Difference between revisions of "Os01g0108200"
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Revision as of 18:42, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0108200 |
|---|---|
| Description |
Similar to Prolyl endopeptidase (EC 3.4.21.26) (Post-proline cleaving enzyme) (PE) |
| Version |
NM_001048322.1 GI:115434057 GeneID:4326161 |
| Length |
11625 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0108200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:436614..448238 |
| Sequence Coding Region |
440328..440437,440514..440733,441605..441805,441915..441985,442058..442217 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgggttctgttgccggcgacgccgcccgcctttcttatccacccactcgccgtgacaattccgtcgtcgacatgtaccatggcgtccctgtcgccgacccttaccgttggctggaggacccagagtcggaagataccaaagaatttgtggcaagtcaggtggagctagcagagtctgtgcttgcgggctgcttcgacagggagaaccttcgccgtgaggtcactcgcctcttcgaccacccgcgccacggggcgccgttccgtcgcggcaacaagtacttctactttcacaactccggactccaagcccagagcgtgctctacgtgcaggatagtttggatggagaggcggaggttcttctggatccaaatgcactaagcaaggatgggacagttgctctttcgacgtattctgttagcaaggatggcaaatacatagcttatggcctaagtgaaagtggcagtgattgggtcactattcgtgtgatgaacattgctgataagcagactttgtctgacaaattgtcttgggtgaaattctcatctatcagttggacccatgatggaaaaggttttttctatggtcgataccctgcaccccgagaagtggaattggatgctggaactgaaacaaacattaatcttaatcatgagatatattaccatgtcgtgggatctgatcagtccgaagatatattatgctggaaagatcctgaacaccctaagtattcctttggtgcatcggtcacagaggatggaaagtacatcatactaggtacttatgaaggttgcgatcctgtcaataagctatactactgtgaaatttgtactcttcctcaagggatagaggggttcaaagagacaaaggggatgcttccatttgtcaagcttatagataactttgatgcccaatatcatgttgtggcaaatgatggtgatgaatttacatttttgaccaatagaaatgctcctaagaacaagcttgtaagagtagatatcaagaagccagaattgtggactgatattcttcctgaacatgaaagagatgtgctcgaatcagctgacgcggttaatggtaaccagttattggtatgttatatgtcagatgttaagcatattctgcagataagagaccttgtaactgggaacttgcttcataagttgcctctagaaattggttctgtttcagagatctcctgtagacgggaagacatggacgtctttattggcttcacaagctttctttcccctggtattatttacaggtgtaacctcacatctgcgatcccagaaatgaagatatttcgtgaaatttcagttcctggatttgatcgaacaaattttgaggttaagcagattttcgtcaatagtaaggatggaaccaaaattcctatgttcataatgtcaaagagagatattgaacttgatggatcacatccaactttgctatatggttatggtggattcaacataagtcttactccttctttcagtgttagtcgtgttgttttatgcaagaacatgggttttgttgtctgtgttgcaaatattcggggtggtggggaatatggggaagagtggcacaaagctggagcacgtgcaatgaaacaaaattgttttgacgacttcattgcttgtgctgaactcctcatttctgctggttatacgagttacaggcagttatgtattgaaggtggaagcaatggtggtcttctgattgctgcttgcgttaatcagcggcctgatctctttgggtgtgctcttgctcatgttggtgttatggacatgctccgttttcacaagttcaccattggtcatgcctggactaccgactatggttgttcagacaatgaagaggaattccactggcttatcaaatattccccccttcataatgtgaggagaccttgggagcaaagttttgttaactgttgtcagtacccagcaatcatgctgttgactgctgatcatgatgatcgtgttgtgccattgcactcattgaagttgttagcaacactgcagtatgtcttgtgcactagcattgaggatacaccacaggtcaatccaataattggtcgcattgacgtcaagtcagggcatggagctggcagaccaactaaaaaaatgattgatgaggttgctgatcggtatagcttcatggcgaacatgttagatgcgtcatggacggagtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MGSVAGDAARLSYPPTRRDNSVVDMYHGVPVADPYRWLEDPESE DTKEFVASQVELAESVLAGCFDRENLRREVTRLFDHPRHGAPFRRGNKYFYFHNSGLQ AQSVLYVQDSLDGEAEVLLDPNALSKDGTVALSTYSVSKDGKYIAYGLSESGSDWVTI RVMNIADKQTLSDKLSWVKFSSISWTHDGKGFFYGRYPAPREVELDAGTETNINLNHE IYYHVVGSDQSEDILCWKDPEHPKYSFGASVTEDGKYIILGTYEGCDPVNKLYYCEIC TLPQGIEGFKETKGMLPFVKLIDNFDAQYHVVANDGDEFTFLTNRNAPKNKLVRVDIK KPELWTDILPEHERDVLESADAVNGNQLLVCYMSDVKHILQIRDLVTGNLLHKLPLEI GSVSEISCRREDMDVFIGFTSFLSPGIIYRCNLTSAIPEMKIFREISVPGFDRTNFEV KQIFVNSKDGTKIPMFIMSKRDIELDGSHPTLLYGYGGFNISLTPSFSVSRVVLCKNM GFVVCVANIRGGGEYGEEWHKAGARAMKQNCFDDFIACAELLISAGYTSYRQLCIEGG SNGGLLIAACVNQRPDLFGCALAHVGVMDMLRFHKFTIGHAWTTDYGCSDNEEEFHWL IKYSPLHNVRRPWEQSFVNCCQYPAIMLLTADHDDRVVPLHSLKLLATLQYVLCTSIE DTPQVNPIIGRIDVKSGHGAGRPTKKMIDEVADRYSFMANMLDASWTE</aaseq> |
| Gene Sequence |
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