Difference between revisions of "Os01g0229900"
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Revision as of 18:47, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os01g0229900 |
|---|---|
| Description |
Similar to Shaggy-related protein kinase dzeta (EC 2.7.1.-) (ASK-dzeta) |
| Version |
NM_001185313.1 GI:297719760 GeneID:9272170 |
| Length |
11401 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os01g0229900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:7196039..7207439 |
| Sequence Coding Region |
7202594..7202641,7202738..7202863 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008394:7196039..7207439 source=RiceChromosome01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcaaatggtcgtccattccctcctctgttcaacttcaagcatgaactagctggcgcctctccagaactcgtccacagattcataccgtaccatatcagacggcaacatggcctcaacttgcgcatgctgggagttagaatggcaccgttttgttcgtttatttttccatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MANGRPFPPLFNFKHELAGASPELVHRFIPYHIRRQHGLNLRML GVRMAPFCSFIFP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6556..6603#6700..6825#gtctcccccgctgcttgcgccgccgccaagacgagtcgcggctgagcatgggagggggcggcgatctccatccggcgagcagagcaggggagaggagaggatcctggtgaggggctgcgatctccatccggcgatcttctcgggcgctcgcgcttccggtccccccaggcggcgatggcggccgcggcggttggggtcgcgagcagagcacgccggagttctggcccgaggggagtggcattctgccgatggacgaacggcctcctccacccgcgcttcgtcttccccgaggccgccgcggtggcgggctcttgggctggctccgctcaaggtacaatccgccgtgaactccctaggttttctttttggtggctcggttgcgggatctaccgcgcgtttgggattccgatgggtgcgcgcgcgcgcgcttcgcgttccgatcgatcgttcatcagatcaatgtgatgtgatgcctgtcgcatgattcgagttctagatagtagattgatgcattaattcatttgcgtactactctgaaatttggggatgtgagtagtaggttatctgaacatcacgggatgctatcggaccaaagtaattagagaatttccctagggtgtttgggtgctggattggagatgtttagagtggagactggacaatctacgttgcaggagttcttctggtgctacacacattttgcatccacttgtttaagcttatgctttaggaaatgtgctgctctgccccggcaaacacgttgcattaggaaatgtgctactctatagtgaactgcggaattaattcctcaccatgttttttctttggggatacagactgcattgcattgagaaacgccattatgccaatgaaaatttctccatatgcttcctatactggttcacatagtgttcaacactgtaagttcccgacagctggaacttacagcatcctcacttcctgtgcccatgttctgaaccgttccatatgcatttcccacttgatgttatttcaaattgctgtgttccacttttgggccatatatctggcagtaattcaaacaaatatagttttgccaggagttctagctaacgtctcttcccggtccttgagatcacatctgcttggttttgcatgtcctattgtttgaaacttgctgcctattagaacctccttagttgtctcaatacttttacttttattactgccatattaattatcttgttgctgagccctgcaactaaaaccctcctccccccctctccactgcagagcagagcgtgaccacctcagacaaacccgaggttttcttcttctcctttttgatcgatgcagccgtcgttcttgcggggaaagggttctttttttccttttttattttgtggaggcgcggccgtgggtgatgggcggtggctgatgatcgggggattaccaccaccttcgcgatctctctttttctctgtggaattggggtggatggatggatggatactctgttcatagatggcgacggtccaagtttattcctttttatttttatatgttttttccttgttggatttgttctgttgctgtagttgccgtttcttggcttcttgctttcaatgtgttctctcttctccttctcttttttctttctttcttttttcttgttgtctgttcttgggggtaatggtgtcccaatcgtattggacaagccttcgcgcatgtcactgattggaattggagtgtggagttagacgccgacaggtgaggcagatgaacaagagttcccaacccaaaagttcactgatgaagtgaagtgtaaataaaataaaaagtaaataaaagggagaaaatactagtagttgcttgggggagttgggattctccaaaagatagtgtccttttttcttcctttttcggttacgcttggtgagaagatgatttatttggagatggtggacgacgcctatttctgttttctggctgtctaattctgatgatggcgtctcatgtttttcaggtgcgttttgcgtgaagtgggttttaaggatggttctaaacaaggtgctcgagctattttgtgtgaagaagaaggattccaagaagaaaggtgctgcacagctgcactactgcccctatttaacatcatctttatgtcagctgcttctgtttgtttgattaatcctaggatgctttcctcatctgatggcatattatcagttcgttttgtgcactctttcttccatgaattctgcattttttttcaaatatgaacttgttttcgggtgaaaggatactgcagattaaatggggttgtcataatggattgaaattattggataattgtggctgctgtacattattgctatatcagatgctttgaggttaacaaagtataccaaaatgtgatatgtttagtaaacttaatctcaacagattgagagtgctactagtgtgattggatatattcactggagagtgaacttatgaatagtctggtattatgaatccatgagtcttggtgatcaatattgttttgaagtttgttaaactgtatatagaaaaaaaaaacttaatatttcattagcctgtatacccagccacgaaatccgcatctccctctgaagcatggaattctccttattttgtttcagaaagataaaatcaagtgttttgctcttctgcctggagttttctaataaaagaatattttcatgcaggcaaagccattaatcctctttgtaaaggtatcttttcatgcaacttgttcctccttatttgtttttgtaaggggctgtttgggaaacagggacttattccaagtccctgtcacattatttagagtattaaacatagactaattacaaaacccattccataaccttggactaattcgtgagacgaatcttttgagcctaattacgccatgatttgacaatgtgatgctacagtaaagttttgataattatggattaattaggcttaaaaaatttgtctcgcggattagctctcatttatgaaattagtttttttattagtctatgtttaatactccaaattagcgtccaaacatccaatgtgacagggactaaaaagttttagccccatctaaacagcccctaattcttatgtttcatgtagctgaacctgttcttttaaaaaattaaaatgaaaaaaaaatagcacccccacccccctgtttaccccaataggggatatttgttactttaacagaactacacattatctaaatgttcatcactatttgctttggtgtcagtaggtagtattgatgcaattaaacctcttttttgcagttaaatgagcttcagtatcccattctgtatctatgtctttaagattggtgtgtgtttttttgtaacatcttggtttgaaactagttactctactggctttcagttgccgctccacaccccactgcaaatgtcagtacaaacaacagccttttggatcccttttcaactgggaatggtactgtgctatctgtgcaaaaacatgagcctgaatgttcaagtgttatatcatcaatgacaaggacagaatatggatttgaaagtgatggttgcaattcgtttagccattttgatgttcaagatttttctgatcattactatgcaaagaattcaccagggaaggtaagctgtgcattttatgaattctatttctatcaatagatccaactgtgaattaatttcctgtctttatctgtggccactgatcagacctccaaagattgggtgaagacaatccagaatgaatggaggcttctacagaaagatctacctggtcagtacatgcttttatatggcaaatcattgtattcaattttatcaaaccgtcagtgcctagatggtgaacacatataatggtcctttcttatactgacctctgttttatgccaattatatctgatccgtttgacatgccaacagactatgtttgaaatctttcttgagttaaaggtagtcacatgctctgtttgggtttgaataggatatattcattggttataccaatttgtttgtggttgggagttttgtcacaactgttgctgaatcccaaactagctaatgacattgtctatgcttgatgtataaaatactttattcgtgctatatctggtttatctgttagtttttgttaatgtgtcacatatcttttagttatggtctgcatttatcgtcccttttccatgcaatcttgtcatagaagcataacagtcttcagaacttaatcttgctaagtttgggtaatgggacaaatggaaaagaatgtacatatctcaaatcatgttgctgaaggaagctaatgtatcacaagtatcattacatacagtttacatttgcgccttaagtttttcgtttagagcaactgtgactgaaattagctgatgtcttcaatactagaaacttgcatctcagtctggtttcaatcatgcagaatctatctatgttagagtttatgaggataggattgatctgctgagggctgccattgttgggccagctgaaactccatatcatgatggtctgttcttctttgatgttcactttccttctgaatacccacaatcccaccggtatgaaagcacttcacacatgctttccaccattattttcatgttactaccaccattggtataacctctttaaaataatatgcaacgtgtacagaaagttcattaccatatgcatttcccacttgatgtaatttcaaattgctgtgttccacttttgggccatatatctggcagtaattcaaacaaatatagttttgccaggagttctagctaacgtctcttcccggtccttgagatcacatccgcttggttttgcatgtcctattgtttgaaacttgctgcctattagaacctccttagttctctcaatacttttacttttattactgccatattaattatcttgttgctgagtcctgttttgatgattatgcacaaa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