Difference between revisions of "Os03g0707300"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os03g0707300

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001057566.1 GI:115454860 GeneID:4333859

Length

9359 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0707300, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:29234741..29244099

Sequence Coding Region

29235056..29235088,29235175..29235220,29235327..29235442,29235566..29235679,29235984..29236054
,29237825..29237873,29238755..29238846,29238935..29238977,29239085..29239197
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,29242974..29243055,29243157..29243314

Expression

GEO Profiles:Os03g0707300

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:29234741..29244099 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008396:29234741..29244099 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgcgtgatccattcagtgccccagtcgatttcaataacgagaatcaccgtgctggaaatgagcttaccaggactaacatgccgttgtctgttggggactatggtttgcaaaatggtgacgctacaacctttgctgtaaacaccgacactctagtgaggcatcaactccagggtgcatccctccagaatgacttgactgcagaagattctattactcgtttgatggatccagaaactaaggggttatacttcagatcacggtcacaagaggaagagatcttattgcttcgcaagcaaattgcagatgcttctgtaaaagagctacagttgctgagcgaaaaacatattctggagaggaagctttttgacttgagaatggctgttgatgagaagcaggaagatgctatatctggtgctttgaagcaactaagccagaaaaaaggccatgtcgaggaaaatatgagactagcaaatgatctgaaaggtgaggaagaagagctatacttcttcacttcttcattgcttagtatgttagcagaatacaatgttcgcccacctcaaataaatgcttcagccattacagctggtacaaagcgtttgtaccaccaaatgcaatggaagatcaaatatttaaatgacagtttaggtgagataactcaacctggacacatatataataatcccaatcatcaacaagcaacgccgttgaggcatgaaccttcctcatcttacaatacggatgcaactaggaacaattttcatcagtatgctcaagatccaaatgaccgaaatactggacagatgtaccatggatccaattatcatcaggaaatagtagctgctaccccctctaattattttgaagaaaataatggtcctagagaagtaagattagacgactcacagttttataggcaggataatcaagagtattcagctgatgatgatcctttgcctggtattgaggggtttcaaattgttggggagcctagaccaggatttacattaacagcatgtggtttccctaccaatggtaccaccctttgtaatttccagtgggttagatatcttgataatggcaccaggcagtctattgaaggtgctacgatgtatgactacgttgttactgctgatgatgttgacactcttctggctgtagactgcacgcctatggatgataatacccgtcagggtgaattggttacagagtatgctaacaacgggagcaagataacttgcgatccggagatgcagaacactattgatatgcatatatcgaatgggagagctcactttaatcttcttgtgctgggatattcttctgatgagtgggaactagccatcttgacgcttaaacgaactgggtaccatattaaggtcaaggatgaagttctaaccgaagagaaatattcatcaaatctacagacaaaaattccgaatggacgcactactcaatttgttttagttagttctggaggtgtaaatataccatttaacacacagggaatatcagaaccaaataacgaggatagcgatgttaggttacgtgatctaatcgtattggtcttgagaactttccagagtaaggcattagatgctaaaaggaaaggaaaggtttag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MRDPFSAPVDFNNENHRAGNELTRTNMPLSVGDYGLQNGDATTF AVNTDTLVRHQLQGASLQNDLTAEDSITRLMDPETKGLYFRSRSQEEEILLLRKQIAD ASVKELQLLSEKHILERKLFDLRMAVDEKQEDAISGALKQLSQKKGHVEENMRLANDL KGEEEELYFFTSSLLSMLAEYNVRPPQINASAITAGTKRLYHQMQWKIKYLNDSLGEI TQPGHIYNNPNHQQATPLRHEPSSSYNTDATRNNFHQYAQDPNDRNTGQMYHGSNYHQ EIVAATPSNYFEENNGPREVRLDDSQFYRQDNQEYSADDDPLPGIEGFQIVGEPRPGF TLTACGFPTNGTTLCNFQWVRYLDNGTRQSIEGATMYDYVVTADDVDTLLAVDCTPMD DNTRQGELVTEYANNGSKITCDPEMQNTIDMHISNGRAHFNLLVLGYSSDEWELAILT LKRTGYHIKVKDEVLTEEKYSSNLQTKIPNGRTTQFVLVSSGGVNIPFNTQGISEPNN EDSDVRLRDLIVLVLRTFQSKALDAKRKGKV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>9012..9044#8880..8925#8658..8773#8421..8534#8046..8116#6227..6275#5254..5345#5123..5165#4903..5015#4711..4826#4504..4592#4329..4430#3301..3342#2559..2669#1555..1659#1406..1465#1216..1293#1045..1126#786..943#ggcctcctccctctccctcgacaccaccccccgtctccaccctccccgccgcctgcgcggcgccgccgcggcgatccccaccacggcgacccgcgtagccggcgtgtcctgctgcttccgccgcgtgttctctcgccggtgacccctcggcgcccaagtcgacctcctcccccccgcccccgcgccccctctgccttcccccgctcccgtctcctcccgagctcgcctcgccctctcgccctcccgcccgcccgccgcctgcgccgatctccatccgtcccgcgcgcgtctaccccgtcgccctgctgcttccgcctccggtgagcacccgtgcccatgaacagcctcttcctttctctcggttctagccacaccttctcgcttttgccttaaccgtatcttctcttctagatctgtggaagctaggtttctctctgtcttaaccttagtaacaatagcagttttttttccccaaaagaaatttggggttgaactgaatcagcagcatatgccccacgacccacgttaggtccgccaatggtgggagatattgtgtgttgtgatgtatctcctttgattgacccgttcgtggacgctgccattagtttgattggattcatccttgtgtagaacataagcgaatgcaacacaagcgatcggcctaaagtactaacttatagtattattaatgatcaaactaggtagaattaatccatgtgctgtgtttttgttatgctgccatgtgcttgatcagctgatactcctactttctacagaggaagaacatgcgtgatccattcagtgccccagtcgatttcaataacgagaatcaccgtgctggaaatgagcttaccaggactaacatgccgttgtctgttggggactatggtttgcaaaatggtgacgctacaacctttgctgtaaacaccgacactctagtgaggtccttcattcttgtgagaaatacaactattgtgggcatactcgtagactgtactcacttctttgtttattgagaaatgggtctataccttgtgctcacaggcatcaactccagggtgcatccctccagaatgacttgactgcagaagattctattactcgtttgatggatccagaaactaaggtaactctgcaggaattgcactggcaactggttctttcagtttgtactccgctttcttccttccaagaccctttgctgttttgttgcaggggttatacttcagatcacggtcacaagaggaagagatcttattgcttcgcaagcaaattgcagatgcttctgtaaaagtatgagctagccagtgtgactttttaaaattattttacacacaaatacttttaacgttttctcctaccatttctgcttaattccaatatcagttacttcttatcttggtaggagctacagttgctgagcgaaaaacatattctggagaggaagctttttgacttgagaatggtctgaatgaatgattcaatttcattttactgcatggccaaattgtgaggcattatattgacatattaacccaaatcttactgtggtaggctgttgatgagaagcaggaagatgctatatctggtgctttgaagcaactaagccagaaaaaaggccatgtcgaggaaaatatgagactagcaaatgatctgaaagtatggcgctactgtacattagaataatgttggcacaagattaaaaaaaaaaatctttgtttgattgtcaaaactgaaaaaaaaagagactatttctttaggttgattatttatatattatgtttttatttaatagaatatgtttcatgcgcaatgataaattggcttagacgaatatcagtgatgccaaatttatgtctaaattgtaatatgctacgacaaaatatttgctactgaaattccaaattgacagacaatgttgcttccacatttgctttgaggggctcgaaattcttagattggtcaaatgaataaaaaggttgatgtcaagttgttttatggtcccaaattataactgtgaaatctccctaggagcctagaaattcttgcattaagcacaaaaagacggaagatctatgttgcttcttttggtggacgttggcccttgattgtaaaggctcaaattaatctcaaataggttgaattagatttacagatatattacagttggttgcttgtgtactgtcatattaggaacataaaaaaatgcctcactttctttagaactcaactcctatagtcacattgcttcattcatgggatttttcagttgcacgctactccaaagcttgtaattttaagaagaaatggcaactgctgtgagtatagcgatcatcattagttctgagcccacatgtgctgttagtgtaagaatgattaacagtttactgaacaaagttcagggtggtatgcttatagttaatacagctgttgtccttgttttctgttttgcatttggctgttcaacctctgttcgttactgccaaccactttataagttcattacatgccattgtctttttaacaatttagatactaacttttgattattcttctagggtgaggaagaagagctatacttcttcacttcttcattgcttagtatgttagcagaatacaatgttcgcccacctcaaataaatgcttcagccattacagctggtacaaaggtaactctttcttgatcattatcagttgaattgtccataatctgggaatatttatcatagtattatctcaacttacaccctttggatgctcttatggtaatagtggtgagtttttccatagactgttgtatatgagctcacaatttgtttacctatgttttgctaaccgcctaatataaagtataatcaataatgaagactgaaagtgaggggaaataagacttactgatttaacttctgcttaacagccacctctgcacaatgttactatgtcactccttatcaataagctacagattagtctaatatatgttgccttctatgttgtttacaataagattattacatggtttccacttagcatatttgttgcttgggcaaccaactgtttatgcagtttacttaggcttaaaaagctgcaaaataaactaacatgttacttatttttgctactatagctatcatgtcaattattttggcattcttttcttgaaatctctggtggtggagttggttcatttacttacctagattaatatttaaaaccggacatatttagtaaattctttttgatatttttgccctgtctgatatgaggaagtaatacatttctattggccataattttcagcgtttgtaccaccaaatgcaatggaagatcaaatatttaaatgtaagtgaccatagttatgtgaactctagatattgaaagtattgaatgctgcactctctgtttgcttttatgggtggtcatcagggcatctgccaggattctgtgacttaaaaatgatcacatgatgacagtgtgtttggatgaaagtaatcatagaggctcatattttgggtgactgcagcccagttaatgttgtttctagaagtaaatatcgaccgcaaaaaatagagatatgaaactttcatgctgttattcaacatctctgaaattcctgtgtccaatcaggataagcatgttgttgccttgttggctgtgcatgagtgtgtgtttgtggtggaaaattcatgtaaaatatgttcacacttgcttttactttttaatggaaaaataatatcttgcatgcaagtaatccaatacaatgagatatggggtgctgttggactttattatttatgtgctggagacattggtgcaggtggattttgtatatctgttggcatggctgctcattgacattgtacgcaccctgttttaatcagctgtagtaggcagctaggccacatacaaggaatggtcccttgttcttgtaaaattggctggtttgatcatataatcagttttagatggggtgattgaacaatgataattgtttcgttgttctttaaaatgagtgatgaatatgcatgccccaagagtgatagattcatacacaatttcacttgttttagagttacgtcaaagcaatgccatttcaacttggtgcagaagggcacaagctcacagcacaattatgacagtttcgaatatttgcttatggaaggtcaaatgtcaattgaatagcttgaatatcatatagttgatcatgccctctgcatgtttgcatgttacaccagccattttacatgttatattgtaagatactgtcgctaatgaattgatatttcaaaagatttgttttagacactcagtttattttactgattcaggacagtttaggtgagataactcaacctggacacatatataataatcccaatcatcaacaagcaacgccgttgaggcatgaaccttcctcatcttacaatacggtatagaatacatggccctctagctagcttgtgtaataatgtagcaccatgcatgacctgatcatatctgcaggatgcaactaggaacaattttcatcagtatgctcaagatccaaatgaccgaaatactggacagatgtaccatggatccaattatcatcagtatgccaaagttttgtttcagagattcttttacgaattacagttattggctgtccaattaatctgtcatctgagtgaaaagatccttcatctgatgtttaactggccttcctttcagggaaatagtagctgctaccccctctaattattttgaagaaaataatggtcctagagaagtaagattagacgactcacagttttataggcaggataatcaagagtattcagctgatggtaaataaagagcaaatcaagtaactagaaaatattccacatcatatctattgaattttttgtatttattatctagatgatcctttgcctggtattgaggggtttcaaattgttggggagcctagaccaggatttacattaacagcatgtggtttccctaccaatggtaccaccctttgtaatttccaggtgtgttgtgttctgagttctgattccagattgcaattacttatcttctctattaattgttaacttctgcaaataaaacctctcattacgaaacgttgttgttttagtgggttagatatcttgataatggcaccaggcagtctattgaaggtaaataagagattattgctcattctatttgttgctgcttagaaataatttgattgtattgattagctctctatattttgcaattcaggtgctacgatgtatgactacgttgttactgctgatgatgttgacactcttctggctgtagactgcacgcctatggatgataatacccgtcaggttattcacttatctgctgtaaactgcagtgcaatgcggttatttcatgtggtcaatcatagcatagtggctaagtctaaagagtttggcaacatgcattttggaacttatctctttgctaactggagggagtgtaaacttttagacgtaaagctgtgatcccagggaaggaaatccatcaactgacttgggagccatctctcgttcagagggggttaaaacttttttctgtgcctagctgttcaaattttggtcctgtgtcctgtacatggtattgcatattaaccccattaattgctttagtctgaatgtgttcttttactgggagtgtgccatcctcaattttttgtgaggctttcggtggcttctcattattggtattctctagaggcttacatccattttggctcttcaactacttgttaactatatggtttgcattattattttgggtattggaatcttcttggcattctgataggctgatcttgttctgttgtatcttttccatcctttactgcatcaattgggtagtttacagagtacaacccatttttggatgctatttctttattgcatcagccagaaaaaaaactgagtcataaataactgtccctttgtgtatttgttggtattcgtttttagatatatctgatatgcaataagtgtacataaaggttggcacatcggctttcctttttgagcaaagacgtgcttgtgcactgataatatgagtgtgcttgaaatctgttgttaattcatgggcttgaacttctaaacagaattatccacaccattgacacatggttattttactatggcagtaattacacctagaaactatgcatgtcaatttgatgagttgctcttcttcattgtagggtgaattggttacagagtatgctaacaacgggagcaagataacttgcggtgagtttatgatgcatgcgttgctggctttttggaccattgattgaatggattattatattgccagtccctgcttcaattttgtttatcaacatatgggaattgttatactttcagtggcacattttttaaaatttattaaataatggttatattttaatacaaagtagacaaaggcatcctgttggtaaaagggcaagttttcaccttcacaagttgaatctttatgattttgtaggtttcactgattaacctttgacattatttaattaaaatttgaccatagtggaaatataattttttggggcatatttaccttctttgagttaactttcttgatgtaaggcttgtcatattgtagcaaaaacaacattttaatgtagaaaacatctggatttctttttgcattgctcattttattttcaggactttatttgtaaaaacataaatggttgtatcattgtttcaagcacagtttgtggaaaaaaaaaacttgtttgcttacagcagtaaccatacttattgacactggactggagattgctggctcagccctcagttcacccgttgaacggccaatttatatactaaaattttagcatgtggatattacctttttttcctctgaaattgtattctgcttattgaaacctgactgtagattgctggcccagcactcagtccactggtcaaacgtctggtcttaaaattttagtatgtggatattattttctctgaaatcgtattgtgtggtactgtggtggaagaagtacccaattcatagagcttaaaatgtaaaattacgacacatgaaatttatgaaaacctatctgttgtgccttgctcttatttttaactcaaagcattacttgctcttattttttactcaaggcaattttactcttatactcaaggcattacttgctcttaggtaaacatattagttgtaccaggataatagatccaggggccttgcagctttgtagtggagtagctatgaggtgaaggacgaagaacaacagttaacctagataagtctcattcttgggtccaagctccaaaaggataatatgtgcatgcgttcacttccgactcactgtagactttgctgacaaatgctccacccgctgtgatgtaccacgcctccaagacttttccagcataatgaaaccatggatcaagcacagaacaatgttgctttgcctaatatggaactcatattcattggaagaagaaacaggatagatagaaagattgtgtgagattgataggggaagatgtaggatttaatgaaagtctggagcgatggctccacacacgatcactcagacctgctgatcagttcagcccaagtcttggccacaccatgtaaatagaaatttctcaactgatcggtcattgactgtcagatgcaccggcgtccttataaaaccactgattcgccttatttttaggtcaaagttcataaatggtcttcaaagcaaagccatcacacacaactgctgatccaatccagttctaatgactatggctgaaagaactaggatatgataactctatttgctgacccatcactagaaccattggatacagacatcatgaataatttacctgaaaatgaataagctttccataactaacaagagtttttgtttctttggtccctaagtaagcataatctatacaatcagttcttaagccaccataagtaactacatggtactattgccacattttataggtttcctaaaactattcatgtttctgcagatccggagatgcagaacactattgatatgcatatatcgaatgggagagctcactttaatcttcttgtgctggtatgtgttttagtgtttaaaatatctacttaccatcaatctttatctttactattacctccatcctaaaatatagcaacttttagctatgcatctggagaaacacttgtatatatagctaaaagttgttatatcttggggcgggggtagtaagtatactgccccatgatcagaaaacatgtttcgattgtttcttcttcaagatgccgtattgttaccatttccactatgttgtgcagagttttacttatgccagaataccccagaatggaggctgatttgcaccgttttgtttgcgacgcagggatattcttctgatgagtgggaactagccatcttgacgcttaaacgaactgggtaccatattaaggtcaaggatgaagttctaaccgaagagaaatattcatcaaatctacaggtatgttctcttgtgtatttattgatcttttttgtgttaatttataaatgctcaagcatattggctattttgattcacgtgatatgtttttgtttgattttgctatgcttcatgttttggcagacaaaaattccgaatggacgcactactcaatttgttttagttagttctggaggtgtaaatataccatttaacacacagggaatatcagaaccaaataacgaggatagcgatgttaggtgccaactgcctccttaactcctctgttacttgcctccttagtgcatttttttggttgatgatgggaataaaattcacacttctgatacaatcctacttctgtaggttacgtgatctaatcgtattggtcttgagaactttccagagtaaggtatctcctaaatagtgcatcttttcagatatgtggctgtatgttaaacccttatttagtctcatgacaggttgaatctaatgcaggcattagatgctaaaaggaaaggaaaggtttagacttggattctgtgtagaagaattttgctcattgttttgtgcagtcttcactttttggattttgagatgaaaggacacattttaagacttaaatggtggtgtgtaggcaaaaaaaaaaagaagaagatcaaatcagtgttaaaaatgtgtagtatgtgttgttctgcttttcgcatttcttttctttccccatgttttccccctctgctaggttatttagttttagagatactattgtatttaatgaagtctgagaaaaatccaatgctgtaagtaaacttcagaggtattctctgcagccatctaattttgatt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0707300, RefSeq:Os03g0707300