Difference between revisions of "Os06g0151600"

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os06g0151600

Description

DNA repair protein RadA family protein

Version

NM_001063363.1 GI:115466457 GeneID:4340150

Length

9234 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os06g0151600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:2651070..2660303

Sequence Coding Region

2651201..2651871,2652112..2652167,2652825..2652883,2653103..2653174,2653365..2653448
,2654531..2654638,2655552..2655614,2655742..2655822,2656365..2656430
,2657098..2657253,2657762..2657839,2658471..2658509,2658682..2658764
,2659237..2659309,2659851..2660021

Expression

GEO Profiles:Os06g0151600

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atgccccacccctccgccgccgcgatgctcccctcgccttcctccctcctccgcctcctccgccgcccacaccctcgcctcctccccccgccgcccccgctcctcacccgcttcctctcctcttcctcccccggcgacgccgccggatgggcctcctacgacccgctgaccgacagcctcgccccaccggcggcagccgccgccgcgtccgactcggaggcccccgcggagggcgaggcttggggcgtgttcgacgccgtgaccggccgcatcgtcatgaaggagcacccgccctactcccagccgccgccgcccggccccgacgaggagaggtccaaggtggggaggaggaggagcgctggggtgaaggacgaggcgaggtggtcgtcggtggccgccgtggggaaggcccgcggcaaggcggggaaggagagggcctcgtacgtgtgcggcaactgcggggagggcttctcgcagtggtggggcacgtgccgccactgcgaggcgatggggaccctgaccaagtacgtcccgggctctgatcctggtgcctccgtggggtcacaccatgccttccggtcgtggattccgcagaagagcaaggagatggtgccccagagccttcagcaagtgaccaagggagttgatcagtccgagtggcgaataccgctgtccgggaacttcggaatggagattgctcgagtgcttgggggtggggttgttcctgggtccttgattctagtaggtggggatccaggtgtaggaaaaagttcattgatattacagcttgcttctatcatgtccgagaatattggtgctggggagtcttctgctatcgtatatgtgtctggcgaggagagcattgagcaaattggaaacagggctgatcggatgagtatcaagtctagaaatttgtacttgtattctagtacagatatcgaggatatcttggacaaaatccaaccattatctcctagggcactcattattgattcaattcagacagtttatctaagaggatttgctggaagtgctgggaatatgactcaggtgaaggaatgcacctctgcgctgttaagatttgcaaaattgacaaatattcctgttatcttgattggacatgttacaaaaactggtgatattgctggtccccgtttgttagagcacattgtagatgttgttttatatatggagggagagagatgcttatctcatcggttgttgcgatcagtgaaaaatcgtttcggttcaacagacgagcttggtgtatttgaaatgtcaggatatggtctacaacctgttctgaatccaaccgagatgttcttaactgaacatgatttggattctgaaatactagctggacttgctgtggctgttgttttggatggatccaggacatttgctattgaagttcaggcattgtgtgtttcaggttctcctcgcaatggagaagttgttggtataccgagaaatagggctgatattataatctcagttcttatgaagcaagcaggtctaaaacttcaggataatgctgtttttctaaatgttgtcagtggtttcatgttgacagaaactgcaggagatctggcaatagcagcttcaatttgcagcagtttcttagaatatcctataccaaatgatattgcgtttatcggagaggttggccttggtggtgaacttagaactgtgccaagaatggacaagcgggtgctagctattgcgaagttgggatacaagaaatgcgtcgttcccaaaacctcagagaagctgctcagaccgctgaaccttgaacttgagattttgccctgcagcaacctgaaagaggtcataaacaccgtatttaggccacaaggatga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPHPSAAAMLPSPSSLLRLLRRPHPRLLPPPPPLLTRFLSSSSP GDAAGWASYDPLTDSLAPPAAAAAASDSEAPAEGEAWGVFDAVTGRIVMKEHPPYSQP PPPGPDEERSKVGRRRSAGVKDEARWSSVAAVGKARGKAGKERASYVCGNCGEGFSQW WGTCRHCEAMGTLTKYVPGSDPGASVGSHHAFRSWIPQKSKEMVPQSLQQVTKGVDQS EWRIPLSGNFGMEIARVLGGGVVPGSLILVGGDPGVGKSSLILQLASIMSENIGAGES SAIVYVSGEESIEQIGNRADRMSIKSRNLYLYSSTDIEDILDKIQPLSPRALIIDSIQ TVYLRGFAGSAGNMTQVKECTSALLRFAKLTNIPVILIGHVTKTGDIAGPRLLEHIVD VVLYMEGERCLSHRLLRSVKNRFGSTDELGVFEMSGYGLQPVLNPTEMFLTEHDLDSE ILAGLAVAVVLDGSRTFAIEVQALCVSGSPRNGEVVGIPRNRADIIISVLMKQAGLKL QDNAVFLNVVSGFMLTETAGDLAIAASICSSFLEYPIPNDIAFIGEVGLGGELRTVPR MDKRVLAIAKLGYKKCVVPKTSEKLLRPLNLELEILPCSNLKEVINTVFRPQG</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>132..802#1043..1098#1756..1814#2034..2105#2296..2379#3462..3569#4483..4545#4673..4753#5296..5361#6029..6184#6693..6770#7402..7440#7613..7695#8168..8240#8782..8952#gtcggcgtcccggcgcgccctttccccttccccttcccgcgccggcgtgctccctcccttccccgcaaaaccctccaaaaccctctcgaattccggcccattcccccctccctctccaacccttccaccccatgccccacccctccgccgccgcgatgctcccctcgccttcctccctcctccgcctcctccgccgcccacaccctcgcctcctccccccgccgcccccgctcctcacccgcttcctctcctcttcctcccccggcgacgccgccggatgggcctcctacgacccgctgaccgacagcctcgccccaccggcggcagccgccgccgcgtccgactcggaggcccccgcggagggcgaggcttggggcgtgttcgacgccgtgaccggccgcatcgtcatgaaggagcacccgccctactcccagccgccgccgcccggccccgacgaggagaggtccaaggtggggaggaggaggagcgctggggtgaaggacgaggcgaggtggtcgtcggtggccgccgtggggaaggcccgcggcaaggcggggaaggagagggcctcgtacgtgtgcggcaactgcggggagggcttctcgcagtggtggggcacgtgccgccactgcgaggcgatggggaccctgaccaagtacgtcccgggctctgatcctggtgcctccgtggggtcacaccatgccttccggtcgtggattccgcagaagagcaaggagatggtgccccagagccttcagcaagtgaccaagggagttgatcagtccgagtggcgaataccgctgtaacatctctcaccatcaacactgttatttcttcatattaaatcatgcaagtgtgcgaaaaatttgaatatatgcatcttctttagttctgtctccaaactcttgtacattactagtaagtgtgtcaaatatatgattgttatttgcgaaaacatgaatgcgctctacaattttattctccatgcgttagttctttccattattggctgatgatgttcatggatctatcttacttgtaggtccgggaacttcggaatggagattgctcgagtgcttgggggtggggttgttcctggtaaaacataactctgaagtatgaactttcatggtacagcttgagaagaaagtcgtaactgtgtatagggctgtaggttcacatgtcatatttgtataaattccataccctgacatggattttacaatttatcaacgcttttgaattgcacatgacaatcatatatatcggtaaatatgacagcatttaaatggtatttaaagtgttatggttatatgttcttttgccttttgaaactgactctgaaatgaactatacattcctcacagtgaatgcatagataatttcttgaattggctttgatgtttgaacccacatcttctgctctatatgttttacttgtttttaacgttcttatcatttcttttgaacatgtaacatggtgaaataccaattatagcagagttcatacaccgaaataattatggctgagtttcagataaatctttaacttgtacctcaccatgttgttgtgactctatttctgtaagttttcttttcatgtcgtaccattctacttctgggttatgtttatcaagtttgagaaatgtacatgtaacatgtcacatggtccacacggatctttttgttactacatgctatcaatgggatacatgctacctactgtataccatgagttgttacataattttgcagggtccttgattctagtaggtggggatccaggtgtaggaaaaagttcattgatattacaggtaaacacacgcatttggctattcattgttagttgatctacctttttcttcaggtgtttccaagccatcacaatttacttatcacacaaatttggaattttaatactttatctacctacttaattacatgctgagttttaaccttgttattttcagtacctaattttaacttttggaattgtacagttacatctctttctgcttctttttcctgtatagcttgcttctatcatgtccgagaatattggtgctggggagtcttctgctatcgtatatgtgtctggcgaggaggttggttactgccttgttccatctctaccgtttgtgcattctcaagtgtcaactgtttcagtttcttgttggcagattcatgggcatatctactgaaaatcttatgataacctttaatatttaataatgatcttaggtctgatacttatttcgagagcattgtttgatacacatgtaattttgtccccagagcattgagcaaattggaaacagggctgatcggatgagtatcaagtctagaaatttgtacttgtattctagtacagatatcgaggtaacattatttggctggcactaattatgtgcattaaagatttattatttgtttgttttataatggcttttttaaaggatgtgaacatataaactaagtttcaaattcagagaatttctcataacctgctgttctaataataagttgagtgtgactttaatgttctcaagtgctaaaatttgttgtatcctctttgctcatccacttatatgcaaggatctcatatgacgcaaataaattagctttggaaatttccattttatggtttcacagtagcttcagatctattaaatgattggtgcatgatgatagttcaaatttcatatcttcaaggaaaatttaacattgtaagaactgctgttaagtgttatttaacccttcccaccccagcggttggactggaaaagagcagatcaatagctttctggggctgggtgagcggatcattttggtctggtaaaactggacttgctcaggcaggtttgcggttgatcagctgatctgcccattatactctaccaatctgctcttcattaaacattgttctttatattcaataccaaccgctaagattactctccagaggcaccgggtacaattaaatgatacgctccgatctcattgtgtcataaaggcaggcttgctctgcttggttaatgtagtttgaaattcagctaaatttctctctactacttcatgtatgtcggggatggttcttctatactttgtgtacatctgttgatattgagtataacatatgtgtggtctgggtgttgatcttcctgttaatggcccagtgtcccgaggctttattaccaggttgatggacatgacaaatctgatatcaccatgttctgcagtagtggcttttaaagaaatttgggcctggattctaaatgcttccatggatatagtacatgcgacctatggtttagacaccaagcttatgtgatctctgacttttattataccatttaaccaagtcaaaacatttctatcctagaggaaacctaagcaaccagagtaataatcaacaaccagattacgctgacaaattgtttctcaacattcttgttccacaggatatcttggacaaaatccaaccattatctcctagggcactcattattgattcaattcagacagtttatctaagaggatttgctggaagtgctgggaatatgactcaggtgcctatgctacttcatctgataggttcctgaatcctgattatctgtaggcatgcctgccatggcatgtcatgtttaacctgtataaactcttttctaattttctttatattatacctgtcaattgcagtccattagggcatatatatagacagcaatctaattccatgcaggggtgaatgcagccataggctaaaccctgggtcggccttgcttatattgggctgagtttgaatttctgtggtcaaatcggcatatcttcatctttttagtcccaggactaagaccaggacccaagcgacctgagtcctgtctgtcctgcctccgtagggccgttggtactgcatgttaacagtactcatatgtcgctgtttgtggtagttgtttgggttaaaggtcaagtcatagtgtctatattcgtacagtttggtatctatttttcatcaagaaaataaataaacaagagtctgtaatcgccccctcttctcccttgcccgtcaatacgaaccctttacgcatctgctgattattattgtgtccgggttactgtatgcgaatgatcaatatgaacccttgcaattcaaactgaaggttgtgttttcggtattctatcatgagtcaatctttctaatttatatcaatcatgggtttgccttgaatgccatttatattccctttttctttttttcccttttgctatatctaaatgttcacttcaccttaaataactagtttttagagtcttagcgttgcatctactaacattttaatttatgagctacatattgcatatctaattcgagtcacagatgtcctgatttcatgaagtggatattgcttctgtgctactggaaaatgcgcacattcacatctctacttgttgaaatgtctgcctttcttttgtggacaataggtgaaggaatgcacctctgcgctgttaagatttgcaaaattgacaaatattcctgttatcttggtaagtttcctaatgtgcaagaagtttattgttttgtatggtacgtcctattccttgatgaatctgtgtctttgttctgttgtcttcatcaataaccttttctttcccttccattttcctttttcagattggacatgttacaaaaactggtgatattgctggtccccgtttgttagagcacattgtagatgttgttttatatatggaggttggtaaattaccccatcaaacacagttttccttatagattaggaatactggagtgtatcaaaatttttatagcctgttgtagattatataacaaatactgtgttacacttgtaaccaatccttttgtgatatctttgtatgtcgtatatttccttcctgggtgcctggttgagaagaaattagtgattcgattcatgtagcctcatgtatgtgccaccttcatctcagaaactagaaagtaatatttgttttctgcagagacggagagaattagcccatggccttggctggacctgcttgcattggctctttgtatctttcaatacttttgcaagttctcctggaaactaaatgagcctttaattctaggcctggaacctcacctgtaattatttaaacccgtgagatggtaaacatgtaaatttgtgataggttgcaagttccccttaacatgctgtttattgttgtttaattatttcttatgagttggcatgttctaggttgaaaagcctaatagaaagtttggtgcttgtatttcagggagagagatgcttatctcatcggttgttgcgatcagtgaaaaatcgtttcggttcaacagacgaggtaagtgtagtcttatatttatgtggaatatatttctttagtatataaaagtttctgttgtggacttgtcttgttagtgctaagatgctaatatctattatctaaaaaaataatgataagatgtgaatgcttcatattcggattaatgtgaccaataagatttaatcttctctagacaagccattgttagcatttttcctctaacagtgctgtaatcatcaaaagtgtggttctctagacaaaccatgtaaaaggtttaattcttctccttgtagctgtccttatatcagagtatcagaccaaaaactttatatatcggtatatgctatcttgttagtattactattacatggaataccttggaataaagcaaaacacaagaaataaatctcttttacgtggttgcaatagtttgattttggaaaatatttcgggatagtaacagctacatcttctaatttgtttctgaactttcatttaataagttagtactgtataaggcgccttttccacttcttgatttaacagttagttaaaagcatatttgagtgggaaaaataaaaatcttattagaattagcagtcacatagctaactagattccatatggaagaacaacacatcaactttaaactggccctaaagcaggtttacgtttgttttttcagcttggtgtatttgaaatgtcaggatatggtctacaacctgttctgaatccaaccgagatgttcttaactgaacatgatttggattctgaaatactagctggacttgctgtggctgttgttttggatggatccaggacatttgctattgaagttcaggtacactatgattgtcagtgtccttttgagtttgctaaattatttttctcctaccacatatattattctcttattatcatattgccttgagcttaccattttaatgaaatatgttgtttatcaataacatccatcttctggcttttggggctctatttgtaaaatacatggaaagatttagaaattacagttttatggactaagctcattgctttgtaaatgttgtacgagcaacttagcaacctcttacacagtgatatcatatcgcaagcttgttcataactctttactttgctctattttaggctgtcttgacagttggtttgtattgttcatgcattctgtataatgcatccgagaaatatggaaatataatttgtttctgaaatcccctttagtaacatgctactgctttaaaaacattttcacctttctttagtacttttttccctactgcagtttaaccatggtgcttcttctatgacatgaaatttctgctattttgcaggcattgtgtgtttcaggttctcctcgcaatggagaagttgttggtataccgagaaatagggctgatattataatctcagtaagtgtttaagtgctcccgtacatacttccaagtaataaaatgacctgcccccatatgtggtgcctatgtcagattttttttaacctgaactttggatagcacccagctggatggacagctttgcaggactcgatctagtgggatgcatgtttggactaactttatggtgttagagatgcataataatgccaatctacatttttttaagcatgttagattgttctaacacttcccggcgagattgttctaacacttaatttcaagtgggcctggtcatgattgtttttatcaacttcagtgtaagtaccatatttaagaacatgctagtactcccaccgattccaaatgtaagttgttttggacttcaccactctctaaatgtaatatgttaggttaagcatatcaagaactacagcaatattattctgtttacaaaaagcatatcccctaagatgatatatttttgtttatttctggctttttttaccctaatcaagttacaacttgccagttaatgcattatcttgttcgagaacatacgaggtgtaatttgacattacaactgatggaaatggttagtttatcgaactttatgtatctaaaataataccttctatttgtaatgcaggttcttatgaagcaagcaggtctaaaacttcaggataatgtaagaccatcaatctttatcgttagctcttactaattatattgtgcagtgccctcgttaacagtgttagttctgagacaaacaatagactgtcgtcatatgcttattgtaacattgatggaaactgttcgatcttgacaagttatgctaacattttctgttcaccttgcaggctgtttttctaaatgttgtcagtggtttcatgttgacagaaactgcaggagatctggcaatagcagcttcaatttgcagcaggtaatatcttttgtgttttattattttagggaggccaaaactggtgagggtatagttttgcttactaaagtactccctcccagtcattaatacatgacattagtatacccaatgtcatgtattaatgaccagagggggtataaggcttccttgtgaccttttttgtattgtctggtatggggcacatggaattttgatcaacttttaagtagattttccaccaagtcataatcaccttatcttcctgttgtcctcactaaatctttatggtcatttgctgaatttctttgggaaatagttataccgggtaattaaaattaccgaataaattgcctgaatactggagcaatttaatgaagcatatggttctatgaccatgtggttctttgctctatataaagcaggtccctttccgttcatattttgatatcttttgcttgttttaatcaaacttttttatccttgtcttcagtttcttagaatatcctataccaaatgatattgcgtttatcggagaggttggccttggtggtgaacttagaactgtaagtttacatcttcattctgcttcatgctatcacttatttgatgcgagtattctttgtttgcaccttcatgtcatcacctactggatctgaatattctttgttggcaattcaagtctgaaagaaaagtgtttgggtctgtttagtatggaataatgaaggttaaacgttttaatttggaaaaaagaacttacctttattactttgaggcttgttcagattatatttgctatagtttgctgccaggttttgctttctaaatagtgataagggatcatacttcatacatctgaatttccttttggaatttattcctccagccaatatcctgtcattaggaattagagcatcaagatagcaacatttcacagatgagaccaaccaacccatttggctgcagtttgctacatacatacatacatacatacatacatcatcgaaagtgcaccaagatagtaacatttctcaaatggaaccaaccagtccatcttccattcggttttactactgctgtaatgcatccttcattatcttctctcaggtgccaagaatggacaagcgggtgctagctattgcgaagttgggatacaagaaatgcgtcgttcccaaaacctcagagaagctgctcagaccgctgaaccttgaacttgagattttgccctgcagcaacctgaaagaggtcataaacaccgtatttaggccacaaggatgatgctacactctgcttactacttacagttgctgaccgtaggtatttagatctagtgtgcctgggtcattggccagatgctatgacgattgagagagatgatgtaactatttatactcattaacgggtttcaatgttccagccatttttgcgccagaatacggtccctttcataggaatcgtattggctatccgtgctggaatcctgaaccctttacctctaccttaagtatgtaagatgtcttctatacactagtctgaaaatgaaatttgcttgcaagcttc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os06g0151600, RefSeq:Os06g0151600