Difference between revisions of "Os03g0187300"

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Revision as of 19:29, 22 July 2012

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os03g0187300

Description

Quinonprotein alcohol dehydrogenase-like domain containing protein

Version

NM_001055743.1 GI:115451214 GeneID:4331878

Length

8003 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0187300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:4539416..4547418

Sequence Coding Region

4544305..4544454,4544533..4544643,4544755..4544866,4545164..4545492,4545613..4545703
,4546091..4546186,4546259..4546329,4546417..4546529,4546902..4546983

Expression

GEO Profiles:Os03g0187300

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:4539416..4547418 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008396:4539416..4547418 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgcaagttgcaacaaaatctcttgagatgggcactaacttgatgcttggggttgaagcatgctctacaatacttctggcagtggaccataatattgatgataacatgaagcatgattgcttgtgtactcgggcaggattgtatctaaagaggaggtggaaaaatgatgtatacatggctataagggattgcaacagtgcaaggtgtatagattccagatcatttcaggcgcatctgtatatggcagaagcactattacagttaggaaggctgaaagaggcatctgaatatgtggatgcattaaatactattgttccaccttattctcagtcagtgaagcaagtggaaaatataaaggagcagctttttgcagctgaacttgagaagaataaaaaggatcaagtagggaatacctacactgatgcacgacatgggcggttacgctcattaagtgatctactgtttagatcagatgccagtggctcgtcatcacaggagggtcgagaagattcagattatgatgatgaaatggagttggactttgaaacatcagcatcaggtgatgaaagccgtgatagtgatccaggttttgtccggggtagtttaagtttaagatttcacagaagagatagtcaaactgacgaacattctggtgaaaatggatcagctgagtccactcagaatggtgattctgcctatcagccagaagttgccgttgacatgaagcaaagatatgttgcacactgcaatgtggggacagatataaagcaagctagctttctcggtgaacaaggggagtttattgctagcggaagtgatgatggtagatggttcatatgggagaaacgaactggaaggttgattaaaatgcttgcaggggatggagccgttgtgaactgtatacaatctcatccatatgactgtgctgttgcaacaagtggtatagataacacaataaagttatggacaccggatgcgaacgctacatctatgattgctggacccgaaattgatgtatcaagtgtcatagaaaacaatcagaggaagctctcccggaaccgtgaaattttgctacctttcgaatttttggaacgatttcgaatgcatgagtttggtgaaggaagtttacatcctttggagtgtgcacagagctga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MQVATKSLEMGTNLMLGVEACSTILLAVDHNIDDNMKHDCLCTR AGLYLKRRWKNDVYMAIRDCNSARCIDSRSFQAHLYMAEALLQLGRLKEASEYVDALN TIVPPYSQSVKQVENIKEQLFAAELEKNKKDQVGNTYTDARHGRLRSLSDLLFRSDAS GSSSQEGREDSDYDDEMELDFETSASGDESRDSDPGFVRGSLSLRFHRRDSQTDEHSG ENGSAESTQNGDSAYQPEVAVDMKQRYVAHCNVGTDIKQASFLGEQGEFIASGSDDGR WFIWEKRTGRLIKMLAGDGAVVNCIQSHPYDCAVATSGIDNTIKLWTPDANATSMIAG PEIDVSSVIENNQRKLSRNREILLPFEFLERFRMHEFGEGSLHPLECAQS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>4890..5039#5118..5228#5340..5451#5749..6077#6198..6288#6676..6771#6844..6914#7002..7114#7487..7568#gtaccttggaagctgaaaggcgcaaaaagcttccagaagcgtccccaaaaccgcccacggcgatcgggggcgcgcgcgcagccggcggcggcgaagaggctgcgaggtctggccttcttcccctgctagatcgccggtcgacggagatggagatggaccacgcggcggcggagaaggcgcggtggcgcttctcggacggcggcgtcaccgacctcctgcaagcccgaagtctccacggcaccgctgtaagcaccccccccccctcctcaccctcgggatggcccgggacgcctctccccctcccctatcgcgtgctagggttcgttgcatttgtggatagctttttggtacggggcgaattgggggtcgattcgttggggggtgctctgtgcggtggaggggttcgcgggggcggacgaatcggtcgagtaggaacgcgtggcgaggtgttttgtggtatgttcgcgagggctggaggctggagctctaggttcgcgtttttttggagctatgttcctcgacccgtttgagagtttcaagggtttatggattgggggtaatatccgtggctgtttgagccttctgttgttttggtagcttgttgcgcgaattaaatccgtagcgtcaggggaaggggtttgggctatcaattgctcgagttgttgtaatctgcatctgctatgagtgcacttgattgcttcttccgttggttgagaatttaggatagatgagaagttctaaggtgaatgacctgccagtgagtcgatgtataataggggtgaacagaggtgaaaaacatggaggcgacccggtggagaagttgaggaccttcaacccagcttttggcacttggcctcttgcattaataatgtttcttctttggtcttgcattttgtgatgcgtgatgcatatgttgatcatggtatcactatatgtgttgtaggcctgtagctaaaatgtttagaagctagtaacgacttcttttccaggacattaataagagagtgcaattccattcttctctagtacaaaggcttgctttggagaaggaaatggaggtacacgactacttttttcttcttgttctactgattttcacacaaggacatttggcacttggccctcttgttgttcctgtattggaaattgtatagctgttcaaaagaaaaagtgctagagttctcttgctttttttacattgaccgtctctgttttctccatgctatataacagggtcacctaggttgtgtcaatgctattgcatggaattcaaagggctcacttctgctatcaggttcagatgacactagagtaagtttctaaaattaagtatggttgggtctgactttgctagattctttattcttgtgtcatgttatcttcagtagttagcacttgaactctaattctccccaacactatgttaaacattgttttgagatatttgcaccccttctctctctctctctctctctctctctctctctctggcttctgaatgccctgtcgtgccacctttatatggctaaattgctatggtaatcatcatctagtagaccttttcggctcaaagaatatggtagcacatgaactctttagttgtttgtcaaacataagaggtttgcaatgatttgtcttcctttatttctatcaagttaaactatttgttaagctgtaactatagggaattattatatgaactgtattagacaattttgttgcaaaaggggtgttgctcagcaggcgacacgagtttgtagttagtaacctctgtggctggctttctcttttctttggcatatgcttggattagtaaaatcagacacttttatgcttgattgagttaagtgctgtatgaacatctacctgcagatcggcatctggagttatgctaatcgagagttgttgcatgacattgatacgggtcattcagcaaacatattttgcacaaaatttgtccctgaaacatctgatgaagtaatagtctcaggagcaggagatgcagaggtatgatctttatagaagttgttctcatctgtctgctattctggtaccagttatttttaggatcctttttctgagagagttgctgattcttttgcaggttcgtgtttttaatttgtcccgtttaagtggaaaaaggcctgtagaaatttctatggaaccatcagcagtttaccaatgccactcaaggaggatcaagaaattagctgtaagattccatgttgagatgacctttggaatttgaatctctagagcatgaaagaagtgttatctttgcattgcatcatcttgacataggtcttttgtaatttgtgaatgatgttctgcacttaagtgagcatgaaagaagtttatatttgcattgtatcatcttgatttagaaggagaaaatgatgctctgcacttaagtctttacacaaatatagatgtgctctagtttcttgtggattgagatttctacccaattattataagcctctgcctggtcttcaattatttaattttttgtattgtttgctatatgcaggttgaaattggtaaccctaatatagtctggagtgcaagtgaggatggaactctaagacagcatgattttcgggagtgcagttcctgtcctcgtgcaagatctactaatcaggaatgccgtaatgtgcttgtgagtcatccaccctttgacaaaatttggttcaactaataacgtctaacattgcaactttgtctaggttgataaattgtttggtccttaataacctcatatcatgataaattttacctttgggagtatttttgttatttcgtttaaatgttattctgttacagatttattggttaccactaggaataatctaataagagcccaactcagtagccttgtatgattccatattgcagtctacctgtaatctttagcactataaataattacgtggaggtccttaatgactagaagaaaatatttaccaaaaaatataaatggtgtctcattattgtttcgtgaactcttgagccagcatgcaattgagatttactttttaaggattgatctgtacaccatttcctattaccatgtggatgaacccataatgctgccttttgttggactatgattgtacaatcatttcagccttatgatgatcatgttgtggctcccacttttaccttctaggcttggtaactgcactgtaccttttgtttttgtgaatcctggaattgtaaggataattaactaaatagagtattaaggtaaacacgggctataaaattgactggtatagttgctaagttgcatgcttggttctatttttgttttctgtgtggcagctagatctacgatggggagcaaagaaatctttagctgatattcccagacagccattggcactgaagtcttgtgatatcagcactgttcgtccccatcagctccttgttggtggaaggtgacctaacttactcttatacattgatccattctaagctttctaaacctgaataacattactttacaacttgatgtttatgcagtgatgcatttgcacgactgtatgataggagaatgcttccaccattgagcacatgccaaacaaaaaaggaaccacctccatgtattaaaatgttctgtccaatgcaccttgctgatactgtgagttccctgttcttgagtgtattgttattgtcccaactgtgtatggtaaatatggtagcagttgttgctgggtatactccctcgtgtcataaaatgagtagcattttgtaccatcaacgcagtttccaaaacacacatttgacaactagtttctgttatatggttttatgaaacatagtaaaatttaagacaaatcaaggatatcaatttcatacttccaatctacacaagtgaatttgatagctaaattttataaagttcgaccacatgttccccaaaacatttatttttttactggatgcaataccatatatatgcgatttgctgtgctggctatatacattttatatgctgactcaaagttgaccaaattaaatgtaaatcttgaatttaaagtttaaaaattcagggtaggagattgatagaacacatgaagcttttttggctgtttttctttagcatgagaattttcatgtaatagtcagtgttgataattctgttattgcgagcagttttatgatttgttacatgtgctttatggataaccttgtattgcacggtcatggataaattttaaatgtgcttttcaacataaactactacttctggaatatttgtattttttcccagaaaaattggcctataaagcttaaagcattcaagctagagtaggcaattttgttctagtttaagaattttgttatttctgaagcaactcgttccttcaatatcaattgacatttggcctacgttgtaaccagaggaagtcaaatttgcatctaactcatgttgcgttcagcccaaatggtaaggaggttctgttgagctacagtggtgaacatgtatatctatttgatgttgacctaggtatgatcattcaactctctttttggtcatgatacctttgttacgttttagcctgtcagtattatcatatctttatattataatgattggggtaatttgtttattggttcagaaaatacgagttctgtgagatacacagcagacaatgtacaggagcaattatgtctacccccttttaacaaagagccagcaaagttaatttcaaaacaacagaagtttcctgtaaacagagcttcaagaaatgtgtgtagggtgagttgtgctctctctctctctctctgcaattcagaccacactgtttgcttgatctgctggacatgttgaaccgctttgcctttaatggcacccgtttcaggtagatacgttcaagaaac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External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0187300, RefSeq:Os03g0187300