Difference between revisions of "BGIOSGA034539"
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Revision as of 17:44, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA034539 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA034539, complete gene. |
| LocusTag |
OS12G0134200 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA034539-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA034539-PA |
| Length |
18393 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:1431782..1450174 |
| Sequence Coding Region |
1449992..1450174,1449418..1449585),complement(1449235..1449324,1448929..1449065),complement(1448760..1448850 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:1431782..1450174 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:1431782..1450174 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGGAGACATCGTCGGCGGCGGCGGCGGCGCAGACCGACGCGGAGAGGGAGGAGGCGCTGGACCGGATGCTGACGCGGCTGGCCCTCGCCGAAGACGCGCGGCTCGCGCCGCTGCTCGCCCGCGTCCTCCCCTACGCCATCACCTCGCTCGCCTCCGCCACCGCATCCGTCCGCAAGCTCGTTATGGAAATTCTCAGCCACATTAACAAACGGGTGAAGCACAGGCCTGAGATTTCACTGCCCATGCTGGATTTATGGAGGATTTATACTGAATCTACTTCCTCCACAATAGTCCGGAATTTTTGCATTGTTTATATTGAGATGGCATTTGAACGTCTGCTAAGTGAGGACAAGGGAAGCATAGCACCTGATCTTTTAATCAACATATCAAATGTTACAGAGCAGCATCAGGGAATCATCTTGAGACTTGTGGTGAAGGCTATTGGTGAATGTAACACACATAAGGTGGGTGACAATGTTGCTTCAAAATATCAATCCATAAGTGGATCTAATGATGGTCTAGTCTTCGCTGACTTCTGTTTTCACACAGTACTGTATCAAACACCACCTCAAGGTGTTGGATGCCCGGCAGGACTTTCGGTTGCTCAATCAGATCGTGTTACTGGAAAGCAGCCACTAAAAGGTGACACACTTACATCAAGAAAGCTAGGAATCTTGAACGTCATTGAAGCTATGCAGTTGGCACCAGAGATTGTTTACCCTCTTTATTTAGCTGCTGCTTCGGATAGTCAAGAGTCAGTTACTAAGAGAGGAGAGGAGTTATTAAAGCGCAAAGCTTCAGCTGTGAACCTAGAAGATTCCAACCTTATGAAGAAACTGTTCACACTATTCAATGGTACTGCAAGTCCAGAAAATATAGCTGCAGAGCTGAAAGTCGCCCCAGCACATAGTTCACTGCGAGTCCGCCTTATGGGTGTTTTCTGCCGATCGATTGCTGCAGCAAACGCATTCCCGTACACACTTCAGTGCATCTTTGGCTGCATCTATGGAAACGGGACTACTTCAAGGCTGAAGCAGTTAGGGATGGAGTTCACTGTCTGGGTTTTCAAACATGCAGCAAATGACCAGCTAAAGTTAATTGGTCCAGTCATTCTCAGTGGAATATTACGTTCACTTGATGGTTCTTCCACTACTGAAGCAGATTCTTCCAGTAGGGATATTAAAATATTTGCCTACCAGGCAATTGGTTTGCTTGCCACTCGCATGCCTAATTTATTCAGCAACAAAACTGACATGGCTATACGACTCTTTACTGCTTTAAGATTAGAGGAGCAATCTCTTCGTTTGACAATTCAGGAGGCAGCTACTGCCCTTGCTACAGCATACAAGTTGATTAATGACTTGATGCGGAACAAACTTACTAGTTTTGTTGATGAAGCACATGAATGGATTGTGACGCCCCATGGTCCAAACATGGGTGCTTCGGTTGTAATATTGAAGGATCTTGAGGCACTTCTCTTGGAAAATTCTCAAATGGAGCAAAGTGAGGTCCGATTTTCTGCTGTAAGATGGGCAACAACACTATACGATATGAAGCACTGCCCAAGCCGATACATTTGCATGCTTGGTGCTTCAGATGTAAAACTGGACATAAGGGAAATGGCTTTAACTGGTCTGAATCTGTTAAATGATGAAAGGGAGTCATTTGCAATAGCAACTGATTCCAACTATCCTGATATTGCAGACATGTTGGTGTCATCGCGCTATGTGAACCGTTTACTTTGGCTAAGAACTTTACTGGGCCATGTTGATGCTGATGCTCGTGAAGCAACTTCACGTCTGCTTGGTATTACTTCTTCAGCCCTTTCAAGCACTGCTGCACTGGATCTTCTCTCTGAGCTCACTTCAACATTTGATCAAAATCGCCCATCAAGATTCGAAAATTACCATGGATTGTTATGTGCAATTGGGTATATAACTGCTGGTTGTTTAAAAGAATCTTATATAACTGAAGAAATAGTGCAGAAATCAATTGATGTTCTTGTAAAAGTTGTCGAGTCTGAGGGTTCAGCATTGGCATCCACTGCGATGGAAGCTCTTGGTCATATTGGTCTCCATTGTTTATTGCCTTCTATTAATCGAAATTCCTCTCAAGCTGCACTTTTAACAATCCTGAATGAGAAGCTGGCTAAGCTGCTTTCAGAAAATGATACTAAAGCTATACAAAAGATTTTGATATCGCTGGGACACCTATCTTGGAACGAGTTGTCATTTGCACACCTGAATAATGCATTGGACTTAATTTTTAGTCTTTCACGCTCTAAGTTGGTGTCATCGCGCTATGTGAACCGTTTACTTTGGCTAAGAACTTTACTGGGCCATGTTGATGCTGATGCTCGTGAAGCAACTTCACGTCTGCTTGGTATTACTTCTTCAGCCCTTTCAAGCACTGCTGCACTGGATCTTCTCTCTGAGCTCACTTCAACATTTGATCAAAATCGCCCATCAAGATTCGAAAATTACCATGGATTGTTATGTGCAATTGGGTATATAACTGCTGGTTGTTTAAAGGAATCTTATATAACTGAAGAAATAGTGCAGAAATCAATTGATGTTCTTGTAAAAGTTGTCGAGTCTGAGGGTTCAGCATTGGCATCCACTCTGATGGAAGCTCTTGGTCATATTGGTCTCCATTGTTTATTGCCTTCTATTAATCGAAATTCCTCTCAAGCTGCACTTTTAACAATCCTGAATGAGAAGCTGGCTAAGCTGCTTTCAGAAAATGATACTAAAGCTATACAAAAGATTTTGATATCGCTGGGACACCTATCTTGGAACGAGTTGTCATTTGCACACCTGAATAATGCATTGGACTTAATTTTTAGTCTTTCACGCTCTAAGGTGGAAGAAGTTCTTTTTGCAGCCGGGGAGGCCCTATCTTTTATATGGGGGGAAGTTCCTGTGACCACAGATGTAATACTAGAAACGAACTTTGTCTCCCTTTCCCAGGCCACAAACTATCTTACTGGTGATGCACCCGTACTTGTCTCGAGTAACTCTAATAAAGGAAGTGATTGTGAAGAAGCACACGCAATGGCTCGAGAAGAAATTATAAAACGGTTATTTGATACATTAATTTATAGCAGTAGAAAAGAGGAAAGGTGCGCAGGTACTGTCTGGTTGGTCTCACTTACAATGTACTGTGGTCAGCATCCAAAGATCCTGGAACTACTTCCACAAATTCAGGAAGCCCTTACCCACCTTCTTGGTGATCAGAATGATCTTACACAAGATCTGGCATCCCAAGGCATGAGTATTGTATATGAGCTTGGTGATGCATCTATGAAGGAGCAGCTGGTTCATGCTCTTGTGAATACACTGTCTGGCGCATCAAAAAAGAAAAGGGCCATCAAGCTGATGGAGGATTCAGAGGTTTTTCAAGAAGGAACTATTGGCAATAATCCTACTGGAGGAAAGCTTAGCACATACAAGGAACTTTGTAGCCTTGCCAACGAGATGGGCCAACCTGACTTAATATACAAGTTTATGGATCTAGCTAACTATCAGGCTGCTATCAATTCCAAGAGGGGTGCTGCTTTTGGGTTTTCCAAGATAGCCAAGCAAGCTGGTGAGGCACTTCAGCCTCATCTGCATACCTTAATTCCCAGGCTTGTCCGTTACCAATATGATCCTGATAAGAACATCCAGGATTCTATGGCACACATATGGAAATTAATTGTTGCAGATCCAAAAAAAACAATAGATGAACATTATGATCTAATAGTAGAAGATTTATTGGTTCAATCTGGATCGAGGCTTTGGCGTTCACGTGAAGCTTCATGTCTTGCACTTGCAGACATTATTCAAGGTCGAAGATATGGTCAGGTTTCTAAGCATTTGAGAAAAATATGGATTACCACCTTCCGAGCAATGGATGATATTAAGGAAACTGTGCGAAATGCTGGTGACAGTTTGTGCCGAGCTGTAAGCTTGTTGACAGTTAGGCTCTGTGATGTGTCACTTACTACTTCATCTGATGCAAATGAAACAATGAACATTGTACTGCCATACTTGCTTTCTGAAGGCATACTCAGTAAAGTTTCACGTGTTCAAAAGGCATCTATAAGTTTGGTTATGAAGCTTGCTAAGGGGGCTGGCCCTGCACTTAAGCCACATCTGTCAGAACTTGTCAGCTGTATGCTCGAATGCTTATCAAGTCTGGAGGATCAAAGATTGAACTATGTTGAGATGCATGCAGGAAATGCTGGCATCCAAACTGAAAAGCTTGAGAGCTTGCGTATAGCTGTGGCTAAAGATTCTCCGATGTGGGAAACCCTTGATATCTGTTTAAAAGTTGTTGACAAAGAATCACTGGATCTTTTAGTTCCTCGTCTGGCTCAAATGGTTAAATCTGCTGTTGGTCTTAATACAAGGGTTGGTGTTGCTAGCTTCATCACCTTGTTAGTACAGAAGGTCATGGTTGAAATCAAGTCATATGCGGCAGCATTGCTGAGGTTACTGTATAGTGCTGTTCTGGAGGAAAAGAGTTCTGCAGCTAAAAGGGCCTTTGCATCATCTTGTGCTGCAGTCTTAAAATATGCCAGCCCTTCTCAGGCTCAGAAACTTATTGAAGATACCACTTCTCTGCATTTAGGTGAAAAAAATGCTCAGTTGTCTGCTGCAATTCTTATTAAATCTTATTTAAGCAATGCAGCAGATATTCTTAGTGGATACAATGCAGTTGTTCTCCCAGTAATTTTTGCTTCAAGATTTGATGATGACAAAGACATCGGTGCATTGTATGGAGAACTTTGGGAGGATATTCCTAGTAGCGAAAGAGTAACCCTACAGTTATACTTACCAGAAATTATCTCTCTTTTGTGTGATTCCATGTCCTCGTCGTCATGGGCTGGGAAGAGAAAGTCAGCCAAGGCTATAAAAAAACTATGTGATGCTCTAGGAGAATCCCTGTCTGTGCACCACAATAATATTCTTGAATCACTTTTGAAAGAACTACCTGGTCGATT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| Protein Sequence |
<aaseq>MAETSSAAAAAQTDAEREEALDRMLTRLALAEDARLAPLLARVLPYAITSLASATASVRKLVMEILSHINKRVKHRPEISLPMLDLWRIYTESTSSTIVRNFCIVYIEMAFERLLSEDKGSIAPDLLINISNVTEQHQGIILRLVVKAIGECNTHKVGDNVASKYQSISGSNDGLVFADFCFHTVLYQTPPQGVGCPAGLSVAQSDRVTGKQPLKGDTLTSRKLGILNVIEAMQLAPEIVYPLYLAAASDSQESVTKRGEELLKRKASAVNLEDSNLMKKLFTLFNGTASPENIAAELKVAPAHSSLRVRLMGVFCRSIAAANAFPYTLQCIFGCIYGNGTTSRLKQLGMEFTVWVFKHAANDQLKLIGPVILSGILRSLDGSSTTEADSSSRDIKIFAYQAIGLLATRMPNLFSNKTDMAIRLFTALRLEEQSLRLTIQEAATALATAYKLINDLMRNKLTSFVDEAHEWIVTPHGPNMGASVVILKDLEALLLENSQMEQSEVRFSAVRWATTLYDMKHCPSRYICMLGASDVKLDIREMALTGLNLLNDERESFAIATDSNYPDIADMLVSSRYVNRLLWLRTLLGHVDADAREATSRLLGITSSALSSTAALDLLSELTSTFDQNRPSRFENYHGLLCAIGYITAGCLKESYITEEIVQKSIDVLVKVVESEGSALASTAMEALGHIGLHCLLPSINRNSSQAALLTILNEKLAKLLSENDTKAIQKILISLGHLSWNELSFAHLNNALDLIFSLSRSKLVSSRYVNRLLWLRTLLGHVDADAREATSRLLGITSSALSSTAALDLLSELTSTFDQNRPSRFENYHGLLCAIGYITAGCLKESYITEEIVQKSIDVLVKVVESEGSALASTLMEALGHIGLHCLLPSINRNSSQAALLTILNEKLAKLLSENDTKAIQKILISLGHLSWNELSFAHLNNALDLIFSLSRSKVEEVLFAAGEALSFIWGEVPVTTDVILETNFVSLSQATNYLTGDAPVLVSSNSNKGSDCEEAHAMAREEIIKRLFDTLIYSSRKEERCAGTVWLVSLTMYCGQHPKILELLPQIQEALTHLLGDQNDLTQDLASQGMSIVYELGDASMKEQLVHALVNTLSGASKKKRAIKLMEDSEVFQEGTIGNNPTGGKLSTYKELCSLANEMGQPDLIYKFMDLANYQAAINSKRGAAFGFSKIAKQAGEALQPHLHTLIPRLVRYQYDPDKNIQDSMAHIWKLIVADPKKTIDEHYDLIVEDLLVQSGSRLWRSREASCLALADIIQGRRYGQVSKHLRKIWITTFRAMDDIKETVRNAGDSLCRAVSLLTVRLCDVSLTTSSDANETMNIVLPYLLSEGILSKVSRVQKASISLVMKLAKGAGPALKPHLSELVSCMLECLSSLEDQRLNYVEMHAGNAGIQTEKLESLRIAVAKDSPMWETLDICLKVVDKESLDLLVPRLAQMVKSAVGLNTRVGVASFITLLVQKVMVEIKSYAAALLRLLYSAVLEEKSSAAKRAFASSCAAVLKYASPSQAQKLIEDTTSLHLGEKNAQLSAAILIKSYLSNAADILSGYNAVVLPVIFASRFDDDKDIGALYGELWEDIPSSERVTLQLYLPEIISLLCDSMSSSSWAGKRKSAKAIKKLCDALGESLSVHHNNILESLLKELPGRFWEGKDAILDALAALCSSCHTAMSAEDSGMPSVILNAVCAACSRKSKLYREAAFSCLQQVITAFKDPGFFNIVFPMLYEVSNRSVICKTRNSSSLTASSSAEQDETEGVSVSLDKVLNCVASLITVAFLQDIINQRKNILEIILNSLSPEESWQIKLSSFLCIKELCYKFQNPDGNNTWPEETTYLVEELFHSTAPKVVDVIRLVKIAQVHTAASECLLELSKLYRDFPLVDRKGPKFSGELAELCESEKSEQAKAFLKQCMDILKDFEDATGLAMEMD</aaseq> |
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