Difference between revisions of "Os02g0778200"
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Revision as of 19:24, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os02g0778200 |
|---|---|
| Description |
Aminoacyl-tRNA synthetase, class I family protein |
| Version |
NM_001054828.1 GI:115449026 GeneID:4330908 |
| Length |
10986 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os02g0778200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 2:33821025..33832010 |
| Sequence Coding Region |
33821160..33821183,33821298..33821457,33822620..33822774,33822854..33822955,33823387..33823454 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacgccgcctcctgctgccgcgtcttctcgacgcagagatgccgcttcccgctgcggaggctggcgccgccgatttcgcggcggccgttcggcacggagtcgacgagtgagctgttcgccgcgtcgacctcgaagcggcgctcccgggggcccgtcatggcggcgaagaaggccgccgagggtgctaaacaagaagaggggaaatacaaacacacggtggatctaccaaagacaacttttggcttgagagctaattctgttgtgcgggagccggagctccagaagttgtgggaggagaaccaggtgctcaagagggtatcagaaaggaacactggggctacatttgttctccatgatggtcctccttatgctaatggtgatcttcatatgggccatgcactgaataaaatcctcaaagatattataaaccgttacaagctgcttcagaatcacaaagtttcttttattcctggatgggattgccatggccttccaatcgaattaaaagttctaaagtcactggacaaggaaacattgaatgctctgacacctataaaattaaggcagaaggctgcaaaatttgctaaagcgacggttactacacaaatgaattctttcaagcggtttggtgtatgggcagattgggacaacccttatctaactctgtcaccagagtatgaagctgctcagctagaagttttcggccaaatggttatgaaaggatatatctaccgcgggcgaaaacctgttcattggagtccgtcatcacgtacagctttagcagaagctgagttggagtattcagaaaatcatatttccaaaagcatgtatgctgcattcaagatcaccaatctgtctaagcctgggttgctggaggaatttctccctaatttatgcctagccatatggaccactactccatggacgattcctgctaatgctgctgttgctgtgaaccctgagctcacttatgtagtagttgagctgcaatctgtactagaaagtgaatcaacatctggtggaaatcaacgaaagcttgggagtattttgagccctgggagtcagaaaccatttatcatcgtggctgctgatcttgtctcagctctagagtccaagtggggtacaaagcttataatccagaaatcatttcctgggtcagccttggagcactgcaggtatattcatcctgtgaatggcaatgaatgttctgttgttcttggaggagattacataacaactgaatctggcactggccttgttcatactgcccctggccatggtcaggaagactacataacaggtttgaaatatgggcttcctattgtgtctcctgtggatgatgaaggaaacttcactgctgaagctggacaattcagtggtttatctgttctgggagctggtaatgccgcggttgtgaattatctggatgaacagtgttctctcattttagaggagccttacaaacacaagtacccctatgactggcggtctaaagaaccaacaatattccgagcaactgaacaatggtttgcctcggtggatggtttccgtaatgctgcaatggatgcaattaggcgagtatcttggattccttctcaggctgaaaataggattgtggccatgacttcaagccgttctgactggtgtatttcgcggcagagaacttggggggttcctattccggtcttctatcatgtagactcgaatgaacctcttataactgaagaaactattgaacacatcaagggtatagtgtcaaagaaagggagtgatgcctggtggtatatgacaattgaggaacttcttcctgaaaaatatcgtgataaagcatctgagtatcgcaagggaactgatacaatggacgtttggtttgactctggctcctcatgggctgctgttttggcacaaagagatggccttaattttccagcggatatataccttgaaggttcagaccaacaccgtggatggtttcagagctcattgttaaccagcattgctactacaggaaaggctccatattctagtgttataacccatggttttgtactggacgaaaagggtttcaagatgagcaaatctcttggtaatgtggttgatcctgagaaagtaattgttggtggtaaaaattcaaagcaagaacctggctatggagcagacgttcttcggctatgggtttctagtgttgattacactggagatgtgttggttggtccacaaattttgcgccaaatgtctgacatgtaccgaaagctacgaggcacaatgcgattcctattgtcgaatctccatgattggaaaccagaaaattctgtgcgctacagtgatctaccgaaaattgacaagtatgcacttttccaactggaaaatgttgtgacttccatgaaggatagctacgagaactaccaattctataaaatataccagatcctccaaagatttgctattgttgatctctccaatttctatttggatgttgcaaaggatcgactctatgttggtggccgagttagctttacaaggaaaagctgtcagacagtcctcagtgcgcatctgctctatcttgttagagccattgcccccattatgccacatctagctgaggatgtatggcagaacctaccgtttcaacacacactggatgatggatctgttgctgagtttgtttttaatctaaaatggccagttaagaatgaagaatggctctcggttccaaaggatgatgttgattttctgagtgttatcctcgagttgagatcagaggtgaacaaaattttggagagtgctcgaacaggaaagctgataggctctagcttagaggcaaaagtttatctccacgcggaaaatgctaacacagtgtccaaactaaaggagctggtttcggcaaccaatgacgctgatgctctgcaccgcctgtttatcacatctgaggtggagatccttccttccgtaagctccgaaactacatctggtgtatcctacactggaacttttagcagtgagcgcaccggcaacatctggattggtgtgactcgcgccgatggcgaaaaatgtgagaggtgctggaattatacccgagacgttggatctttccttgaccatcctactctttgtgcccggtgccacggtgtcattgatctgccaccagttcctgctgccgcggctgtcagctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDAASCCRVFSTQRCRFPLRRLAPPISRRPFGTESTSELFAAST SKRRSRGPVMAAKKAAEGAKQEEGKYKHTVDLPKTTFGLRANSVVREPELQKLWEENQ VLKRVSERNTGATFVLHDGPPYANGDLHMGHALNKILKDIINRYKLLQNHKVSFIPGW DCHGLPIELKVLKSLDKETLNALTPIKLRQKAAKFAKATVTTQMNSFKRFGVWADWDN PYLTLSPEYEAAQLEVFGQMVMKGYIYRGRKPVHWSPSSRTALAEAELEYSENHISKS MYAAFKITNLSKPGLLEEFLPNLCLAIWTTTPWTIPANAAVAVNPELTYVVVELQSVL ESESTSGGNQRKLGSILSPGSQKPFIIVAADLVSALESKWGTKLIIQKSFPGSALEHC RYIHPVNGNECSVVLGGDYITTESGTGLVHTAPGHGQEDYITGLKYGLPIVSPVDDEG NFTAEAGQFSGLSVLGAGNAAVVNYLDEQCSLILEEPYKHKYPYDWRSKEPTIFRATE QWFASVDGFRNAAMDAIRRVSWIPSQAENRIVAMTSSRSDWCISRQRTWGVPIPVFYH VDSNEPLITEETIEHIKGIVSKKGSDAWWYMTIEELLPEKYRDKASEYRKGTDTMDVW FDSGSSWAAVLAQRDGLNFPADIYLEGSDQHRGWFQSSLLTSIATTGKAPYSSVITHG FVLDEKGFKMSKSLGNVVDPEKVIVGGKNSKQEPGYGADVLRLWVSSVDYTGDVLVGP QILRQMSDMYRKLRGTMRFLLSNLHDWKPENSVRYSDLPKIDKYALFQLENVVTSMKD SYENYQFYKIYQILQRFAIVDLSNFYLDVAKDRLYVGGRVSFTRKSCQTVLSAHLLYL VRAIAPIMPHLAEDVWQNLPFQHTLDDGSVAEFVFNLKWPVKNEEWLSVPKDDVDFLS VILELRSEVNKILESARTGKLIGSSLEAKVYLHAENANTVSKLKELVSATNDADALHR LFITSEVEILPSVSSETTSGVSYTGTFSSERTGNIWIGVTRADGEKCERCWNYTRDVG SFLDHPTLCARCHGVIDLPPVPAAAAVS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>136..159#274..433#1596..1750#1830..1931#2363..2430#2579..2693#2886..2954#3286..3393#3861..4005#4589..4820#4911..5197#5295..5431#5864..6011#6808..6939#7583..7711#8051..8178#8255..8419#8806..8931#9432..9505#9629..9878#10219..10398#10472..10714#gcttctccggtggttctcttctcttctcttatcccccggagacgccgctgcggcgccaccccctcctcgccgtggacctcggggtgggagcgtggcggcctgcacagccggagctcagctcgcccgccgcgtcggatggacgccgcctcctgctgccgcgtaagcgcgggcgcgctcccccgatttccgttctcgcttctcgaacgttctagagccttctacggtgggggatccgtgtggtgtgacccatcgtcgcttctctcgctctcgcaggtcttctcgacgcagagatgccgcttcccgctgcggaggctggcgccgccgatttcgcggcggccgttcggcacggagtcgacgagtgagctgttcgccgcgtcgacctcgaagcggcgctcccgggggcccgtcatggcggcgaagaaggccgccgagggtgagtcgacttgatcccattgctgtactgttcttatttttggttcaggttgagggtttggtgagggttttagtagggggattggtgtctatatgttggtatttcagtgatgtgagttttggctgtggagtaggtgcattaggcgtccgatttttcttgggattactctgtgtctgtggtcaatgtatatcgtacttgctctgtggattgtggggatgccagccatttttgtctggtgaggcgttggaggttgaagctggtctatggcctggagattttcgttcttgctgttcacgttttgatgggattgatcacagggtgaggcacatgattacagatattgaactcgtgtgacgtacagcttaaactggttggttaatttaggttcaaatatgtgattgtagtttccacttctgcaattgctataattattttcagcttaagcacgtagggcttattaaactcattaccaaacttgttttactgcagttttctgttacatttgtacttttatgattgatgtgtgttacttaggctcaatctgcttggtttagccttaagtatgctatgacctgggatttttgtaattggtgtacttttcagatttaagaatgtacacacctattggacttctcagttcgcaccaaaatgcacttattaggtctcaagcaccatggttggaagattattattgttttgcgtatcagattaagcttaattctcattttctccatttggagtagcatcaactagtgctcgaaagtcgaaacttgatgcttatgcttgttaggatgaaagctgtttaagcttaaatgtgttttgtatacccagaattcggtaatcagattgatttttgaaaataactttgttatctggtgttagttgaaactttgttatttcagtacattccattgagattcaaatgcagtgagaccctctgcttacttagtaggtgtcaatactgaagcttttactggcaaaagttatggtgtattttgtaatgaaaatctcgtagagacatgtaattaattttatctggctgttttataatgaatagtagttggtagtttgacaggttgagtcccagtttcaatttagtactgcttgcagagttaaattcattaagatataattatatatttagcttcttgattctggctaggtgctaaacaagaagaggggaaatacaaacacacggtggatctaccaaagacaacttttggcttgagagctaattctgttgtgcgggagccggagctccagaagttgtgggaggagaaccaggtgctcaagagggtatcagaaaggaacactggggtgagtatttcttcgagtaaagctaaaagtaaaattaaaatttacctgactttgttggttttcttgactgttggattaggctacatttgttctccatgatggtcctccttatgctaatggtgatcttcatatgggccatgcactgaataaaatcctcaaagatattataaaccgttacaaggtatcgtttactcttcaatctaatctgagtatttttctttaaaaaccattgatgtatttttcagggcaattactgatgcagtcatagtatgttgtcttattcagttcaatccataggatattctctgttctgagatcaatgttactgtacggatgattggtgcatagattttattgtcttttccaatgcagtgcaatttctgtcatttctttatcttaacatgtagagctctttagtgtagttgattgtgtacgagatttggatgattaatgaactttttgctaattctagtagttttttcctgataactctcttcgctgaaatgtctttaactttttttggctggatgactatgctttttatgttggtccaaaccaaaattgggaacataaatcaactgacaccaaaatttgcttttcttctgtgtgcagctgcttcagaatcacaaagtttcttttattcctggatgggattgccatggccttccaatcgaattaaaaggcaagttcatctttatatccaatggaaacaccctatgtttacaagaagttaggtaggggttggttttaacacaatgcttgcatgtgttagaccagccaagtaattattgaatatccttccaaatgtaaccattgactatttgctgcagttctaaagtcactggacaaggaaacattgaatgctctgacacctataaaattaaggcagaaggctgcaaaatttgctaaagcgacggttactacacaaatgaattctttcaaggtaaccatttctttattttaaagtactttagtggtgacatgatctaatagcaagttgcccttatctatgttttgtggtatttcctggtatgattgctgacttgcagtcatctaatatctggaattctgtctcatgttagcctttagtttcatatttctataattgtattaaccaatgacattgtgcctgcagcggtttggtgtatgggcagattgggacaacccttatctaactctgtcaccagagtatgaagctgctcaggtctgatcctattgtttatagtaattttgccattgcatcaaaacttatttatccatttcacatgaatgaaagcttggaggtttggaattaccttagttagatcattgatatcatcttggtcacattatagctgctagctctaataaaaaaaatagagctgtttactttcagttccttttagtccatttaccatcgttgatataaaatatataacgtgtatgcaaattttatgctgcgagaataaatactgatgttttctttttcatccttatcatatgtttttaatcaaggctaaccgtaacaactcttgttctccattttgatatgccagctagaagttttcggccaaatggttatgaaaggatatatctaccgcgggcgaaaacctgttcattggagtccgtcatcacgtacagctttagcagaagctgagttggaggtatgcttgaactttctacttgatgctattaatttgctgtcaaaggctttgttgtgcattaatttttaagtgactattaaatattcgaataaaaaattgacaattccgatttgtttcctgtttaatttcaataattttcttgtgcttcagtatgtcttctcagtgaaaagccactagatgtgtcacttatttcttcctgttaatattaggcctacactgctgcagaaaaactaccgagcttttttcatgaagtcctttcatgtttaagaacacttctcttactaaccaaccataagagcgctttatgtgtcttattacataaagcacattacttcgtacatgtagtctttcacttaattcatgattggtgatcttttattttttttctcccttttcatttatgttctttagatttcttttgaatttgattcctcatatcatcacatgcattccttctgttcttccagtattcagaaaatcatatttccaaaagcatgtatgctgcattcaagatcaccaatctgtctaagcctgggttgctggaggaatttctccctaatttatgcctagccatatggaccactactccatggacgattcctgctaatgctggtgaggtgatgccttgattgctttaatgtattcagtgagtgtcactcttataattggatttcatcagagccaacgtaattaatttcaaaatatgtggctaattttgaagctatatgcgtctgtacatggaaaatagcatattaagaaacagaaaacttcacatgttttgtagttcctagaacctgtaattcctagaaggctagaacttgattaagaaatactaagtaatatctacgttacagtgatataacatagtttgattgtaaatcatggcacacatcttgcttccaataaaaaaaagaaagctctttgccgatttatccctccatagcaagaagatgcttcatttcaagtatgggtaagatcgaataggtgatactggtatgctacacagcatttcatgtttttgtttcaccagcagaaacagtgtcttattgtctcagctattctggaattgtagtagatagcattatgtccctgtctattcttatgtgtctgctgcgcatactgtatggattcgcttcaactctttggtattctctacatattaacttgtctaagaagccctttcttctttaaccagctgttgctgtgaaccctgagctcacttatgtagtagttgagctgcaatctgtactagaaagtgaatcaacatctggtggaaatcaacgaaagcttgggagtattttgagccctgggagtcagaaaccatttatcatcgtggctgctgatcttgtct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