Difference between revisions of "Os03g0624000"
(Created page with "{{JaponicaGene|
GeneName = Os03g0624000|
Description = Similar to CDPK substrate protein 1|
Version = NM_001186618.1 GI:297722366 GeneID:9269134|
Length = 10368 bp|
Defin...") |
|||
| Line 1: | Line 1: | ||
| + | Please input one-sentence summary here. | ||
| + | |||
| + | ==Annotated Information== | ||
| + | ===Function=== | ||
| + | Please input function information here. | ||
| + | |||
| + | ===Expression=== | ||
| + | Please input expression information here. | ||
| + | |||
| + | ===Evolution=== | ||
| + | Please input evolution information here. | ||
| + | |||
| + | You can also add sub-section(s) at will. | ||
| + | |||
| + | ==Labs working on this gene== | ||
| + | Please input related labs here. | ||
| + | |||
| + | ==References== | ||
| + | Please input cited references here. | ||
| + | |||
| + | ==Structured Information== | ||
{{JaponicaGene| | {{JaponicaGene| | ||
GeneName = Os03g0624000| | GeneName = Os03g0624000| | ||
Revision as of 19:39, 22 July 2012
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os03g0624000 |
|---|---|
| Description |
Similar to CDPK substrate protein 1 |
| Version |
NM_001186618.1 GI:297722366 GeneID:9269134 |
| Length |
10368 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0624000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:24454699..24465066 |
| Sequence Coding Region |
24454699..24455113,24455686..24455766,24456011..24456079,24456408..24456513,24462918..24463083 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008396:24454699..24465066 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008396:24454699..24465066 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgactactgctgccaccgcgccggatctgtcactccacataagcccgccttcgccgccggacatggccgccggcggcgagacgatggagcagttggctgagccaaagctgtgcctagggtttggcacggcggcggcggcggcggcggagcagtacaacaatggcggctgcaacctccagcagcagcagcggctgcaccaacctagccagatccagagattcaagaagagcgccagcggcggcagccctgtgtgctccggcggcgccaccggcaccggcggcgttgcggcggcgagatccgggaatggcggtggaggtgggaagaggagctctagggcgccgaggatgcgatggacgacggctctccatgcgcactttgtgcaagccgtcgagcttcttggaggccatgaaagagcgacaccaaagtcagtattggagttgatgaacgtgaaagatctcacgctggctcatgtgaagagtcacctgcaggcaacttatttgcttgacctggtgcagatgtatagaacagtgaagggaaccacagacagaacatgtgctgaaggccatgggcagatgagagatatgggctttctgaggagaggaggtggtggagtggatggctttgacgtgcttggtaacacctcttcaattgcaatcgccaatattagaaggcaggcagcagggtcgccgggtgagcatcatcaagagacgatgatgagcagcgcctggtgccagccgcagttcgcccagcagcaaaccactgcttgtgggctgccgctgccttgcccctacatcgtgtccactcaccactacctcatcaaacaaaaccagctgggaggttggaggggatcatcagggcagcagctggcggtacagcaagatgctgcagcccatagcagcctagggatcaagaacatgggacaacaacgtctgcctgctgctgctgctgcggctgcaggcaaccatgatgatgagattgtagtagtcgccagcaggattggacgacgatcgtcgggtactgcaggctttgctaggtcgtcgcctcctgcagcttcaggctgctggacgccgacgacgacgacgtggtcgccgccgccgccgctgacaccgcagaccacgtcgacgacgacgacgatgaggggcagcagcgtcgtcgtcgccgcagcagcgcaggcgtgcatgaagcagcagcagcagcagcagacgccatcgagggtgccaagcctggagatcagcctcgggaggcaggggtggcaaagcggcagcagcttggagcagcagcagcagcatcagcagcgtcatcatcagcagcagcagcggcagcgcagcgtggagtcctcggcgtccaaagaactaacgctactaaagtgctttgcatgcatggcttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATTAATAPDLSLHISPPSPPDMAAGGETMEQLAEPKLCLGFGT AAAAAAEQYNNGGCNLQQQQRLHQPSQIQRFKKSASGGSPVCSGGATGTGGVAAARSG NGGGGGKRSSRAPRMRWTTALHAHFVQAVELLGGHERATPKSVLELMNVKDLTLAHVK SHLQATYLLDLVQMYRTVKGTTDRTCAEGHGQMRDMGFLRRGGGGVDGFDVLGNTSSI AIANIRRQAAGSPGEHHQETMMSSAWCQPQFAQQQTTACGLPLPCPYIVSTHHYLIKQ NQLGGWRGSSGQQLAVQQDAAAHSSLGIKNMGQQRLPAAAAAAAGNHDDEIVVVASRI GRRSSGTAGFARSSPPAASGCWTPTTTTWSPPPPLTPQTTSTTTTMRGSSVVVAAAAQ ACMKQQQQQQTPSRVPSLEISLGRQGWQSGSSLEQQQQHQQRHHQQQQRQRSVESSAS KELTLLKCFACMA</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..415#988..1068#1313..1381#1710..1815#8220..8385#9529..10067#10353..10368#atggcgactactgctgccaccgcgccggatctgtcactccacataagcccgccttcgccgccggacatggccgccggcggcgagacgatggagcagttggctgagccaaagctgtgcctagggtttggcacggcggcggcggcggcggcggagcagtacaacaatggcggctgcaacctccagcagcagcagcggctgcaccaacctagccagatccagagattcaagaagagcgccagcggcggcagccctgtgtgctccggcggcgccaccggcaccggcggcgttgcggcggcgagatccgggaatggcggtggaggtgggaagaggagctctagggcgccgaggatgcgatggacgacggctctccatgcgcactttgtgcaagccgtcgagcttcttggaggccatgaaagtaggttcatatgcatgcatatatactatgcacatacagatcatacagccttggatgtaattaattagttaattaatgctttgcttgcttcttcttcttgttcgattgttccttttgctgtttgacctttttcaattcacatgactgttcttggactagttgaagtttttgcacaatcacatgagacaagggaattgtgtctattcaatatatacacctgcaacttgagtttctcgcgtgttcttgtattaactttcttttttgttcttgtatgaatttcagaggagtcaaattgactttttccccccttagctgttccaatataatgcatcgattgtttgcaatcttgtgactccatttgtagttttcccgtttactttttgaaagcattgttgttcgaagagttttttttttctaatccaatccagtatttgctatcatggtttccttgttgttttgaaattttctcttattcatgtgtaccatatactacggatttaacaagttcgatcgttcattatgaaaaaaaaaatgttgtaaaatgaagctattaattttcactatgtttctaggagcgacaccaaagtcagtattggagttgatgaacgtgaaagatctcacgctggctcatgtgaagagtcacctgcaggcaagtagatctctcactctagtccatatcaacattcaagagaataaaacaatgtaactaaagtatgtataattgtataataataaatttttttatcgattagctctcttttcttttttatttttggtctctctcgctataacattttgcatcttaagacacactagtatgattaactgcaaaagtaaaccaaatggaacacgcgcgaggtctagtctattctctctttttgcctttgttttacttagcttatttgcttgacctggtgcagatgtatagaacagtgaagggaaccacagacagaacatgtgctgaaggtaaaacaaggcctagaaaataataacttcttcttttccagagacatattttcttgcctgagttgatcattcagtaaggtcaaatcacataatgctagctgaattattggcatgggatgtgtgtatggttttgctaggaatgtcccataaagctagcaaagcatgcagtctagctagcactgtatatattgggtagtaccgtttatatatatgattttagtggaggcatatatatatcatatactgaactgttccatccataaccaaaaacacataatttttgcatatgaattagttggtcagacatgcatctatgtggtgcctgcaggccatgggcagatgagagatatgggctttctgaggagaggaggtggtggagtggatggctttgacgtgcttggtaacacctcttcaattgcaatcgccaatattaggttagtatactccacattatatctggtcgattaattaattattgtagcacactaatattgcgcaatgaatgaaataaaagtatcagctagggtttcccttttcttttacacatcagggttgtttctaaccttaatttgattcttccttttttttttgcataatcggcatttgtattataaaaaaattatattgtacgttgtggctgcaaatctctgcgtcttccatttttctccatttgatgcatgttttgttggatttgagcatcttctgtgcatgcaattaaacagatatgtctttatatacatcaatgcatgcttgcaagtatgtggggcagttaaattgcatggcagaaaattttggagctatttgaatgtacatcataattaaactcatgtgccggatctattagatcgactcataattgtctttcgatactaatttgtacaatgctcatgttaactttctctatatcaaattaattatgtgaaggggtacggtttgcatgaaacgacgttttaatttccatttatggtttatggttatacatataattaattgataacatttaattaatagggccttcaatctcaaggatgcaaatatataagtcacattaattaaaaaatcaatattattaatatgtttcgatgttcacatattgtcagaatgtgcaagtttaacagttatattgtcttactatttggcatcgttacttaattaaacttgatattcgacactacattagcaattcccttttcattaacatgaccagggatgcatctaaaatattaataagactgcagccggtttgtgtcgcagaagtactcctgttttgatatgattgttattaattaaatatcctcagtagcgcatttagagagtagatctagtactcctacttgattttcagacacttaacgcatcatttcaatcaggttttgtcctgtgtagaagtacaagttaacaaattatcattaaacgttcagagaatgtacgacagattcaaattaatggatttttagtacaaattaacaacggtccgttcatatatactccagaaaattaggaatgcaaaaaatgaggggatcatcatatcaaacattgtgtgtaatgcatattatccacaaatacacatggtatttgtcatatggatatttgtatggatgaattaagtagatgggagtgattctgaaggattttataattaagaagctgatctgagaaagctacgaacaggaaaattgtgtatattatatatcattattaatatgttccataaagtataaacatattaaattgtattttacattttaaattttttaaaagaacttggggtcgaataattaacaaatattttctgcaagaatcttatgtattttatctaaaggaaggaattctcatatatttatatattgattttttccaaaaaaaacctgttattttggaggaaaaacaagtttcctaaaacaattagtttttacccatgtttttcaaaagcttgttttctcaagaactaccacatgagatgtttgctagcattttacccacgggaaataattattaacaacattattacaaaattaaatatcggttacgtgcaggggcggagctacatgtgcatggggtgcaggaacctagctcagacatttttttagctataatttatctattttcactatatatgcaccttctaaattaaaacttacatactcgttccagtctaaacttgatcttgtcccaatatatagagggtaaagcaagcgattgaaaccctctccatttgattctagcttcacatctggttatgtgtatatcgatctaggatacttaatttcacgcctagaatatacatcaggctggtgaacatttatcaaatacttcaattgacctactatatatgttatatctaggatgactggctgtgaacttaattacagtaacttacttaggcatatgtaaaaaataagtgaagtattcgtgtattattgtgcagattaagatattggtcaaattcatgaatctatatttatttacacatgataaaactttttcctcccattattagtttgggtagtgtgaggttttgagaggatttgctatgacgtgtaactgtatctacaagccttaatttcatacctatgatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatagacacacacacacaagggttgtactttaataaactaaagtttaaaaaaaacacacttttataacccttgtataattgtacgtgtatgatcttagaataactgtactacttaggcctatgtaatagaataaatgaattttatcgcattattattcatatttaagacattactttttgagcaattttacagtccttgaggggtaacatgaggcaccattttttctattgcaaatttggtatctctttatatctagatactatgaggtactaaattttatactaaatttttagtatcttatggtacatccttaaggaccgtagaatgctcttactttttaggtatggtttcatgggttatcactcatttgatggtttcctcgcatactattcccctttcttatatataataacaacttattttctctcattagttttgtgtggtgcggtgtgataggttttggaagggtgcggttgcagtagtgtaccccattgtcaatcctaggatttgatccctggaccaatatttggttatcggtcgtccttttcgacacaatgggaattgagtgctaacaacttctattggctgtcatgcatatttcccttcacttatgcatgaatacatatatctcccagagaacaaggtggctagctatagctaagggtgacaaatcctgcatactgtctgatgtagtagtactactactacagccatgcatatactgtccttctctcgtgattcaaactctcatgcatgacacatcctctggtgtatgctcagcatgcacacagggatagagccatctatcagacgactattatcacatatgctacccagggtggacatggcctgggctgggggacattgattaatgtctttaaaggaaaagtaatgcctactagtagctatcattaatgtttgcaaaaaagaaataaaaattgtactggctgctggaagaaaggtcatgatgcatggcaagactttcttctggcctccccctcttctccttgcttgcagtactgcagttttgttgcagctacagtagctgatctattctctctgaggtcccaatattaagcatgcacagagctactccctttataaaaaaaactcaatttagaagagattatattggctctcaattgagtttttcctgaacggaaggagcagaagtctagccaccataccacgtacggaccgggagtgtagctagctagggtttctctctatatatttttttctctcgctcacttgccgagaaagggggcgcgtttggtcttgtgtgtttctccgtctcttttttgttaatccgcattgcattgcatcttgccgttgtataaatctggtccatacattctgtctgtctagacccgtgttttcttctaggttaagttttttttttatggatggagtagaagtatagcagctgtaggtacgtagcagtggcagcagggatatatgcagcagatagctgagagagggctgcatatatgccttagttgttgctcttgtgatgattcattgatttccatggccagatccatatcaattgtccccctgcacccatgcatcagggctagtggtggccggaatcttggcgtaaaacaagtagaagatgacaagccgctgctgcagctcagcttgcttgcttgcttctgcgccctgcgatcgactacatttccatccatccatccatccatcccttgccttgaccgagcagcccagaaagcctgccatgcacacagcgacctctaattagcgcatgtagtactaagaaaatatttttaaaattttctctaggaaaattaaggggctgttatgtggctcaaaatttgatggccacgcttgtggcaaactttgactaagaaaagggtttatgactagtgggaccaaaagagtagaaagtgtggcataccaaagttatagaaacaaaccaaacactagccacatttggtcaaactaacatacctcaagtgtggcaaaatgtggcaccaaccaaacaggcctaagaagatcggttagttatgagataattaattagttgtgtgattggtaagaaaagaaaacggatgtagaaattaagtcagagatgattacagtttagttagttatatttgaaataaattttaaacgctacaagttactcctctatggccatgtttagttctttggctaaaaactttttaaagtatacggacacatatttaaaatattaaacgtaacaaaataaattacagattccacctgtaaactgcgagatgaatttattaaacctaattaatctatcattagcaaatatatactgtagcatcatatcgttatgatatcatggcgtaattaggctcaaaatattcgtctcgcaatttacatgcaaactgtgcatttggtttttttttcgtctacatttaatactccatgcatgtgtcaaacatttgatatgatatttttaccaaaattttttttatctaattaaacactccctatatatattttgtggccatgtaggagatctattacttaggccctgtttagttcacaccaaacttcctccagctcccaactttccatcacatcacatcacatccaaaactttcctacacacataaactcttaacttttttttttcaaaataccaactttctctaaacttctccctaatttcagaaactaaacttcttcctaattttagatactaaacacagctttagctagtggcgagcatggacaagccaacttggcagcagctagctagctgtagctagcaaacattgcattaacagcacaacgacgacactgtcactgctgctgctaatgccgggctctttgtgcctttgctctcgtgtctctcgatctctgacgatgatgcgttgattgcgtacacaagcgacgacaatgtatgagagcgagcgagatcctctctctgggctctggcctagcttgccaggcgagacggagttaattccttctgtgccgctgtgtacgtacagtatgtacgtacgtgtgagtgtgctagctagctagctgctgctgcatgcatctttgtttgtgtgatgagttgtaatctctgatggttttaactgtttctctgcacgttgtattcattgtgtctgctgctcttgtctgacccccggcctgcgtacgtgtacgtatgtatatacagtatgtatgtatctacgattctacgtcacgtgatccgctacgtatatatctctgtacatgcatatgtactacagtacgtatatcttgctatcatcagatgtacactgcagtctgcaggcatattttctcgtctagttcttttaattccagctgcttcttttgcgcacacacacacacacacacatatatatatatatatatatatatatatatgctagtactacctccggtcatttttaatttattgtcgttttggacatatgtcttagcttgttttctttctaatttggttgtcctaaatattaattcttaattaatacaaagcacaccccaagtcttctgttgtgtagttattagccaaaaaaaaatacgctacatgcagaatgctcccaccatccaaatttatgaaagttttaactaataattaaactataacaatatgcatgtttactgttacgcatgtgatattaagatatattcgtacatattcgagttttatttatattacgtaaattttgtagttgctgataatatattatagaaaaataatacaatgtagtccatgtaaaacaaattttacgtcctatattttagagacggaagtagtgttacagatgtgtaaaaggaaaaaactagctgggagtgtggagcgctagatcgatggggtgtgtggggtcaggctgtgttcgagaggaggggaacgcaaaataaagctcgtattattgcataattagttaagtattaactattttttaaaaaaatagattaatatgtttttaaaagttttttttttgcataaattgtaccgtttagcagtttgaaaaacgtgcgcacaaaaaacgagagaggtgggttgggaaaatgggggaaggaacacagccgcctagctaccgagctgtctgttagaattcctaattaacaaatttaatttgattgatgaaatgtatcacctgttagcgaagaaaattaactgagagccggagtatgatgcaatattaatttatttgtgttgttttattgcagaaggcaggcagcagggtcgccgggtgagcatcatcaagagacgatgatgagcagcgcctggtgccagccgcagttcgcccagcagcaaaccactgcttgtgggctgccgctgccttgcccctacatcgtgtccactcaccactacctcatcaaacaaaaccagctggtatatgcatataattgatcatacattcacatccgtgcttgccgttggtctctacgtatatacagctatataaaggccggttagattgatttagattatcagaaaagtaatgcatatttaatttgcccattatctaagctaaccaccacaaaatataagtaggtttactttatcactgctattttattaatttggtgaaaacaggtgattcaataatcaataattcatactttcataggggtgtctggtttactaccaaatttgtcaaactccgttagcctattattgtttgtttcgttgccacagttaaatcaggccatagtacgttttattttaatctagaggcccacacgtcatacactctttttttaaaaaaattcacatcttgtctaaggtattgccatcaattagcaacacatttgggtggcaatcatgtctggcaatttctggggtgaaataaacatgaccttaaactctagcttaattcctggctttcctccttttgaccttttttttattttctctttcctgtattttggatcatatttttcaatcaatctttaaattaccacacttccagatcccccttatgttttccccttaaaaataattaactaaaactcaataggagtgttattctcattgatgtgtccccacaaaactaaaaattaagtgcatgatggtcacatgcatttatatggatcacatcctgcacattaatgggttttctctgtatacagcgctaggtgtggggatatagaggtttaattaggggagtaattgatatttgcagtgttggggactacaaacagcatattttcaatgtccctgcaggctgtacgtaccttactccagctagctagcactgtaccctctgccatatatacgtgccaaatatttttgcctttggaccggttaattactgtactcgctcctgattgaatgcatgtccaaacagtagtatatactgtatattgcagagcttgtcctgcctcgatgataaatcggccaggtcttcagatgtgtacagtttaatgccgttaattactactcatcatcgatctgcattacatgttgacatggatatgtgtatatatattaattgtgagttttaattaattaatcatgtaaaagatgatgcagggaggttggaggggatcatcagggcagcagctggcggtacagcaagatgctgcagcccatagcagcctagggatcaagaacatgggacaacaacgtctgcctgctgctgctgctgcggctgcaggcaaccatgatgatgagattgtagtagtcgccagcaggattggacgacgatcgtcgggtactgcaggctttgctaggtcgtcgcctcctgcagcttcaggctgctggacgccgacgacgacgacgtggtcgccgccgccgccgctgacaccgcagaccacgtcgacgacgacgacgatgaggggcagcagcgtcgtcgtcgccgcagcagcgcaggcgtgcatgaagcagcagcagcagcagcagacgccatcgagggtgccaagcctggagatcagcctcgggaggcaggggtggcaaagcggcagcagcttggagcagcagcagcagcatcagcagcgtcatcatcagcagcagcagcggcagcgcagcgtggagtcctcggcgtccaaagaactaacgctactaaagtgcttgtgagataattaattaagtaaattgagtttatagtagagtatgtttagcaagtagtagtagtttaagtagtggttaattagttattaatctcaacaagcagaattaatcgaagtgtaacaaaaattaatggccgatccccaagcctgctgctggctagcttaatttcaacaaatatgagggcggatgctagctagattaattcttggctagcttaattaatgtttttgttctgtcttctctgctggttgcttttcatattttccaactttattttttctttctagtgcatgcatggcttga</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
