Difference between revisions of "BGIOSGA033130"
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Revision as of 17:36, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA033130 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA033130, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_34027 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA033130-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA033130-PA |
| Length |
12385 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:16575941..16588325 |
| Sequence Coding Region |
16575941..16576038,16576124..16576222,16576837..16576879,16577501..16577572,16577651..16577746 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome10:16575941..16588325 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome10:16575941..16588325 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCAAATGCGAGATTCCAAGCTGCTGGAGCAATTGGTGATGCAGCAATAAGGGAGTGGGGAATCCTTTCAGATGACAACAAAAAAAGCCTAATAGTATATTGCTTGAACTATGTTATGGAGCATGCAAGTTCCCCGGAAGGTTATGTGCAAGCAAAAGTTTCTGCCGTGGCAGCTAGACTACTCAAAAGAGGCTGGGTTGAGTTTTCAGACCAAGAAAAAGCTGCCATCTTCTTTGAGATTGAGCAATGCGTACGAGGCATCCATGGACCTAATCGACAATTTGCTACCATCAATTTCTTAGAAGCCTTGGTTTCGGAGTTTTCCCCTGGGACTGCTTCTGCTATGTGCCTGCCTAAGGAATTCCATGAGCAATGCCAATGGTCACTTGAAGTGAAGTTTCTGAAGGACTTCTATTGCTGGGCACAAGCTGCTGTGTTCAATTCTGCAGACAGGATATTGAATGTAAATGCAAGTGTAGCGGAGGAGAAAGCATGCTCAGCAGCATTTCGCCTTATGTTCCAGATATTAAGCTGGAGTTTCAAGCACAATGTGGAGCATGCAAATTCAGAAGCTAAGATAAATTCTGGTTTGAGGAGTGATGCCATAAATCTGAAGAAATTTGAGCGTTCGCTGGTGAAGCCAGGGTCTGTGTGGAGTGATATTCTAATATCAAGTGGGCATGTTCAGTGGGTTTTGAACTTTTATACTGCTGCCCGCCAGAAGTTCTCATATGATACGCTATGGGTTGATTCTCCTATTGCTACCTCCTGCAGACAGCTCATAGTGCAGCTATGCTCGTTGACAGGCTCTGTGTTTCCTAATGATAACGCAGATGGACAGATTCAATACCTTGTGCGCATATTATCTGCTGTTGTACATTGGATTGAACCTCCTGATGTCATTGCTGCATCAATTCGAAGTGGAGCAAGTGAAAGTGAGTTTGTAGATGGATGCCATGCCCTTCTTTCAATGGCGTCTTTGACTACTTGTTCGCTTTTTGACAACCTCCTGAAGTCAACGAGGAACTATGGCACAATCAACCTACTTTCTGCTTTGACATCCGAAGCTGTCAAGTCTTTTCTGGATAACCAGAATGAAGAAGAAACCTGGGGCTCGGAGGCTCTTGATATATTGTTAGAAACATGGAATGTTATTCTGGGGGATGTTGATTCCGAGAAAAGTCCTATGTCAGTTGATGGAGCAATTGCTGCTTCAAGTTTGTTTAAGATCATCGTGGAGTCACATTTGAAGGCTGCTGCTGATTCTGCATTCGAGGATACTGATGATGCCGAATACTTTCATGTTTCTGTTTCAAAGCGTGATGAGCAGCTGGCCTTGTATGCTCAGATTGCACGTTCAGCTGCTGACACAACTATACCCTTTCTTGCACAATTGTTTTCAGAGCGATTTGCACGGCTGAGTCAGAGAAATGGTGAAAATGATCCTACTCAGACTTTAGAAGAGTTGTACTGGCTGTTGCTGATAACCAGTCATGTCCTAACAGATTCAGGCGAAGGAGAAACACTGCTTATACCAGAAGCATTGCAGGTTGGATTCCCCTATGTAGTTGAAGTAGCACAGCATCCTGTAGTTGCACTCTCATGGTCCATAATAAATTTTTCTCGACAGTGTCTAGATCCAGGAATCAGGGCAAGGTACTTCAGTCCGCGACTCATGGAGGCTGTGATTTGGTTCTTGGCCAGATGGGTCGCAACCTATTTAGTACCACTTGATGTGAGTAGGGGGCAAGTAAACAGAGCAGAAATTGACAGTGTGGATAAACACATGCTCCAACATTCTAGAAAAATGCTAAACAGTTTTGCTTGGGAGAATAACCAAGGAGAGCGTGTTCTTGATTTTGTTGTTCTTATTTCAATGGTAGCACTTACTACATATCAGGGAGAAATTGAGCTGCAGACACTTACATGCCAGAAGCTACTTGCTACAGTTGTTCGAGGGAAGCACACATGTACTTATGTTGTTCAGTTGGACTCGTGGCGTGATCTTACAAGAGCTTTTGCAAGTGGACGTTCTTTATTTTCATTAACTGGACGCTTACAGAGATCTCTAGCAGAAACACTTGCCTGTGCAGCTTCCTGCATCAAAGATCCTGAAGCATCTGTGCAGTATTTGAGGGACCTCATGGGACAGGTTGCTGGATGCCTAGTAGAGAATGCTAACAGGAGTGATCTCAAATCTGTGGCACAGCAAGCAGATGTTGTTTATATGTCTGCAGTCATATACATGATACTCAAGTTCGTCGTTGATTTTGTTGATGGTCAAGCTGTGTTTTTGGATGCTAAGGAAACATCAGTTTTGGTAATGCTCTCGCTTTCTTCAAGTTTGCGCAGTGAGTCACAAGCTGAAAAATATAAGGATCTACGTGCTTTGCTTCGTCTTCTGACTAATATATGCTCAAAGGATTTGGTTGGTTTCCTATCTGATAGTAGCATTGAAGGTTCACAAGATATTGCTGAGGTCATCTATGTTGGAGTTGATATTGTGACTCCCTTGATATCTTTGGACCTTCTGAAGTACCCTAAACTCAGTCGTGATTATTTTGCTCTTATCTCTCATTTGCTGGAAGTGTACCCGGAGAAGGTTGCTAACTTAAATAAGGATTGCGACATTGTCGACAGGTGCCTTACAGCAATAAATGCTCTCGCTTCTTACCATTTCAAAGAGAGACTTGGAGGTAGGGGAGGACTTAGCTCACAGCTTATGGAATCAGAAGGATCAAATGGCAAACTTCAGGAAAGCATATCAAGTCACTTTTTGAGGCTGCTTCTGCAATTGCTTCTGTTCGAAGATTTCAGAATGGAACTAGCAGGTTCTGCTGCAGATGCTTTGCTTCCTTTGATTTTATGTGAACAACCATTATATCAGAGGCTGCTCCAGGAGTTAGTTGAGAAACAACAGAATCCAACAGTGAAATCAAGGCTGGGAATGGCATTCCATAACCTCACAAGCTCCAACAATCTCTCCAACTCGCTCGACCGCCCAAACAGGCAGAGATTCAGGAAAAACCTCCGCACTTTCTTGGGCGATGTCTCGGGCTTCATGCAGATAAAATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPNARFQAAGAIGDAAIREWGILSDDNKKSLIVYCLNYVMEHASSPEGYVQAKVSAVAARLLKRGWVEFSDQEKAAIFFEIEQCVRGIHGPNRQFATINFLEALVSEFSPGTASAMCLPKEFHEQCQWSLEVKFLKDFYCWAQAAVFNSADRILNVNASVAEEKACSAAFRLMFQILSWSFKHNVEHANSEAKINSGLRSDAINLKKFERSLVKPGSVWSDILISSGHVQWVLNFYTAARQKFSYDTLWVDSPIATSCRQLIVQLCSLTGSVFPNDNADGQIQYLVRILSAVVHWIEPPDVIAASIRSGASESEFVDGCHALLSMASLTTCSLFDNLLKSTRNYGTINLLSALTSEAVKSFLDNQNEEETWGSEALDILLETWNVILGDVDSEKSPMSVDGAIAASSLFKIIVESHLKAAADSAFEDTDDAEYFHVSVSKRDEQLALYAQIARSAADTTIPFLAQLFSERFARLSQRNGENDPTQTLEELYWLLLITSHVLTDSGEGETLLIPEALQVGFPYVVEVAQHPVVALSWSIINFSRQCLDPGIRARYFSPRLMEAVIWFLARWVATYLVPLDVSRGQVNRAEIDSVDKHMLQHSRKMLNSFAWENNQGERVLDFVVLISMVALTTYQGEIELQTLTCQKLLATVVRGKHTCTYVVQLDSWRDLTRAFASGRSLFSLTGRLQRSLAETLACAASCIKDPEASVQYLRDLMGQVAGCLVENANRSDLKSVAQQADVVYMSAVIYMILKFVVDFVDGQAVFLDAKETSVLVMLSLSSSLRSESQAEKYKDLRALLRLLTNICSKDLVGFLSDSSIEGSQDIAEVIYVGVDIVTPLISLDLLKYPKLSRDYFALISHLLEVYPEKVANLNKDCDIVDRCLTAINALASYHFKERLGGRGGLSSQLMESEGSNGKLQESISSHFLRLLLQLLLFEDFRMELAGSAADALLPLILCEQPLYQRLLQELVEKQQNPTVKSRLGMAFHNLTSSNNLSNSLDRPNRQRFRKNLRTFLGDVSGFMQIK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..98#184..282#897..939#1561..1632#1711..1806#1920..2153#2225..2408#2558..2669#2758..2844#3014..3152#3940..4030#4133..4195#4357..4466#4620..4724#5293..5366#5690..5765#6097..6333#6730..6801#7393..7464#7551..7615#7695..7797#8080..8169#9184..9291#9374..9424#10494..10571#10652..10714#11501..11697#11800..11869#12197..12385#ATGCCAAATGCGAGATTCCAAGCTGCTGGAGCAATTGGTGATGCAGCAATAAGGGAGTGGGGAATCCTTTCAGATGACAACAAAAAAAGCCTAATAGTGTGAGTTTTTTGCGGGAATTTCATACTTGTTTAATATGAATCGTAGCATTTCAACGCCCTTGGTATAATTATTCTAACATTGTAGATATTGCTTGAACTATGTTATGGAGCATGCAAGTTCCCCGGAAGGTTATGTGCAAGCAAAAGTTTCTGCCGTGGCAGCTAGACTACTCAAAAGAGGCTGGTTAGTTTATAATTTCTGCTTTCTTTGCCCATGTATCTTTTGCCTGTCACTCTATTTCTCCTCATAGCTTCTATTTACGTAACATGCATATTTTTTATTGGTGTTTCTTCAAGTTAATTTTGGTCATAGAGGTATAAGAACCACCAGTGCGTGGTTGAATATTCATCTGCATTTTTTCATTCATCGAATTATAGGGGTAAGGTGTTATTTTGTGCATGTTTTGGTATGCACACTAATGTACACAATCTTTCCTATAAATGTCTTGATGCATTAGGTAGCTGATGAGTTATGTACTTAACTTACCCAGCACTAGCTCATACAGGACAGATATTTAGTATGGACTCATTCCTTTTGGGTGGCTAGTTGCACAGAATCATCAAGTGTAATTATTGCACAGATGAAGGTGGAGGAATCTTTCTCCAATCCAACATCCCTAGTTTATAGTGGCATATATTCAAAATTATGAATAGCTATTTCTTAACGGTACAACCGTTTGCTTTTAAATGAATTATCTGCTTCTTGGTGTGCTTCAAGGCAACCAGTTGGTCTAATATTTTGGCTTCTGAAGGTTTGGTATTCAGAAATAAGCTTTGATATGGAATACATATTTACAGGGTTGAGTTTTCAGACCAAGAAAAAGCTGCCATCTTCTTTGAGGTACAGACTGCTCTGAAAGTTAGACGACTCCAGACTGATAAGTGATGCTTTCCTTCAGTTATTTAGTCCTTAAAATCTCTATCGGCCTATTTGGCAGAGATCAACTCCTGGATTCTTGCGAAATATGGAGTTTGTAGACTAAAATAAAATGGTTCAAAATGTGAACAAGATAGCTCACCCAAACAATCTCAGTTTACCCCCAACTCCAGCTCCAAGAATTTTTGGACTAGATATACCCAGAGCTCTGCTAAACATGCCCTTTTAACAGAGCTATAGCTTTCACCCTCTTATATCAGCAATGCTGGACAATATTTTGTCCTATATGAAACAATAATATATCCAAGCTCTTATAATAGTAGCTTTTATAACTTTTAGTGGGTCAGCTAGATGGATGTGTCTGATTGTTTTTTCCCTTTTGTTATTTTGTGTAACATTTTCACCTTATGAGAAAGCATGGTGCCTTGAATATACCGCCACTAATCTTATGCTAGATAGAATATTTATTTGGTATTTCTACCTCATGTTTTTTTTAATCTTCCTTATCTGAGTTCAATTACAGTGCCAATCAATTTGTTTTTTGTGAAATACCTTGCTAAGTGTGCTGTTTGATATTCTTTTCAGATTGAGCAATGCGTACGAGGCATCCATGGACCTAATCGACAATTTGCTACCATCAATTTCTTAGAAGCCTTGGTATGCTAGTTCATGCAGTCTAACATCACCATTTCACTTCTCCAACTGATTGTGAACTAAACTTCATGTCTGAACTAGGTTTCGGAGTTTTCCCCTGGGACTGCTTCTGCTATGTGCCTGCCTAAGGAATTCCATGAGCAATGCCAATGGTCACTTGAAGTGAAGTTTCTGAAGGTGGTTAACTGGTTTCCCAAATAATTTGAAGTCCCATAAGAATCGCTCTTTCACATGATCATTGTAGTTTTGCTCTTCGATTGTCATCCTGATATGCCATTTCCTGTTTCAAGGACTTCTATTGCTGGGCACAAGCTGCTGTGTTCAATTCTGCAGACAGGATATTGAATGTAAATGCAAGTGTAGCGGAGGAGAAAGCATGCTCAGCAGCATTTCGCCTTATGTTCCAGATATTAAGCTGGAGTTTCAAGCACAATGTGGAGCATGCAAATTCAGAAGCTAAGATAAATTCTGGTTTGAGGAGTGATGCCATAAATCTGAAGAAATTTGAGCGTTCGCTGGTGAAGGTACAGTTATTTGAGCTATTAACATCTTTTACTGTGTTCATATGATAAATGGTTTACATTTTCTATTGTAGCCAGGGTCTGTGTGGAGTGATATTCTAATATCAAGTGGGCATGTTCAGTGGGTTTTGAACTTTTATACTGCTGCCCGCCAGAAGTTCTCATATGATACGCTATGGGTTGATTCTCCTATTGCTACCTCCTGCAGACAGCTCATAGTGCAGCTATGCTCGTTGACAGGCTCTGTGTTTCCTAATGGTATATTCTCATTTTGAGTAGGCATTGTTTGCTTAGCCATAATTTACATATTTAGTGGTCATGAAAAGCTGCGTAATACTATATCAACCAGCAAATATATTGCCAAATGCACATTTGATCTTACCTAGCTGATTCCCCTCTATTGTCAGATAACGCAGATGGACAGATTCAATACCTTGTGCGCATATTATCTGCTGTTGTACATTGGATTGAACCTCCTGATGTCATTGCTGCATCAATTCGAAGTGGAGCAAGTGAAAGGTCCTTCAGGAACCGTGATTACAATCTTTCTTGAATCTGAGAAACGTTGGGAAATACTAATGAATACTATGATTTACTCATTTTGCAGTGAGTTTGTAGATGGATGCCATGCCCTTCTTTCAATGGCGTCTTTGACTACTTGTTCGCTTTTTGACAACCTCCTGAAGTCAACGAGGTTAGCTGACTGCCTTTTGTAATTTCTACTAGTAAAAACACAACGACAAAAAATAATGACTACTCACTACCGTGAGTACCTCCTGAATTCCGTGATCATTTATTCTTGCAATACCAGCTTGGACTTGGCATGCTGTTTCCTTGTTGCTCTAACATGAGCGCGCTTGCAGGAACTATGGCACAATCAACCTACTTTCTGCTTTGACATCCGAAGCTGTCAAGTCTTTTCTGGATAACCAGAATGAAGAAGAAACCTGGGGCTCGGAGGCTCTTGATATATTGTTAGAAACATGGAATGTTATTCTGGGGGTACTGTATCTCAGCTTTGTATCAAGTTTAATCTACAAATGTGTTTTCCTTTCTACATAGCTCTTTTTAACCCAGTTCTTATTTATTACTCCAGTTTAAGATATATGTTGGACGTATTTGTTGGATTTTTTTCTCTAAAATTTAAATAGTAATTATCCCATAGTAGTTATTTTCACATTTCCCCACTCCAGTGCTTGTTAGTTGGGATTATTGTGCAAATGAAGTACCGCTGCTCATTGTGCTCTCTTTTTCTTGGATTAGACGGGAATTTCGACTCTGCACGGGAATATCATTTTACCCTAAATCTCCCGTGCACTAAATTTTAACTACCTTTTTTTTTATGAATTAGTGTCTTGACCTGAGCATCTGAGCTCTGATTTTCTGTCATGCGATGACTTAATATTGTCAGAACCAGTTGATTAACTGTTATATCCTTAACCATCACTTTCACATTGTTTTATGCATCCTTTATCTCAACAATTGCATTTCCTTCCTTTAAAAGAACATTATGTAGTGCCATGCACTATACAATTGCATGTTTTGGTTACATATATCATTATCATCAACAATGTGGGAACTCAGAACTCCCTTTCAAAAAGAAATGGAAGTATCATGATTATTGATGGCAATTTCCTGAGCAGTATTGAGTGATGAAGTGCTTTATTTTAGTTTTGCTTGCACATAAAATGGTAGATAGAAAAACCAATTAATTATCAGTTGATTTGGATTGCATTGTGTTACCATTAATTACTGTAAAAAAATATTCATTTATGGTCCTTTTACACAGGATGTTGATTCCGAGAAAAGTCCTATGTCAGTTGATGGAGCAATTGCTGCTTCAAGTTTGTTTAAGATCATCGTGGAGTCACATTTGAAGGGTACAATCTGTTGTATTTCCATTTAGACTTACTCATGAAGATAGTTGTATTTGTTAACATCCGCACATAAAGTACATACTGACTAAGCTTTTCTTGAAATAGCTGCTGCTGATTCTGCATTCGAGGATACTGATGATGCCGAATACTTTCATGTTTCTGTTTCAAGTATGTTTAAATTCCTTGGAGACATTTAGGAACAAGTCTGGTACTCTGGTTGGATGAGGGGATTTGGATCCTAATGAGCAATCCCCTTCATCCAAACAACCCTCACTATTCTCTTTGGATGGGTTCCTTAATTGGACTAAAAGAATACTTTCTTGTTCCAGAGCGTGATGAGCAGCTGGCCTTGTATGCTCAGATTGCACGTTCAGCTGCTGACACAACTATACCCTTTCTTGCACAATTGTTTTCAGAGCGATTTGCACGGCTGAGTCAGGTGTTGCTTTCATCTTCATCTTGTGATTTACTTCAGTTTTGAACTTATTTACAGCTTCCTGTTACACTATCTTTTCTACCATGTTATGAGTTATATTATTGTAGGATTTTTTTTTAATATTTGTATGTAATCTTTAATATCTCTTCTTTGCAGAGAAATGGTGAAAATGATCCTACTCAGACTTTAGAAGAGTTGTACTG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