Difference between revisions of "BGIOSGA032341"

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Revision as of 17:33, 22 July 2012

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA032341

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA032341, complete gene.

LocusTag

OS10G0127700

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA032341-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA032341-PA

Length

10239

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 10

Location

Chromosome 10:1676573..1686811

Sequence Coding Region

1686597..1686811,1685620..1685854),complement(1685287..1685456,1683665..1683807),complement(1683365..1683542
,1682138..1682705),complement(1681015..1681127,1678246..1678489),complement(1676573..1676800

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome10:1676573..1686811 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome10:1676573..1686811 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGATGATGAACCGGACGCGGGATCTGCTGATGGAGGGGTTCGAGGGCCTCGTGCGGGAGGGCTCCTTCAGCTGGGCCCTCCCCCGCCGCGGGGCTTCGCCGGTGGACGACGCCGATGACCCCGACAGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGGCAAGCAGCCCTCCATCTCCGGCCTCTCCCCCAAGGCCAACGCCGTCGTCTCTCGCTGCTCCCGGGTACTTGGTACTTCCACGGATGAGCTGCAATATGACTTTGATATACAAGCATCTGATTCCATAAAGCAGCCAAGAAATTATGCAAGAAATTTTTTGGAATATTGTTGTTTGAGGGCACTTGCACATGCCTCACAAGTTGCAGGGTATCTTTCTGACAAAAGCTTTCGTCGCCTAAATTTTGATATGATGCTAGCTTGGGAAGTTCCCTCTTCTTCAAGCGAGCTCACTGTTAAGGTTGAAGTAGACAACACAGTCAGTTTAGAGGCTTTTTCAAGAATAGCACCTGCAATTCCAACAATCACTGATGTGGTAACATGTTCAAATCTATTTGATGTACTTTCATCTTCAAGTGGAGGCCGGCTTACATTTCCTGTATATGATAAATACCTTACAGGATTGGACAGAGCAATTAAGAAAATGAAAGGACAATCTGAGTCCTCGCTTTTATCTGCCCAGCGGTCTCAGAGAGGAGAAAGGATTGTAGAAGTAGATGGAACATTGACGACTCAACCAGTACTTGAACATGTTGGGATTTCGACATGGCCAGGAAGGTTAACACTTACTGATCATGCTCTTTACTTCGAAGCACTTCGGGTTGTGACCTATGATAAGCCTAAAGCTTATGAGCTTGCCGAAGATCTAAAGCAGTCTGTTAAACCTGAGCTGACTGGTCCATGGGGCTCACGGCTATTTGACAAAGCTGTTATGTATAAATCAACAACTTTAACAGAACCAGTGATCATAGAATTTCCAGAGTTGGCTGGCCACTTTCGTCGTGACTATTGGCTGGCCATCATATCAGAAATTCTCTATGTCCACAGATTTGTTAGGAAGTTTGACATAAGTGGAGTTGACAAAGAGGAAACAATTTTGAAGGCTGTACTAAGCATTATGCGGCTACAAGCTATTGAAGAGTTAGCCATTCCAGTTTCTAATCGATTCGAGTCTCTTTTGATGTTTAATCTATGTGACAAACTTCCCGGAGGTGATGTAATACTTGAAACACTAGCTGGTTCTATATCATCGAGAAGATCAACTCAAGTTAACCAACCTGGCACTAGCAGTGGAAGGCATTCAATGTCCCCCTTTACTGTTCTGTCGAATCTTGGAGTGGTATCACCAATTAATAAAGGTGAGAGACTCTTTGTTGGCGAGATAGTTGTTGGGGAAATGAGTGCCTTGCAGAAGGTAGTTAATGAGTCAATGAACAACTATAAGAAGGTTGAATTGGCCCAAGCCACAGTTGATGGAGTCAAAGTTGATGGCCTGGATACAAACTTGGCAGTGATGAAGGAATTGCTATCTCCCGTAAGTGAGCTATGGAGGTTTTTGGTGTTGCTGGCATCTTGGGATGAGCCAATTAAGTCCATGGTATTTTGCTTTTCATCGTCTTATATCATTATCAGGGGGTGGTTAGTCTATTTCCTTGTTTTGGTGCTCTTGTTTTCGGCAGCTTTCATGTTCCTTACAAGACTAACTAGCCATGGAAAACCAATGACGGAGGTCAAAGTGACATCTCCACCTCCAATGAACACAATGGAGCAGCTCTTAGCTGTTCAAAATGCTATTTCCAAAGTTGAAGAGCTTGTTCAGGATGCAAATATTGTTCTTCTGAAGATTAGAGCTTTATTGTTGGCTTTTCCCTCCCAGGCTACTGATAGAGCTATACTTGCCTTGGTAGTGATGGCTCTGAGCCTTGCATTCGTGCCCACAAGGTTGCTTGTCTTGATGATGTTTCTGGAGGCATTCACGAACCACTCCCCACCAAGGAGAGCAAGCACAGAAAGGTGGACCAGAAGGTTAAGAGAGTGGTGGTTCAGCATTCCTGCAGCTCCAGTAGTCGTGGAGAAGGATAAAGAAGACAAGAAAACAAAATAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAMMNRTRDLLMEGFEGLVREGSFSWALPRRGASPVDDADDPDSSSSSSSGKQPSISGLSPKANAVVSRCSRVLGTSTDELQYDFDIQASDSIKQPRNYARNFLEYCCLRALAHASQVAGYLSDKSFRRLNFDMMLAWEVPSSSSELTVKVEVDNTVSLEAFSRIAPAIPTITDVVTCSNLFDVLSSSSGGRLTFPVYDKYLTGLDRAIKKMKGQSESSLLSAQRSQRGERIVEVDGTLTTQPVLEHVGISTWPGRLTLTDHALYFEALRVVTYDKPKAYELAEDLKQSVKPELTGPWGSRLFDKAVMYKSTTLTEPVIIEFPELAGHFRRDYWLAIISEILYVHRFVRKFDISGVDKEETILKAVLSIMRLQAIEELAIPVSNRFESLLMFNLCDKLPGGDVILETLAGSISSRRSTQVNQPGTSSGRHSMSPFTVLSNLGVVSPINKGERLFVGEIVVGEMSALQKVVNESMNNYKKVELAQATVDGVKVDGLDTNLAVMKELLSPVSELWRFLVLLASWDEPIKSMVFCFSSSYIIIRGWLVYFLVLVLLFSAAFMFLTRLTSHGKPMTEVKVTSPPPMNTMEQLLAVQNAISKVEELVQDANIVLLKIRALLLAFPSQATDRAILALVVMALSLAFVPTRLLVLMMFLEAFTNHSPPRRASTERWTRRLREWWFSIPAAPVVVEKDKEDKKTK</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..215#958..1192#1356..1525#3005..3147#3270..3447#4107..4674#5685..5797#8323..8566#10012..10239#ATGGCGATGATGAACCGGACGCGGGATCTGCTGATGGAGGGGTTCGAGGGCCTCGTGCGGGAGGGCTCCTTCAGCTGGGCCCTCCCCCGCCGCGGGGCTTCGCCGGTGGACGACGCCGATGACCCCGACAGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGGCAAGCAGCCCTCCATCTCCGGCCTCTCCCCCAAGGCCAACGCCGTCGTCTCTCGCTGCTCCCGGTAATGGCCTCCCTACACACGCAATTGCCTAGATTCTACTGAAAATTGGGATTTCTTGGGTTGGGTTTCTAGGGATGGGAAATGCTCTGGGGAAGCATTTTCTTTCTGATATACTACTAGGTTACTGCGTTGGATGTGACAATTCTTCGAAATTCTGCAATTAAGTGGCTGTTCGGTGGCTTTATCAGCAACCAATATTACTTTGCATATGTTTGAAGATCGATTATTGGAGTATGTAGTGCTCAGGATGTGCTCTAGGGCCTATGAGTTCGTGTTGGATCTGAAATGGGTTTGGTTTATGATGTCCAAAGTCCAAACGTCAACTGCTGTGTGCAATGTAGTTCGTTGCGTCCATTGTACTTGTTCCGAGGGAATTTTAATATAGAATCAAAACCATAGCTGTTTAATATGTCCCTAAGGTGGGTTTTCTTTAAGGGATGTTGGTAAATGAATAACTTGTGTGAGCTAATATAGTTTATGTCCTTTCAGAATGACCTGCAATTCTTTTATTAGCTTGATTGGAAACATGTTGATGAGCATCCTATGCTTCATGGAACCAATATGATGTTGTTTGCATTTGCTACTGTTCTGTTAAGCCAATTGGCATAGTTGTGTAATATTAGTTTTTCCAAATCGCTATGTCATGTAAAATCAATTCCCTTTTCATGCACAAACTTATGTAATACCAGTTTTGCTTTCATTAGGTGCTGAACATTTGCCTTTTGTGTTAATTACATTTCAGGGTACTTGGTACTTCCACGGATGAGCTGCAATATGACTTTGATATACAAGCATCTGATTCCATAAAGCAGCCAAGAAATTATGCAAGAAATTTTTTGGAATATTGTTGTTTGAGGGCACTTGCACATGCCTCACAAGTTGCAGGGTATCTTTCTGACAAAAGCTTTCGTCGCCTAAATTTTGATATGATGCTAGCTTGGGAAGTTCCCTCTTCTTCAAGCGAGCTCACTGTTAAGGTTACAATTTTCCTTTCTTTACTTTCTTAAATAGTTTTCTTTTGTTCACGCCTTATATAATTTGTTAGCGTTGCATTAATAAAATTTTCCCAGGTTACTTCCTCGTATTAAGGGCTTTTAAGAATCTTTCTACATATTGAATTTCATCTCCTTTCCCTTGCAGGTTGAAGTAGACAACACAGTCAGTTTAGAGGCTTTTTCAAGAATAGCACCTGCAATTCCAACAATCACTGATGTGGTAACATGTTCAAATCTATTTGATGTACTTTCATCTTCAAGTGGAGGCCGGCTTACATTTCCTGTATATGATAAATACCTTACAGGATTGGACAGGTCACTTTCTCTACTGGTCTGTCCATTCAATTTTATTTGTTGTTGGTTTGGATATTTACATGGTCAGCAATAGACAGTGACAAACTGCCTTTTCTAATTTCATATCAGCAGTAATTGAATGTTATGGAAGTTCTCTTGATGAAATGTCTACCACTAGTAATATATAATTTATCTGACAAATCTAAATAGTTATATGTCTCTTAGTTGTCAAAACTTGAATGTTTGTATGCAAATGTTGTAAAATGATGTCCTTTTGAGAATATGGGGAGGCAGGGAGTATTACTTACCATAATTATCATACATATTGACTTATATTTTCTCTTTTGTTTACCTTCCAAACGTACAGATACAACTTAGATTTACATGGTGCAGTGTAGCAGAAACCACTAGTTTCTTGTCCCATGATGAATATTTTTTTTTCAAAATGAAATGCATAAACATGTTGTGCATCTCTTTAGTGCTTATTCTCATCAGTGATAAGTGGATAATCCACTTTCTTGATTTAAGATAGAGAAAATTTGGGCAACCATTATAGGTCTATAGCTCTTTATTTCTGGATGTTTAACCTGTTACAACCTTACAATAGATGTTGTTATCTTCCTACTTTGCACTGATAAGTATATCACCTGTTTGAGTTAAGATTGATGTAGTAGATCCCCTTGTTAACTATTCTCCATAGAAAATTATAGGGCATATTTCCACAAGCCCTCTGTTGATGTTTATAGAAACACACACGCACACTTCCCAATCCATATTTTGTTGGTAATTTTCCCATAGTGCCCATGCTTAAAGAGGCCTGTACGCATGCACGCAGTTAGATTTTAGTGAGGTGATGCATTAATACCGTGCATGCAACTAGAATAAATGGAGGTATTTAGATAAAATAGTTGGCTTCCTTTGGTCTATGAGCCCCAAAACTATATGCCGTACAATTTTCTAGGGAGGGAGTACCCTTTTACATGCTCAAAGTTGTACCTGCTAATACAGGGACTAGGGTGTAATGTTTATGGTACCATAGCATGTAAACAATTTTGGAGAATGAATAAATGCAATATGGTGCATACCATTATATAGGCATGGACATAGATTCTACTATCAAGTTCAATGGTTCAATAGCAAGCAGGTTATCTGATTGTTGAATATCTTTACATCCTTGTTCATATAGAGATACCATTATATTTCCATCAGTTAATATACATAACCTACTAGTTTGTACTCTGAATTTAGAATTAGTGTCTGAAGTAAGATAATAATTGGGATTCCTTTAAAACATTAACCATTTCTTCATGCTTTACCATTTTTAAAGGTAGATCTGTCATAAATGAATGGGGATATGGGATTGCATATTGCCAATTTTTGTTACCAAAATAAGTTCAATTATGCTCTTTTTTTTTTCTGGAGATAGGATATGCAAGCATAACTTTCTGTTGGATCTTGTTTCATAATGTCAGGACTGAGAGTATGTTTTACCTCATGTAGAGCAATTAAGAAAATGAAAGGACAATCTGAGTCCTCGCTTTTATCTGCCCAGCGGTCTCAGAGAGGAGAAAGGATTGTAGAAGTAGATGGAACATTGACGACTCAACCAGTACTTGAACATGTTGGGATTTCGACATGGCCAGGTATGTCTGATTTCTCAGTGAGGAGAAATGATTTCTTCTTGTTTACATGCTGGCATGTTCTTTTAACTTGCCTTGTTACGGTTTTATATCACTGGGTTTCAACTTTTCCTTTCCTGGCACAGGAAGGTTAACACTTACTGATCATGCTCTTTACTTCGAAGCACTTCGGGTTGTGACCTATGATAAGCCTAAAGCTTATGAGCTTGCCGAAGATCTAAAGCAGTCTGTTAAACCTGAGCTGACTGGTCCATGGGGCTCACGGCTATTTGACAAAGCTGTTATGTATAAATCAACAACTTTGTAAGTTTTTTCACACTTAGCAAAGCAAATAAGCAATAGAGTACTACATCTATGCTACTTAAAATGTTAGTAGTGGTGGTGTCCGTTCTGCCACACCACCCCTACCACTGATATTTAGGACCAATAATCTATAGTATTACACAAACCTCCAACGAGTCCTCTCCCGTTTCACTGTTGGTTTATCTTAAACTTTGAAATCACCTACTTATTCAATCTATACTACTTCAAATGTCAGTAGTGGTGGTGTCTGTTCTGCCACACCACCCCTACCACTGATACTTAGGCCCCACAATCTATAGTATTACACCTACCTCCAACGAGTACTCTCCTGTTTCACTGATGGTTTATCTACTTATTTAATAAGGAAAATCATAAAAGTGTTAATTTGACTAAATATGTGCTTAATTGACTTGATAAGCTAGAAACTGAATTCGTTTTCCGTTGCAACGCATGGGTTCTTGGCTAGTAAACGTAATAGCTGATTCCTATAGTGGTATTTTGCTAATTAGTTTTAATTTACAGGTCGTTGCTATCCATTCCTTTTTATTAGGAGATAGTAGCAACATGTATCCCTCACCTGATATCCTTATAACTAGCACATAGATTTGCTCTTATCACCTTTAGTTACATGTTTTTCTTTATTGTTAATGCAAATGCAGAACAGAACCAGTGATCATAGAATTTCCAGAGTTGGCTGGCCACTTTCGTCGTGACTATTGGCTGGCCATCATATCAGAAATTCTCTATGTCCACAGATTTGTTAGGAAGTTTGACATAAGTGGAGTTGACAAAGAGGAAACAATTTTGAAGGCTGTACTAAGCATTATGCGGCTACAAGCTATTGAAGAGTTAGCCATTCCAGTTTCTAATCGATTCGAGTCTCTTTTGATGTTTAATCTATGTGACAAACTTCCCGGAGGTGATGTAATACTTGAAACACTAGCTGGTTCTATATCATCGAGAAGATCAACTCAAGTTAACCAACCTGGCACTAGCAGTGGAAGGCATTCAATGTCCCCCTTTACTGTTCTGTCGAATCTTGGAGTGGTATCACCAATTAATAAAGGTGAGAGACTCTTTGTTGGCGAGATAGTTGTTGGGGAAATGAGTGCCTTGCAGAAGGTAGTTAATGAGTCAATGAACAACTATAAGAAGGTTGAATTGGCCCAAGCCACAGTTGATGGAGTCAAAGTTGATGGCCTGGATACAAACTTGGCAGTGATGAAGGTATACTCACAACAGAATTAGCCTTTTCAACTGTTAAGGATCTGTTCAATTCAATGTTTGGGTTTAGCTACTCCCTCATTTTTCGTGAGCAGGCTTCCTGATATGTGAACGGGGCCTAATTAATCAGAATAAATTGTGGTTTATCCAAATTGATTACAGCACCATTTTGATCTGTTAAATTATTCAGAACAAAACTAACCTATTTAGAGCTTGTGC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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA032341