Difference between revisions of "BGIOSGA031983"
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Revision as of 17:31, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA031983 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA031983, complete gene. |
| LocusTag |
OS10G0396400 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA031983-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA031983-PA |
| Length |
13469 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:11641866..11655334 |
| Sequence Coding Region |
11655108..11655334,11653275..11653536,11653058..11653190,11652300..11652399,11652023..11652220 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome10:11641866..11655334 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome10:11641866..11655334 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAGGTGGACGATGCCTCCTCATTCATGGGACCACGACGCAGCCGGGAGCTCGCGGGCTGCGACACACGTCCCTCCGCTTAGGTGTCGCGACATTTGGCACGGAGACAATGATGCAGGGGGCGCTATAGAGGGCGCGGAGGAGGGAGACGAGGAGGACGAGGAGGGAGATGAGGATGGAGACAGGGATCTGCAGAGTAAACGGCCCAAAGTGCGCGGCTTCGGCGAAGAAAGCCCACAACATTCTGGTGTAAATGCTTCCTTCTTTGGCTTGGAATCAACACATTTCCCTGGTTCTGATGAACATGGCCATTTCAAGCTCTCACACTGTCCAGAAAATGAATTAGATTTTGGTTTGTCGCTTTTCCCAAATGATGGTGTTAATGAGAACCCAGGGGATGGCAATGTTGGTGATGTAGAAATCTCAGGTGGAGAAAATTCTGAAGATGTTGAAATAAGAATGGATCTATCTGATGATCTATTGCACCTGATATTCTCTTTCTTGGGTCAGAGGGATCTATGCAAAGCAGGTGCCTCCTGTAAACAGTGGCGCTCTGCTAGTATGCATGAGGACTTCTGGAAATGCTTGAAGTTTGAGAATACTAGGATATCTCTGCAAAACTTTGTTGACATCTGCCATCGTTACCAAAATGTGACATACCTAAATCTGTCTGGTGTCCCACATGCAGAATTACTGGTGATGGAAGCGATAACATGCTTAAGGCATCTCAAGACACTAATAATGGGCAAAGGGCAGCTGGGAGAAGCATTTTTTCAGTTGTTGTCTGAGTGCCCATTACTGACTACTCTGACAGTTAGTGATGCATCCCTCGGGAGTGGCATTCAAGAAGTAACTGTTAATCACGATGGATTACGTGAACTTCAAATTTTGAAGTGTCGTGCACTCAGAATATCTGTCAGATGTTCCCAGCTTCAAATACTCTCATTGAGGCGAACTGGCATGGCTCATGTATCACTCAACTGTCCCCAGTTGGTTGAATTGGATTTTCAGTCCTGCCATAAACTTTCTGATAATGCCATTCGCCAAGCTGCTACAGCTTGTCCGCTGTTAGCATCAGTAGATATGTCATCTTGCTCATGTGTTACTGATGAGACACTGCGTGAGATAGCTAATTCATGTCCAAATCTCTCTGTTCTTGATGCATCTAACTGCCCAAACATTTCATTTGAGTCGGTAAGGCTTCCTATGTTGGTAGACCTGAGACTACTAAGTTGTGAGGGGATCACGTCTGCTTCCATGGCTGCAATAGCTTACAGTCGTCTGCTTGAGGCATTACAACTTGATAACTGCAGTTTGTTGACATCTGTGTCTTTGGATCTGCCACATCTCAAGAACATAAGTCTTGTTCACCTGCGCAAGTTTGCTGAGTTGACTTTGCGAAGTCCTGTTCTTTCTTACATTAAAGTTTCCAGATGCTCAGTACTTCATCGTGTTAGCATAACATCAAATGCTCTTCAGAAATTGGTGTTGCAAAAGCAAGAGAGCCTATCAAGTTTGTCATTGTTATGCAACAACTTGATCGATGTCGATCTTAGTGACTGCGAATCATTAACAAATGCAGTTTGCGAAGTTTTCAGTGATGGAGGTGGTTGCCCATTGCTCAGATCATTGATTCTTGACAACTGTGAGAGTCTGAGCACTGTTGAACTGAATAGTAGTTCCATGGTCAATCTCTCTCTTGCTGGTTGCCGCTCCATGACATTACTAAAACTTTCATGCCCAAATCTGCAAAATGTGAATCTTGATGGCTGTGATCACCTCGAAAGGGCGTCATTTTGTCCAGTTGGTCTTGAATCCCTAAACCTTGGAATATGTCCAAAATTAAGTGATCTTCACATTGAGGCCCCAAAGATGTCTCTATTGGAGCTGAAGGGTTGTGGTGTTCTTTCCCAGGCATCAATAAATTGCCCTCGCTTGACATCCTTAGATGCCTCATTCTGCAGGAAACTAATGGATGATTCACTGTCTCAAACAGCAGAGGCGTGCCCGCTAATTGAAAATCTTATCCTGTCATCATGTGTATCAATTGACCTCAATGGATTGTCCTCTTTGCATTGCCTTCATAAGCTGGCCTTGCTTGACCTGTCATACACATTTTTGACCAACTTGAAGCCTGTTTTTGACAGTTGCCCACAGTTAAAGATCTTAAAACTTTCGGCTTGCAAGTATCTCAGTGATTCATCATTAGATGCCCTATACAGAGAGGGTGCTCTTCCTATGTTGGTTGAGCTAGATCTGTCCTACTCATCCATTGGGCAGACTGCAATCGAGGAGCTTCTTTCATGTTGTACAAATTTGGTTAATGTGAATCTGAATGGATGCACAAACCTGCATCAGTTGGTGTGTGGGTCAGATGACTGCAGTTCTGGTGACATGCCTGTTGATGTTTGTCCACCTGATTCAGCACCAGTGAGGAGTGAAGAGATCAGTGAAAGGTCTGATCGTCTGCTTGAAGTTCTGAATTGTACTGGTTGTCCAAATATTAAGAAAGTCATCATCCCTTCAATGACAACCTATCTACGCCTGTCTAAAATCAATCTTAATCTGTCCACAAATTTAAAGGAAGTGGATTTGACATGCTCCAATCTTTATACTTTGAACCTGAGCAATTGTAGCTCCCTGGAGGTTCTGAAGCTTGATTGCCCAAGACTGACAAATCTCCAACTTCTGGCATGCACCATGTTGCAAGATGAGGAACTAGAATCTGCAATATCGCGCTGCAGTGCATTGGAGATTCTCAATGTGCACTCTTGTCCAAAGATAAATGTGCTGGACTTTAGCAGACTGCGTGTGGCTAGAAATAGACAAACTATCCGGTATCCGATGTATACCAGGAACCAGAAGACATTCAGGCCAAAGAAGAATGCACCATCTGGCAATAAGGGTGTGCAGCTGAAGAAGCACATTGATGCAACCTTAGGAAGTGGTAATTTGAGGGATGCGGTCAGGCTGCCTCCTGGAGAGGATCTCAATGAATGGCTAGCTGTTAACAGTGAACATCCTTTACGGCACTCTGATGGAGTTCTGCACGCCTACTACATGTCCAACATGTCAGCTGGACCTAAGTTTGAGTACAGATGGGCTGATGGAATTCAGATCAAGAAACCCATCGAGGTTTCGGCACCGAAATATGTCGAGTATCTGATGGACTGGATTGAGGTCCAGCTTGACGATGAATCCATTTTTCCTCAGAAACTTGGAACCCCCTTCCCACAAAATTTTCGGGAAGTCGTGAAGACGATATTCAAGCGCCTTTTCCGTGTTTATGCTCATATTTACCACACACATTTTCAGAAGATTGTGAGCCTCAAGGAAGAAGCCCACCTTAACACCTGCTTCAAGCATTTCACATTGTTCACCTGGGAGTTCAAATTGATCGATAAGGCTGAGCTTGCTCCACTTATCGACCTAATTGAGTCCATTGTTTCCGTTTGCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRWTMPPHSWDHDAAGSSRAATHVPPLRCRDIWHGDNDAGGAIEGAEEGDEEDEEGDEDGDRDLQSKRPKVRGFGEESPQHSGVNASFFGLESTHFPGSDEHGHFKLSHCPENELDFGLSLFPNDGVNENPGDGNVGDVEISGGENSEDVEIRMDLSDDLLHLIFSFLGQRDLCKAGASCKQWRSASMHEDFWKCLKFENTRISLQNFVDICHRYQNVTYLNLSGVPHAELLVMEAITCLRHLKTLIMGKGQLGEAFFQLLSECPLLTTLTVSDASLGSGIQEVTVNHDGLRELQILKCRALRISVRCSQLQILSLRRTGMAHVSLNCPQLVELDFQSCHKLSDNAIRQAATACPLLASVDMSSCSCVTDETLREIANSCPNLSVLDASNCPNISFESVRLPMLVDLRLLSCEGITSASMAAIAYSRLLEALQLDNCSLLTSVSLDLPHLKNISLVHLRKFAELTLRSPVLSYIKVSRCSVLHRVSITSNALQKLVLQKQESLSSLSLLCNNLIDVDLSDCESLTNAVCEVFSDGGGCPLLRSLILDNCESLSTVELNSSSMVNLSLAGCRSMTLLKLSCPNLQNVNLDGCDHLERASFCPVGLESLNLGICPKLSDLHIEAPKMSLLELKGCGVLSQASINCPRLTSLDASFCRKLMDDSLSQTAEACPLIENLILSSCVSIDLNGLSSLHCLHKLALLDLSYTFLTNLKPVFDSCPQLKILKLSACKYLSDSSLDALYREGALPMLVELDLSYSSIGQTAIEELLSCCTNLVNVNLNGCTNLHQLVCGSDDCSSGDMPVDVCPPDSAPVRSEEISERSDRLLEVLNCTGCPNIKKVIIPSMTTYLRLSKINLNLSTNLKEVDLTCSNLYTLNLSNCSSLEVLKLDCPRLTNLQLLACTMLQDEELESAISRCSALEILNVHSCPKINVLDFSRLRVARNRQTIRYPMYTRNQKTFRPKKNAPSGNKGVQLKKHIDATLGSGNLRDAVRLPPGEDLNEWLAVNSEHPLRHSDGVLHAYYMSNMSAGPKFEYRWADGIQIKKPIEVSAPKYVEYLMDWIEVQLDDESIFPQKLGTPFPQNFREVVKTIFKRLFRVYAHIYHTHFQKIVSLKEEAHLNTCFKHFTLFTWEFKLIDKAELAPLIDLIESIVSVC</aaseq> |
| Gene Sequence |
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