Difference between revisions of "BGIOSGA035059"
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Revision as of 18:19, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA035059 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA035059, complete gene. |
| LocusTag |
OS11G0240900 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA035059-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA035059-PA |
| Length |
16069 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:6538671..6554739 |
| Sequence Coding Region |
6538671..6538904,6541354..6541458,6543323..6543409,6543971..6544024,6544121..6544266 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:6538671..6554739 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:6538671..6554739 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCTCCCAAGAAGGACGCCGGCCTCTCGCCGCCGGTGGCGGCGCCGCCGCCGCTGTCGCTCGCCGGCGTGCCCGTGCTGACGGGGAGCCTACGCCCCGCGGAGTGCGCCGACCTGCTCGGCCTGGTCGCCGGCGTGAAGCGCCCGCTCGAGGACGTCGTGGCGGACTTCCTCGCCCGCATCCAGCCCGAGCGCCGCCTCCGCTTCGGCGCCGCCATAAACTTCGTCCTCAAGGACAAGATGATGCTTCGACCAGCTGAGCGTTTAGTTGCATTCACAATTCTTCATCAAGGTTATTCCTCACAGTTGGAAAATCCCTTTGTTCCTCTAATAATACATGCTGCTTGTGATGAAACCTCTGATAAACCAGAACAGTTGTTTCTCCAACTTCTGTTAAATTCAACTAATGGGGACAACGATAGGGAGATTCTGAAGCATTCTGCTGCAGATTACTTGGAGGAATCTGCTTATGCATCTCAGGTCTTGCTCACCAGAGAGCAGCTTGAAAGACAATATACCTGCAATGAAGTGCAACCCCAGCCTAGCACTGGTAGTTTCAGAGAAGCTACTGTTAGAAGTGTTATTCCTGATCCAGATATTTCTCAAAGCTGCACTGATTCATCAGAGATATCAATAACCAAATCAAATAGAGATAATTTGGTCACTGGTTTACTTCAACAAACATCACTTGATGGAATTGGTCCTCAGTGGATACGGCCTCCTCCTCCAAGACTTGAAATACTTGATGGAGAGTTGCAGTGGCTGAACCTAGACAACAACCACGAGCTATTGTGGGACAGTAGTATGTGTGCTGATACTAGTCGAGGTGCTGCGATCCGAGATTTAGTTGGAAAAGCTTGTAAAGGACCACTTTCACCTGCCCAACAGGAGCAAGTTCTGGTGGAATTGGCAAAGGACTGGAAGCTAGTTTATCATTGTGGGATGACACCACAGAAGCTCCCTGACCTTGTGGAACATAATCCACTCGTTGCTGTTGAAGTCCTTTCAAAGTTAATCAACTCGCCTGACATGGATGCTTACTTTGATATTCTTGTGCACATGGAAATGAGCCTACATTCAATGGAAGTTGTAAACAGGCTCACTACAGCAGTAGATCTACCACCAGGATTCATTCATGACTACATCTCAAACTGTATTCGATCATGTCAAAACATTAAGGATAAATACATGCAAAACAGGCTAGTAAGGCTAGTATGTGTTTTCCTACAGAGTCTCATTCGAAACAAGATAATAAATGTGCAAGATCTCTTCATCGAGGTACAGGCGTTCTGCATTGCGTTTTCCCGAATAAGAGAAGCGGCTGGTTTGTTCAGGCTTTTAAAATCATTAGAGTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSPKKDAGLSPPVAAPPPLSLAGVPVLTGSLRPAECADLLGLVAGVKRPLEDVVADFLARIQPERRLRFGAAINFVLKDKMMLRPAERLVAFTILHQGYSSQLENPFVPLIIHAACDETSDKPEQLFLQLLLNSTNGDNDREILKHSAADYLEESAYASQVLLTREQLERQYTCNEVQPQPSTGSFREATVRSVIPDPDISQSCTDSSEISITKSNRDNLVTGLLQQTSLDGIGPQWIRPPPPRLEILDGELQWLNLDNNHELLWDSSMCADTSRGAAIRDLVGKACKGPLSPAQQEQVLVELAKDWKLVYHCGMTPQKLPDLVEHNPLVAVEVLSKLINSPDMDAYFDILVHMEMSLHSMEVVNRLTTAVDLPPGFIHDYISNCIRSCQNIKDKYMQNRLVRLVCVFLQSLIRNKIINVQDLFIEVQAFCIAFSRIREAAGLFRLLKSLE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..234#2684..2788#4653..4739#5301..5354#5451..5596#5706..5832#5913..6050#13990..14061#14136..14209#14318..14459#15080..15158#15972..16069#ATGTCTCCCAAGAAGGACGCCGGCCTCTCGCCGCCGGTGGCGGCGCCGCCGCCGCTGTCGCTCGCCGGCGTGCCCGTGCTGACGGGGAGCCTACGCCCCGCGGAGTGCGCCGACCTGCTCGGCCTGGTCGCCGGCGTGAAGCGCCCGCTCGAGGACGTCGTGGCGGACTTCCTCGCCCGCATCCAGCCCGAGCGCCGCCTCCGCTTCGGCGCCGCCATAAACTTCGTCCTCAAGGTAACCCGCCCCTCCCTGGATTGGATTCCCCCCCTCGCTCCCGCCCGCCCGCGTCGTCTGCTTGATGCCTCCTGGTTCGAGGCGAGCGCCCGCTCGGCTTAGGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCTCCGCGTGGTGGTGGGGCGCTTAGGTTTTCGAGGGGTTCTTGGGGACGTGTTGGTAGGTGGGCTGGTTTGGAGCGCGGGTGGATTCAGGAATGGATAGATTCTGAATCAATCGCTTTTGTTGGTAGGGGAATTTTATGGTTTTTGCTGGGTTCTAGTGGTGCGTGGATAGCGATGTTTAGCGGATAATTTCTGCTTGTAGTGTTGCTCTATAGTCTATGTGCGATCTCCTATTTCGAGAAAGATTGAGTTTTTGATTGGGGACTGGTTGTTTCCATTTCTTGACAACCAGTAAGCTTTCTAATGGTGGGTTTTGTATTTTCAGTGGAACAGTAGATATGTTGGTTGCTTGATGAGGTTTTTAGTGTTGCACAGCTTGATTACCTGTCTATTTTATCTTTTGAGGTGCAGTTGCAAGCCCAATCGACTGCTGTCTTGCTAATTTTTGCGTTTTCCTTAGTCACGCGATAGGTTGCGGTCAAAATTGGTGACGGTCTATGTGTTGAAATGGATTTTGTTAGTGGGTAAATTTGTACAGCATGTGTTCTTCTGTTGCTCAGGCCACTGTTGTTACAGGGCAAATAATTGCTGCTAGCTGCATTGTTTTTTTTTTTACTGTTTTAACTGTCTTGAGTCCATATGAGTTTTGTGTTCTGACTTTAGGCTTTGAAGCGATTAGCAGATTTGTTATGTTCTGTGTAGAAACTAATATTGTTATTTGATTTAACAAGAGCGTAGTGTTCTACATGTTTTAGCTGGGCATGAGTAAGGGGTCCAAGTTATCAGTCTGTTGTTTGATGAGATTTGCGTCATTGAAATGAATTTGCAAACCATTATACTTGAGGTTTAAAATCAATGATCTCTTTCCCCCTTTATCTTTTTCCATTTCTTAAATTCTAAAAGAAATTCTTTACATGGGTGAGTCTTTCTGTACACTATCCACAATGGATGAAACCTCCTGGAATTATGCTAACATCTCATTCTTCCAACCTACCATACGGAATTCTTCCCTTTTTGCCCATATGCTCTGCCTCTTATGCCTTACGCTGCCCCTTCTACCCAACCTGTCAAATTGTTTTAGAATGTACTAGCTATTAGCTTTTCAAGGTTTTAGTCACTTGGAATAAATTAAGCAGTGAATAATATGATTAAAAAGTCACACAGTTACCACTTTTAGCTCATGGTAGAAATCAATGTTTCTTCTAGTGATCATAATTTTTGTGCCGCTGTTGTTTTAATGGAATATAATTGAATATGTGGATGGTTGCTTCCTTGACTGCTTATGGGCGTTGCTACTGTTCGTACTACATTACTAACGCCCACAACATTGACATATTTGCTTCCTTTTTTTATTGTTGTTCAGTGTCAGAAGGACTCAACATCATCGTCTGTTTTCATTTCCCCTTTAGGGAATGGTACTAGTAGTTGTAGGGGGTCTGTCTTCAATGCATTTAATTTTCACATCTTCTATTGGAGTTGACATGATATGTTATAGATGATTTGTTGGATTTGGTGGTTTCTGCACATCACTAGTTTTTTCCTGAGTGATGATAGCCGCGTAAATTGTTATGTTGATGGTGATATATATGATTTTTGTGTGATGTTATTATTGATATGATTTGAGAAAAACTTATTCACCTCCATATCAAAATCTAAGTCATTGTGGGATCTGTGTGGTTAATTATTTCTGACATTTCCCTCAGAAACATTTTGAAAGTCTGAGCACTGATATATTCAATTGTACATAGATGGAGTAACAAAAATAATTCCATTGGATCTATCTTGCAAAATACTTCTGTAATGTGTGATTATTATTTCACTTATACAAAGGTAGAGCAATCAATGGGTTGATTTGCAGGCCTGTTATCCTGTTTTGATCATTTTTCTTGAAATTATACCCTTCTTTTCTAAATTATATTTTCTTAATGCACAATCCATGGAAACTCTGCAAATCTGCACATTTTTTTCTCCCTCTGTAAGTAGATGGTAGTGAAATGCTTGGCTTAGACTTACATACTGCAATGTGCTGTCAAAAGGTTTAGATGTTTTTGTACTGTTTACATAGCTCTATGGATTCTTGATGGTAGACTCCCATCTCTCAAAAGGTTTTGATGTTTAGAGAATGATATACCGAAAGGAAAGAGTTTTTCTCCAATTATTCTTCTGTTAAGGTCCTTTTTGTCTATTCCTTGTAAATACAGGACGGTTTTTGGCAGCTTGTTTTTCATTTCATTTAATGTGCCTCCTGTTTCTGGGATTTCTTCTCTAGGTATAGGAGAATGAAAATAACACTTTGACTTTATACTACTTTGTTTTTTTCAGGACAAGATGATGCTTCGACCAGCTGAGCGTTTAGTTGCATTCACAATTCTTCATCAAGGTTATTCCTCACAGTTGGAAAATCCCTTTGTTCCTCTAATAATACATGTAAGTTGCAACCTTTTTTCTTTTTCTTTTTTTGGGGGCATAAATATTTTACAGGCTTCATTAATGTGTGCTGATAGTCTGAATTGGTCATGTTTATCCTTTTAATTTCATCGAATAAACTAATTTATTGTAAAAACATATTTGTCAAAAGGATAAATGTACCAGAAATTGTGATTTCTGTCTGCACTATTTTATTTTTGTTGTCAATTTCTCGCAAATAGTTCCACTTGCCTGTCCAATTTCTATGTTTGAGTTCCATGTCACAATTGAACCAGGGCACATTCCTTCCACTTCCAAGGTTTATCAACTACTATTAGGTGCATTGATCTTAGTGCCTCAAGAAAGTAATATTAGAAAAGGTGAAACTTCATGAAAACGCCTGGTTTAGTGCCATAATAACACAAAACACTGGGTTTTGTTTTCTTTTCACACAATACAATATGCACTATGCAGAACCTTGTGTGACAGTGTGGTTTTAATAATAGTGACATTGGGGAGATCTTGAGGGCCATCATGCCATTGTACTTTGCTGCTGAAGTGCTGAGATTGGTTTACGCTACCTATAGCTCTGTTGAGGTGTCTGCCTGAGCTCTAGTCTGGACAATACTGTTATATCCTATGTTCATCATTCTGTTATGACTTATAACACTTAGAGCCACATTGGGTCTCCGACATAGTTGGAAGTGGCCTCATTCCGTTGCGAAGTTCTGAGGCATGATCAAGCATAGGTGTTTGATGGAGTGAGCTGCAACCCTGTACAGAGGTGGTATATGCGGAAATTGGGAATAAGAGGCAAGGAGGTGAACCATGTGAAAGAAAAGATTTTTGGATAAAGATGAAATCTATTAGAAGATAATATATATTTTTGGAGCCTTGGAGGAGTGTTTTTCTGCTTTTTTAATAGAGGCTTTTCTCAGAGCTTAGGTGGGCCAGTAGGATGGACGGTCAGTACCAATTCCTTTTAAATAGTAAATAGAATGTAGAATCCATCAGTTGAGATTCAATTTAAATTATGAAAGCACCAGGTCCTAATTTTCAAAGCTAAAAGATGGGATTAATTAGGTGCTTACTATGAGTATTTAATATATTTACCCTGCATCTCACGCTTTTTGCTTCATGAGCACACTCAAAAAATTGGTTGGTGTTGATACATCATGGAAGCCATGCCAGGAGCAGAACATGGACTATGACGTAGACATTACATCAAATCCTGTAACCTACACATACATGTTAATTTCCACACATACATGTTAATTTCCACTGCTTATATGTCACTCTGCTTTTCTACTTGTTCTCCCAGCGTACATACAATTGTTAGTTTAAAGTTGCTTCCTATTTTCAGAAGTGTGTAACCTTGTGTTCTGACTTCCGAGTCCTTGATCACCATACTGTCTTATTTTTTCGTTGGTTGTTTGATTGCTGTTGAAAGGTTTGTATTTTCACGCTTAGAAGATGGTTTGCAGTTAGTACATGACTACATGCATACCTTCTTCTCCATCTATCCTGCTACGAAATTTGTCATCTTATGTGATGTGGATGGTGGGTTCTTTGCAACTTTTGCACCAGCATGGTGATGCTGTTCCGTAGTGTCTCAAGTTTAGAGGGTCGACAGTCAACACAGTGTTACGCAAATTGATCAGCAATATTTTTGGCAATTAAAGAAATCGATCATCTTATTCCTGGCTGCCATCAGAATGATTGGGTTTTTGCCTCAGCATGAACCAATTAAGTGGTGTTGTTATTATTATTTATCACAGCAGCAGTATGATTCTATCCTTTTCAGAGTCTGTTTTTTTAAATAGTGCACTATTTCTCGGTAATGCTTTGTGACTTCCGCTACCTGTTTTTTTAAATTTTTTGACAGGCTGCTTGTGATGAAACCTCTGATAAACCAGAACAGTTGTTTCTCCAACTTCTGTTAAATTCAACTAATGGGGACAACGATAGGGAGGTATTTTATCGCTCTATGATTTCTTGTTTAACTATATGATTTATATAGGCAAAATTGGTTATATGATTTTGCCATTTATATATAAATTTCACATGCATGGAGGTTACTG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