Difference between revisions of "BGIOSGA033852"
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Revision as of 17:40, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA033852 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA033852, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_36388 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA033852-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA033852-PA |
| Length |
13638 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:16576488..16590125 |
| Sequence Coding Region |
16590015..16590125,16589754..16589826,16588888..16589027,16587689..16587970,16587436..16587558 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:16576488..16590125 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:16576488..16590125 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGGCGGCGGCGGGGAGGAATGCTCTCCTGGACGAGCTGCGCGCGCTCATGGCGGCCCACTCCCCGCCGCTCCACGCGCTCGTCGTCCCATCCGACGACGCCCACCAGAGCGAGTATGTGGCGGAGCGGGACAAGCGGCTGCAGTTCATCTCCGGGTTCACCGGGATCGCCCGCAGCGCTGGTTTGGCTCTTATCACTATGAAGGAGGCGCTACTGTGGACGGATGGGCGTTACTTTTTGCAGGCAGAGAAGCAGCTCAGTGATCACTGGGAATTGATGTGCATGGGAGAAGATCCACCAGTTGAAGTTTGGATTGCTGATAACCTATCAGATGAAGCCGTCATTGGAATTAATCCATGGTGCATCTCTGTTGACACTGCCCAAAGATATGAGCATGCATTTTCAAAGAAGCACCAGACACTGTTTCAACTTTCTTCTGACTTGGTAGATGAAGTATGGAAGGATCGTCCTCTGGCTAATACTCAGCCTGTAGTGCACCCTGTCGAGTTTGCTGGGTGTAGTGTTACTGGAAAACTTAAGGAGTTAAGAAAAAAATTACTACATGAAAAGGCTAGGGGCATTATAATTGCTGCCCTTGATGAGGTTGCTTGGTTGTACAATATTAGAGGAAATGATGTGCACTACAGCCCAGTGGTCCATTCGTATTCTATTGTAACCCTGCACAGTGCTTTCTTTTATGTGGATAACAGAAAAGTATCTGTTGAGGTCCAGAGCTACATGTCTGAGAATGGTATTGATATCAGAGACTATAATATGGTTCAATCAGATGTAAGCTTGCTTGCATCTGGACAGCTAAAAGGCTCTGCAGTTAATGGTAGCTCACATGAGGGAAATGGTATGAATGATAATTCAAAAATTTTGATTGATAATTCGTGCTGCCTTGCACTCTACTCAAAACTGGATGAAGATCAAGTTCTTATACTGCAATCACCTGTTGCTCTTTCAAAGGCTGTGAAGAATCCCGTAGAGCTGGATGGTTTGAGGAAGGCACATATTCGAGATGGTGTGGCTGTTGTGCAATACCTGGCTTGGCTTGACAATCAGATGCAAGAGAACTATGGAGCGTCTGGTTACTTTAGTGGGGCCAAGGGATCACAGAAAAAGGAGCATGTGGAAGTAAAACTTACTGAGGTTTCTGTGAGTGATAAACTTGAAGGTTTCCGTGCCGCTAAAGAGTATCTTGATGGTACTACAGACATCACAAGAACTGTACATTTTGGCAAACCATCTGAGCATGAAAAGTCATGCTACACGGCTGTGTTGAAAGGCCACATTGCACTAGACACTGCTGTATTTCCTAATGGAACCACAGGGCATGCTCTTGATATTCTCGCACGGACACCACTTTGGAAAAGTGGTCTTGATTATCGGCACGGCACAGGCCATGGGGTTGGATCTTATTTGACTGTTCATGAAGGTCCTCATCAAATTAGCTTCAGACCTTCTGCTAGAAATGTACCACTACAAGCATCGATGACTGTAACAGATGAACCTGGTTACTATGAAGATGGAAGCTTTGGTATAAGGTTGGAGAATGTTCTGATAGTTCAAGATGCCAATACTAAATTTAATTTTGGAGATAAGGGTTATTTGGCATTTGAACATATAACATGGGCTCCGTACCAGACAAAGCTGATTGACGCCACTTTGCTGGCCCCTGCCGAGATTGAATGGGTAAACACGTATCACTCAGATTGCCGAAGGATTTTGCAGCCTTACCTGAATGAGCAGGAGAAGGAATGGCTGAGGAAAGCTACTGAGCCTATTACTGCGTCTCGCTGCGGAGGTCTCGCAGCGCCCACGAGCTCCCTACCATGGAGAACAGATCGGGAAGAGAAGAGGGAGGGAGAGAAGGGGAGTGATGGCATTTTATATTTGGAGCTTGGGGCTGGTGAGGAGGACGGGCTTGATGAGGAAGCAGAGGTTGTGGAAGATGATGAAGAAGAAGCGGTGCTTGCTGGCGAAGACGCCGTGAATGGCGGCGCGGGCTGCGTGGATCCAACGGCGGATCTTGGCCACCAGGGCTTTCCACTCAAGGCACACTCCTCGCCGACGACCCGGATGATAATCAGCACGAGCTCCCGATGGTTGCGGGCAATGGTGGCGCGAGGCAATAGATATGGAACCGTTAAGTTCCCACAGAAGGTGGACGGAATGGCACATGGGTCAACGAAAGTTAGGCTCATGGCATACAAGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSAAAGRNALLDELRALMAAHSPPLHALVVPSDDAHQSEYVAERDKRLQFISGFTGIARSAGLALITMKEALLWTDGRYFLQAEKQLSDHWELMCMGEDPPVEVWIADNLSDEAVIGINPWCISVDTAQRYEHAFSKKHQTLFQLSSDLVDEVWKDRPLANTQPVVHPVEFAGCSVTGKLKELRKKLLHEKARGIIIAALDEVAWLYNIRGNDVHYSPVVHSYSIVTLHSAFFYVDNRKVSVEVQSYMSENGIDIRDYNMVQSDVSLLASGQLKGSAVNGSSHEGNGMNDNSKILIDNSCCLALYSKLDEDQVLILQSPVALSKAVKNPVELDGLRKAHIRDGVAVVQYLAWLDNQMQENYGASGYFSGAKGSQKKEHVEVKLTEVSVSDKLEGFRAAKEYLDGTTDITRTVHFGKPSEHEKSCYTAVLKGHIALDTAVFPNGTTGHALDILARTPLWKSGLDYRHGTGHGVGSYLTVHEGPHQISFRPSARNVPLQASMTVTDEPGYYEDGSFGIRLENVLIVQDANTKFNFGDKGYLAFEHITWAPYQTKLIDATLLAPAEIEWVNTYHSDCRRILQPYLNEQEKEWLRKATEPITASRCGGLAAPTSSLPWRTDREEKREGEKGSDGILYLELGAGEEDGLDEEAEVVEDDEEEAVLAGEDAVNGGAGCVDPTADLGHQGFPLKAHSSPTTRMIISTSSRWLRAMVARGNRYGTVKFPQKVDGMAHGSTKVRLMAYK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..111#300..372#1099..1238#2156..2437#2568..2690#2803..3054#4142..4228#4393..4460#6309..6372#7527..7607#8450..8504#9011..9115#9212..9283#9432..9556#10651..10806#11373..11470#11902..12148#13555..13638#ATGTCGGCGGCGGCGGGGAGGAATGCTCTCCTGGACGAGCTGCGCGCGCTCATGGCGGCCCACTCCCCGCCGCTCCACGCGCTCGTCGTCCCATCCGACGACGCCCACCAGGTCTGCTCTTGGCGCCGCCTCGTCCGCGGAATGGGGGGAGGCGATTGATCGGTCGGGTCGGGATTAGATCCGATCCGACCGAGCTCCATTTTTTTTTGTTGGATTTTGCGTTTTCAGCTATCTCTCCTCCTGTTGGTTTTGTTGGTTCGTGCTGGTGATTGAGGATTGGCGCGACTTTGTGGGTGCAGAGCGAGTATGTGGCGGAGCGGGACAAGCGGCTGCAGTTCATCTCCGGGTTCACCGGGATCGCCCGCAGCGCTGGTATGTTGCTTCCTCAACCTCAATCCATCCGTCCCTTATGACTTGTGAGCTCATTCTCTGCTAGTTCACCAGCCGATGAGTTGGGCTGCGATGAGTTCAGGATAACTTGCCTTGGATCTGTACTGGGTTTGCACGATTTGGTTAGGTTACTGTTTCGGCAACCGCATTACATTCTGTAATAGTGTGATAGAAGTGGCAGAAGTGGATTGTTGAAATGGTTAAGTATTTAGATCTTCTGCGTGGCATGGCATGACCGCAACGATTGGCTATTTTTCTCATAGGTTTGCTTAACACTTAGCGTGGTTTGTTACTTTTGTTGTGACGTGCTAGGCAGCCCAGAAAAGAAAATGCAAACATGGGCCACACATCAAGCGTCTTTGTAATGTCAAGTGCCACTCCATCCAAACTTGTGCAATCAATGGGTGCTTTAATCAAGTATAATCATGTGATGGTAAATTTTTTATAGTTTTGTTCACTACTTCACTGCCTATAGACATAAGGCACAAAAGTTTCGTGTGGCTCTTTATGCCATTGCCCATTGGGGAGACAACTTTTACAATTTGGGGTGGTACCTCAAAGTAGTTTTGTACTGGGAAGAACTTAACTCATTTCTGTTTTTTACTAGGATGGATGTAACATAATGAACTACTTGTCGATTTCTTTTGTTTTCTGGTTATCATAGATGCAGTACTTTCTCAGTTCATGTGTATATTGGGTTCTATACAGGTTTGGCTCTTATCACTATGAAGGAGGCGCTACTGTGGACGGATGGGCGTTACTTTTTGCAGGCAGAGAAGCAGCTCAGTGATCACTGGGAATTGATGTGCATGGGAGAAGATCCACCAGTTGAAGTTTGGATTGCTGATGTAAGTCTTGAACATCTGTTCTTGAGCATGTTCACGAAATTAATTAATTTTCTCAGTCTAACATAAAAAATGTAGGTTCACACAACTTGTACGTGGAAGTTAATATAATTTAGTTATATCCTTCCTATCTCTTTTTTTTTTCAACAGCCAGGTCAAAGTTTTCATCCTTAGTTTTTGAAATCTGCCACAGTTTTTGTGTTGTAAAATCCCAAAAATGGTTTTATTCTTGTTAACTTTAGCAAGTTTCTCTCCTAAATGCGGTCTTTATAGCTTTGTTTTTAGATAACCATATTCAGTTGTGTTGGTAATACCTCAAGCCTACTATCTTTCTACCTGGCTGCTCTGGTAGATTCAAGTAATCACATGATAGCCGGTTTGATACATGGGACTTCCTTTCAAAATTTGTCAGAAATATCAGAGTTTTGGACACATTAAATTATTGTGATCTTAGCAAATGTGAACAGAATTGAAAGACAAAATTGGTGAGATGTTTGTTTTGTTATATGGAGAAAATGTTTATTTTATTATATGGAGAAAACCTATGCACAATTATGCCAGTTATGGAATGATAAATACATTAATAATATATCTTTCTTCCTGGTTGCCAGAGTAGATTCAAGTAACCAGTGATAGTTGGTTTGGTATACGGGAATTCTGTCCAAAACTGCCAGAATTATCAGAATTTTGGACAATAATTTATTTTGATCTTATGAAATGCAATCAGAAATTTAAAGACCTGCACGAGGTTTCTGTTTTGCTATGGAAAAAACTATGAACAATCATACCAATTATTCTATGACTAGAGAGAATGAGTTTAGTTATTTGTTTTTGCATTGTAACACTACTCATGATGACCATGTTATTTTGTTCTGAAATAGTATTGTTTCTGACTAATTTGTTTGTTATTGTGCAATCAGAACCTATCAGATGAAGCCGTCATTGGAATTAATCCATGGTGCATCTCTGTTGACACTGCCCAAAGATATGAGCATGCATTTTCAAAGAAGCACCAGACACTGTTTCAACTTTCTTCTGACTTGGTAGATGAAGTATGGAAGGATCGTCCTCTGGCTAATACTCAGCCTGTAGTGCACCCTGTCGAGTTTGCTGGGTGTAGTGTTACTGGAAAACTTAAGGAGTTAAGAAAAAAATTACTACATGAAAAGGCTAGGGGCATTATAATTGCTGCCCTTGATGAGGTGCTATTAAACTTATTTGTTTCTTGGTTTCTTATTCAGTACAATATATCCAATTGTGTATGTTTTGATTTCTTGAAATTTTGTTAACTTTGCCAGTTTTAATTATTCTCCTTTTGTTATTCTTATTTAGGTTGCTTGGTTGTACAATATTAGAGGAAATGATGTGCACTACAGCCCAGTGGTCCATTCGTATTCTATTGTAACCCTGCACAGTGCTTTCTTTTATGTGGATAACAGAAAAGTATCTGTTGAGGTCAGTTAATCCACTGAACATATTTTCTTCAATTATACCATTATGTCTTTCATAGAATCGTAGTCATGATTTTGAAGGGCATGTAGTGAACTGTGACTCTTATTTAGTCAAGGTCCAGAGCTACATGTCTGAGAATGGTATTGATATCAGAGACTATAATATGGTTCAATCAGATGTAAGCTTGCTTGCATCTGGACAGCTAAAAGGCTCTGCAGTTAATGGTAGCTCACATGAGGGAAATGGTATGAATGATAATTCAAAAATTTTGATTGATAATTCGTGCTGCCTTGCACTCTACTCAAAACTGGATGAAGATCAAGTTCTTATACTGCAATCACCTGTTGCTCTTTCAAAGGCTGTGAAGGTAAATTTTGCTTCCGTTGTCCCTCTTTTATGCTAGTATTTAACAGATCATGTCGGCAGCTTTTCCAATATACTATTCGTGGATGAAAACTGATGTATTTACTTGATTATGGGAAAAAAAATATTACACGTTATAAACCTAACAAATAGCTTAGAATAAGTTGTCTAAGTAATAAAGTAGAAGATTTTTTTTTGAGAATTGTATTTTTAGAAGCATGGAGCAAATAATCTGTGACAATAATCCGATTAATAAGCAGAAAAGAACGGGATCTAAAACCATGTGTTTTAATTTATACTTACTCTAGTATTGTTAAGAGGGTATATGCGTTTCAAGCATCTTGGAACTTGCTAGTAAAACAACAACCTGATAATTGAAGTTTGTAGCCTGAGTTGTATATATGAGCTCAATCAATTACCAAGAGCTTTTGCCTCCTGGTTAGGTTGAAATTAGGGGAGTTGGAGATAGAAATGAAGGACAAGAATCATTGACAATTTAACGTCAAGCCACATAGTTTTGTGCTATCTAGCTCCACCAGCCTTAGCTAGAATTTGCTCGCAAATTAGTTTTGTGAGAGACTGTCACCCCTCAGCTTGGCTACCGTAGTAGGACCTATGCTGTGCTGTTCTGGGAATGACAAAATACTCTTGGTCAGCCAAAATTTGTATTACAAATCAAGATATAACCATATATATGTTGGGGTTATGGTGGGGTACTTTTTTGGGTTTTGTAGGGCATAGGAGGGCATAGGAGGAGGTAATGGTGGGGTGGCGGGAGCGGACGGACAACTCCCCTTTTAGAATAGTAGAGAGAAGAATGGGAATATAACACTTTACACTAGAAGTGTATTCTGTTCAAGTATTCCTTTTGTTTCCTGCTATTATTTTTTGTTCTTTTTATCTATGGAAAATCAGCTATATGCCATTACAAGTTTTTATCATTTATTAATCTGTATGCCTGTATTTTTTATTTCTAATGATGATGTAAAATCCGATAGAGCTGGATGGTTTGAAAATCAGCTATATGCCATCGAAAGTTTTATCATTATTAATCTATGCCTGTATTTTAATTTCTTGTAATGATGGTATAGAATCCCGTAGAGCTGGATGGTTTGAGGAAGGCACATATTCGAGATGGTGTGGCTGTTGTGCAATACCTGGCTTGGCTTGACAATCAGGTTGGTGTAAATGTATTTCTTGTGTAGCCTGTTAGCCTTGGACTTTTCTTATGCTCATATTTGAGGATATGACAATTTGATTTGTACCTGCAATGTTCTTTAATGCTGCTGCAATCTTTCTAGTTATTTTCTACTTGCTCTCATGCTCGTTGTCCTATTGACAGATGCAAGAGAACTATGGAGCGTCTGGTTACTTTAGTGGGGCCAAGGGATCACAGAAAAAGGAGCATGTGTGAGTAGTAGTGTTGTATTTATGTTCTTTCGGTATCATATGGAACATATGATCTTTTGTTTACCTATAAAAAATTTGGAATAATGCATTATCAAAAGATGGCCAACATCTCTTTTTAGATTAGGTTTGGGCTGTCAGAACTGTCTAAATCATTTATAGGATAAACAGCGGTTTCATGCCCTCACGACATCGTTGTCTTGAGATTTTATCTTTAAGAGGCTGGGATAAAATTTTCTTGAACTTCATGTGCAATACTTGCAACTTGACTTGGTTGCGAGCTTGAGACAGTTCTTTCAATAATCATCCATTTGAGTTTTTCTTTGGAG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