Difference between revisions of "Os02g0581400"
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Revision as of 19:17, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os02g0581400 |
|---|---|
| Description |
Similar to 2-succinyl-6-hydroxy-2, 4-cyclohexadiene-1-carboxylate synthase (EC 4.1.1.71) |
| Version |
NM_001053780.1 GI:115446930 GeneID:4329786 |
| Length |
10858 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0581400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:23273153..23284010 |
| Sequence Coding Region |
23276510..23276512,23276891..23277001,23277065..23277259,23277491..23277589,23278212..23278265 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MDLCLQSNKIESFIRRCSNINLAWASFIVEEFVRLGFTYFCIAP GSRSSPLALSASVHPLTTCISCYDERSLGFHALGYGRGSRKPAIVITSSGTAVSNLLP SVVEASQDFVPLILLTADRPPELQDVGANQAINQLIQQPTMPCKHHKGQCI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>3358..3360#3739..3849#3913..4107#4339..4437#5060..5113#tattcactccacccacctcgccggaatgctcgccgtcgtcttctcctccggtcaccgcctcctccccctccccgtcctccccggcacattcaccacccctcctcctcctcctcctcctcctctcctatcccctcgccgtcctctgctcgcccctcgccggcgccgctgcctatgcggcggcggcggtggcggcctcctcctccttcgcgccgtcgccgcgaggcgcgcgggcatcgtgatcgacgtcgacgaggtgggcgaggtcggcgaccgcgacctccccgtggacgtgtcgttcacccggaggctgccgccggtgctcaccctcggggacggcctcgccgcgctgcggcgggccggggaggaggtgaaggcctgcccgcctgccgccgccgcgagcggcgtcatccggttcgaggtgagccgcccagcgaggctgtgtgggaggggatatgtcgtgttttacagatttgcagttggtttcgttgtgagcagccgctgcaatatttgctgcgcggcggcgaggcgacatgctcccccccctcccttacgaattttaatccagcactgtgaaattattgaataatccactcagctccttgacgcaataggcgtaaatcgagctcgcgtctagctcattgtttatgctttgcgatgcatttggatttgtttatcccttacggtctaagcaacaagtgaaacaatgatgattaattctcagttctgacaatgcaacggtgcaggtgcttgttccacccagtacgaaggcgctcaaatggctgtgcacacagtttaagagatcatcattgtttcctcagttttatttgtcgaggaagcaaaccactgattcatcaattcagcttgaaatctctggcgctggctctgcaatttgctttcatggttcctctcgagtagataatgggtttgatttgatatcaaggtgcctcctctctattgctttccgtagcgtacgtgtgatgcagggtgtttctaactaaattaggacctgtttgtccctgcagatatctttcgtttaattcacacttgattagagcctatggatcagtaggtgttaaatatgacaaggaactattgtctttagaggagagaattggttcattttacttctttattcctcaggtaacaactttcagtattctgtggtgctactctagctacctgaatatttatcaagttggtgcgagatacagactatgtgtacaagccattttgaatttagcaaggaaaatcctcgaagttctgtgatatgacattccctgtataaatttggttacatggtttaatatcatattgtcagacaacagaaacagttttacacctgaatttttcttgttagcctttttatgattgtggtggggtcctcaaagtaatccgttggtgcaaagaaagtcctattctgaacatgcatgagtggcacaagtactgcacttatatctagaaaaatgacatagaagttagcctattagaacatttttttaatgtattaaaaagatctacataaacaatttacaagaggatcacaacgctttatgacctactttgactggtaagttattgcacagaaagtaatgcaaatgcaaagggttaaaagtggaggtcaacttggttgaggatttttcttgcattcttgcatacaagtcacataggaggcagtaagaatttacagaattctttcttggttatcttctgcaggcataatgtagatatttgatcttatagcattcgtgatgatcagcaaaattgaatttacaggttgagctgagtgaatttgatggctattccatgttatcgtcaactattgtttgggatgactccgtgtctcacacatttgaggattctgtttgtttatttgaatcttgtttcagtcaggtatgtggaactaactagattaagaaaaaaatatatttaattctgtttaactttctttcatattaatatagcatttccatgttcttttaaaacaattaattttctgttttgtattttcccctgtaagatatggagtagctatgattcttcagctactatctgttatgaaaacatggtaacaagttacattggagaatcgcgtatgtcagagagcaggaatactcagttggtacatatttctatcaatcttaatcactttgttaatttcatgaatttacgcttgtgccatttgttctccactctgcaaagtccatctgtgatgaagcttcagttgtatcaggccttcacatgaacactcatattcactattccgatgttcttacttctatgccttaattagttcacagggttttgagtctgaaacattatttagttatattacggaggattataatagcagagttttgtgatgtgctctactgaagtttgcaacaattgcttctccaatctctaatggccattcttcccaccattttgtttttggttgaatgataaaaaaaatcctctttttcaacaaaaatagataaatgaaacgtctatgccttttaacatatagaacatgctggcttccaaaaaaattagctatggctaatgatatagattgggtgctcatattgtattccatacagagttttggctattcatcgttaaccagtttgtgagttatggaacatagttctagtttgcacgcaaacactctttatagctgtttatgtatttcgacagttatctgctattcctattatcatcagacatcaaagtgctcaatttgattttgttgaatccactgttccaggtatacttggatgctgaatttctcgctgtaatagatggcaaagctgtcacggaaaaggtatcctcttaaccctggtaagcttctttaagctatttcattactttgcaattgagattaatccctggttttaatataagaaatgccccttgcaaaaaggaatattatgtttctttctttgcggtttatggatattttgtctgtatcttgctggaaggcacattcacacctatcacatttataatagtaattcaagattattttttttacgtccctgctgccctgcattacctggtaactaacaagtttgcctacctgttagttagttgaattgcttttgaccaactccacaaattcatggaccaaaaagttaaagtcaagaagttcatgggtacacatagacctcgccacaattattaggacagacataattttcctattatttcctttttaaactttttgttgttcatgttctcttataagactagacacaataaacttgaatttatatccctgatcggatatggaacttattcttttgtctgtaggagaattgcccaacttctgatcagtcatttgttcggttttcgccgcagttcttgttttgtgcaaacatggtaatggtttctacctgagtttctttttttcataaataaccattaaattattttgttaaatacttcctccgtttcacaatataagtcattctagcatttcccacgtttatattgatgttaatgaatctggacatatgcctatctagattcattaacatcaatatgaatgtgggaaatgctagaatgacttacattgtgaaacggagggagtacaagctttctgtagtaagccttttcctacagcattttctactttccaatttaaaaaaaatgatgcatataattagaatatgatataattggtgggttagcttaaaaacagatagtatgtaatttgctctctgtaattgaagttgtacttatctaatttttttataggatttatgtttgcaaagcaacaaaattgaatctttcattaggagatgctctaacattaatttggcatgggcatccttcatagttgaagaatttgtcaggcttggttttacggtaagcttaactgaatacatagctctagcgtttttaccatgcctctgacctggtttgctttagtacttctgtatagctccagggtcgagatcatccccacttgcactttctgcttcagtccatcctttgacaacctgcatatcatgttatgatgagcgttcacttggatttcatgctcttggctatgggagaggttctcggaagcctgcaatagtaattacatcatcaggaactgctgtatcaaatctccttccttcagtgagttggaacatttctctttcttactttttttatttccttacttccagcctttacagaaatacccaccatttgctgaaatcacaattcaacaagtcttgttgctataacttcatctgtgtagtgtatacctttatgctctctatgtgctactacaggcaatccatgcagtaatggatatatcaactattgagaaatagtctatagtgtttaatcaagattcatatgtaggtggtggaggcaagtcaagatttcgtaccacttattttactcacagctgatcgtcctcctgagctgcaggatgtaggagccaaccaagccatcaatcaggtattgtaactgaatacaatattacaaaaactaaaagtttctggcaatagctcctattctgaaaagagcttcgaatcagcactgttaattcagaattttggctaccttttaattgccttaaattgcttataagtattgtcatgcacataaagccaatcatgttgttcccttaactatgttttagtgtttattttatttctcagcaccatcaaaattatgtcctacctgtacaatccatatatattcctcacatgacctatgtgtctcactcaagcaaagacatatacagaacactagtcaaacccatacagtgaacttgagaagcaaaggcctatattcctcacgcaataagacccatacagtgaacttggaatttgctggattaccattccagtttatgcatatagttttatgtttatttccttttaatggcatactgcctctatagcatatgcaaacttatctggtaagcctatgatgttcttctgttattc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