Difference between revisions of "Os04g0691500"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os04g0691500

Description

Armadillo-like helical domain containing protein

Version

NM_001060894.2 GI:297603633 GeneID:4337505

Length

12111 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os04g0691500, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 4

Location

Chromosome 4:35768971..35781081

Sequence Coding Region

35775478..35775579,35775689..35775760,35775898..35776008,35776491..35776574,35777880..35777987
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Expression

GEO Profiles:Os04g0691500

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ttattatatattttcttctgttttcaggaggctgctgaagagttagtaccacacttgggaattattttgcagcaccttatgtgtgcctatggaaaataccagagacgaaaccttcgaatactctatgatgctctcggcactcttgctgatgctgttggagctgagcttaaccaggcaaaatatctagatatatttatgccaccactaatcacaaaatggcagcaacttgccaactctgataaagatttattcccactgctcgaatgctttacatctatcgctcaggccctgggaccaggattttcacagtttgctgagccagtatttcagagatgcatcaatcttatccaatctcagcacctggcaaaggttgatcctgctgcagctggtgcattatatgataaggaattcattgtgtgtgcattggatctgttgtcaggacttgcagaaggacttggcgctggtattgaaagcctggtttcacaaagcagtttgagagatattcttttgcaatgttgtatggatgaagcagcggatgttcgacagagtgctctcgccctcctgggggacctttctagggtttgccctatacatctgcatccccgccttcaagaattccttaatgttgctgcgaagcaactgaacccgcaatgtgtgaaggaggctgtgtcagtggctaacaacgcctgttgggcaattggagaattagcaatcaagattggcaaagaaatttcacctgtggttatcactgttgtttcttgcttggtgcctattttaaaatctcctgagggcttgaataagtcacttctcgaaaatagcgcaatcactcttgggaggctttgctgggtctgtccagacattgtggccccccacatggaccatttcatgcaagcctggtgcaatgccttgtgcatgatacgagatgattttgagaaagaggatgcattccatggtctatgtgcaatggtagcagcaaacccaactggagctgtgggttcactaacttttatctgccaggcctgtgcaagttggaacgagataaagagtgaaggttacacaatgaagtgtgccagattttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>LLYIFFCFQEAAEELVPHLGIILQHLMCAYGKYQRRNLRILYDA LGTLADAVGAELNQAKYLDIFMPPLITKWQQLANSDKDLFPLLECFTSIAQALGPGFS QFAEPVFQRCINLIQSQHLAKVDPAAAGALYDKEFIVCALDLLSGLAEGLGAGIESLV SQSSLRDILLQCCMDEAADVRQSALALLGDLSRVCPIHLHPRLQEFLNVAAKQLNPQC VKEAVSVANNACWAIGELAIKIGKEISPVVITVVSCLVPILKSPEGLNKSLLENSAIT LGRLCWVCPDIVAPHMDHFMQAWCNALCMIRDDFEKEDAFHGLCAMVAANPTGAVGSL TFICQACASWNEIKSEGYTMKCARF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6508..6609#6719..6790#6928..7038#7521..7604#8910..9017#9968..10069#10154..10216#10285..10359#10662..10733#10824..10948#11012..11063#11141..11209#11286..11330#gattgattccctttctcctccggagttgtcttctcctcagccgccgcctcgccctcctcttcctcttcctctcgactcgcagcttcgtcggcggcgatggcggcggcggcggcgctgtggcagccgcaggaggagggcctccgcgagatctgcaccctcctcgacgcgcacatctcccccaactccgaccaggctcgcatctggcagcagctccagcactacagccagttccctgacttcaacaactacttggttttcctcctcgcccgcggagaggtcatccatcatctactctacctcttcccttccccatccccaactcccccctcgctagggttttcaccgatgcgaatatgcgatacccctgcctctaacgctgctgcaggattactctcgatctgaatcgcgccgcttcttcttatcgtttactgtttttttcctgcttgccttgcccccgtttgactgctacattagaagctccaattgctcggttggttgctacattagaagttactcgtgttgtagaatcgccactgctgattgggtgggattttcgatgctcagctgctgataccacctcttcaatggcgtggtgtctgttcgtcggagatacttccacatgtttcatcttatctactgcgtttgattataattacattgcccatgcttacaactatgttagaaattcattttgtttcttctcacacaaccctacatgcccgtgcacactccttcgccttcttgttttagctgctatgtctccatatacaagggtttcagttttctttaagcaaatgagcagcaactaaatcatgcgtttatgtcactgcgatgccccgtcttgtcatacatgctttctaaagtacaacctccgaatttttagattactcctcacattatttgctgttgtgacaagtcataggtcagcccgtagcgcaacgtatttgaaatgacctcaggttttagtgaggtttactttttatggaactaggcaacatcacgtgaaagcttaaatataggggtggacacctgttaaaaaccaaattgctccctaattagatgtacagattgaattgaagcaatactgttgttttggtttaaggtgttcgtgcaccatacagtagtgcggtcttgattcatcaatatcaatcaataaataatacattcaatatgattctatatccactccttccctctagaaaattacacatacagttgggatgatatttatctaaacaatggcagcaaggtaggatgaaaatttttaaaatgtttgtttctttctttcaacctttgaaatactatttttcgtttttatggccaaccaatgctaggaaactgtagacctgatgcagatttagccttgtaagaactctgcagattatcagccttgttctggaataaaatgtgttctttaatcttgatacggttataaccctataacctcctagtgtttatgtcttctctgacgtgtagtcaaatctcttgccagggaaaatcttttgaagccaggcaagctgctggacttctgctgaaaaacaacctccgagctactttcagctccatgcctcctgcttcccagcagtacgtaaagtctgagttgttgccatgtataggggcaaccaataaggcaatcagatccacagtcggaacagtcatcagtgtactctttcaaattgttcgagttgctggatggatcgagttgtttcaagctctacatcaatgcttggacagtaatgatctggatcatatggaaggtgctatggatgctatatacaaggtaaacttctctctcatatttttgagcctgatctgtgattttcacatagaagacttcgaacagttggtgtctacgtgcttaagcagtaactcagtagcgaacctgtagcatgaatactctatgtgaacttgaacatgatttgcatgctcaaaaacttgtttttctacagatctgtgaggatgttcctgaggagcttgatgttgatgttcctggtttgcctgaacggccaatcaatgtattcatgccaagattactgcaggtttgtgttacatctataactatcaaacatggtgtgtgtactttcatttccacaatctgtaaaatcataaattctatctgtttatgtgcaccatctgaatgcttattctcttcacaacatgcatctgtggaggtgtatacatgtttgcacactctggtcaacatgtttgcagcatttgttctaacagtctgctcaattgatttttcagtttttccaatcaacacatgcaatccttagaaagctagctctgggctgtattaatcagtacatcgtggtcatgccagcagtaagaatacccctcctctctctatgtcttaccttgcttaacaatttttctaatcattttcatttatatgcaggctttgtacatgtcgatggatcagtatcttcagggtttattcaaccttgcaaaggatccgtcagcagatgttcggaaactggtatttcaccatagagaaattacactatgttgctatccaactactttcttttatggaaatataaccaaaataattatattagtgtatagaagtacacaatttacagagcatcccacaagatccacattaaaccaaaataagataaaactcagaacactttctagttccggaataacgaaagcttgattataccccttaagaacaatgaggcctacctagatttcctttcatccttttatgagttcatttttctagctgaccactccctccggttgcaaaaacatgttgtttttgacgttgacgtggacatggtcttcaaaaatgcaatttcgacagataaatttctactggggatcatttgaaaaccctgataaaactataacgcagtgaaggctaatccgaatatttaaaaagacattgatgttcaaagttttaaagttttacttgaaacatgtccaaaattacatgtttttatgacaggagggagcacagtgagtatctatagatgctcctatgtactattcagttgctcagttgcatgttttaccttgatatagttctgcttcctgtctctttgataggtttgctcagcctgggttcagcttattgaagtaaggccatcaattttggaggtaactagcacattgcctgggcatttcagcaatctcaaataaaattaccataagttctattttttttaaaaaataataaatcctaagatctaaatatttcacaccagattaaatgccacatacacacacatttcacttgcagctcatgccctggtttgtagccaggcaatgaaatgtttaatttcccttgtgtttatgtttgtgcagaaactatccaatatctgttgttttctttttgtttgtttttaatcacaatacttttgatgccctgctgcaaggtttactttgcactgatttttgttattttttcattaagtagtccgtgaagttaccctattgagctcagatttcatgctattcatttttttaagaaataaacaactgtcgttgactagggttgcttgtttatctctggggttgttgatcttcatttgtagatttttcaattgcttatatcttgtgttatgctggatctaacattggatagtaaactgcagcctcatttgaaaaatgttaccgaattgatgctgcaagctaataaagattcagatgatgaagttgctctcgaggcttgtgaattctggtatgtcccctgtaaacatggtaatccagcatgcatatcaaaactatattgtgtccatatctatgtgtcaactacttgttcttattcttaaaatttcagtagttcgttatgctcacattttattaggcgtcatccatctgattttaaataaactatcatcagctgcgatataggcagtagtttcttttatgttgattaatgctttattgaagttgtaactatggtgcatatctaggtcggcatactgtgatgtcagcatgcctcctgaggggttgagagagttcttgccacgcttaatcccagtaactgtccctttccctctttataattagttctgatgcatttgagagctggtcacagtttctttacatattttgcttgcattcatttgtagacactcttatcaaacatgagctattctgatgatgacgaatcacttgctgatgctgaggtggtaaattttctttatatctcgcatatttcactggtgggttattggtgatagtgacttgctctgatatatattatatgttatcaggaggacgaatcgtttccagacagggatcaggttggttaaatcttctgtaacgataaagttctcagtgaatgtcctagattaaccttgcagtcctgtagttttgttctggaactggtgtatcagaggttttgctaccttttatgttttttgaaattagttactaccagcttgcgttgtctattgctcctttattaggttgggcaaccctaaaatttataaaagatatggaaagtgactgtatgttttacagctatatgctctctgcttttatttctttataaacaagaaaggcattgtataacaggacttgaagccccggttccatgcctctcgactacatggatctgaaaccggagaagacgatgtgagtccagaaatgttatttgtttttaaaaagcttaatgacttccaccaacttaaactgtcgagatgaagataacattgttttgttgtcgtatggacaggatgatgatgatgctgtaaatgtttggaatttgaggaaatgtagtgctgctggcctggatgtcctttctaatgttttcggtgatgacattcttcctactttaatgcctttgatacaggtaagttgtactttt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External Link(s)

NCBI Gene:Os04g0691500, RefSeq:Os04g0691500