Difference between revisions of "Os06g0111600"

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os06g0111600

Description

Acyl carrier protein-like family protein

Version

NM_001063122.1 GI:115465975 GeneID:4339893

Length

9178 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os06g0111600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:646480..655657

Sequence Coding Region

646686..646848,647248..647444,648152..648352,649088..649798,649944..650674
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,653869..653913,654697..654800,654877..655099

Expression

GEO Profiles:Os06g0111600

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggacgacgacttatggcaagtgtttgaggatgaaaagggtgggattggtcgagatgagcttgcttggccgtgcaagtacaagaagccgagggagttctgctacgtgatgttcacatctggttccactggaaaacccaagggtgtttgtggaacagagaaaggtcttctgaaccgctttttgtggatgcaaagatggaaacctctatgttcagatgacctgttattgtttaagacatctgtcagctttgtagaccatctgcaggagttcctttctgctgtgttgacttgcacaacacttgtcattcctcctcctaatgattggagagctaatccagcatccttggccaacttgattaaggcatatggtatatcaaggatgaatttggttccatcattgatggagataatactaccttccctggagaaaaatctttcatggggacataacccgcttaagatgctaatatttagtggcgagaatctatccatattgttgtggaagagagtgcatgaaattctgccagagactactattgtaaatctgtatggaacgacagaggtttctggtgactgtacattttttgattgcacagatctgcctatacttttaaagcgagaagaattaactagtgtaccaattggatttcctatttcaaattgtgaagtttgtattgcaaccgacgccgaggtagcagatgaaggagaaatgcatgtcactggagcatgtttatttgctggatatttagaagagtccatggcgagtaatcacactgaagacaatggaagttcaacatactacagaaccggtgactttgctcgacgcttaaagagtggtgaatttattttccttgggagaaaggaccgtactgtaaaaatttatgggcagcgtttttcactgcaggaagtggaatctaccttaaatgaacatccagatgtcagtgctgctgctgttacttttcaaaataatgaatttctggattttagggcatacctggtgcttaagagtagcgccgcatctgtggaagactgtcagcggcgtaaaagatacaaatcttttgaagttatcatgccatcaattcgaagttggctcataatgaagcttccaccagccatgattccaaggtttttccttcccatggaatcattacctctgacttcttcaggaaagattgattatatgaagctatcaagcttgaagtgtgccttggagtcctgtgaaactgaaactgaaagaattacagttaatccacatttgcaagttatcaaaaaggcattttctgatgccttacttgttgatgaagtttccgagtttgatgatttcttcaccttgggtggtaattcaatttctgctgcgcacgtagcccacaagctggagattgacatgaggatgctttatatatattccaccccttctaagctcttggatgctttatttacaaagcacggttgtttactttcttctagtcatgagcctcaccctaagaagggattggacatatcttccagcatacatagctcatttaatccgatcgctacaagtgtagatgataactttcctgaagtaaaagcacatataaatggagatggagagtgtgcacatgatgccatttcagggaattatgcaaatgaagtagatggccagcttaacagaaatgtgcctttatctaatgatagataccagacaaaatccctcttgttggatacatgctcaaatgacagaaacagtgtcgatgtcagtccatggatcttgaatttttgtttagtaaagaaatggtctattggacgttgcaatagatttatgcatggatacgaagataagctgcaaattgaagatgtttgctcatatgttccctacaacaaaagaggttatcttcaggccctttggaacattcctctcggttcatgtgttgacgcgtcacctttgcttgtctccaacaatggcatgctgagtatatttatcgggtcccattcacacagatttctctgcattgatggctgtagtggttctgtgaggtggagtgtcaaattggaaggacgtgtagagtgttctgctgctataacaggtgacttttcagaggttgtagttggatgttataaagggaaaatctacttccttgatctgttaactggaaaacaagcttggaccattcagactgatggagaggtaaaaatgcaaccggctgtggacatgataaggaacttaatatggtgtggctcttatgaccaccatttatatgcgttaaattacaaagatcgttgctgcacttacaaaatttcttgtggtggaagcatttatggttctcctgctatagacatgacacacaacatgatatatgttgcatctacgagtggccttgtgactgcaatatcacttgaggtatcgtcatttaagataatttggcaatatgaagccggggcaccaattttcggttctcttgctatacatcatcatggtggaaaagttatctgctgcctggtgaatggtctggtgattgcattgaactcacatggctctgtcgtttggaaggcatctgttggtggtcctatttttgctggtgcatgtttgtcatctggccttcctactcaggtgttgataccttcccgtgacggaagattatactcttttgatactacatctggtgctcttctttggaaatatgaagttggagaccctattaccgcatctgcttttgtcgatgaagtgttaacagcaacctcacctggagcatctgaaagattcgcttgtatctgcacgagttcgggacaggtccatgtcattaggattagagctgatgctaaggaagagaaagttaatggaagtatttgtaatgacttggtgcaaggatttgctgcaatagatcttcctggggacatcttctcatcgcccttgatggttggtggacgcatctttgttggatgcagagatgatcaactacactgtctcacaatcagctcatag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDDDLWQVFEDEKGGIGRDELAWPCKYKKPREFCYVMFTSGSTG KPKGVCGTEKGLLNRFLWMQRWKPLCSDDLLLFKTSVSFVDHLQEFLSAVLTCTTLVI PPPNDWRANPASLANLIKAYGISRMNLVPSLMEIILPSLEKNLSWGHNPLKMLIFSGE NLSILLWKRVHEILPETTIVNLYGTTEVSGDCTFFDCTDLPILLKREELTSVPIGFPI SNCEVCIATDAEVADEGEMHVTGACLFAGYLEESMASNHTEDNGSSTYYRTGDFARRL KSGEFIFLGRKDRTVKIYGQRFSLQEVESTLNEHPDVSAAAVTFQNNEFLDFRAYLVL KSSAASVEDCQRRKRYKSFEVIMPSIRSWLIMKLPPAMIPRFFLPMESLPLTSSGKID YMKLSSLKCALESCETETERITVNPHLQVIKKAFSDALLVDEVSEFDDFFTLGGNSIS AAHVAHKLEIDMRMLYIYSTPSKLLDALFTKHGCLLSSSHEPHPKKGLDISSSIHSSF NPIATSVDDNFPEVKAHINGDGECAHDAISGNYANEVDGQLNRNVPLSNDRYQTKSLL LDTCSNDRNSVDVSPWILNFCLVKKWSIGRCNRFMHGYEDKLQIEDVCSYVPYNKRGY LQALWNIPLGSCVDASPLLVSNNGMLSIFIGSHSHRFLCIDGCSGSVRWSVKLEGRVE CSAAITGDFSEVVVGCYKGKIYFLDLLTGKQAWTIQTDGEVKMQPAVDMIRNLIWCGS YDHHLYALNYKDRCCTYKISCGGSIYGSPAIDMTHNMIYVASTSGLVTAISLEVSSFK IIWQYEAGAPIFGSLAIHHHGGKVICCLVNGLVIALNSHGSVVWKASVGGPIFAGACL SSGLPTQVLIPSRDGRLYSFDTTSGALLWKYEVGDPITASAFVDEVLTATSPGASERF ACICTSSGQVHVIRIRADAKEEKVNGSICNDLVQGFAAIDLPGDIFSSPLMVGGRIFV GCRDDQLHCLTISS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>207..369#769..965#1673..1873#2609..3319#3465..4195#4463..4538#4617..4703#5495..5538#5923..6031#6111..6170#6356..6440#6699..6763#7215..7274#7390..7434#8218..8321#8398..8620#gggtttacgcctcgccttcggtggagtacatcgccgccgtcctcgccgtgctcagatgcggggaggcgttcctgccgctggacccatcgtggccagaggagaggattcgatgggccacctcgtcgtcgaatgcggtgctcgttgtatcatcagggggtttgggagcagctcatgtgtttgcgagcagctcttgctctgttattcacatggacgacgacttatggcaagtgtttgaggatgaaaagggtgggattggtcgagatgagcttgcttggccgtgcaagtacaagaagccgagggagttctgctacgtgatgttcacatctggttccactggaaaacccaagggtgtttgtggaacagagaaaggtaacgtcactgcaccttgcttctggttcactgtttcttctatgctatcatttagaaattttgcttctgacatggcaaaggaattggttgacatgtctctagatgctcttcttgagaaagagtagtttagtatactgccgtcatggctatcttatgccaatgtttacaatatccaaaatgctagcctaagcccaaatgtttactatgccaaactgcaggcatagagtatctgaaattacatggtagcaaaaatatatgttaccagcgaaacattaaatggctcatgtttttttatcttttgctttgtaatttcttatttaaggtctgttagattgtctttctaggtttggattgggcggacagctcattaagatctcttattttgctattattccttaggtcttctgaaccgctttttgtggatgcaaagatggaaacctctatgttcagatgacctgttattgtttaagacatctgtcagctttgtagaccatctgcaggagttcctttctgctgtgttgacttgcacaacacttgtcattcctcctcctaatgattggagagctaatccagcatccttggccaacttgattaaggttacctagtttaatcattgttttggtggaaatattgctattcttttttaatgaaatagtaggggagagagagttatgctttcattgtccaatttgtcttctccataaaacattatatccaaggcttctgcttgttgaaataaattgcagtagcgttcgaaaacagcatctctgatgaattttgcaaatatagtcctttttgtagcagtcattttgaaattttgaattacaatttagtggggcaaactaggatgaaagtggactgtgcacatgttggcacggttgtacactaatttgcgataaataggcttaccttttcattttccttacattttcgcagttaggaattttttttttctaatacaagttatatttgcttaattgtgtccaaaagtgggtaaaatttaatgtatattagtacatttttgtcctctttcaaatatcattggaaagagctactgctaagagatatagttctacattattcttcttccgtagcaaaacagtaattttaggatgctaccaatgttgtcagaattggtactatagtttctggctcttgtctattttagattcaattgctttgataaaaaagtagcaactcatataatgggattttcatggtaaatcaatacatattacgattatagctattacgccatgttcttcttggtgggcctgattttttttttctaattttttcttaggcatatggtatatcaaggatgaatttggttccatcattgatggagataatactaccttccctggagaaaaatctttcatggggacataacccgcttaagatgctaatatttagtggcgagaatctatccatattgttgtggaagagagtgcatgaaattctgccagagactactattgtaaatctgtatggaacgacagaggtgagaaaattaaccacttgcatttcatattatgttatctttgttttaataatgtattcttataatcatatggtttacaccatttatcttactggcttctggcgatcaaaatcaacagtacattggccggccatctggcttgacttctcctaaaataaatattggtgaaaactgatttgtaccacatcttttccatgtacacagaattgagagcatgacttgtgtcatctttactattgttagcataaattacagtaaaatattcttgcaatattaagcttgtgaccatgagtggtaattcatggtttggttgcacatcatttcctaaccatcattttactgattcctgttatactaaaactttaagggagttatgatgaagagcacatgtgccataagggttgagtagttaaattctcttacacctttttattcagcatgaatcaaacttgatatttgcttcatgataatttaaattggtcttgaattatgatatgaaaattgaaaaggtacagttagtgttccattctgaaacacgtgttacggtgttaggtaactcgtgtagcaatatagcgtacttatcattacttggtatatgaaggccatcgaactgtgatcttgaaactagcatgtttcatttatgctatattggtcctgttctcctcatgcaaggagctgaaatggcagtggtgatatttcttctttagctaataaaatgttgcgcttgtgattcaggtttctggtgactgtacattttttgattgcacagatctgcctatacttttaaagcgagaagaattaactagtgtaccaattggatttcctatttcaaattgtgaagtttgtattgcaaccgacgccgaggtagcagatgaaggagaaatgcatgtcactggagcatgtttatttgctggatatttagaagagtccatggcgagtaatcacactgaagacaatggaagttcaacatactacagaaccggtgactttgctcgacgcttaaagagtggtgaatttattttccttgggagaaaggaccgtactgtaaaaatttatgggcagcgtttttcactgcaggaagtggaatctaccttaaatgaacatccagatgtcagtgctgctgctgttacttttcaaaataatgaatttctggattttagggcatacctggtgcttaagagtagcgccgcatctgtggaagactgtcagcggcgtaaaagatacaaatcttttgaagttatcatgccatcaattcgaagttggctcataatgaagcttccaccagccatgattccaaggtttttccttcccatggaatcattacctctgacttcttcaggaaagattgattatatgaagctatcaagcttgaagtgtgccttggagtcctgtgaaactgaaactgaaagaattacagttaatccacatttgcaagttatcaaaaaggtctgttcaagcactctcttgtttttaccgtctactctactgttaattttgtttctgtttgtttctctttggagctattgtattctttgagtattcattattataatgatcattttttactgatgtcatctcttatctactgtaggcattttctgatgccttacttgttgatgaagtttccgagtttgatgatttcttcaccttgggtggtaattcaatttctgctgcgcacgtagcccacaagctggagattgacatgaggatgctttatatatattccaccccttctaagctcttggatgctttatttacaaagcacggttgtttactttcttctagtcatgagcctcaccctaagaagggattggacatatcttccagcatacatagctcatttaatccgatcgctacaagtgtagatgataactttcctgaagtaaaagcacatataaatggagatggagagtgtgcacatgatgccatttcagggaattatgcaaatgaagtagatggccagcttaacagaaatgtgcctttatctaatgatagataccagacaaaatccctcttgttggatacatgctcaaatgacagaaacagtgtcgatgtcagtccatggatcttgaatttttgtttagtaaagaaatggtctattggacgttgcaatagatttatgcatggatacgaagataagctgcaaattgaagatgtttgctcatatgttccctacaacaaaagaggttatcttcaggccctttggaacattcctctcggttcatgtgttgacgcgtcacctttgcttgtctccaacaatggcatgctgagtatatttatcgggtcccattcacacagatttctctgcattgatggctgtaggtgagttttccttgttgcaaggagttttttttttatcttaactagtcattgtttcttttgcttttcctgatttactttgaagttgaatctagaacaatctaatgtgccacatacgctctaatgttcttatgaaatggcatgttgtgtatttaatataaagtaatttattattgatttgtttcattttaatttgattcaatgaagtatttaggttctgacctttgcatactaactgttgtttgaacttgctcccaacataatatgaagtggttctgtgaggtggagtgtcaaattggaaggacgtgtagagtgttctgctgctataacaggtgacttttcagaggtaactcaacaataaacaccagcacgaattcacttagcattcttgcagccagttcatggtagtacatcttttgggcaggttgtagttggatgttataaagggaaaatctacttccttgatctgttaactggaaaacaagcttggaccattcagactgatggagaggtacagctgctgcaattttctcattcaagacatcttttaagccttatagtgacatagaagttgtactttcatttcagaataataccgaaatgacgctgaactgattattat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External Link(s)

NCBI Gene:Os06g0111600, RefSeq:Os06g0111600