Difference between revisions of "BGIOSGA035179"
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Revision as of 18:20, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA035179 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA035179, complete gene. |
| LocusTag |
OS11G0310800 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA035179-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA035179-PA |
| Length |
21845 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:10688649..10710493 |
| Sequence Coding Region |
10688649..10688881,10689453..10689545,10689625..10689729,10690556..10690773,10698559..10698611 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:10688649..10710493 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:10688649..10710493 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCATCGTCGCCGCCGCCGCCGCAGCCGTCGCCGCCGGCGCTGCCGATCTCGGAGCACGAGGACGAGATCATGGCTGCGGTGGAGGCGAACCCAGTGGTGGTGGTGATCGGTGAGACCGGCTCGGGGAAGAGCACCCAGCTCTCCCAGATACTCCACCGCCGCGGCTACACCCGCCGTGGTGCCATAGCCGTCACCCAGCCCCGTCGCGTCGCCGCCGTCTCGGTTTCCAGGAGAGTAGCACAGGAGCTCAGTGTTCCCCTTGGTGATGAAGTTGGTTATGCCATCCGATTTGAAGATAGAACTTCAGAGAAAACCTGCATAAAGTACTTGACAGATGGTGTTCTTCTGCGCGAAAGCCTTTCAGACCCTGAGTTGAAGCAGTATTCAGTAATTATTCTGGATGAAGCTCACGAGCGCAGTTTAAACACTGATATTCTTCTAGGTTTAATGAAACGATTAATTAAGGATCGAGCTTCAGATTTGAAAGTTCTGATCACTTCTGCTACTCTTGATGGTTTGAAAGTGTCAAAGTTCTTCTCTGGATGTCCTGTGTTGAATATCCCTGGAACCTTATTCCCTGTGGAGAAGTTTTACAGCACAGAACATCCAACGAATTATATAGAATCTTCTCTGAGAACCGCTATAGATATTCATGTTAAGGAATCCCCTGGTGATGTCTTAATATTCATGACAGGAAAGGATGACATTGATAAGATGGTATCAAAATTGGAGGAAAGAATTCAAAATCTAGAGGAAGGTTCTTGTATGGATGCTCTTGTCCTTCCACTTCACGGTTCTTTGCCACCTGAACAACAGGTCCGGGTATTTGCTCCAGCACCTCCAAATTGTCGACGCTTCATTGTTGCAACAAATGTAGCTGAAACATCTCTTACTGTGGATGGTGTTGTGTTTGTGATTGATTGTGGTTATGTAAAGCAACGCCAGTATAACCCATCGTCTGGAATGTATTCACTTGACGTAGTTCAGATTAGCAGAGTGCAGGCTGACCAGCGAGCTGGGCGAGCTGGAAGAACTCGGCCTGGGAAGTGCTATAGGTTATACCCAATTTCCATTTATCAAAAGGAGTTTCTCGAGGCTACAATCCCAGAAATCCAGCGTTCTTCTCTTGCCGGAAGTGTTTTGTATCTAAAATCGTTAGATCTACCTGATATCAACATACTGAAGTTTGATTTCCTTGACCCACCATCTCGTGAATCATTAGAAGATGCTTTGAGGCAATTATACCTCATCGATGCAATTGATGAAAATGGGCAAATAACAGATGTAGGACGAATTATGGCAGAGCTCCCTCTTGAGCCTTCTCTTTCAAGGACTTTGATTGAAGCAAACGAATTGGGATGTCTATCTCAGGCATTGACTGTTGCTGCAGTTCTGTCAGCTGAAATCACATTCCGGTCAACTAGAAGCAAAGACATGGAGGGAAAGAGGAAAAGGCAAGAGCTTCCTGATGGTTCTGGTTGGGGCGACCATATACAGTTGCTTCAGATATTTGAAAGTTGGGATCGAACAGGCTATGATCCAAGATGGTGCTCAGATCATGAGTTGCAGGTGAGAGGCATGAAATTCAGCAAAGATGTGAGAAACCAATTAAGTCAGATTATTCAAAAAATTGCAAAAGGTTCAACAGATGTGCAAGCAAAGAAAGAGCGGAAGAGTGACCCTGATTATAGAAAATTAAGGAGAGCTCTATGTGTTGGATATGGTAACCAGCTCGCTGAGAGGATGCTGCATCACAATGGTTATCATACGGTTGGATACAGGGCACAACTAGTGCAGGTGCATCCATTTTCCGTACTGGAAGGTGATGAATACGGGAAACTGCCGGTATATGTTGTCTACCATGAGTTAATAAATACTACTCGTCCTTTCATGAGAAATGTTTGTGCCGTGGATCAGTCTTGGGTTAAACCTATATTGAAGAAGCTTGAAAGATTGGACATGAACAAATTAAGTGGTGGTTCCAGCGGATCGAAAGATCCAGAACCTCTAGAGGATAAACAAGTAAGCTCCCCAAAGAAAGCAATGGATGTTAAACAATCTGACGTGGACAGTAAAATACAGGCAGCTCGCGAGCGCTACCTGGCTCGAAAAGGTAAGAAATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPSSPPPPQPSPPALPISEHEDEIMAAVEANPVVVVIGETGSGKSTQLSQILHRRGYTRRGAIAVTQPRRVAAVSVSRRVAQELSVPLGDEVGYAIRFEDRTSEKTCIKYLTDGVLLRESLSDPELKQYSVIILDEAHERSLNTDILLGLMKRLIKDRASDLKVLITSATLDGLKVSKFFSGCPVLNIPGTLFPVEKFYSTEHPTNYIESSLRTAIDIHVKESPGDVLIFMTGKDDIDKMVSKLEERIQNLEEGSCMDALVLPLHGSLPPEQQVRVFAPAPPNCRRFIVATNVAETSLTVDGVVFVIDCGYVKQRQYNPSSGMYSLDVVQISRVQADQRAGRAGRTRPGKCYRLYPISIYQKEFLEATIPEIQRSSLAGSVLYLKSLDLPDINILKFDFLDPPSRESLEDALRQLYLIDAIDENGQITDVGRIMAELPLEPSLSRTLIEANELGCLSQALTVAAVLSAEITFRSTRSKDMEGKRKRQELPDGSGWGDHIQLLQIFESWDRTGYDPRWCSDHELQVRGMKFSKDVRNQLSQIIQKIAKGSTDVQAKKERKSDPDYRKLRRALCVGYGNQLAERMLHHNGYHTVGYRAQLVQVHPFSVLEGDEYGKLPVYVVYHELINTTRPFMRNVCAVDQSWVKPILKKLERLDMNKLSGGSSGSKDPEPLEDKQVSSPKKAMDVKQSDVDSKIQAARERYLARKGKK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..233#805..897#977..1081#1908..2125#9911..9963#10542..10658#11948..12039#12803..12889#13020..13234#14589..14681#18648..18771#18850..18991#20348..20417#20835..20992#21435..21610#21695..21845#ATGCCATCGTCGCCGCCGCCGCCGCAGCCGTCGCCGCCGGCGCTGCCGATCTCGGAGCACGAGGACGAGATCATGGCTGCGGTGGAGGCGAACCCAGTGGTGGTGGTGATCGGTGAGACCGGCTCGGGGAAGAGCACCCAGCTCTCCCAGATACTCCACCGCCGCGGCTACACCCGCCGTGGTGCCATAGCCGTCACCCAGCCCCGTCGCGTCGCCGCCGTCTCGGTTTCCAGGTAACCCGACTCCGTGCTTCGCTTGTCTTCCCCCACGGTGGCACGGTCGCACCTGCGCGCGCTCGTTGTTATCTGCTACCTGGGAGTTTAGTACAACTTCCCCCTTTCTATTCATGTTGTTATTTTCAAATGTTGGTTTCCTTTTAGCTCAGGGTACATTCTTACTGGGTTCGTGTGGGTCTGGTTATGCCTGAAAAGCTCTCAGATGTGTTGGATTTTGGCCATTAGCACTTAAGGGATACGAAAATTGCAGATTCATCTTGAAATTTAGAATCGTGATGGTGGAGATACGAGAACATCGTTTGTAAAAACTGCAGCTGCTTTCTGGATAGCCAAGCCATTTATTTTAATTTAGAAGTGTTTTAAGGGGAGAAAACTTAAGAACCTGCTTGTTAAGAAATTTTGAAGTGGTTCTTCCTGGCGAGCAGCACTATGTTTACAGCATATGCATATTTATACATGTACAGAGAAGAATAGTTTTCCAGTGCAGTCTTGTGCTATGCCTATATTCAAGTGTGGAAAATGTTTTTTAGGATGCCATTATGAATGCTGGCAATCTGAATATTTGCAGGAGAGTAGCACAGGAGCTCAGTGTTCCCCTTGGTGATGAAGTTGGTTATGCCATCCGATTTGAAGATAGAACTTCAGAGAAAACCTGCATAAAGTAAGCCTCAGAGGGTGTTTATGTGACTTGAATTTCTTCTTGAACAATATGCGAACTCATTCTATTTTCGGATATGCAGGTACTTGACAGATGGTGTTCTTCTGCGCGAAAGCCTTTCAGACCCTGAGTTGAAGCAGTATTCAGTAATTATTCTGGATGAAGCTCACGAGCGCAGTTTAAACACGTATGCGTTTTATATGTTCAACTGATCTATAAGAGTTCGAATTAAAGTTTAGCACTTTATCAAGTTTGCTGCTTACTCTGCAGTTATTCCACACCCATTTCTTGTTGTTTGAATTGAAAACTTGTGATTTGAAAACAAAATAAGATAATTACCGGGAATGGGTCATACACTACATTTAGTTATAGTAATATGTTAAACTTTTGTTGCTTATACACTACATAGATTTACCCAAGATTGATTGCATGCCTGTTGAACTTTTGTTGCTTATGTGTCCGGTTTTTGGAACAGTGAACAAAACAGTGCTGGGAAGCCATTCTGTGTGCCATGAAACTGGGAGTCAACATAAATGTATTGGTTATATTTGGTCTTCCTGTACCTATTTTATATAAATCAACTTAGCTTTGCCTTTTCTTCTGATGCGTTTTTTCTCTACTGCTAGGAATTAGTACCTATACGATATTTTCACTCACAAGTAATGTAGACATCTAGTATGTGTTCTCAAAATTGACTTTGATATAATCGATAGTTCTCTATATTAGATGTTTACCTGGACAACTTTGAATGGGAGGGCCTCGGATCGCAAATGCCTAGTAACTATTTACTAACTGTAGGATGCAACTTTACTGTGGTTTTCGTTCTCCATATTTTGCCCATATTTATTATAATTGGTTCTCAGATGCTTCAATTGTAAGCTAGCAATTGTATTTTTAAAGTGATCGATAGTCAGTACTAACTTTTTCTTGTTTGGCATCGGCCACACGACCGCTGGATTTTGTTGCTATTTGTTGAAAGCTTTAGTCGCGTTCTGATATTTGTTTGTTTACAGTGATATTCTTCTAGGTTTAATGAAACGATTAATTAAGGATCGAGCTTCAGATTTGAAAGTTCTGATCACTTCTGCTACTCTTGATGGTTTGAAAGTGTCAAAGTTCTTCTCTGGATGTCCTGTGTTGAATATCCCTGGAACCTTATTCCCTGTGGAGAAGTTTTACAGCACAGAACATCCAACGAATTATATAGAATCTTCTCTGAGAACCGCTATAGGTAATTATCATTTTCTTTATGTGGCTATATTTTAAACCTTGACAATGACATGTGAATATTGTTGGTGCATCTCTATTAAGTCACTATGTGTTATTTCACTACTGGAATACATCAATCATTGTCATAACAGATAAGCTATGTAACAAATGTCATGGATGGTTTTGATATGTGCCCATGAATGGGCTAGCATTATAGTGGCAAGAGGGTAACTAGGCCAGTTTCCCTTGAATCTCTCTTACAGTATTCGTCCTGCTATGGTCAAGTTGGATGGACAAATAATGTAAAAAAAAAAAGATGAAATAAGTGCTGGACCTGCTACACCTATGAATAACCTCTTTAAAGCTCTGGCGAATTTGGGATGTGTCTGTATCTGATGGCTCTTATTTATGTTAAGTACACTCCGCACTGGTTTTACTAACATTATAAAACATCATTTTAAAAAACTACTTTTTTTAAAGCCATATCTTGGGATACCATCATGGTTGTTAAGGCGCCCCTGTTAGAATTTCAATGGTTACTCTCATTGAGAAGAGGATGGCACTCGAGATGGGGCAATTTTCTGGTTTTCTTCATTCACTAAACACAAAAAGCCATACCTTCCCGAGGGAGGTTGGATACATATATATAGCCATAGCTGGCTGGATGGCTGCTAGCTAATTGCTGCCCACACTAGTCTAAAATTTGAACGCAATGCTGTCCTAGAGAGCATCCAAACTGAATAAAGCATAAAGGAGATGCTAGATGCTGTCCTAGGGATGCTAAAAGCAAAACCGAAAGATGCTAAAAGCAAAACTGAAAGGATGCTGTCCTAAAAGGGGAAAAACAACCTAAAAGCAAGAGATGGACCACAAGGACCAAAGACCACAAGGCTTATTCCATCATTCTCCCCCTAAGTCTTGTGTGTCGTCTTGTGGGAAAGTTGGGCCATCCCGATCCTGGAGCAGAGCTCGAGGAACTTGATCCTCCCAAGAGGCTTGGTGAGCAAGTCCGCAAGCTGGTCCTTGGTGTTGATGTAGCTCGCCTTGATGCTCCCTTCCTCCAAGTAGTTTCGGATGAAGTGGTACCTCACCCGGATGTGCTTGCTCCGTTCGTGGAAAACGGGGTTCTTTGCCAGGGCCAGAGCGGACTTGCTGTCCACCCTGAGCTCTACTGCTCCAGTGTCTCTGCCGAGGAGATCACCAAGCAGTCGAGCAAGCCAGAGCGCCTGGGTCGAAGCGGCGGATGCCGCCATGTACTCGGCCTCGCAGCTGGACAGGGCCACCACCTGCTGCTTGACCGACTGCCAGCTAACGAGGCACTCGCCGAGGAAGAAGAGAATCCCGCTCGTGCTCTTGCTGGTGTCGATGTCGCCGGCGTGGTCGCTGTCGCTGTACCCGACGAAGTGTGCCTTGCCAGGACACCTCGGGTAGTAGAGACCGTGGTCGAGAGTCCCTGCAACGTAGCGGATGATCCTCTTCACAGCCTGCTGGTGCTCCGTCGTCGGTCGCTGCATGAACCGACTGACGTAGCCGACGGAGAAGGCCAAGTCCGGCCGTGTGTGGGTGAGGTAGCGAAGGCTCCCCACAAGACGTCGGTACTGTGTGGCATCCACCTCCTCCGCTGTGCTGTCGCGGCTCAGCTTCAGTCTCTCCTCCATCGGAGTGAGAGCTGGGTTGCAATCGGTGAGCCCAGCCAGCTCAACGACGCGCTTGGCGTAGGCGGTCTGTCGAAGCGTGATCCCGGAGTTGTCCTGGTGCACTTCGATCCCCAGGTAGAAGGAGAGAGGCCCCAGATCACTCATCTGGAAGGTGGCCTTCATCTCCTCCTTGAACGCCGCGACCTCTGCATCCTTGGTGCCGGTGATCACTAAGTCGTCGACGTAGACACCCACCAGCAAGGCATTTCCTCCATTGCCCCGCCGGTAGATGGCCGCCTCGTGCGGGCTTTGCTCGAAGCCCATCCCCTTGAGCGTGGAATCCAACTTGGCATTCCACGCCCTCGGTGCCTGCCGCAAGCCGTAGAGGGCCTTGTGCAGGCGTAGCACCTTGCCCTCCTTGCCGGGGATCACAAATCCCGGCGGCTGGTGCACGTAGACCTCCTCCTTCAAGTCGCCGTTTAGAAACGCCGACTTGACGTCCATGTGATGACGCCCCAGCCTTCCTGAGCAGCCAGCGCAAGAAGGAGTCGCACGGACTCCATCCGTGCCATGGGAGCGAAGGCATCGTCGTAGTCGATCCCCTCCTGCTGCACGAAAACCGCGAGCCACCAAGCGAGCCTTGTGCTTGACGATGGCTCCGGCTTCATCCCTCTTCAGCTTGAACACCCACTTAAGGGTGATCGCGCGGTGACCACGAGGGAGGTCAGCAAGCTCCCAGGTGCGGTTCTCCTGAACCGCGTCCATCTCCGACTGCATCGCGGCACGCCATGCCGCGTGTTTCTCGGCCTCTGCAAAAGACCGAGGCTCACCGTCGTCGCTACGCAAGGTGCAACTGCGCCTCCAGGTTGCGAGGCTACCTAGTCCCGGCACCGGCTGGTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCGTCCAATGTGATGGACGCCCCAGCCTTCCTGAGCAGCCAGCGCAAGAAGGAGTCGCACGGACTCCATCCGTGCCACGGGAGCGAAGGCATCGTCGTAGTCGATC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