Difference between revisions of "BGIOSGA035520"
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Revision as of 18:22, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA035520 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA035520, complete gene. |
| LocusTag |
OS11G0586100 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA035520-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA035520-PA |
| Length |
15483 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:18802711..18818193 |
| Sequence Coding Region |
18802711..18803083,18803709..18803958,18804746..18804855,18806040..18806271,18807979..18808057 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:18802711..18818193 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:18802711..18818193 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCGGCTGGGTTGCTCCGGCCGCCGCCGCCGCCTACTCCGAGCCGCGCGTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCGTCCTCGTCGCGCCGCCGCGGAGGTGCGCGGGGGAGTCGGCTACCTGCCTCGCCGTGTACCGCGAGGGCGGGGCGCCCGCGGTGTTCCAGTCCGCGCACTGCCCGCGCTGGACGCTCCTCGCACCCTCCGCTGGCAGCGGCGGCGAGGGGGATGGGGACCGGAGGTCGTCCACCTCCTCCTCCCCGCCGCCGCCGCCGCACCCGAGGGGGTGCCACGTGGCGGTTGACAGAGGCAGGCGGCGGTCCCAGGAGGACCGCGCCGTCTGCGCGCTCGGCATCCGCATCCCCTTCATAGAGCATATGAGGATTAAAGAGGTGGACGTCGGAGTGGTTGCAGTATTTGATGGTCATAATGGGGCTGAGGCTAGTGAGATGGCTTCTAAGCTTTTGCTGGAGTATTTCTTGCTCCATGTTTATTTTCTTCTTGATGGTATATACTCCATCATGTTCAGAAAATCTACTGGAAAGCTGACATATAAAGAAGTTACTATTCTTAATAATGTCATTAATCTGTACAAGGAGGACCAGTCCAGTCATAGCAAGGGGTCATGTTGGGCTTTACCTGCTATTCTAGATCGATCATTCCACATGGAAGTTCTGAAGGAATCATTATTGAGAGCAGTTCATGATGTTGATTTGACATTCTCCAAGGAAGGAAAATGGAGAAGAAAGAGAAACTCCAACAATCGTGATGACTTTGCATTAGCAAATTATGATGGACCGTTCTATAATGTAAAGGAGTTGACCAAGGATCATCATCCTGATAGAGAAGATGAGAGAAGCCGTGTGGAGGCTGCTGGTGGTTATGTTCTTGAGTGGGCTGGTGTGCATCGTGTTAATGGTGAGCTAGCACTATCAAGAGCTATTGGTGATGTGCCCTACAAACGATTGAGGTCCTACATGGAATTGTGCATTTTAGTCCCAGGAATTTCCTCGCAACATCAGGGCAGTGGTGACTCCGAACATGGTCAGTTTCGGCCGGCTTCTTGGAAATGCTCTGAAGAATCATTTGCGCATCAAGTGAAGATCAGAGATCCTCTTAAAATGGGATTTCCTAATATATGGGCATTGCGACTAGCACGCCAGTTACTAATATGGCATCCTGAGGACCGCCTAAGTGTCGATGAAGTATTAGCTCATCCTTACTTTCAGGAGCCACCGTATGGTGTAATACCGACACCTGAACTGACAGAGTGGCAATCTCTGTCAGCAAATGATACCTTTCTTATTGCCTCCTCTGATGGTGTATTTGAGAAAATGACTATGCAGGATGTTTGTGATCTGATGTTGCGTGTGAAACTTGGTGTTAACCAAGAATTAGGATCCTTTGCAGTAACGCAACAGAATTTGGCAGATTATGTAGTTGATCTTGCTTTAGAGAAAGGGACAACAGACAATGTAGCAGCTGTGATTGTTCCATTGGGATCTCATTATAGCTCTAAAGTTACATTGGAAGATTGGTATATGCTTGAAGAAAATTCCAAGACATCTATTTCACCATTACAGACCATTCCATACCAACAGAAGTCTGATGATGGTGTTAGTTCAGCTCTTATTGGCATGGATTATTACAAGCGTTCATCAGCAAAGTTCCATCGATTCTTGGTTGAAGCAAAAATGAAGAGACTGGGCTGTTTCTACTTATCTGAGAGTCTTGATGAAGATATGGACTATATATTTAGAGTGCCAGAAGCCTATCAGCGTGAAGGAGTCAATGACTTCGATCACTCGCCAGTTGAAACTGTCTTATTTTCTGATGGAAATCTTGATAAATACAAGGACAGACATTTTTGTTGGTACCTTGGTCATCAAGATGGTGAAATGGGACGGTGTCATAGTCCTGAAGCTTTTGCAAATTTCTTTGGATTGCTTGACTCTGTTTCACATAATGGAAGCAAACCGCATAGTTCACATTCATTTGGCTACAAGATATCTGATTTTAGGTACAAGCTGAAGAAAAGATTTGACCGTGGGTCATATGGTGAAGTCTGGTTGGCATTTCATTGGAACTGCTCTGAGGATGTAGACGTACATAAAGATCATTCACACTTTAACACTATACTTAAACCAGACTCATACAATTGCACAAGCTCAAACACAACTTTGCCTGATGAAAACCATGTTTCAGACACAATAGATGGCGATTTATTCATATTAAAGCGCATAATGGTGGAGAGAGGACGTGCTGCTTACTTGAGTGGATTGCGGGAAAAATATTTTGGGGAACTATTTTCAAATGCTTCAAGAACTCTTGAAGCTTTGTCAAGGGCAGAGTCATCCACAGCCTTTTCGGTGGACAGACAACTTAATCCTCATATCTTTGCAGAAAATAACATGTCATTTACTGAAGAACCACTAAAGCACATTGCTAGGTTTATAGAATCTTTTGAATCAGAATTGAAGGAACTATGGCTTGTGTACCGTAATGAAGGCCGCTCTTTATCGAAGCTGATATATACAGCTGAAGAAACAAAGTTAGTTACTGGTAACAATAATGAGAGGGTCAGGCATATTCAAGTTCTTCAACCATCAAAGTGGTGGCATTGGTTAAGGACAACGAAAGCTGGGCAAAAGCAAATGCAAAATCTCTTATGGCAGCTGCTGATGGGTCTGAAAGCTTGTCATGATCGTAATATCACTCACAGGGATATTAAACCTGAGAACATGATAATCTGCTTTGAGGATCTGGAGACAGGAAAGTGTTTGAGAGAGATTCCGTCGGAAGCAAAACACAACAAACTGAACATGCGTCTTATTGACTTTGGCAGTGCCATTGATGATTTCACATTGAAGCATCTTTATGATTCAGGGCCTACTCGGTCTGAGCAGACTTTCGAGTACACTCCTCCAGAGGCACTTCTTAATTCAAGTTGGTTTCAGGGATCAAAAAGTGCCAGACTTAAGTGTGATATGTGGAGTGTTGGTGTTGTCATGCTGGAGTTGATAGTAGGTTCTCCACATGTTTTCCAGATAAGTGACCGTACACGTGCTCTAATGGATCATCGCCTTGAAGGGTGGAGTGAGCAAACAAAGGAACTTGCATACAAGTTGAGGTCCTACATGGAATTGTGCATTTTAGTCCCAGGAATTTCCTCGCAACATCAGGGTAGTGGTGACTCCGAACATGGTCAGTTTCGACCGGCTTCTTGGAAATGCTCTGAAGAATCATTTGCGCATCAAGTGAAGATCAGAGATCCTCTTAAAATGGGATTTCCTAATATATGGGCATTGCGACTAGCACGCCAGTTACTAATATGGCATCCTGAGGACCGCCTAAGTGTTGATGAAGCATTAGCTCATCCTTACTTTCAGGAGCCACCGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRLGCSGRRRRLLRAARLLLLLLLLLVLVAPPRRCAGESATCLAVYREGGAPAVFQSAHCPRWTLLAPSAGSGGEGDGDRRSSTSSSPPPPPHPRGCHVAVDRGRRRSQEDRAVCALGIRIPFIEHMRIKEVDVGVVAVFDGHNGAEASEMASKLLLEYFLLHVYFLLDGIYSIMFRKSTGKLTYKEVTILNNVINLYKEDQSSHSKGSCWALPAILDRSFHMEVLKESLLRAVHDVDLTFSKEGKWRRKRNSNNRDDFALANYDGPFYNVKELTKDHHPDREDERSRVEAAGGYVLEWAGVHRVNGELALSRAIGDVPYKRLRSYMELCILVPGISSQHQGSGDSEHGQFRPASWKCSEESFAHQVKIRDPLKMGFPNIWALRLARQLLIWHPEDRLSVDEVLAHPYFQEPPYGVIPTPELTEWQSLSANDTFLIASSDGVFEKMTMQDVCDLMLRVKLGVNQELGSFAVTQQNLADYVVDLALEKGTTDNVAAVIVPLGSHYSSKVTLEDWYMLEENSKTSISPLQTIPYQQKSDDGVSSALIGMDYYKRSSAKFHRFLVEAKMKRLGCFYLSESLDEDMDYIFRVPEAYQREGVNDFDHSPVETVLFSDGNLDKYKDRHFCWYLGHQDGEMGRCHSPEAFANFFGLLDSVSHNGSKPHSSHSFGYKISDFRYKLKKRFDRGSYGEVWLAFHWNCSEDVDVHKDHSHFNTILKPDSYNCTSSNTTLPDENHVSDTIDGDLFILKRIMVERGRAAYLSGLREKYFGELFSNASRTLEALSRAESSTAFSVDRQLNPHIFAENNMSFTEEPLKHIARFIESFESELKELWLVYRNEGRSLSKLIYTAEETKLVTGNNNERVRHIQVLQPSKWWHWLRTTKAGQKQMQNLLWQLLMGLKACHDRNITHRDIKPENMIICFEDLETGKCLREIPSEAKHNKLNMRLIDFGSAIDDFTLKHLYDSGPTRSEQTFEYTPPEALLNSSWFQGSKSARLKCDMWSVGVVMLELIVGSPHVFQISDRTRALMDHRLEGWSEQTKELAYKLRSYMELCILVPGISSQHQGSGDSEHGQFRPASWKCSEESFAHQVKIRDPLKMGFPNIWALRLARQLLIWHPEDRLSVDEALAHPYFQEPP</aaseq> |
| Gene Sequence |
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