Difference between revisions of "Os01g0607600"

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Revision as of 18:54, 22 July 2012

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os01g0607600

Description

Similar to Transcriptional corepressor LEUNIG

Version

NM_001185528.1 GI:297720190 GeneID:9269401

Length

10656 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os01g0607600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:25609646..25620301

Sequence Coding Region

25609646..25609672,25609766..25609876,25610096..25610176,25610600..25610719,25610823..25610987
,25611079..25611228,25611300..25611409,25612136..25612253,25612332..25612562
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,25616131..25616218,25616745..25616836,25616935..25617264,25618219..25618328
,25618545..25618642,25620273..25620301

Expression

GEO Profiles:Os01g0607600

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggtagctatgtttggaggttcaatcttgctggacatttacatatatgactattttgtcaagagaaatttacagacaacagcaaaagccttccaatcagaaggaaatgtctcaacggatccagttgcaattgatgctcctggtggctttctttttgagtggtggtcaatattttgggatatattcatagcacaaacagatcgggaacattctgatgttgcaacgtcatatattgagactcaacaagcaaaagcagagcatcaaaaacaacagcaacaacaatatcatcatcaacaacatcagcatcaacaaatacaaatgcaacaaatgttattacaaagagctgcacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaactgcatagagatggttctcatctttttaatggtatcacaagtggattttctggaaatgatcttttaatgcgacataaccctgctattgcaaatgctatggcagtaaaaatatatgaagagaggttaaagctcccttcccaaagagattctttagatgaggcatcaataaagttgcaacaaagatatggggaaaaatatgggcaagtgcttgatccaaaccaagcatcattgttgaaagcagctacatgtggacaatcttcagggccaattttgcctggaggtattggtgacttatcaagtactctgcaacaagttcaggcaagaagtccgcgacttcctattccagaacagaatatcaaaattaggatcaatccaattttgacaaatagagatgttatttctgatggatcattacttggtctacaaggatctaatcatggtggaagaaattttatgctgaaaggttggtcactcatgcagaagccgctcctacaatcaccccaacaatttcaacaactccagtttctaactccacaacaacaacttttgctgcaaacccatcaaaacatggcttcccttccagctaatgatgtagagactagaagattatggatgcttcataacaacaaaaatatggccattcatctagatggacagattaataataatagtggtcatattattccaaatattggttcccctgaccaaattggtggatcacgtaataagatagatatgttaatagcgaaaattgctcatttacaacagttgcaacaacagggtcatagccagcagcaacagcttcaacagtctacaatctcccatcagcaggctcaaagcttgaatcagcttcaccatcaacaggctcaaagcatcggaagtatgctagatgggagcataccaaattcttttggattagctaaccgagcatcaaagaagagaaagaaaattgtctcatcctctgaaagagctaatagctcaggaacatcaaacaatgttgggtcgtcttcaagttctgcaccttcaacacctttcactcacactccaagagatgaaatgtccatgccacaactgaagtataatggtggtaaatcaaaatcattgtctatgtttggctatgatgacaccaaaagcttgatctctccaacaaatccactgggtgatgtagaccagttgcaggaagatggctccttggatgaaaatgtagaatcttttttatctcaggaagacatggatcctcaggagaccatggggcattgcatggatgccagtaaagggtttggttttatcgaggttgcaaaagctcgtgcaagtacaaacaaggttgattgttgtcatttctcgtcggatgggaaacttctagccacgggaggccatgataaaaaagttgttttatggttcacagatgacttaaacattaaagctatatttgaagagcattctatgataattacagatgtccgatttagctcaatcatgactcgtcttgctacatcttcctttgacaaaaccatacgggtttgggatgctaacaatccggagtattctctccatactttcataggtcattcaacatctgttgtgtcacttgattttcacccaaataaagaagatataatttgctcatgtgacagtgatggggaagtgcgttgctggagcatagataatggtagctgcgtgaactgtgttagggtatttaatggaggtgctattcagttgagatttcaacctcaccatgggaaatatcttgcagttgtctcagaaaagatgatttccatactagatgcagaaacgctgcacatttataggagtgatctacaggggcacttaaagaatatccattcagtttgctgggatgctacgggtggctacctagcctctgttagtgaagattctatcaagtctttggagctgtgggacatcagggagaagaatatcgtgaccattaacaatgctcatgatggcatgattccatcgctagcagcatcaaatgcatcagggttgattgcctcaataatcataggacaaaatggcagctaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MVAMFGGSILLDIYIYDYFVKRNLQTTAKAFQSEGNVSTDPVAI DAPGGFLFEWWSIFWDIFIAQTDREHSDVATSYIETQQAKAEHQKQQQQQYHHQQHQH QQIQMQQMLLQRAAQQQQQQQQQQQQQQQQLHRDGSHLFNGITSGFSGNDLLMRHNPA IANAMAVKIYEERLKLPSQRDSLDEASIKLQQRYGEKYGQVLDPNQASLLKAATCGQS SGPILPGGIGDLSSTLQQVQARSPRLPIPEQNIKIRINPILTNRDVISDGSLLGLQGS NHGGRNFMLKGWSLMQKPLLQSPQQFQQLQFLTPQQQLLLQTHQNMASLPANDVETRR LWMLHNNKNMAIHLDGQINNNSGHIIPNIGSPDQIGGSRNKIDMLIAKIAHLQQLQQQ GHSQQQQLQQSTISHQQAQSLNQLHHQQAQSIGSMLDGSIPNSFGLANRASKKRKKIV SSSERANSSGTSNNVGSSSSSAPSTPFTHTPRDEMSMPQLKYNGGKSKSLSMFGYDDT KSLISPTNPLGDVDQLQEDGSLDENVESFLSQEDMDPQETMGHCMDASKGFGFIEVAK ARASTNKVDCCHFSSDGKLLATGGHDKKVVLWFTDDLNIKAIFEEHSMIITDVRFSSI MTRLATSSFDKTIRVWDANNPEYSLHTFIGHSTSVVSLDFHPNKEDIICSCDSDGEVR CWSIDNGSCVNCVRVFNGGAIQLRFQPHHGKYLAVVSEKMISILDAETLHIYRSDLQG HLKNIHSVCWDATGGYLASVSEDSIKSLELWDIREKNIVTINNAHDGMIPSLAASNAS GLIASIIIGQNGS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>10630..10656#10426..10536#10126..10206#9583..9702#9315..9479#9074..9223#8893..9002#8049..8166#7740..7970#7043..7222#5659..5928#4588..4637#4279..4354#4084..4171#3466..3557#3038..3367#1974..2083#1660..1757#1..29#atggtagctatgtttggaggttcaatcttgtatgtctcacgagtaggaggatagtagacgtgagtttgggagctggggtttcagggaaaccccactttgttgttttggatggttttcaatagtttgtttggcttgtgaaaatgatttaaagcataaccatttggggtctaggtctggaatgcctcaagaaaacaaagtaatggaccagggagtggggtagatttcctcttgtctccagaaaatgttgtttgtgacaataggtgaatcctaagtattgcttgtaaagcgggtcatacaaggaataatatatgccttgtttatgaccgagaggggtctcaatatctaaaaatatttagtacaattttgtcttggttattttagttgggagtaaattgtattcacgatacatcaactttacaagtgggtataacttaagaagtaaccatacgggtgtactcgctccatcccgaaaaaaacgaatctaggacgggatatgacatattctagtacaatgaatctggacaaaggtatgtctagattcgtagtactaggatgtgtcatatccagtactaggttagttttttttacgggacggagggagtaccaacttggaatgtatgtgtaatggttgtaccattacttaagaagtgagcatgttagcgcattaacttgatttttttaattagcatcgttttgctatacatgttcaatttccaagtatatattttctcaatatataacatagttttatatagcatatttaatatgctgtcattctagtaattaaaagtcaattaaattgtattatttagaaaattttgtattttggtttaaattgtagaaggtgaagaaacaaatccaaactagtggtgcaaattgaatgagtaacataatttttatagattaaatgcaagattgtaaggtaatatctgcataactggtatatgatggcatataaacatcatgaaaaaactcatctagcatttctgaactaaaacaacacacatctagccaaattgttgcacaaaaatgctaaattgtcaagtttcttttactagaacgtacccatttgccaagttgatgcacttagatgttcaattctcactttcttgtactactagatcatactcgcatgtcaagttgttgttccaagtttatactattttactgggattcaggtcttcttttagttgtgaatgtagaaatggctagtttttgtagcattctaattgcaatacggaatttgagagtactgttattgttaatgggtatttttgtaaagtctggactttgtaataaatggattagccaaagcttgttttgttttgggctatcatttaacaggcttattgatgagtcttggtgatttctataatatcttgtggaagcgtacataacatagtgtgttaatgcacctttctaatatccgagagaaatcccagttccagaaacactagaacaaaacatggttgctttctactattatttaacattttcatttctaagaaatatcaaaggtgaaaaaagtatacaatgtgtactatcatgtatctttctacatcctttttgtttacaacattattgtatgataagttaaaatttatctgtttcagaatccatccttggaaggactaatttattgagtgtgtaacaaaacaggctggacatttacatatatgactattttgtcaagagaaatttacagacaacagcaaaagccttccaatcagaaggaaatgtctcaacggatccagttggtatgcatctccctgattctttttatggagaatcacctagaaagttgccatggagctattttttttggcttgtgtttgccaccgaattttagtgattggaagttttttttttgacttaattagtgattggaagttgctatggagttatttaatttggcttgtgtttgccacaattttaatgatattacttacttccttgaattaactttcatacagcaattgatgctcctggtggctttctttttgagtggtggtcaatattttgggatatattcatagcacaaacagatcgggaacattctgatgttgcaacgtcatatattgaggtgtgtatctgtgcttttatttatccttttatgattataatttccatctatgacaaatgctactaattagggcctttcattcttccttttctgctacatcacaacatagaaaattctttgttgccttcataaaccatgtataatgtagatagttgaaccattaaaaactcaattttatctacttcataatgtggcatgctagttaaatcatcaaacatttttccagtgaagcctatttggattgctaattgtttgtcttttatttgttagctccagtttagcctgttgataacctctttcaaatttgtcatatgtatttcatctggtgctaagtgtagtctatgaactttatagttgagttgcatacttgatgatgcgtagttttggattgaattaaataataaagcaatgcccaagtgcataaaaaaattgcagaacaatagacaaagaaaaaatggagcacctatcacccattttgtagcatgcctaatgggagcctttgcctactcccttgtgcaccacctacataggcactgcacatgtaatgggcttctgttatgtctgatctacatgatgcattggaaaacctagtaccttattgtgacaaaccgtagcttgtctcatgttgccttgatgtgaattagagtcatgagtatagtgttacgaagagtagtctggcttggtcatggctgaaccgccttgacgtgatattttaggatatttactacaactaatgggtctttgcaggtaaataagcttactatttgaatgatgttactttcgcaataaatgaagtatctttttccatgtgtagtttctgcaggacaagaaaataattgtatcacctccttaattctcgtgtacgagtgtaaaatgacttgcatttggaatatgatgcatttttcacatgaatagataatgctaattaaattgtactttgctaaaatctttcagactcaacaagcaaaagcagagcatcaaaaacaacagcaacaacaatatcatcatcaacaacatcagcatcaacaaatacaaatgcaacaaatgttattacaaagagctgcacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaacaactgcatagagatggttctcatctttttaatggtatcacaagtggattttctggaaatgatcttttaatgcgacataaccctgctattgcaaatgctatggcagtaaaaatatatgaagagaggttaaagctcccttcccaaagagattctttagatgaggcatcaataaaggtaccacaccaagtccaaccttcctaggctcctatctgcctcttagataatgcgtttttggttgatctaaatcttgcgttgttgtgctgaacttatagttgcaacaaagatatggggaaaaatatgggcaagtgcttgatccaaaccaagcatcattgttgaaagcagctacatgtggacaatcttcagggtattttcttgcactttttttttgttgtactaacatcagcaaagtttacttgcaaagatcactagaacttagtagatgcaacacactactaaattaaagtaattgtgattctttattctttttcaatgtatgctatgttcttgttagaaaattattatcttaatcatgcatgtagtttgctatgatatacatttgtttgcacctagtaatttcattttgtatatgtatgcacatagttagaattttgacattaggaacactatattattttattgggtattgcattgcgtgtacacttataatattattatggcgtgtaagctatgtagctttattcttaatagtgtaagttcatagcttatccagacctgccatgatacatgaatcatggttaagccattcagaaatgaagttaataaccataccagcaaggattacttgttgacttgttggatgttcaatgcatgtagcaactagcaacttgttgtacatgtgctttcatatagtattgacacatacctttcaggccaattttgcctggaggtattggtgacttatcaagtactctgcaacaagttcaggcaagaagtccgcgacttcctattccagaacaggttaatttgaattgtatactgcttatcacctctcaccataccaaatacaaaataacataagaaaaaagattattaccaatttcatcttatcatgatattcttggcagaatatcaaaattaggatcaatccaattttgacaaatagagatgttatttctgatggatcattacttggtctacaaggtaattttcatctagcttgaacccttgaattactgttctaccttgcctagtaaataattcatgtttcaactttcactttcctttttagttcaaaactcgtaccgctttttagtctaaaaaattacatgagttttgattcatgttgaattcttcaggcgattgttattggtatgcaaagttgcataattttattggttagtttttgaagctaaattgagatgtcattttaataggatctaatcatggtggaagaaattttatgctgaaaggttggtcactcatggtaagctttagagccaactattatcttgtatttggtttaagtgcattttcttttctctaggagacgttggagacatttattttaggaaattacatattgcaaaaaacatgggtatttaataaaaatatgtatgcattaa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External Link(s)

NCBI Gene:Os01g0607600, RefSeq:Os01g0607600