Difference between revisions of "Os03g0680400"
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Revision as of 19:40, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os03g0680400 |
|---|---|
| Description |
Tetratricopeptide-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001057437.1 GI:115454602 GeneID:4333724 |
| Length |
10076 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os03g0680400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:27771177..27781252 |
| Sequence Coding Region |
27771177..27771252,27771381..27771458,27772125..27772287,27772355..27772389,27772645..27772809 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggatccgccgtcgccgccggatgtgctcagcaggtccgacgtcctctcctggatcgccgaccgcacgtcaatcggaagcggcggcggcggcggctcgagggagagcgcgttgctggaggccgtggcggaggggaacgtccgccgcctgaagactgtgcggtggtggtgggctgacgacaccataacaaagatgttggaagatgtgatgagcagttctgagcgtttagtctatgagctgttgcagttgagcgggccagggtcaacaagcatcgggttatggggtcacttctcacatatgaaggaacacactggttggttgcgccaagctgctaatgaattaagatcctgcgaaatggtgaatagaatggatgagaaggacagggaaaagcttactgatatgcatatagatggcattgggttaatgcaagtggcagcaaacctgggaaaaattgaggtcatcaggtaccttgtggaggagcttggctttgacgtcaatgctggttgcctctgtggtggtgctacagctttgggttgtgccgcattatttggagaagttgatacttaccatgttggttgttcattttatttagggcatgaagaagtagcacgtctcttgttatctagtggatccaggcttgatatagctgttgctcacgggacaccactacatattgctgtttcctttgggaagactggtgttgtcaagattttattggatcaccatgcagatccaaataacacttcaggagtttggggtacccctatactcacggctcttcattctactaaacatggattggatgaatctgattctttgggatgtgtaaagctgcttgtcaaggctggtgctgatgtgaactatgcttgtccaaacactcccttggtggtggccacgacagagggtttaactgattgtatgaagtacttgcttcaggttcacgcagatcctaacatcccagataaacagagcggacgcacaccaatagaaatcgctgcaagcttacgaaaaagaaatcatgtggagattctatttcctttcacttcccctgttagagcagtaacaaattggacagttgaaggaattattactcatgggaaatcaagatgctcaatgcccaagattaaggatgagccatgtagcaaggtcaatgacagaaaggttgagctaaaatcactgggaggaaaagcagttaagagaaaggactaccttggtgcatcaaggatatactctgaggcacttgagctagattattttgatgcaaccttgtattcaaacagaagcctttgctatctacgaattggagaagtgcaaaaggctttgcttgacgcagaaatgtgtgtaaaactgcgacctgagtgggtgaaaggccactaccgggaaggagctgctttgatgttgctgaaggagcacaagaaagcattcgaggtgttcttgaatgcattgaaactggatcctgcgaatgctgacattgagaaagtgttgtgggaagcattggaggcgatgaaaaaggatgatgctgctgaagagaaaaccttaaagtcggtagattacacgctccatttgcagatgcatatatgctgtcctgctgggtctgaagtgaacgcttcttttggggtcttttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDPPSPPDVLSRSDVLSWIADRTSIGSGGGGGSRESALLEAVAE GNVRRLKTVRWWWADDTITKMLEDVMSSSERLVYELLQLSGPGSTSIGLWGHFSHMKE HTGWLRQAANELRSCEMVNRMDEKDREKLTDMHIDGIGLMQVAANLGKIEVIRYLVEE LGFDVNAGCLCGGATALGCAALFGEVDTYHVGCSFYLGHEEVARLLLSSGSRLDIAVA HGTPLHIAVSFGKTGVVKILLDHHADPNNTSGVWGTPILTALHSTKHGLDESDSLGCV KLLVKAGADVNYACPNTPLVVATTEGLTDCMKYLLQVHADPNIPDKQSGRTPIEIAAS LRKRNHVEILFPFTSPVRAVTNWTVEGIITHGKSRCSMPKIKDEPCSKVNDRKVELKS LGGKAVKRKDYLGASRIYSEALELDYFDATLYSNRSLCYLRIGEVQKALLDAEMCVKL RPEWVKGHYREGAALMLLKEHKKAFEVFLNALKLDPANADIEKVLWEALEAMKKDDAA EEKTLKSVDYTLHLQMHICCPAGSEVNASFGVF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..76#205..282#949..1111#1179..1213#1469..1633#2748..2794#3456..3623#5314..5424#5703..5828#6225..6377#8350..8463#9172..9342#9430..9509#9938..10076#atggatccgccgtcgccgccggatgtgctcagcaggtccgacgtcctctcctggatcgccgaccgcacgtcaatcggtcagttcgtcgtacacctccccggccaccgcctcatcaaacctagctagttcgcatctcaatttggttagtatctaatggcgttgcttctgcttcggttcttcgtctcctcctcctcctccctccaggaagcggcggcggcggcggctcgagggagagcgcgttgctggaggccgtggcggaggggaacgtccgccgcctgaagagtgagtgctcctccctcctcgtctcaccgccctccgacgccgcggcgggtttgatttcttctcgtcgggattcggcgcggcgcgcgtgcgtgtgtgtgtgcgctcgcgtatgttacggttgctcgtcggcctgcttgcttgtccgtgtacgtgcgagcgtggctgtttcgatcggtctgcctacgtttttttttccttccgcgcatgtcacttccaggggcggagccagtattttgaggcaccggggtcacactagctagtctaagctaacgccatgtttaattaggctctaattctaagatcatttttttaatctacaaatctttagagccaaaagatattggaactaaattaattgtggattgagataatttcgatgagatatcattatcttagactaaacataaagtgttaaatcactttagttagttatgtagacataaaactccaaatttggcaataatttatgagctaaaactatataataattgacaaactacgcctaattattttgggcacaaaaacaggtccccagagttgtttattaactaaaaggcctaatgtgtagtgtagatgattagtagaattactagcctaattgcatgtataaacacactacatagaaatagctaatttgttaagtgatgaaatatgctaatgggttagctgtgcggtggtggtgggctgacgacaccataacaaagatgttggaagatgtgatgagcagttctgagcgtttagtctatgagctgttgcagttgagcgggccagggtcaacaagcatcgggttatggggtcacttctcacatatgaaggaacacactggttggttagatatcatcagtgtcatctaacccgggtgatataacgtagttctgcccctggtcacttcgcaggttgcgccaagctgctaatgaattaagatcctgcggtaatctgcttatctctgatgggcaattatagtattgcttgcatcgcggttggatttcgctatgctttacaagctggaagtgcttcacaccttcagcttgggatgttttcatgctctacagttgtgcttggcgagatatggttttgtgatttgatgttactttccaattatgacccagacatggtagtttagaattgaatttttgttgcacaatctttcaccatatcatgattatcattttcttctatgaaacagaaatggtgaatagaatggatgagaaggacagggaaaagcttactgatatgcatatagatggcattgggttaatgcaagtggcagcaaacctgggaaaaattgaggtcatcaggtaccttgtggaggagcttggctttgacgtcaatgctggttgcctctgtggtggtgcgcgcatttcttccagtaattaattgtatttatttatttttggattgttttattagtttattcagaaattatgtcaaccaagctgttgcgttttacaatatttagttcatacaatgctacattcttttatgtttgattgtgacatgttataaatagtagcagcataagaaagttgggctgctttagttagcaatctgctgtgattgataaaaaaatgtattttggatttgaggtcatttctgaacttgtacgctactttctagatttcattccatatataacataaggttccatacaggatcgatatatagcatcccataattcagtgagaagcaagctgggacatatagcctttcctaaaatgcaaacaaatgcatgcatctactccgtgcaatgtgccattttgtggccatcctatggtgagatggtcttttagaagggactatctacatgccatttgacaaattttttattcaaaatcacctggatttttgaacctctccattatcaactcctagcttacattagagcaatacgaagaagaaactcattaacaagattaaaaagaataagtagtttcattagaaaatacaatatgattaatttttttttgataaattagaatacaaaaagttacatagaaatctaaaaagttaaagcgtgttaaaagtagtgtaagagtaatatttacattgtaacttagactatggtttctctttgtcaacattgccttcatctctctcccgtgttaaagtcgagttgtcatccaatcatattattgggtagtggaaaaggtaaaggctgcatgcaaaatatttgccacctatgccctgcacctggggaacgagtgaacaagaaaacttggttgtgcctgctgcctggggatgatgaggccaaaaaaaaagggacacatatctcgaggtatatcgaacggttaaaaaatgagtaattttatgctaaaattctgtcgaaagatttatagcaaacccgctttcagaaatcgtattatttaccatgctactaggatttcagcttgaccgctgaaatcttttggatgagagccaagttgttggtaacctcacaaggtacttgtcttcattgttgttgacaggtgctacagctttgggttgtgccgcattatttggagaagttgatactgtgagatatcttcttgactgtggggctgatcctaataagatagatgagacaggccatgttgctcttcattgtgctgtgaaaaatggtctttctcttcatgcctactactatgttttctcatttcatgactaaggatgtcttgctgaacatgaactgatggattcaccgcaaaatttaaccatcaaatgaagaaccattttgggtttaattatgaaaaaaatatatttagtaatccatttttgtgactgctctctcggggtagtttctaaacattggattataacactctcctatattcttttttgcttggctagtttgcttgctgtactctcctatactctcgtacattggattaacactctcctattatttgaagtaaagctgtctaaaatattatcctcattattctttgtaaagttctgttagctatattttttttactgtttattcaactattcccccacaaacgatcattttcctgttgtcctgtgtagtattataaaaacaagcagttaagtatttagctaagcacctcaccaagaggcctataactcctgccatttttagctttggcaagaagttagttggatctttttagcacatatcctacttttacctaattatgtagtgtgctaataatacttgttctttgttatgacagtaccatgttggttgttcattttatttagggcatgaagaagtagcacgtctcttgttatctagtggatccaggcttgatatagctgttgctcacgggacaccactacatattgctgtttcctttgggaagactggtgttgtcaagattttattggatcaccatgcagatgtaataactattttcacgtttttttcatttgcattattcttgtagctcgatacaatctgaatgatttgtgtgcttgtgttcattcggtatttcatgccttcgtagtttactggctcttaacatattttgtgctgataaatcaaataaatcatttcataatattgtttcaggcgcattatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatagagagagagagagagagagagagagagagagagagaggagctggataatatgaaccttggttcatatgcacctcactcatttgggtgacatgtgtacacattataatcactgtaagatgtacctatctagctttgtgcccttatagtgtgagcaggggttggtacatgatctaattgccaagaccaaaaatgcccttgaagtagtactccactcctattggacaatggctcatcactcactcacaattctctgttaacccatgcgcatgatagtgctagaaggtagaatcacttgattaagtcatatcattaataaccgttgctagcacttaattggctaagtatctgatttttatgttttgacatttcacctcaaataatttcttttggtgattttgatttcacatgagctctcataatgttttgcgttacatcaattgtttaacaaaaaaatgtcaacccgtgtatataacaaatcgatatttcattttgtaactgccttttttggtgaatggtgatatactgttcttgtaaatgtagatatatagatatgttgaaattttattgtatgtacatatatagatcaaactttctttttgtaaaatgttataatggtaaattgacatgtattattttctatattacatttgtaggtacatcatttaatgtaaatctagctatatgtcattatttcgaatatgtatgacatttcatatgaatttgaaaatatgtataaaatttaaaatgcaccacaaaagtatcacgtgagttgtcccggacctctttattggagtaatgtacacgttgcataatcttataattcatattatcttatatatgcacgttagatttttattcaaaaatgatatagctgcaaattttctcctgccaactgccataatatccttcctttggtggatcttagctgaggtattatttacatatttcatttag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