Difference between revisions of "Os03g0404800"
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Revision as of 19:36, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0404800 |
|---|---|
| Description |
3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase domain containing protein |
| Version |
NM_001056861.1 GI:115453450 GeneID:4333070 |
| Length |
10077 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0404800, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:17187314..17197390 |
| Sequence Coding Region |
17187411..17187696,17192907..17192996,17194156..17194289,17195230..17195388,17196561..17196683 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggaaacggcgccggccgcgaacggttgtagtggcggccgccggctgcaggaagaagagcccgcagctcggtggtgcgcggtgaccggtggccgcggcttcatggcgaggcacctcgtggcggcgctgctccgctccggcgagtggcgcgtgcggatcaccgacctcgcgccggcgatcacccttgaccccgtcgaggagaaggggctcctcggcgaggccctccgcgacggccacgccgtctatgactccgtcaatgtttgcgacataacgcagttgaccaaagcttttcaaggggtggaagttgtttttcacacagctgctgcagaccctgacatcaacgacttccaactacattacaaggtcaatgttgaagggacaaagaatgttattgatgcttgtgtaacgtgcaaggttaaaaggctgatatacaccagttccagtggtgttgtatttgacggagttcatggcctttttgatgtagatgaatcaatgccatacccaaacaagtttcctgatgcatatgcacaaagcaaggcagaagcagagaagttagtgagaaattccaacggcatatgtgaacttctaacttgttccatacgtcctggtagcatttttggccctggtgacaccattgtaccacatttactttcccactggagaacgatgtttattatcggcgatggaatgaattgtgatgattttgtatatgttgaaaatgtggtacatggccacatttgtgctgagaaaactctctcgactaaagagggttcaaagataagtggaggcaagaatgtgtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>METAPAANGCSGGRRLQEEEPAARWCAVTGGRGFMARHLVAALL RSGEWRVRITDLAPAITLDPVEEKGLLGEALRDGHAVYDSVNVCDITQLTKAFQGVEV VFHTAAADPDINDFQLHYKVNVEGTKNVIDACVTCKVKRLIYTSSSGVVFDGVHGLFD VDESMPYPNKFPDAYAQSKAEAEKLVRNSNGICELLTCSIRPGSIFGPGDTIVPHLLS HWRTMFIIGDGMNCDDFVYVENVVHGHICAEKTLSTKEGSKISGGKNV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>98..383#5594..5683#6843..6976#7917..8075#9248..9370#9778..9786#gcagcacactaatcgatcaccgcactatacacaatacgaccattagctattactagctagctatatatccctcccttgtttctttcgagcaagagcgatggaaacggcgccggccgcgaacggttgtagtggcggccgccggctgcaggaagaagagcccgcagctcggtggtgcgcggtgaccggtggccgcggcttcatggcgaggcacctcgtggcggcgctgctccgctccggcgagtggcgcgtgcggatcaccgacctcgcgccggcgatcacccttgaccccgtcgaggagaaggggctcctcggcgaggccctccgcgacggccacgccgtctatgactccgtcaatgtttgcgacataacgcagttgaccaaaggttaattaattcgatcttcttaccgtatacgtacgcttttttcgaaccgctaaacgacaccgtttgtatgaaaattttctatataaaaggttattttaaaaatgaaacaaatctagttttaaagttttcaataattacttcctacatctcatcatatttgcgaatggtattgaggccaagacaagaaaaaaaatctttccttttaaattaaacctcatcgatcaaaacgttatgttagcatgtatgtggatatgcaacgatatcatttttactcctgcagtgataaacgaactgacatgcaaccatagtatttacttgtatataaataaacaaatagacatataatcatgatatttactctacagaaataaacgaattgacacctcttatataatgattattatgagatgagcaaaatgtaatgaatgaagtaatactcagttaatcatatgctaataaaatttctcgttttacgtgtggctaatcggccatttcaaaaagcactttaggacggggtcttagacaacaacgctgtatttaattgctctctctatattgagaaatacgagctgcttattatgtaaaaaaaggaaatacaagaagttttgaaaatatcagtatcggttttttagccggtggtaacaaagtaagtaacaattatgcttgtgcttggaggtataattgccggttataacaccatcagttacaatatgtatagtactatatcactgctattttgtggtttatgaactgggttgcaaaattcgaattctttgacggaaaaaaaatcgtattatacgaataatctactagtaaataatacgatgtgtcaagcaacttttacctcaacctcgatatgcgagaaacttgcttaccgctaaccatctcagagatagcacacagatatgcttcttcccctagaccctttttccgaagcttttggcaaatattttccctacataaaggagtgttggcaaaagtgggtcacggtgtagtgcaatgagtcaacgtttgattgttactaaaatggagtataattatccatatatatactttcaaacaaaaatccgcataagaagagaataattaagttgattgggcctctctgatctgtcacgtgagctaatgctccaatgacaagccaaccacttaaaatcaaatcaaatcaaatatgtgactggtacaatataacagttccaccaagaaaaatcaatggtgatcgatacacttagctagtacaaaatgacatgatgttttctaaataggccatttttcaagatttcactaattaatactcaattaatcatatctaataacgtttctaattttacatgtggctaatcagtcaattccaaacgtggcccttcgacagcaactatgtattcaattgctctctccatcgagaaatacgagctatgctttcattaaagaaaaagcgaatacaagacatgcttgaagaaagtagttcatccgtccttaaaaaaataaaccctaaaccctaaaccctaaaccctaaaccaaaaaccctaaaccctaaacagatctatgccctaaaccctagttctatctagataccctagttctatctagattcatagtcccatcatagatttgtttttatatataggactgagggagtacacgtcatgaatttcgactaataattaattattaaggcatcaacatataatgtctatacgcttttgcttttctttttgttatgttaatttatttggttgatataatataatgtcaaagaaaacaatgaccatatggccgtgacagcatcacagttggttacaaaaatggctatggataacaaatcatcggtactacagaactactccctcattcccaatgtttgacgccgttaacttttttaaacatctttgaccgttcgtcttattaaaaaaattttgtgaaatgtgtaaaactaaatgtatacataaaagtatatttaacaataaatcaaatggtaggaaaagaattaataattacttaaattttttgaataagacgaacgatcaaatatttttaaaaaaagtcaacggcgtcaaacactttagaattgagggagtaggtaccagagacagttcaaactactagcagtaaccggtttttttagccggtggttagtggtaagcaagcttcgcagagatagcatgcagatgcttctcggaaatgctactgagctagcgatcgccctcgctcgcccagagcgatcaattcccccccccccccccgcctcctcctcctccctccacctggtttccttttttggtaccgtattacttttctattttagtaaatttatgcacctcaagtttacacatctaaagtttagagaccaaaagtttataagtcaaaagtttatatatccgattcaaatttgaatttgaattcaaatattttttatatatagtatttctatacatctaaagtttatacacctaaagtttagagacctaaagtttatatatccgacgattcaaatttgaatttgaattatatcttattcaaatttgaatttgaattatatcttattcaaatttgaatttgaattcaaatatccgattcaaatttgaatttgaattcaaatatttttcatatatagtatttctatacatctaaagtttataaacctaaagtttatagacctaaagtttatatacccgattcaaatttgaatttgaatttaaataattcaaatattttatatatatatagtatttctatacatctaaagtttatacacctaaaatttatagatccaaagtttataagtcaaaagtttacatacccgattcaaatttgaatttgaattcaatttttttatacataaatttttccaactttttgtttttttaaaatttttttgtggtgtactgtaataggaagagaagaaggtgaggaggaaggggagaagtgggaggagtgcctataggagcggggggcccgggaccgatcgctgggcgccccccccccccaccccatgcttcttattaactagaccctttttccaaagcttttggcaaatatttaggcattcaatatgagccaaaataaaaaggttatcaattataaagttacaggattttcatataaaattttctccgtccaaattcatgtgtgtcatgtatactataatctttaaatttgcaatgatgagttagcgaaactacacttattaattaccattccggatttgtaatttgaacctgactgataacacaaactggattaattaatgggattaatggttactccctccggtttcattttaattgacgttttagacaatgacatggtctacaaaatatatatttgaccttatttttctattataatatacacaataaataaatgcatgtttacttttattatagtgctttgaaagacaaatctatatacgttgttctagtttttttaaactaaatatttttaaagttattgatggtcaaattataaaagtttgacctcaatcttatgcaaaacgtcaattattatagaaccgaggaagtatgttacatcatggaggatggaggaaacatagcactaggaccataataattaagtctatgaaattcgcgcgggcaacaatccctgtgtaacgtcacaattatcaatataaaaaacggctaagctccaagtaaagtatactttttttcaacaatactttcaaacaaaatcctctgacttgctttttgatttaaattcctagtatagggctaacagtaggcgcataaacaacagaataattattctgtgacatgaggtaatgctcttatgataagccaaccactcaaaatcacaatcaaacaaaatactccatcctcccaaaaaaaaagttacacctattacttttgtcaccaaaactaaagaagaaattaacttatcttgcatgaaacaaagatcaaagagtgtatgcacgcatgcaatacattaatattaagataactcctcatgtttcgatgaaacaattacttacctctccatttaattcttacatgcatagaaacaacaaataaaaacaacttatttgaaagaactcaaataggaaatatgtctaactcttgtaaatggagagagagtatgtgactgatacatcatacagtttcaccaagaaaaaacaatgcagattaagatccaaatactatctcggtttccgttagcatattttttaaattgctaaacggtatatattttgtgcgaaaaatttttatatagaagttgcttaaaaatataaaaaaacattttctaaatttgtaataaataaaacttaattaatcacgtactattttctcgttttacattttctacttaatcctcgtattcgcctatttcaatcgtggcattagtaggaaaagacacgatcatttctaaatggatccttatcacacacaaaattcttttggaagtatacctttttttcaccggtattactagaaagaagtagcgtaagtactaccgttaccaccatgaagcaaggtgcaaattctcggcgagttaacacggtgagtgctcgaactcgtgacatgtt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