Difference between revisions of "Os05g0358700"
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Revision as of 20:08, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0358700 |
|---|---|
| Description |
Similar to Phospholipase D2 (EC 3.1.4.4) (PLD 2) (Choline phosphatase 2) (Phosphatidylcholine-hydrolyzing phospholipase D2) (PLD1C) (mPLD2) |
| Version |
NM_001061839.2 GI:297604372 GeneID:4338532 |
| Length |
11302 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0358700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:17029226..17040527 |
| Sequence Coding Region |
17033423..17033713 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:17029226..17040527 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>gttttcctgctgtacataagggaatctgagccaaattcctgggaggacacaatgaaagatgagctggaccgaacgaaatatcctcgcatgccttggcatgatgttcagtgtgctctctacggtccaccttgtcgggatgttgcaaggcattttgttcagcgctggaattatgcaaaggtttgtcttttccattgcatactcatcatagtcttccccttcattattgtaaataaaataccttttttttccagaggaacaaagctcccaatgagcaaggaattcccttgctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>VFLLYIRESEPNSWEDTMKDELDRTKYPRMPWHDVQCALYGPPC RDVARHFVQRWNYAKVCLFHCILIIVFPFIIVNKIPFFSRGTKLPMSKEFPC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6815..7105#ttcctcgcatttcccgcaccacgaaggaatcaaacggaaaaaaaaaagaaaaaaaaaactccaattagatcggcccccacgtatcgtcttcccgttccattccttctcgaagcttccatgaacgtggagcgcctcgtccccggcggcgccggcggcggcggcggccgcttccggtacgagcggatgccggctaggggcccggcggatgacggggagggggaggaggaggaggaggaggcggcggtgccggagcggcggccggaggtcctggcggcgtcggcgtcgttccgcctctcggaggcggcgcgggtgttcgaggagctccccagggcgtcgatcgtcgccgtgtcgcgccccgacgccggggacatcaccccgatgctgctgtcgtacaccatcgaggtgcactacaagcaggttcgcggatcctcccctgccttctctcctgttcggtttattcacggttctgagaaacatcatgtgaaaatttggtgtgatgagagggggtgaattagtctagaattgcgtccttttttttttggttggcaaattccacgatcatattacatacatacacgttatagttcaatttgttggtactaataactacagctcatgattttagttgctgcgcgaaatgtgccttctgattgtgagttgtgatctctacgccactacgaacttgtttgattttaatggcctgcaattccccatgtagaaagggaaagggggttaatgttccatgattgatggtaccagtcaactactagtaggatttttcacaatctcaaacgttacagcgtgtccatggcattgtgggagttgatattaatggttcagtattggataggcgtgacttttatgcatggatgttaagactacatcagatttactgctgatcagcctgtctcgagcaggtctgctcttaaattaatcatgtgcaaatacagtctatgtgaatagattaaacttgtgtgtggaattttttggtgcagtatgcgcctaatcgatcattgtttttgattggatgatgtggttacttgcactgtaaacggcctattaacctgagtataatgggatgtttgttctacctgttatgcgctcatttttatctgctcttacttggtgaggctaactgcctagagtactcacctactcagtcagatgagtactcagccatgtagacttggttttcatacactgaagtttatggtggtttctggttaagcatgttccatgaaccgatatttgctgctttgttgctagatgttcatatgaaatttgtggtgtgtaaaattgtcatccccatttagcatttgcaacaacgtgcgtcctcacgtacaacttggtagaacttctttgtccttttatatttattgtaagtacttgttttcttttgttacaagaatttataaatggaccacttttaacttttattttgtgttggatttagattttaggtcctgatgtttcctgtaattgacaggtatttttggtcctaatttctgatgatcattatgatccattggaattctaatatggttacctacatatacagaggtacttaattagacacaatcaattcaagatcaagaaattgactaacttagaggatatctcaaatatagattggagtgccatggtgattttgtttgtgccaatttgtaactgcaatagatcctaaactgaaatgatttctatcatcttgacttgtaacgttgcaaatcaactatctagtattgactactgaccaactcggccttaacaacttggtacatgcttaatttctcaaaactcgaggctgttaagaaagtccgtgttccctttcacttcacatcttattatcttaaaatgtgataaggaactttgtggaacacatgtttatgaccagtttgaaattaatggactgcatgcactacacggcacaacctgtgtgcagatgttttatacatgcacacacggacaaaggcaaacaaaaaatgttgaacttgtgaaatgcatgagttttatttcttaatacttgtcatatataatttttctacttgtggtgcatacttgctttcctgtgatggacattttcttctttacactgttctatttatttccattaaatatgaatgtttcatatgtgaactgagaaatgtttcactgcttccaccagtttaggtggcgtctatataagaaagcttcacaagttctctatctacattttgcattgaagaggcgtgaatttcttgaagaattccatgagaagcaagaacaggttggttatatgaccattatgattcatgatgcttttcagtactggatttcaacctgtaagttccttaaagcaaactcgttgagttgccgtgcagttgtgctgtttgattggagatataattaatttttttactcttaacttctgtacatctcaaaagttagttagttttaggattagaatgggccgcaactatttattttagaattatatgagccattaggtcataataaaaacaactgttaacagtatggtattagagctaggttgaatagagacatccaattcataatatggtattagagctaggttgaacttctccttgttgctagtgtggatatggcatcattgccttatcctcttcagatttaggtcgtccttgttgtcatatgagactattgacgactagaggatctcacctatttgttgcctgcgcggtggcacacctgctcctcaaaaacccctggtgacaccagcaacaccaatctattgtggttccctattgatgtatctccaagagattgttcctggcacaagtaaagatctttatgatgaggtgcagggcatgacatcttctctcccccttgcttcaagtgtatctcatattatatattctatttattgttttaaggttcttgccgatccctttttattttttttctcgaaaacgcaggatgactgcatttcatttaaggagacccctttttattttaaaatgttaccgtaacatcttgttattagaatttatcatcatttaacttttacaagtattgatgcaccctatggaaagtggaggaggcataaatatgtgtgaaaataggatggggtatagaaggaagccattgcatctggtcagatttagtttgttagataacagataataaaatagcttattatttatggctcatacttcctagtccgcttagtggatcaatatttacatattcctcatcagttcatcaggttttgcaaatttttatgttttttaatattatgtccaaacaaaaagaggcagtttccacaaatataaggggttgaagggaaagattgggaaagcagcactccaaaatcccttatatttgtggatacaggcagggagtaagtctttaagcacagatttttatgttggagcaactcacctacttcttcctcgttactttaacttaaatatgacacgttttaaccatttgatatctggagaaatgtcattaggatgggaagcagagttaagcggggagtactaagttgatttctttattttgtgattcaaggtcaaagagtggctccaaaatctgggaattggggagcacatgccagtaggacatgatgaggatgaagcagacgatgtgaatgttcctgcacaggctgaagaaaactccattagacataggtaaaaatttttatacatcaacgacgcactagtagttgatgtatagttatgctttatcatattgcaaatgttgaattagagcagttgagtctccatatgttatcccatgcatgcagtaagcaagacattgaacctgttgtggcagaaatgttccttcaagtgctgttttgcctgtcattcgaccagctctggggcgtcaacactcagtttctgatcgagcaaaagttgccatgcaagaatatctgaaccattttttggggaacttggacattgtcaactcaccggaggtactcattacccaaatctttatacatttcactctattgtttccaattagaataaatgttgaccaaaatatcctatctgcatctagattagttttatcgtcaagagtcagtactaaaatatctttcaaaatacaggtttgcaaatttttggaggtatcatgtttgtcatttttaccggaatatgggcctaagctaaaggaagattatgtatctgttggacacttgccaaaaattcagaaggaccataaagaaaactgttgttcatgtgggttgtttagctgttgcaaaagcagctggcaaaaggtattatattttttgtagttcagttttgtatttagctatcttataatcattgtatttaagatattgaattgaacaatttttcaataggtttgggttgtcctgaagccaggattcttagctttactcaaagatccttttgatccaaagcttttagatgtccttatctttgatgcactgccacatatggatataagtggagagggccaaatatctctagcaaaagagatcaaggaacgaaacccgttgcatttcggactccaggtacatattccattttatgatctcatgccaagttagcacgtttgtttgaaatgcaatacttttatttttggttgttgacgatggaaacatttttatatctattgcaagaatgttgagtttagccagattgtgattgtttagtttggccttgctgcaaagtgacagctagctagatatcagaatattacttaaaaaatcttagtgatttttttgttctgggcctaaaaaagatgcactcagttaattatttcatcttacagtaaatatataagtgcttctggaaagccaccacaatgcccaatagagccttaggagtctgcaggattatctctttctccttttgtcgtatggatatcttaatgaatacataacatccttgttatgaaaaatgctacttttacagaatatttttgtagtgaattgcatactcataaaaaaatacataaactctaaaacaagttttgaatgcggcga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