Difference between revisions of "BGIOSGA033048"
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Revision as of 17:36, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA033048 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA033048, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_33820 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA033048-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA033048-PA |
| Length |
10578 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:14649186..14659763 |
| Sequence Coding Region |
14649186..14649354,14649877..14649935,14650828..14650936,14651588..14651667,14651954..14652022 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome10:14649186..14659763 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome10:14649186..14659763 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGCGGCGAGACGGGCGAAGGTGGCGGCGGCGCTGGGAGTGGTGGTGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGCGGTGGCGGTGGTGGGCTGCGGGGCGCAGCCGGTGGTGGTGGGGAGCTACGGGCAGCCGAGGCTGTGGCTGAAGCCCTACGACTGGAGCTACCTGCGCGTTGAATTGCCGCCGTCGTTTTCTTCCGTCACCATGGATTTCGCGACTGACAGAGACATTCAGAGGGAGCACTTGAAGGATCTGCCAAGAAGAGATCTTGCTATCATTTGTTTGATGAATTCCAACCCTCCTATTCCTGATATATCTGATTCTTTTCTGGACACTTTATTAATAACAGTCTTAGTAGCAGATTTGACACTGATGCAGAAGTGCACATCGGTGGTTATCTTGATTGAGTTACAAATAGTTATATCTCCAGGAATATGGTACATTGGTTACTTTAATGGCCTTGGACCTGCTCGCACGCAATCAAAGATGATTAGCCGAGGCAGGGCACGTTCTGTGAGCACCAGTATAACTGTAGAAGGATGTCCAACTTCAGCACTATGGGGACCATATTGTAACCAAACAATAGAAATGATTAGTTGTTCTCAGTCTTCAGGATATAACAACTCGAGAAATCTTATGGGTTTGAATATTGACAAGCGGAAAACTTTGAATACCAGAGAGCACACAAGGCGTATTAATTTTCTGTCGCAGTGGAACCATTTAGAAGAAAAGGGAGTTGGCTCCAACAGTACAACCTATTCGAGAATGGACAACTCGATCACTTGTGCCATTTCAAATGGCTCATTATGCTTAAGGCAGGGTGATATGAAGTTCTACTTCTTGGATGTGGTTGACCTAGCATTGCAATTTGAAATTACAGCTACGAATTTTGGGTTAGCTCAAAGGTCATCCTTAATTTGTTACCTGCGCTACAATGCCTTTCCTCGGAGAGATTTGCATGATTATTCAGGTGACATCAGCAGTGCTCCTTTGGTTTTAAAGTTGCCAAATATTGGACGGTGGTATTTCGCTATTGAGACTGTAAATATAACACAGATGAATAGCACAGCATCAACACCTTTACTGGATACGACATGCTTCTCATTAGAGTGGCAAGTGACTGGATGCCTGAATGGAAAAGCTGGAACCAATTGCTCATGGGAGGCATATGTGCTCCAGAGGGTTCCTAAACGAAGTCCTTCTGTCCCTTTCGAGTCATATTATGTTCCTAGTGATGGAAAGGCATCCCTGGAGTATAGTCACTTCTCCCTGGAACAATTTTTAAGCAACTCATCTTTTGAGCCATTTGCATGGACTTATTTCTTTCTGGATATTCCCGAAGGTTCAGCCGGTGCGCTTATCCATGTCCAGATAAAATCAGATAAAGAATTGAATTATGAGTTGTACTCGAGATATGGTGGTTTACCATCAAATGAGAGTTGGGATTATTATGCAAGCAGGACAAGCAGCAGTAATGGCTCAGTATATTTTTCATTACAAAATTCCACAAATTCAGATATGGATCTATCTATTTTCTATGCAAAGGAGGGAACTTGGTGCTTTGGTGTGAAACATCCAAGTGATAAATCAAATTCTCAGACGTACATGTCCATATCTCTTCAGGGATGCCATAAGAACTGCAATCAGAAAGGAGCGTGTCATTCCTCAATTGATGAAAGTGGGCTAACGTTCTACAGCTTCTGCACGTGCGATCGTGATCATGGTGGGTTTGATTGCAATGATGAATTAGTTTCACCTAATGGGCACATCTGGCAGTCTGTCTTTCTAATTGCATCAAATGGTGCAGCAATTTTACCTGCCTTTTGGGCTCTCCGGCAAAAGGCATTTGCAGAATGGATTCTTTACACTTCTAGTGGAATTTCTAGTGCTTTATACCATTCATGTGATGTGGGTACCTGGTGCATACTATCTTTCCGTGTATTACAGTCAAACGTAGACACTCATGCCACACAAGTCCTTGCGCCTACTGCATATTTAGGAATTTCGCATAGGCTCCAGGGCCTCTCCGAGCATGGGCAGCTTTTCCACTGTATGTCACTGTTTTTGGATTTCTGGCTTTCCTTTATGGCTGTTGTTGGTACGTTCATATATATGGCTACAATTGATGAAACTTCAAAGCGAGCCATGCATACCGCTGTCTTTATTCTCACAGCTCTTTTAGCTGCAACAGGTGCTACCAGATCTGCAAATATTGGTATTGTCATTGCTATTGGTTCTCTTGGCCTGCTTATTGGATGGCTATTGGAGTTCTCTACAGCAAGAAGATTCGTATGCTGGCCGTGGCGAATTAATCTTAATGTACCTCAAAGCTGGCCAAACCTCAGGAGTTTATTTTGGAACAGTCTGGATTTGCTGAACAAACGATTCCGTTGGTTCTATTTACTTCTGGGTTTCATCACATTAGCATTTGCGGGTACAAGCTGGAAGCTAGAATCAAATCGTAGCTATTGGGTTTGGCACAGCCTGTGGCATATTACTATTTACACGTCCTCATTCTTCTTCCTGTGCTCAATGCGCATCAATACGCTTACTGGACCTACCCTGGAAGAAGAGTTGAATGCCATATTCTTTTTGACAGTGTGCATGCACCGGCCTCTTCAGGTTGGACAGCTTCGAGAAGGACTCTGGAACCTGGCTGGACAAGTCACAATTGCCGCCGACGTGCAGCGACTTGAGCAGTCGTGGCTCGCCGAGGACTCTGAGAGCTCGTTGGAGAGGCGGTTGTCGAACAGCTGGAGAACAAACTCATGGCTGGATGACGAAAGTGGCACGGAAAGAAGGAATTCACACCCCCGATGGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAAARRAKVAAALGVVVWWWWWWAVAVVGCGAQPVVVGSYGQPRLWLKPYDWSYLRVELPPSFSSVTMDFATDRDIQREHLKDLPRRDLAIICLMNSNPPIPDISDSFLDTLLITVLVADLTLMQKCTSVVILIELQIVISPGIWYIGYFNGLGPARTQSKMISRGRARSVSTSITVEGCPTSALWGPYCNQTIEMISCSQSSGYNNSRNLMGLNIDKRKTLNTREHTRRINFLSQWNHLEEKGVGSNSTTYSRMDNSITCAISNGSLCLRQGDMKFYFLDVVDLALQFEITATNFGLAQRSSLICYLRYNAFPRRDLHDYSGDISSAPLVLKLPNIGRWYFAIETVNITQMNSTASTPLLDTTCFSLEWQVTGCLNGKAGTNCSWEAYVLQRVPKRSPSVPFESYYVPSDGKASLEYSHFSLEQFLSNSSFEPFAWTYFFLDIPEGSAGALIHVQIKSDKELNYELYSRYGGLPSNESWDYYASRTSSSNGSVYFSLQNSTNSDMDLSIFYAKEGTWCFGVKHPSDKSNSQTYMSISLQGCHKNCNQKGACHSSIDESGLTFYSFCTCDRDHGGFDCNDELVSPNGHIWQSVFLIASNGAAILPAFWALRQKAFAEWILYTSSGISSALYHSCDVGTWCILSFRVLQSNVDTHATQVLAPTAYLGISHRLQGLSEHGQLFHCMSLFLDFWLSFMAVVGTFIYMATIDETSKRAMHTAVFILTALLAATGATRSANIGIVIAIGSLGLLIGWLLEFSTARRFVCWPWRINLNVPQSWPNLRSLFWNSLDLLNKRFRWFYLLLGFITLAFAGTSWKLESNRSYWVWHSLWHITIYTSSFFFLCSMRINTLTGPTLEEELNAIFFLTVCMHRPLQVGQLREGLWNLAGQVTIAADVQRLEQSWLAEDSESSLERRLSNSWRTNSWLDDESGTERRNSHPRW</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..169#692..750#1643..1751#2403..2482#2769..2837#2951..3640#3905..4422#4518..4582#5807..5886#6691..6795#7563..7676#7824..7963#8052..8180#8698..8850#8980..9043#9193..9267#10378..10578#ATGGCGGCGGCGAGACGGGCGAAGGTGGCGGCGGCGCTGGGAGTGGTGGTGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGCGGTGGCGGTGGTGGGCTGCGGGGCGCAGCCGGTGGTGGTGGGGAGCTACGGGCAGCCGAGGCTGTGGCTGAAGCCCTACGACTGGAGCTACCTGCGCGGTTAAGAGCCCTGGAATCTCTGCTCGCGGTTGCGGTGGGGTTTGGGTTTGCTTCGGCTTGAGCTCCCTCGTGTGATTATCATGCCGCGTGCGCCTTTTCCGCCGTGATGATCGCCGCCGCGGGATTCCGTTTGTTTTTTTTTTTGGTCACGCTTTTGTGTTGCGGTTTGGGAGATTTTGTGTTCGTATTTAGAGATTTCTTCCCAGGTGGTGGTGTTCGTCTCACTTCCCCCCTAAACTAGAAGTGCGATTTTGAGTGGAATTAGCTGCTGCGACTGCTCTAATTTTTGCTTAAGTTAAGTTTGCTTAAGTTAAGTTAATTAAGCTCGCTAGATGCTTTGCTTACCTAGGTAATTAAAGAAGATTGGTGCATCTAGGCTCGGTTGTGAGTTTTCACATGCAACATGTTCACCTTTAAGCGTGCAGCGAAACCACGGATTTTGTCGCATCTGTATTTGGATTTCTTTTGTTTTTTTGTTTTCATCTTGGATTTACCCTCATACTTTGCTTTCGTTGCTCGCAGTTGAATTGCCGCCGTCGTTTTCTTCCGTCACCATGGATTTCGCGACTGACAGAGACATTGTAAGTGAAGATTCTGGCCTTCTGAGAACTATATTTTCTGTCTAATAATAAATACAATATTCTTTTTATAGATTCGTTGGTTTATGGATATGCTAGTATTCTTATAATCAGTGAGCAGTGTGGGTTTTCTGAGTTGACCTGGTAGATTGGGCCGTGGTTAGTACGAGAAGTATCTAAACATTAAGATATTGTGACCTGAACATTTGGTGGCAGTAGTAGTTCATTTTGTCAGCTATCCTTGGTTGGTATGAATATGCTGATTGTTTTGAAGCTAACTTGGGGTATCATTTTGAGTGTGAATTTACTAAGGCATGATGTTTTTTTTTCGAGTTTCGAGCACCTCCATGGATGCAAGGACATGGTGTTTTCTTCTGTTATGGATGAAAAAAAAATTGGAAATCCCCATTTTTTACTTTAAAAATATTTTCTTTTCATGATCTTATCATCCCATATGAAAGTATGTGTGCTGTCATGTTCATATTGATTCCCCAGAATCTATACATAACACACCACACAGGGATTCATGTATTCCTTTTTGGAAATAGTATATCAAGATAGAGGAGCAAGGGTTGATGAATATGGTCTTCATCTAAAAGTGGGCAAGCAGCTTGTTTGTTTAACCTTTACTTTCCAAAGAAAATTTAGGTGGTACAGCAGTTTAGCTCGGTGCCTTCTATGTGTAGTGCAGTGAAAGGAATATGAAATGCTGATCGGTGAGTAGTTATGTGTAATAGAGTGAGCTGCATTATTCTGTTTTATGAACTCTTTAACTTGACGTAGAACAGCATTTTGGTATTGCATCATCTGTTTAGTTTATATCTGACTATATTGTACAGAAGATTGCACAGTTGACTTATGTATAGTTTGTGCAATATTTCTTTGGAAAATACAGCAGAGGGAGCACTTGAAGGATCTGCCAAGAAGAGATCTTGCTATCATTTGTTTGATGAATTCCAACCCTCCTATTCCTGATATATCTGATTCTTTTCTGGACACTTTATGTGAGTACCAAATACATTGTCTTATGTGATGATTAACACCTTTGAGGTCTTAAATAACTTTTTGTATAATTGTATTCAGATAATCCTGCATGCATGGTTAATTGCAAGATAAATTTGTTAAATGAGTAATAGATATACGATTTAAGAATATTGTCTTTCAAATTGGGAATGGAGTATACTATGTAGTTCTCAACCCAATAATAATGGAGTATACTATGTAGTTCTCAACCCCATAATAATTAGTGTTATATTTTATATGTGAAAATCCATTACAATTCCTTGCAAATAAAAGAGAACTGAGAAAATAAATAAACCACATGACAGATAGGCATGATTAGGAGTTCATTAGCTCCATAAAAAAAGTTCATTTTGAGGGCATTTTTCTAGTGAGTTGTTCTTTTGGTTCTTCTTATTGGATCCTTATTATCAATGTTTAGATAACTTTCTGATTAAACCAATTTTGACAGGAAGGTTCTTTGTTGCAGTATCAAACTTTCTCGTTGTTGGTCTTTTGGCAGTACCAATAATCAGTCAATCTGGCGCAATGCATACCATTTCAGAAAAACACGACGATTGTGTTAAGAAATGACCAGGTTAACAATCCTGATGCTGTAATTTGTAAATCGATATGCTGTTCTTACCTTTTTACAGTAATAACAGTCTTAGTAGCAGATTTGACACTGATGCAGAAGTGCACATCGGTGGTTATCTTGATTGAGTTACAAATAGTTGTATGATTACACATAAACTAATAATGACATTTGGATCCTTATAATTGAAAGTCAACTTCCACACCGCATAAACCTGTTAGGTCTATTTATTGAGTTCTTCTGTGCCCTTAGTGCTGGAATTTTCTCAAGTCAAATGATTGATTCTGCCCATACAGTTCTATTTACTTGTGTTATCCATTGGCCTTATCTGATCATTAAGTGCAAGAAATGTATTGTTGTCCCCTGATGTAACAGCTCCATCTTCCGTTGTAGCATCTTATGGTTTGTCAACCATTGTTCTGTGCAGATATCTCCAGGAATATGGTACATTGGTTACTTTAATGGCCTTGGACCTGCTCGCACGCAATCAAAGATGGTATGCCTCATTTCTAACTAGGGAATGTGTAGTTTACTGCACTATCATCTATTTTATTTTTCAGCATGAATGCATCAAGCAAATTTTGAATTGTTGATAATATACTTCTGCAGATTAGCCGAGGCAGGGCACGTTCTGTGAGCACCAGTATAACTGTAGAAGGATGTCCAACTTCAGCACTATGGGGACCATATTGTAACCAAACAATAGAAATGATTAGTTGTTCTCAGTCTTCAGGATATAACAACTCGAGAAATCTTATGGGTTTGAATATTGACAAGCGGAAAACTTTGAATACCAGAGAGCACACAAGGCGTATTAATTTTCTGTCGCAGTGGAACCATTTAGAAGAAAAGGGAGTTGGCTCCAACAGTACAACCTATTCGAGAATGGACAACTCGATCACTTGTGCCATTTCAAATGGCTCATTATGCTTAAGGCAGGGTGATATGAAGTTCTACTTCTTGGATGTGGTTGACCTAGCATTGCAATTTGAAATTACAGCTACGAATTTTGGGTTAGCTCAAAGGTCATCCTTAATTTGTTACCTGCGCTACAATGCCTTTCCTCGGAGAGATTTGCATGATTATTCAGGTGACATCAGCAGTGCTCCTTTGGTTTTAAAGTTGCCAAATATTGGACGGTGGTATTTCGCTATTGAGACTGTAAATATAACACAGATGAATAGCACAGCATCAACACCTTTACTGGATACGACATGCTTCTCATTAGAGTGGCAAGTGACTGGATGCCTGAATGGAAAAGCTGGAACCAATTGCTCATGGGAGGCATATGTGCTCCAGGTAGGATGAGAAGTTATGGAATTTACTTTTGTTATCGACTGTAGCTGCACGTGTTTTGACCTTTCAATCTCCGGTTTCTATGATGTGATGATTTTAAAGTTGAAATAAACCAAACACTTTGCTACCCATGAATTGCCATCTGACTGATTTTGTAGTTTTTCCATCACAAGTTCTTTTTTGTGCTGGCATCTGCATGCTTTGTTAGGTAAAACCTAGTTTCTGCAAAGACATCTTTATTAATTAATCACTGTTCTTAAAATGCAGAGGGTTCCTAAACGAAGTCCTTCTGTCCCTTTCGAGTCATATTATGTTCCTAGTGATGGAAAGGCATCCCTGGAGTATAGTCACTTCTCCCTGGAACAATTTTTAAGCAACTCATCTTTTGAGCCATTTGCATGGACTTATTTCTTTCTGGATATTCCCGAAGGTTCAGCCGGTGCGCTTATCCATGTCCAGATAAAATCAGATAAAGAATTGAATTATGAGTTGTACTCGAGATATGGTGGTTTACCATCAAATGAGAGTTGGGATTATTATGCAAGCAGGACAAGCAGCAGTAATGGCTCAGTATATTTTTCATTACAAAATTCCACAAATTCAGATATGGATCTATCTATTTTCTATGCAAAGGAGGGAACTTGGTGCTTTGGTGTGAAACATCCAAGTGATAAATCAAATTCTCAGACGTACATGTCCATATCTCTTCAGGGATGCCATAAGAACTGCAATCAGAAAGGAGCGTGTCATTCCTCAATTGATGAAAGTGGGCTAACGTTCTACAGGTAATTCCACAAGATGTTTCCCTATAGCGTGAAAATATTTGTTTCTCTTTTTTTGCTCTTTGCGCTGTAACGATATTTTTTTCTTCATTTTCTAGCTTCTGCACGTGCGATCGTGATCATGGTGGGTTTGATTGCAATGATGAATTAGTTTCACCTAATGGTAAACTCCCTCATATTTAGTTTCTAAATTTTCTCAGCTAATGCATACTACAGCAGTAGTAGCCCTATTTCTGGGTAGAAATCACAAATGTATCTAATATACTCCCTCCTTCCCAAATTGATCATCATATAAGTTTATGCACCAAGACCAAGGGCAATTTAAATCACATCAATGAAGACACCATGCACACATTCTCCCACAATGCATGCATCAATTAAAAC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