Difference between revisions of "Os02g0597300"
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Revision as of 19:18, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os02g0597300 |
|---|---|
| Description |
Hypothetical protein |
| Version |
NM_001053861.1 GI:115447092 GeneID:4329870 |
| Length |
8204 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0597300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:24069570..24077773 |
| Sequence Coding Region |
24069640..24069673,24070655..24072663,24077451..24077612 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgtcctttcttcaatattcaagtcttgtccctgattacacgggactacgggaggatgctaagtgttctatggtactcagcatgcatgatttgatgcatgatcttgctagatgtgttatgggtgatgagctacttctaatggataatggaaaggaatacaactctggagaaggcaattgtcggtatgcattactaatcaattgtgtcgggcaaacaaagttctcctattcatctactaaattaagagctatgcgttttttcaactgtgatggaattcagctacccttatttacaaaatctttgcgtgtcttggacataagtaagtgttcttgtggaaaattaccttcatctattgggaaattgaagcaattgaagttccttagtgctactggcatgcaacataaaacaattcccaagcatgttatgaaactttcaaaacttatttatttgaacataaatgggtctttgaacatttcaacattgccaacatcagtgaacaaactgagatgcttgctacacctggacctatctggttgtagtaacctttgttcattgccaaactcattcggtgacctgacaaatctcttgcatttgaacctagcaaattgttatgatcttcatagtttgcccaagtcttttcataggctaggtgaactccagtatctaaacttgtcacgctgtttatcattaaatttaatggttgacatcaatgctgtgtgctgccttacaaagctacagtacttaaacctgtctcgttgctcaagtctcatccacctacctgaaacaattaggggtctaaaagatctccacactttagatatctcaggatgtcaatggatagagatatttccgaaaagcatttgtgagatcaccagcctcaaatttctgctaatacaaggatgctcaccctggttagagaagcgtgtgagggagtctcagttcaagaatgatatgctagcattgcccaagtttattgttcaaagagcagcttttggcatgtgtagcaatatttcgcggcttcaatctgtacatcctgctgagctagaaattgaatgccttgagaatgtaacaagtatcggagaagtggatgttgtaaacttgacgtataaatcagcactatcaaaattggcattggcatggactcctgcagctgagcgttttgtggaggatgaagatttgctgcggaagttacaacctcctgacactctaaaagttctccagatacaaggctacatggcgacatcatttgctagctggatgatgaacttggcatcacgtctgccttatctagtccgaattgagatggtagatttaccaaggtgtgaatatttaccaccatttggtcaattacaacatctggaactgttgattcttaggagaatccttagcctcaggaaactgggaggagaaatttgtggtggtaatggagcattcaggaaattgagggaatttacattggtaaagatggataacctaaatgagtggatcaccaaagtatcggctaatggtgaattcatgttccccagtcttcacaagctggaaatttctcagtgtcctattttaaggttaaatccatgccttcctagagctcttgaatggagaatagaagcaagcgatcaaattatagcagatttctatcacacaggctcgtcatcgtctttggtactatcgaaaatgcatattagaagctgccgcctgctgcccaatgactggaaactgcttcagttccttcctgatcttcaggtgttggaacttacacactgttggttttacgaattgccaaagagcattgggtacctgacgacactccgatcactgcggatagatggctgcgatagcatgacgaaactatcaaaatggttggtcagtctgtcattgctacatgaattaattattactggttgtttgaatctggtatatttgccggcatttgtacaaaagcttagtgccttggagaaattggaaattaatgataatgatgcactgcagagatggtgcagaaacagcgacagctggatctcagagaatggcataaaaaacaagatttattttgatggtaagttgatgagtactaagaagcaagaggacacagcagacattgacagaactgacgtccgtgattacagaaatccatgcgatgaagatgaatatgtagactgttttgcgatgctcgaacttggtgagtcgtcacggatggggcgatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSFLQYSSLVPDYTGLREDAKCSMVLSMHDLMHDLARCVMGDEL LLMDNGKEYNSGEGNCRYALLINCVGQTKFSYSSTKLRAMRFFNCDGIQLPLFTKSLR VLDISKCSCGKLPSSIGKLKQLKFLSATGMQHKTIPKHVMKLSKLIYLNINGSLNIST LPTSVNKLRCLLHLDLSGCSNLCSLPNSFGDLTNLLHLNLANCYDLHSLPKSFHRLGE LQYLNLSRCLSLNLMVDINAVCCLTKLQYLNLSRCSSLIHLPETIRGLKDLHTLDISG CQWIEIFPKSICEITSLKFLLIQGCSPWLEKRVRESQFKNDMLALPKFIVQRAAFGMC SNISRLQSVHPAELEIECLENVTSIGEVDVVNLTYKSALSKLALAWTPAAERFVEDED LLRKLQPPDTLKVLQIQGYMATSFASWMMNLASRLPYLVRIEMVDLPRCEYLPPFGQL QHLELLILRRILSLRKLGGEICGGNGAFRKLREFTLVKMDNLNEWITKVSANGEFMFP SLHKLEISQCPILRLNPCLPRALEWRIEASDQIIADFYHTGSSSSLVLSKMHIRSCRL LPNDWKLLQFLPDLQVLELTHCWFYELPKSIGYLTTLRSLRIDGCDSMTKLSKWLVSL SLLHELIITGCLNLVYLPAFVQKLSALEKLEINDNDALQRWCRNSDSWISENGIKNKI YFDGKLMSTKKQEDTADIDRTDVRDYRNPCDEDEYVDCFAMLELGESSRMGR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>71..104#1086..3094#7882..8043#tcaagaaagacctaataagcacatatcgcttgaaaagataggagaacagtatgtaagcgagctattgggaatgtcctttcttcaatattcaagtcttgtccctggtgagcgaattttccaacttacatataaatctctttagttgatttacatataaaccttaaaatattcaagagatgtaagttggaaaattttaatgttcacccaacttattttggggcatccattccatgaattccaacagttaagattacatgacttttatggtgtttgcatcccaaaaagggtaaaacaccataaaagttctcttaagattgccatctaggaaggagtaattggttagcacttatcatgccaagggtagtatagtcttttttgacagtatcataagtaagaaaacacacatagccactgtcatttgaataatagagcaatgcaatgttttcttatcattcatgatttaattttggtctaagtgtgttacttttatgtgatatgcatgaatctggacattgggcattagcagtaatgcttaaacgtataattgtggctatccatggcgcacaaaaaaaaaaggatgcacgcattgattccatgattttgttataaaaaaagttaacatgtttaataccgcatacagagaacatatatcagttttcaaatattgatctatatttctatttacatagattgtacagaagaaatatttataaatttatatgagtatttgtgattttgtgtaccatgaaatgttatattaagccaaaaggacatctgatttccttgaatacatgggaggatgaactaaatgtgcttagaaaagtttcttaattaacataataaaaatctgccatactaggcaaagtgcatgcatggcaattacccttgatcaatggatggttcggatttaatactcatcttacctcatagcagctaagtggagcaccctaaaattgctcatataagtttagtagtctaatcctttttcttctattgaattaaaattcaggccctctttctattgaataggtgtactttcagggtcatcctggactaatttaaacatttcaatgtacgaattttagattacacgggactacgggaggatgctaagtgttctatggtactcagcatgcatgatttgatgcatgatcttgctagatgtgttatgggtgatgagctacttctaatggataatggaaaggaatacaactctggagaaggcaattgtcggtatgcattactaatcaattgtgtcgggcaaacaaagttctcctattcatctactaaattaagagctatgcgttttttcaactgtgatggaattcagctacccttatttacaaaatctttgcgtgtcttggacataagtaagtgttcttgtggaaaattaccttcatctattgggaaattgaagcaattgaagttccttagtgctactggcatgcaacataaaacaattcccaagcatgttatgaaactttcaaaacttatttatttgaacataaatgggtctttgaacatttcaacattgccaacatcagtgaacaaactgagatgcttgctacacctggacctatctggttgtagtaacctttgttcattgccaaactcattcggtgacctgacaaatctcttgcatttgaacctagcaaattgttatgatcttcatagtttgcccaagtcttttcataggctaggtgaactccagtatctaaacttgtcacgctgtttatcattaaatttaatggttgacatcaatgctgtgtgctgccttacaaagctacagtacttaaacctgtctcgttgctcaagtctcatccacctacctgaaacaattaggggtctaaaagatctccacactttagatatctcaggatgtcaatggatagagatatttccgaaaagcatttgtgagatcaccagcctcaaatttctgctaatacaaggatgctcaccctggttagagaagcgtgtgagggagtctcagttcaagaatgatatgctagcattgcccaagtttattgttcaaagagcagcttttggcatgtgtagcaatatttcgcggcttcaatctgtacatcctgctgagctagaaattgaatgccttgagaatgtaacaagtatcggagaagtggatgttgtaaacttgacgtataaatcagcactatcaaaattggcattggcatggactcctgcagctgagcgttttgtggaggatgaagatttgctgcggaagttacaacctcctgacactctaaaagttctccagatacaaggctacatggcgacatcatttgctagctggatgatgaacttggcatcacgtctgccttatctagtccgaattgagatggtagatttaccaaggtgtgaatatttaccaccatttggtcaattacaacatctggaactgttgattcttaggagaatccttagcctcaggaaactgggaggagaaatttgtggtggtaatggagcattcaggaaattgagggaatttacattggtaaagatggataacctaaatgagtggatcaccaaagtatcggctaatggtgaattcatgttccccagtcttcacaagctggaaatttctcagtgtcctattttaaggttaaatccatgccttcctagagctcttgaatggagaatagaagcaagcgatcaaattatagcagatttctatcacacaggctcgtcatcgtctttggtactatcgaaaatgcatattagaagctgccgcctgctgcccaatgactggaaactgcttcagttccttcctgatcttcaggtgttggaacttacacactgttggttttacgaattgccaaagagcattgggtacctgacgacactccgatcactgcggatagatggctgcgatagcatgacgaaactatcaaaatggttggtcagtctgtcattgctacatgaattaattattactggttgtttgaatctggtatatttgccggcatttgtacaaaagcttagtgccttggagaaattggaaattaatgataatgatgcactgcagagatggtgcagaaacagcgacagctggatctcagagaatggcataaaaaacaaggtaaacgcttataacattctctgcaaataagtacaattactatacttgtttggtaatgcggaacattaggcgcctgaatttttctattttaagtatcgtatattttgaaacaaaccagggcatcttattgtaattaagttctcaaaaagtacatacaaatataaaaactactatgctgtaacggttttttgcaaccactccaataccttctatgaatttgtatgacaaagtacgcctaatgcatggatccccaataaatgtagctgtgtcctaactcctagttgtagccttgtagggcttcaggtgaactttgttcttacttctatgatgtaatgtatgagatgtcactcggctatatattaattttaatttgccatatactacatttcatgttcctctatatatctattatatactaaaagtccattaaacttcctacaaacgttcctaaatcaccacttggcgctctaataaattagagaaatcaaagaaattctgataaaaaagcaaaacatcctacccttaattttcaatacggtggacctattattctttaccattagatcaaaatcaaaaaatctatccataaccccaccacctcctgggcctcctcctcctctccccatcacgtaggtacgtacgtacatccatctgtccatccatcccctcctccgtctcctatcctataccattatttccatcttttaattttctacctaccaaaatttaaaatttatgatgattaaaaaaaatcaaacattataaccaatagattataatctacctattaatatcctaaaaaaatatattaaacttcctaccaacactcccaagacatcacgtctgtaaacgctcctacgtcaccacataatgctctaatgaattagagaaaatcatagatattcaacgctccaaagccgtcacgtgatactctacaaaccctcctacaccaccatatgatgctctaatgaattagagaaaattgtagatattcggagaaaaaataatatgtcatctttatttttacttaaattgatggatccattattttagatcattagattaaattttacttttagaaaaattaaaatataatatttccattctaatcaccgtccacgtacaagagaaaatgcgtacattcataaagttcaccaggaaaaatgtacgtgagaaaatacgtatgtacatcaagttcgccacatacgtacagttcactgggaaaaatgatacagcccaaagcaaaaaacccaaaacaacatacttatagtatgatggaaaaatatactttacaaactacatacgtagatgaaaccttaaaaactgccaatgcatccgaaaatgaacgcatgagatttgtccaagtcactacatattttccttaatatgattggaaaagaaaattcaactttgaattgggatattccaggttagaggaagctaaaatatattacttcctctttattttcctataagttgaccatccatcttattaaaaaattgtataaatatgtaaaaatataaattgggattatagattttttatgataaaacaagtaatgataaaacaaatatcatttatatattttttaatacaaatggtcaaatgtcatatcaaaatttaatagtgtcatacattcaaaatcattacgagtacttcacatacattaaattggtaaacatattattttaggccattaaatatccctatcctaatagcccatctacgtatgtagaattcaacagaaaaaagctaaaaaaaatacattccaaacggaaaatgatacatacgcacatagtattatttagaaaagtaagcggtctttaaaactaaaattttctatgatttaaaggtaatatta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