAACGACAAAGAGATCCACGAGTACTTGGTGCTCGTGCATTTCGCTGATTTCCAGAGTACGCTCCGGCGCCGGTTCCAAGCCTACAGCAATGGCGATCCTATCGAAGGTGGCCCCTACGTAGCCGACTACTCCGGTCAGACCGTCGGCACCGTCGACTGGATCAGTGCTGAAACCTCCGGCAAGTATAACATCACTCTTGCCGCAACTGACAGCTCCCAGCTGCCCCCGATCGTGAATGCCTTCGAGGTCTACGGTCGCATCCCTCTGGACAATCCTTCTACGTTCCCCAAAGACTTTGATGCTATCATGACTATCAAATTTGAGTATGGGATAAAGAAGAATTGGACGAACGATCCGTGTTTTCCATCCAATTTAGTTTGGAATGGCGTGAGATGCAGCACTGGAAGTGATAATACTATGAGGATAATATCTCTGGATCTCTCGAACAGCAACCTGCATGGATCAATATCTAATAACTTCACATTGCTAACCGCTCTCGAGTATTTAAATTTGTCAGGAAACCAGCTGAGCGGGACAATTCCATCCTCCCTGTGTGAAAACAACGCAGGATCATTTGTTTTCAGATATGTATCTGACGAAGATATGTGCAACACAGCAGGAACTCCAGTCCAGTCAAAAAAACGATCAGCTATTTTAGCCCTTGCAGTAGTGATTCCAGTGCTGGTAGCGGCTATCCTTATTCTTGCATATTTGACCTGGAGAGCTAGAAGAAAGCCCAATAATTTTGTGCACCTAGATTCCACATATGGTCCAGAATTCTTGAATGCTCCAGGAAGTACGAAAAATCATTGGGACCATATGCAAAAAACTGAAAATCGCCGATTTACATACGAGGAGCTTGAGAAGTATACTGATAACTTCGAACGGCTCATTGGGCATGGAGGCTTTGGACAAGTTTACTATGGTTGTCTAGAAGAAAATATTGAGGTTGCTGTCAAGATGCGATCAGAATCATCACAACATGGGCTTGATGAGTTTTTGGCTGAGGTTCAGAGTTTGACAAAGGTGCATCACCGAAATCTAGTGTCTTTGGTTGGCTACTGTTGGGAGAATGAACATTTAGCACTTGTTTATGAGTACATGTCTGGAGGCAATCTTTGTGATCATCTGAGAGGTAAAATTAGTGTTGGTGAATCCTTAAATTGGGCAACACGTCTACGTATTTTACTTGAAGCTGGACAAGGCCTGGATTATCTACACAAGGGTTGCAACCTGCCAATTATTCATGGAGATGTCAAGACCAATAACATTCTATTGGGTCAAAATCTAAAAGCAAAAATAGCAGATTTTGGGCTTTCTAAAACATACCATAGCGACACGCAGACTCACATATCAGCCACAGCAGCTGGATCTGTGGGATACATCGATCCAGAGTACTACAACACTGGAAGGCTCATGGAGAGCAGTGATGTTTACAGCTTTGGTGTTGTTTTACTAGAGGTAGTCACCGGTGAGCCTCCAATAATACCTGGACATGGTCACATTGTTCAGCGTGTGAAGCAGAAGATTGTCACTGGTAACATCAGCTCAATTGCTGATGCGCGTCTTGATGCCTACAATGTCAGCTCTATGTGGAAGGTTGTTGACACTGCCATGATGTGCACAGCTGATGTTGCTGCTCAAAGACCAGTGATGGCCACTGTGGTTGCACAACTTAAGGAAGGCCTGGCATTGGAGGAAGCTCATGAGGAAAGGGTCGACCTCGAAAACATAGCAAGTGATATCGTGTCTTCCGTGTCAACATTTGGTCCATCACCAAGATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDADGFLSIDCGLEGDKNGYTDNSNGIVYTPDGAPYVDTGVTNNVSAQYVNTWDRALNTLRSFPLTLFGERNCYALPTVPGAIYLVRLRFAYGNYDNMNSESVQFSLLLGVNHWDEVYIANEGKDYSSEAMFVAWASWASVCLVNTNQGTPFVNTVELRQLDSMLHFRKIMGNSSIYLYERRNMGPSSRDNPIIRYPNDTYDRFWYPWGSEDDPTYSNLSAPSTLIIPPSPSYAVPSLVLETAVVPADNNKSVLSIIQTNDKEIHEYLVLVHFADFQSTLRRRFQAYSNGDPIEGGPYVADYSGQTVGTVDWISAETSGKYNITLAATDSSQLPPIVNAFEVYGRIPLDNPSTFPKDFDAIMTIKFEYGIKKNWTNDPCFPSNLVWNGVRCSTGSDNTMRIISLDLSNSNLHGSISNNFTLLTALEYLNLSGNQLSGTIPSSLCENNAGSFVFRYVSDEDMCNTAGTPVQSKKRSAILALAVVIPVLVAAILILAYLTWRARRKPNNFVHLDSTYGPEFLNAPGSTKNHWDHMQKTENRRFTYEELEKYTDNFERLIGHGGFGQVYYGCLEENIEVAVKMRSESSQHGLDEFLAEVQSLTKVHHRNLVSLVGYCWENEHLALVYEYMSGGNLCDHLRGKISVGESLNWATRLRILLEAGQGLDYLHKGCNLPIIHGDVKTNNILLGQNLKAKIADFGLSKTYHSDTQTHISATAAGSVGYIDPEYYNTGRLMESSDVYSFGVVLLEVVTGEPPIIPGHGHIVQRVKQKIVTGNISSIADARLDAYNVSSMWKVVDTAMMCTADVAAQRPVMATVVAQLKEGLALEEAHEERVDLENIASDIVSSVSTFGPSPR</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..584#2382..2869#6146..6284#6380..6451#7272..7349#7498..7655#7747..8012#8130..8256#8488..8556#8695..8884#8968..9358#ATGGATGCAGATGGCTTCCTCAGCATTGACTGCGGGCTGGAGGGAGACAAAAATGGCTACACGGACAACAGCAATGGCATCGTTTACACCCCCGACGGCGCCCCGTACGTCGACACCGGGGTGACTAACAATGTGTCCGCCCAGTATGTGAACACATGGGATCGTGCTCTCAACACGCTCCGGAGCTTCCCGCTGACGTTATTCGGCGAGCGGAACTGCTACGCGCTGCCCACCGTCCCCGGGGCCATCTATCTGGTGCGCCTGCGGTTCGCTTACGGCAACTACGATAACATGAACAGCGAGTCTGTTCAGTTCAGTCTGCTCCTCGGGGTGAACCACTGGGACGAAGTGTACATCGCTAATGAAGGCAAGGACTACAGCTCAGAGGCCATGTTTGTGGCGTGGGCGAGCTGGGCGTCGGTGTGCCTTGTGAACACCAACCAAGGCACGCCGTTCGTGAACACGGTGGAGCTGAGGCAGCTCGACAGCATGTTACATTTCCGGAAAATCATGGGCAACAGTTCCATCTACTTGTATGAACGGCGCAACATGGGACCTAGCAGTAGAGATAATCCAATTATAAGGTATGCTGTTCATTTTCTATCACAAAGAGTCCCCTTTATTTAAACGTAGAGCCCCCCAACCAACCACGAACCCTCTTTCCAATTCCTTTGAATTTTGTACATGCTAATTTGTCTTTGTGATCCTAAAAGTGATGTTACTGTCGGTAAGAGGGATTACTAGCTTGTTATTAATCCATGCATCACATATATATGAAACATGATTATATAATTAATATCAAATATATATTTATCAGTTCATATTTTAGAATGATTAAAAACATGAAAAATATAATAATTGATATTTATTCCACATTGAATGTGACTTTTTTTAGGCGGAAAATTGAATGTGACTTCGGTATTTGTTAGTTTAAATTTCGAAAGCATTAAATTATCAAATGATTTAACTGAGAATCAGACAAGTCACAAGTAGAACTCAATATCTATAAACTGGTTATTATTAAATTTCATTAATCTCAGTTTTATAATTTATTAGATTGAGAAATAATCCTATCTTACTATAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAATATGCAATCAATGTCAAATCATTATCTCCACATCAATATCAACATGTACACCTATCATTTCTATAATGTATAACATCCATTCATCCATATATCTCACGGCAAAGTGCAGGGTATCAATTCAACTAGTATAAGTCATACTCCCTCCGTTTCACAATGTAAGACTTTCTAGTATTGCCCACATACATTTAGATGTTAATTAATCTATACGTATGTATGTGTTTAGATTCATTAATATATATATATATGTATGTGGGCAATGTTAGAAAGTCTTACATTGTGAAATGGATGGAGTACTCAATAACCAAATAGAATCATATATCTATTATTTTCCAAGTGTGGAATTATTAAATCTTAAGAACAACTATATATAATTCTAAAATAAAAAAAATATATATGTAATTCAGACTTCAAGCCGAAAACGACTCATGATTTATTATTTTAAATCATGAAAGATCTAAAGCTTAGAGTTCAAATCCAAGCAAAACTTGATACTTATTAATTCTAAATATGATAAATTCATATATTTTGTGATGAAATGACTGTCTTAAATTTTAAGATGGATGAATGTAGTTTTATACTTTTTAGTTTAAAATAGTAATGTTATATTTTTGTGATTAATGAATGAATTTTAAACTTTCATTACCTCTAGAATTAATGTGAGTGGTTTAAGGACAGCCTCCAAAAACCTATAACAAGTTATAATGTAACTTCTAAGTATGATACTATAACTTCTAGGTAAGTCGCATGTAACTACACTAAAGCCACCATAACTCAATAAGAGGGAGGCACAGGTGTGATTTTTTTTTTGGGAGGGGGGTTTGACAGGATCGACTCCCCTTAACTTCCTATTGAATGTTACTCCCTCCGTTTCTAAATGTGTGACACCGTTAACTTTTTAGCACATGTTTTATTTAAAAAATTTTGTGAAATATGTAAAGCTATATGTAAACATGAAAGTATATTTAACAATGAATCAAATTATAGGAAAAAAATTAATAATTACTTAATTTTTTTAATAAGACGAATGGTCAAACATGTTTAGAAAAATCAACGGTGTCAAATATTTAGAAACGGAGGGAGTATATAGGAAATCCAAACTTTTATATTTCTTACTTTTGTTTGTAATCATGGACAATGCGTTGTCCAATAATGGTCGAATTATTTTCATATTGGATTTCACTTTTACATGCAGGTATCCTAATGATACATATGACCGCTTTTGGTATCCTTGGGGATCGGAAGATGACCCAACGTACTCCAACCTTTCCGCGCCATCGACGCTGATCATTCCTCCTAGCCCCTCGTACGCAGTCCCGTCGCTTGTCCTCGAGACGGCCGTCGTGCCAGCCGACAACAACAAAAGCGTTCTATCCATCATACAAACGAACGACAAAGAGATCCACGAGTACTTGGTGCTCGTGCATTTCGCTGATTTCCAGAGTACGCTCCGGCGCCGGTTCCAAGCCTACAGCAATGGCGATCCTATCGAAGGTGGCCCCTACGTAGCCGACTACTCCGGTCAGACCGTCGGCACCGTCGACTGGATCAGTGCTGAAACCTCCGGCAAGTATAACATCACTCTTGCCGCAACTGACAGCTCCCAGCTGCCCCCGATCGTGAATGCCTTCGAGGTCTACGGTCGCATCCCTCTGGACAATCCTTCTACGTTCCCCAAAGACTGTAAGCTCACACAGTCCATCTCTGACATACACTAAATATTTTGAAATTATTGCATGATTCTTTGCTTAATTGCACTGTCAAGTTTAGTAGAAGATAGGGAGAGAAGAAAAAAAGAAAAATACTGTTAGGGGGTTTTGTATATATATATATGTGTGTGTATATATATATATATATGTATATATATATATATATGTATATATATATAAGCATATATGTATCAGGAATTGTCAAATGTATAGTTTAGGAGTTAAGTGTTCCAGTGAAAAGTTTGAGGGAGTAAAAATGACATTTTTTTTAGCATGGGCCTTTTAGATTTTACAAACTATAATAGTATAAATTTCTTAATTTATAAATATGAATTTGTGCCCATATATAGTTAATTGACTCTTAAATCTGAATTCGAAAATTGATAATTAGCTAATAAGTTATTATAACAGACCATTTATTCCTATTTCTAATTTAAGTCGCCATATTCCAAAAAAAAAAAGAAGAAAAAACAATGCCATATTCCAAAAAAAAAAACAACGTATTCATTACATAACTAAAATATTACTACAATACCAACAATAATGTTGGACGGGTTAGCAATGTACACTTCTGAAGTCCGTAATGAGCAGAGTAAAAATAATGATTACGATGAAAACCATGCAAATGTCTAAAACGGCGAACAAAGAACACGTAGAGAAAGAACAATAAAAGAATCATAATAAAAAAATATTTCTAAGTAAATTTCACTTTGGTCCATATTTGATTACCAATGTTTTACTTTGGACCACTATTTAACCAATGTTTTCATTTCTAACCCGTTAATTTTGCCTTTTGTTTTACTCTCGACCACCTCAATTCTCTTCTTAAGCATATGAACGATATCGAGTATGTCTCCTACTCATCAATTAACTCTCTCAGATACATGTAAAACCATTTCTTTGGCATATAACAAGTTGAATAGATGGATAAAAGAGTTGAGGCTGATCAAAGTACCACACAAAGGTAAACACATCATGTCCAAAATGAAAACATTGGTTAAACAAAATATTAATAATAAAAGGTGACCTAAAGTAAAATTTACTCATATTTTTATATTATTTAAGAGATCATACTAGGCTCTATGATATGATTAAACTTGCCCTTATTGTCGTGAGACGTACACATCGGGAGGTGGAACAAACACACATTAACCTCACTCCACGAAGGGGAATTTTCTTACCTGAGCCCTAACACGATTGTGAGCCATCTATTACTTTGTTTTTGATGAATCTGATCGACTAAACTTGATAATACAATTAGTAGAAACTTTTTAGGGGTAATAGTGAAATTGAAATATATAATTGTACATTAGATTTGCATACCATACATCTTGTTAAAATAATGAATACATCGGGTGAAGCTACCATAGCATAGTTTCGAGTACAATATTTTAAAAAGGATAGGACTACACAGGGCATGTGCACTAACTAGTAACAACTAGCTACCATGCATGCCGACAAATGCTAGAGTTAGGCTGTGTTTAGATCCACGGGTGTAAAGTTTTGGTGAGTCACATCGGATATACGGACACACATTTGAAGTATTAAACGTAGTATAATAACAAAACAAATTATAGAATCCGACTGTAAACTGCGAGACGAATTTATTAAGCCTAATTAATTTGTCATTAGCAAATGTTTACTATAGCACCACATTGTCAAATCATGGTTTAATTAGGCTTAAAACATTCGTCTCGCAATTTACACGCAATCTGTGTAATTAGTTATTTTTTCGTTTATATTTAAAACTCAATGCATGTGTCCAAACATTCGATGTGACAAGGTGTAAAATTTTACCGGGGGATCTAAACAGACCCTTAACTTGTACTTGTATGTATTTTTCAGCCATTTTTCTGTTTTTTAAGACCTCTGTTTAAAATGACTCTGTCTCATTTATAGTAAAAGAAATGGAGGCTTTCTTACCCGAGTTCCAAAAAAAAGTATTTTTCTATGCGGAGTATACATTTAAGTGAT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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA029925