Difference between revisions of "BGIOSGA036490"
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Revision as of 18:28, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA036490 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036490, complete gene. |
| LocusTag |
OS12G0193200 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA036490-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA036490-PA |
| Length |
10458 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 12:4951487..4961944 |
| Sequence Coding Region |
4961834..4961944,4961239..4961377),complement(4960953..4961104,4960378..4960461),complement(4960232..4960294 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:4951487..4961944 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:4951487..4961944 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGATTTGAATGCTTCACCATCGCCTGAGGAAGATGACCAGTCTTATGAAGAGCATGCTGATTTTTCACAGAGTGAACATGCTGAGTCTGCTGTTGAGATAATGCGAAGGGAACGCGAAGAGAGACGGAGAAAGTTAAAGAGGGAGCAACATGATGATGGACCAAGGCTGAATCGACAACCGATTAGGAATGATCATATGAATCAAAATAAAATCATTAGACATGGACGAATTAAAGAGCCACCTCAGGGCTGGTTGGATTGCCCTGGATCTGGTGAGCCAATAGATAGGATTGTACCTTCTAAAGTTCCCCTGGATGAAACATTCAATGAGTCTGTGCCTGCTGGGAAAAGATATTCTTCCAAGCAAGTTGTTAATAAACAAAGAAAAGCTGGAAGAGATATAGGTTTAGTGATTGACTTGACAAATACCACTCGGTACTATTCACCAACTGAATGGACAAGACAAGGTACTAAATATGTCAAGATTGCCTGCAAGGGAAGAGATGCTGTTCCAGACAATGAATCTGTTAACACATTTGTGTATGAGGTGATGGCGTTTCTTGACCGTCAAAAACAATCAAGGAATCCCAAGTATATTCTTGTTCACTGTACCCATGGGCATAATCGTACAGGTTTTATGATTGTTCATTACCTAATGCGCACACAACTCTCTAGCGTTACTGAGGCACTGAACATATTTGCTCAACGGCGACCTCCTGGAATATATAAAAATGACTATATTCAAGCTATCTATTCATTTTACCATGAAATTCCTGAAAATATCGTATGCCCTCCAACACCAGAATGGAAGAGGCCCTCTGATCTTGATTTGAATGGTGAAGCTAAGCAAGATGATGATGATGATGGCAATGTAGATCGTGCACCATCACCTAATCACGAAGATGATAAAGTCATTACTAATGATGATATCTTAGGGGATGCTGTACCTTATGACCAGCAAGATTTCCTGCGCAGTATATGTTTTAGGTTACTTGAATTAGTGCCCAGTGGTAGAGCTAATGCTCAGTTTCCCGGATCTCATCCAGTTTCTCTTAACAGTGAGAATCTGCAAATTCTGAGACAGCGATATTATTATGCTACGTGGAAAGCTGATGGAACGCGATACATGATGCTTATAACACGTGATGGTTGCTTTCTAATTGATCGGAACTTCTGCTTTAGAAGAGTTCAGATGCGTTTTCCCCTTAGAAATTCGAATGAAGGTTTTCACCACTATACGTTAATTGACGGAGAAATGATTGTTGACACTGTACCGGATTTGGGATTGAAGAGGAGATACTTGGCATATGATCTAATGTCAATTAATTCCCAATCTGTAGTCAAGTTGCCTTTTTCTGAGAGGTGGAAATTACTTGATGATGAGATAATACGCCCACGCTATCATGATAAAGGACGCAGTCCATCATACAAATATGACATGGAACTATTTTCGGTAAGGAGAAAGGATTTCTGGCAACTTTCTGCAGTGAACAAGATACTGAAGGAGTTTATTCCAAAGCTTTGTCATGAATCTGATGGGCTTATATTACAGGGCTGGGATGATCCTTACGTGACTCGTACCCATGAAGGTCTTTTGAAGTGGAAATATCCAGAGATGAATTCAGTAGACTTTCTGTTCGAGATTGGCAGTGAGAATCGTCAGTTCATTTTCCTCTATGAGAGAGGTAGAAAGAAACTTATGGACGGTGCCCGGGTGGTGTTCCCTGATGAAGTTGACCCGCCTTCAATATCAGGGAAAATTGTTGAGTGCTCTTGGAATAAAGAAGAGGACTGTTGGTCCTGCATGCGCATTCGAACAGATAAATCAACTCCTAATGATATCAATACTTACAGAAAGGTAATGAGGAGCATCACTGATAACATTACTGAAGACAAGCTCCTGGAGGAAATATATGAGATCATGAACCTTCCTATGTATGCTGATAGGAAAGCAAAGGCTCACGCGCGAAGTATGGCTCAACAACGAAGGAGATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDLNASPSPEEDDQSYEEHADFSQSEHAESAVEIMRREREERRRKLKREQHDDGPRLNRQPIRNDHMNQNKIIRHGRIKEPPQGWLDCPGSGEPIDRIVPSKVPLDETFNESVPAGKRYSSKQVVNKQRKAGRDIGLVIDLTNTTRYYSPTEWTRQGTKYVKIACKGRDAVPDNESVNTFVYEVMAFLDRQKQSRNPKYILVHCTHGHNRTGFMIVHYLMRTQLSSVTEALNIFAQRRPPGIYKNDYIQAIYSFYHEIPENIVCPPTPEWKRPSDLDLNGEAKQDDDDDGNVDRAPSPNHEDDKVITNDDILGDAVPYDQQDFLRSICFRLLELVPSGRANAQFPGSHPVSLNSENLQILRQRYYYATWKADGTRYMMLITRDGCFLIDRNFCFRRVQMRFPLRNSNEGFHHYTLIDGEMIVDTVPDLGLKRRYLAYDLMSINSQSVVKLPFSERWKLLDDEIIRPRYHDKGRSPSYKYDMELFSVRRKDFWQLSAVNKILKEFIPKLCHESDGLILQGWDDPYVTRTHEGLLKWKYPEMNSVDFLFEIGSENRQFIFLYERGRKKLMDGARVVFPDEVDPPSISGKIVECSWNKEEDCWSCMRIRTDKSTPNDINTYRKVMRSITDNITEDKLLEEIYEIMNLPMYADRKAKAHARSMAQQRRR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..111#568..706#841..992#1484..1567#1651..1713#3025..3162#3242..3448#4984..5100#5570..5619#6521..6683#6772..6894#7582..7689#7780..7878#8851..8940#9025..9109#9620..9750#10321..10458#ATGGATTTGAATGCTTCACCATCGCCTGAGGAAGATGACCAGTCTTATGAAGAGCATGCTGATTTTTCACAGAGTGAACATGCTGAGTCTGCTGTTGAGATAATGCGAAGGGTAAATAAAATACTTTCTTGTTTTAAACCATGCAACTGTTTAGCAGCATTAGAAGAGCATTCCCCTTGAGATGAGACCATGGAGTTTTTGGACTTTGTATTATGGGTTGTGGTGAAGGCGATATCATAAGAAGTATATTAGAATATAATACTCTGCAATAGACAGACCTGGCAAACCACGTTTTAACTTAACATTTTTCTTCTAGTTACTCAATCTACATCTCTATTATCTGGACCAACTGGTCATTTGGTGCGATCTTCTTTTGTTTCATATAGCCAGCGGCATTTGGTTTTCATATGTTCTGTTTATTTTATTACTAATTAAGTAGTTGATGCTTTTTAAAAACAGCAATGGTGCAAAGCGAGCTTAATTATTATTTTAACCAATTTCTTTTGAGTTATGATCCATCATTGCTACCTGTTTATATCTTTCATTAATCACTACCATGTTTCATAGGAACGCGAAGAGAGACGGAGAAAGTTAAAGAGGGAGCAACATGATGATGGACCAAGGCTGAATCGACAACCGATTAGGAATGATCATATGAATCAAAATAAAATCATTAGACATGGACGAATTAAAGAGCCACCTCAGGGTATGTATCGTGTGCTACGGATTTCTTTATCATGTTGAATTCCCCCATGTAATTCTTAATTGATCAACCTATGCTAAGTAGACTTTAAGTTATGTATTATTACATTTAAATTATCATTTTTTAATTATTATCAGGCTGGTTGGATTGCCCTGGATCTGGTGAGCCAATAGATAGGATTGTACCTTCTAAAGTTCCCCTGGATGAAACATTCAATGAGTCTGTGCCTGCTGGGAAAAGATATTCTTCCAAGCAAGTTGTTAATAAACAAAGAAAAGCTGGAAGAGATGTAAGTACTGCATGCTACCTAATATGGCCGTGATAATAATGCACATGATATTCGTTTTGTCCTGCCTTCTGTTTTTTTCCTTACGCATGGTCACAGATTTGAAGCAATTTTTGTTAGAAAAAACATTCGTATTTCTCAGTTCAATTCTTACGAATTGTTATTTGTACAGTGATGCAGAGGCTTCTAATAGTCACAAGAGGGACATAAATCTAGTTAAATTTTAGATTATTATTATTATTTATTGAATAATATGATTTACAGTGCAAATATCATGAATTAACAAGCAGAAGTTGCTTGTAATAGATATCTGAAATAACATTTATTCTGCTAAGTGCTAATGCACTTCTCTCATTCTTTAATATCTTGTTCCTATTTATTGTTGAAGGGAGCATCACAAACTCCAGGACACTTTATTCAATTTAAATTATTTTAAAGAGATTGCAGCTAATTACCTGTGTTGACATATTTTTTTCCTCCACTTATTTTATCAGATAGGTTTAGTGATTGACTTGACAAATACCACTCGGTACTATTCACCAACTGAATGGACAAGACAAGGTACTAAATATGTCAAGGTGAGAAAGTGAGATGCACTCCGGTAGTTTAGGATTAATCTAAGATAAAGTCCTTTTCACTCTTAAAGTGTATTTTCATTTAGATTGCCTGCAAGGGAAGAGATGCTGTTCCAGACAATGAATCTGTTAACACATTTGTGTATGAGGTAATTCAAATTATTTGGATTCATGATTTTGACATAATCTTTTTTGTCAGCTATGTTGTTTTTCCCACTTTCTTTTAGATATGAATATTCAGTGTCCCTTCATTGTTTTACAATTGAAGCAATTTGCTTTTGTTTGAGATTGAAAAAAAACTTTATGATGAAAATGTATTTGCTCCTAATGTAACTTCATTTGACAATGCAACTGGAGTTAGTTTTTGATTTTAGGTAACTTTACAGGTTATCCATTTGCTTTGCTTGAAGTTTGACTTATAGTTGTTGATATATTTCATCTTGTTAGCTGTTTGTTATTAATTCTAACCTCGAATGTGTTGGGTATTTATTTTCCAACATGGAAGAATTACTCCCTAAGGTTTATGGTAATTACTAATATTCTTTCCAAATCAATGACACTACATGAGAGATGCTTTGCTGTTATACCTTTTATATCATCAAACTACAAAGAATTAACTTTCAACATTCAAATGCATGTCTGCTGTAGTTATCAGTTCTCTTAGGAGTTCATTAGGATCAGTGATAATTCTCAACCTGTCCCCATGAAAAGTATCAACTGTTTAAAATGCTGCATTTATCTAGTGTTCTTCTGGTTTATGTGCGTAATAATCACCTATTGGCTTACACAAAGTTTCGAAAACTAGCATTGACCGTGTGTTCCGTATATTTAATCAGGACTGGTTAAACACAGTGGACTTTAGAAATTACATGTCTAGATTTGAGTTTGAGCTTCAAAACTATGAACTGGTTGGCATTGATTAAAGCTATGCGTTGTCTATGTTATGCCTTCTAAATAGAAGGCCTGCATATGTTTCCTTCTAACCTGAAAATGTTGCATATATGTCACTAGAAGTGAATTGGCACACATACGACTGTGAACAGAGTTATTACATAGGTAGCTTATGGCCTCGTGTGTCTTATTTACCAATAGAAGTACCCTGCTTATCAACCGTTCCAGATTAACTCCATTCTTGCCTCTGCTGGCTGTCAATACTATGGGTTGCTGGATGATAAATTTGTTCTAGATTGACATAGGTTAGTTAGCCTCTGAATTCTGGAGTAAATATTTTTTTTGCAATTCAGCTATCTTCAAGTTATTGTGGTAGTTATTTTTGTTGATTCCAATTATTTTGTTGTTATGTTTGCCTGTTTGGTGCAAATGTTGTAAATGTATATGAAATGCAATGAGTAGGTAGTCTTGCCCTATGTTTCACCTTTCACTGGAAAAGCTCTTTATTTTAGGATGTGACAATTGTATGTAATAAGTCTGTTGATCAAACTTGACATTGTAACTTTTAGGTGATGGCGTTTCTTGACCGTCAAAAACAATCAAGGAATCCCAAGTATATTCTTGTTCACTGTACCCATGGGCATAATCGTACAGGTTTTATGATTGTTCATTACCTAATGCGCACACAACTCTCTAGCGTTACTGAGGTAAGAAAAAAACATGTTTCAATTTGTATTTGTTGAAAATAATTTGACATTTTCCTGAGCTAATGTTTTTATTTGCTAGGCACTGAACATATTTGCTCAACGGCGACCTCCTGGAATATATAAAAATGACTATATTCAAGCTATCTATTCATTTTACCATGAAATTCCTGAAAATATCGTATGCCCTCCAACACCAGAATGGAAGAGGCCCTCTGATCTTGATTTGAATGGTGAAGCTAAGCAAGATGATGATGATGATGGCAATGTAGATCGTGCACCATCACCTGTAGGTTTTCATATAGTACTATTTATGACTCCCTTTGTTGATTTTACCTGGATGTATAAGTATCTGATTCCTATTCAATACCGCAATATGATTTGACAACACTAACAATTAATTTGAAAAATAAGTGACTATAGGGAGGTATATCTAGTGTAAACTAGAATATTTTTGTACCATGTAATGTTAGTAAAACTGTCCTTAAAGATTGCCCAAAATTCTCAACGTAATGGATGATATAGAGGAACAGATATTTGATGCCCCTACTTTTTTTATGATCAAATTTAAATTTTTTGGGAGAAATAAAAATTATGTTTTTCCATATACATGCGAGTTTGGCCATAAAAGTTTTGCAGTGTCATTTAACACATTTCTTTTGCAGACCCACATCCACCAAAGTTTGAATATTTCATGGGAACCGTATGCACAGAATTAACTTGAATTGCACTGGATTTAGTCTTACAGCTGCACCTAACATTTAACTCTGCATATGCTGCTCCAATACAGACCAATAGTAAAAATGCCACTGTGATGCATTAGTGAATTACCTACCCTTAGCTCTTTCATTATAGCTCTTGTGCATAAAAATGCACAAGAAAGATCATGTTACTCTGTTTGCCACTGTTGTTTCTCTCACTAACCACTTAAAGAATATGGTCACCTCATAATAAGAGTAAATACAGGGCAATATTGGAATTTACTGCACATTAGGACTTGGTATTTGCTAAGAGCAATCTTAGGCAAGAAACACAATTGGATGATTGTAAATAGGGAAAAGAAGATGAGGACATCTTGGAGGTGTTACATAACTATCACTTCTTCATCCCTATCATAGTTGGGTGAGACAGGAACCATAATCATGATTGGTAATTTCCATTGTACATGCCAAATCATAACCCAATTCATGTGCCATGAAATTGGTTTAAATAAATCAAAAGTTACAGGGTGTTAGTTTGAAAGTGGCTTATAGGATTCTCTCTTGTCTGAGATGATTGCCAAATTGGAAAGTATGATCCACTTCAGTTCAGACAGGTTGTACAACCTAGGTAGGCCTTTTTTAAGGAACTGTTGTGCTTTTGTTTGAGGACCAAAAGCCCTGATGATATTCATCCAACCTCATCCTCTGTTTGAGCACGTGCCTATTAGAAAAGGGTATAAAGTATAAACCTAATTCATTGTTTATAAAATGATGAATCTAATTCATAACGAGGCTAAGCATCTCCTAGACGATAGCCAGATGGCTTTGGCTTGCTAGTAGGGAAGGAACTAGTGAGTGAGAGGGGTCAAAAGGGGACTTATGCAGTTCATTGTTAGCTTTCAATGGATGATCTGAATGTATTTCCTATAATCTCATCATACTAAA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