Difference between revisions of "Os06g0351500"

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Revision as of 20:22, 22 July 2012

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os06g0351500

Description

Lipolytic enzyme, G-D-S-L family protein

Version

NM_001064120.1 GI:115467971 GeneID:4340980

Length

9224 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os06g0351500, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:14349553..14358776

Sequence Coding Region

14349577..14349910,14355141..14355268,14355424..14355657,14356527..14356779,14358485..14358672

Expression

GEO Profiles:Os06g0351500

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>atggcgtcttgctgggagcagctgcagggcctctgcgccgccggccacttgcgtcgccgctgccgcggtagaagcttggtcctgctgcagcagctgcagctgctgggggttttggtggtggtggtggccggggttgcaccaggcatcagtgaggcacaggtgaggagccggttcaaggcgatcttcatgttcggcgactcgatcgtggatccagggaacaacaacgggcaactaacggaggcgagagccgacttcccgccgtacgggcaggatttccccggcggggtcgccaccggcagattctccaacggcaaggtccccggtgacttgatagcttctaagttgggcattaaagagctattgccagcttacaaagatcaggaccttgaactaaatgacctacttactggtgtggcctttgcctcaggaggcagtggatatgatcccctcacttctatatcgactgccatatcgagttcaggacaactcaatttattcagtgactacaagcagaagcttacatctttgatcggagaggaggcaatgacacgtattctctcagaagcagttttctttactgtcatgggagcaaatgacttgctcaacaattattttacgcttcctgtgaggcggcatcaatatgacattcctggctacgtggactttgttgtctctaacgcagttaactttactctgacaatgaatgagatgggtgctaagatgattgggttcgttggtgttccaccacttggttgttgtccctcacagagaactggtccatcaagagaatgcgaaccattacgaaatcaagcatcagaattatttaatactagaatgaagcaggaaatcgatcgactaaatgtcgaacataatattgatggtttaagggttgtttattttgacatatactacaatttgctcgacctgatccacaatcctggttattatggtttcaaggatacatctgatggatgctgcggcaacacagtgctaaatgctgctatattcattaaatatcacagtgcatgtccaaatgtttatgattatattttctgggatagcttccatcctaccgaaaaggcatacgacatagtggttgataagcttatccaggaaaataagcagtatctgatgtaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MASCWEQLQGLCAAGHLRRRCRGRSLVLLQQLQLLGVLVVVVAG VAPGISEAQVRSRFKAIFMFGDSIVDPGNNNGQLTEARADFPPYGQDFPGGVATGRFS NGKVPGDLIASKLGIKELLPAYKDQDLELNDLLTGVAFASGGSGYDPLTSISTAISSS GQLNLFSDYKQKLTSLIGEEAMTRILSEAVFFTVMGANDLLNNYFTLPVRRHQYDIPG YVDFVVSNAVNFTLTMNEMGAKMIGFVGVPPLGCCPSQRTGPSRECEPLRNQASELFN TRMKQEIDRLNVEHNIDGLRVVYFDIYYNLLDLIHNPGYYGFKDTSDGCCGNTVLNAA IFIKYHSACPNVYDYIFWDSFHPTEKAYDIVVDKLIQENKQYLM</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>25..358#5589..5716#5872..6105#6975..7227#8933..9120#ccgctggtccaggcagagagaccaatggcgtcttgctgggagcagctgcagggcctctgcgccgccggccacttgcgtcgccgctgccgcggtagaagcttggtcctgctgcagcagctgcagctgctgggggttttggtggtggtggtggccggggttgcaccaggcatcagtgaggcacaggtgaggagccggttcaaggcgatcttcatgttcggcgactcgatcgtggatccagggaacaacaacgggcaactaacggaggcgagagccgacttcccgccgtacgggcaggatttccccggcggggtcgccaccggcagattctccaacggcaaggtccccggtgacttgataggtactactacgcacgtacacacgtactcctaaattaatttccgagaatagctccgaacaaatatttatctattggtctttgaattttttttttatggagggagtactccttcctatagacgatgcactctctggatactttctgctaattaagtaactgcacttaattgctctatttttagctatttcctctgttccaaaataagaacagctctattaatttaaactgtgtggggctacacttatttgcaacagagaaagtatataagctgtgacagcgtgttcgggcttattttgacactaaatagtcgtagcaccatcattttgtgtagcttcggtttacagcatgtttatttaaggagtactccacgtcctatggtttgcactatgtaacacaattaattattattctctaattctgtttttaagtaggagtatgtttttgagatagagatagagtactccctccgtcccaaaatataagcatttttaaacttgcatacagtttttgatatgctattttgaccaccaatatctataaaaatatgatattttaaataaaaagagttacatattatgatagtttgtttaataataaatctaataacatcaattttatatgattgatcttttttatttttttactactaatagttaaagttaaaaatatttgattttacagtatactaaaaatgcttgtattttgggacggatgaagtacctcttaattggtttgcaccacacgccctatgcaacacaattaattacacgcaccaagcgacacagttagtttgctcaccgtgggccataatggaatgagcgatgccgcatgctagcttgacgcggctttgtttggatcctccgggttattaaatagccctccgaaatcttgctatttaggagtattaaacgtagattaccgacaaaaccgattccataacccctaggttattttgcgagacaaatctaatgatgtatattaatccataattagcggctgattactgtagcatcactgtagcaaattatggattaatatacctcgttagattcgtctcgcaaaactagcctaggggttatggaatgggttttgtcagtaatctacgtttaatactcctaaatagccctccggatctaaacagggcggtaggtcaacacattgtcattagattggtcggccggttgtctcatccacggtttatgctccaaaagtattttttatttgccggatgaacggattaaattagtaactaagttggatcaacgcatcggtcggtttaagtttcacgcactttttgaaattcaatacagctggatttatattcttgacgaagttttgcttccaccatctgttgaagtcgtactccaaattttgctatcaagagttgtatcttacaactcgttttaaccatttttcagttaaattaaatatctctattcagaacaattacagttgcagttaggtcaataccgttatcgatcaaatttaaatgcttctgcatttttttttacccagatgatgttgtgtaaattgtgcattttttttacaaaattaacacaacatcatattgatatcgctcttacatgtgttggttcccaatgagggtattcctacttgtgagaattttgaatattttagaatataatattttttgtaaaagtattcctaactttgtttaaaattcaatattctcccaaattaattaagttatgctgaaatttaattactgtactttgaaaattttcaaactacaacctcaaaacttcaagttagaactttcaaattttgaatttctattcctcgcataagaaaattttcgaattgctattttataatttcagaataacaacaaattatttgaaaacaatgcagtctgatagtttcatataattaaatatattcttaagttcatttggatgcatgccgtcggtccatagtgtgatatttttctcctgcgaccttaatgcaaaccacattccaactaccctactggtcaccattaaacttatgaatagttctcggacaacagggctataatgtatttcgcctagttgtgggcttgtggcatgattaatttacttgtcagaacgtttggctttgtagccaatcctgtaataaaccttttagagcaccttaggctctgtttagatggaactaaaaaactttttagttcctatcacatcggatgtttagacactaattataaatattaaatttaaactattgataaaacccattctataatcctggactaattcgcgagacgaatctattaagtctaactaattcatgattagcctatgtgatgctacagtaaacatgcgctaattatggattaattaggcttaaaaaatttgtcacgcgaattagctctcatttatataattagttttataagtagtctatatttaatactccaaattcatctgatatgacagggactaaagtttagtccccggatccaaacacccccttagtaaatgaacactaaaatgcagtaatagagtgtcattactcattgaattcctataaaatcaaaggaaggttacataattatagtttggataacacataaatttgtgtcaacgaaagagaaaattaaacatgaggtagaacctcatgtccaaaattcatatgaaatagcccatttcacaggaatttcaaagaaatttgagagagagattcctttgctccaaaggatcatatagtaaaaaagaaattcataggtatcaaatcatcaaaaattcatctagttttcctttgttgcaaagaatctcttagcatagaagtgtattataatagttgcgtacattaatgaagaacataaaaatattatggcgtgcatatgaaaagatttatcgcgaaaagatgttataaatttttagtacataagaagtaaaaattcatcactgagtttatcctggttcaatgatttgccattgacattgtcaatttccgtaatatactacgactttactaaattgttctacaatatgccattgtattgcatttctttcaaaaatacctaaaatacccttataagaaggtttgaaaaaaatatgcctttttatacattatctttatactacatggaagtttgtgtataagtttttgtgtgcttttgttttttaatgtaaactagctaaatgcatgtgctttgctacagataaaatttatttttcatgaaatgttccacctgtcgtgttgctatggaaaacatttaccttaatttgattctatgcatcgatatccttagattgattgttattaatataaagaagctcagggggtgatttctaaaatttacaataggagtagctataaggtgacaaattcactattcccccactagatcctcttaaagtagcatagatcatctttcatatggtaaaaaaaatatttttgtgttgttatcttttgtgtaagcaatttcactatcataagccaaaaaaatttaaataaaaaataccaagaaaacttgaaagttatatacaaacttccaggttgtgtaagaaggctacactaaaatacgtagtttttcaaacttctactgagataaatcgattgttgacgtggtacatttttaagggtattttgggtgtctttgaaaatagtcagtccaatggtatattggagaccaattgatgaagccgtcggtatattatagaaaacatcaatatctatggcaaattattgaactgagacaaactcagtgacatggagtagattatccctaaaaattattatatgtctacaattaaaataatgttcattatatgatttgccacgatgatgtcattgaactacactaggattaaaaaaaataatggaaaggacttggtagctataaatgatacacactgctatggaacacatcttttacgtgaccaggcactccacctgtgactaaaggctttgaaaaatcgacgatcttcccagataggtcacaaaagttgatttttatagttacagcaggctatggttaagcggactacgtgagaaaattattttttacaggcaactatatgaagccaaccgactggaaaaaatattttcaacaaaaaaaaaacaatgtatgcagctgccttatgaatgacagttgccaaacccatatccatagatcaagacacaaattagagagagaacaattcacatgattggaaaatgaaacaaatcaagttgttccataataatttgtattcacaaatccaacccagattcacaagcatacataaacatcagaagcaggccagatcgggttcgaacatatttattctccccacacggatgaaggcacttgtagcagcagcagcagccctccttgctcacctcctcacagcagctggtcatcgtcgcagctaccattgccaccagttagcacagccctcgcatcgggcctggagtggcgcaaggccagcattgtcaccgccaaccaagggcttccccgcggccgctagttacgttcctcctcttcgtcgtgtcaccactagctcaggcagtatgaggctactcctccccttcaccatcactgacacccctacccttctccttcgccgcagtcgccttcaccaagccc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External Link(s)

NCBI Gene:Os06g0351500, RefSeq:Os06g0351500