Difference between revisions of "Os09g0533100"
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Revision as of 21:03, 22 July 2012
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Expression
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os09g0533100 |
|---|---|
| Description |
Similar to Pantothenate kinase 4 (Fragment) |
| Version |
NM_001070301.1 GI:115480344 GeneID:4347680 |
| Length |
8761 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0533100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:21761270..21770030 |
| Sequence Coding Region |
21761270..21761309,21761807..21761862,21762452..21762568,21762736..21762855,21762945..21763039 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>tgtttagacttcatttcttccaaacaactacatcgtggcggggttgattcaccttcgtggcgctcaggagctcagcctgacaacattgtaatcaaggcaacaggtggtggagcattcaaatatgctgatctcttcaaggagagattgggagtcagtcttgaaaaggaagatgaaatggactgccttgtagctggagcaaattttttgctgaagtctatacgccatgaagcctttacgcacatggatggccaaaaggaatacgtgcagattgaccagaatgatctgtttccattccttcttgttaatgtggggtctggtgttagcataatcaaggttgatgggcatggaaagtttcaacgagtaagtggaacaaatgttggtggtggtacatactggggtttggggaggttaatgacaaagtgcaagagtttcgatgagttactagagctgagccagcgtggagacaacagcacaatcgacatgcttgttggagatatatatggtggtctggactactccaagattggcctttcagcatcaacaattgcctctagttttgggaagacaatttcagatgacaaggaactgtcagattatagaccagaggatatttcactctctctgctgcggatgatttcttataacattggtcagatttcctatcttaacgcactccgatatggacttaagaggatattttttggtggattcttcattcgtggtcatgcctacactatggacacaatttctttcgctgtaaatttttggtcaaaaggagaggcaaaagccatgtttctgcgtcacgagggttttctaggagcacttggtgcatttatgagttatgagaagcatggtcttgatgacttgagaatacatcacttggttgaacgcttcccaatgggtgctccatatgttggtggaaaaattcatgggcctcctcttggggatctcaatgagaagatatcatggatggagaagtttgtgcagaagggtactcagattacagcacccgtacctgttggatttcctgtgacaacaggtatgggaggttttgagaggcctaccgccaagggagacattttgcggtcagatgcaagtgcagctctgaatgttggtgttctccatcttgtacccacattggatgtatttccgctgttagaagatccaaagatgtatgaaccaaacacgattgatctcgacctgaatgagtacaagtactggttcaagattttgtcagaccatttgcctgaccttgtggacaaggcggttgctagtgaaggtgggactgatgatgccaaaaggaggggtgacgcattcgcacatgctttttctgctcatttggcaaggttgatggaggagcctgctgcttatgggaagtttggtttagccaacctgttggagctgagagaagaatgcctgagagaattccagtttgtcgatgcatatgttagcattaagcaaagggaaaatgaagcttcactggctgttttacctgatcttctgatggaacttgatagtatgaatgaggaagctagattgcttgcactaatcgagggtgtccttgctgcaaacatatttgattggggctctcgagcttgtgtggacctttatcacaagggaactataatagaaatttatcgcatgagccgcaagaagatgcaacgtccttggcggattgatgactttgatatgtttaaaaagagaatgcttgctgataagaagggccaaccatacaaaagagcactgctttttgttgataactcgggtgctgatgtggtccttggaatgattcctttagcacgggaattattacgcaatggaactgaggtggttttggttgcaaattcattgcctgctttgaatgatgttaccgctaatgagcttccaggaattgtggctgaagctgcgaagcattgtggtatacttcggaaagctgcagaggcaggtggattgatctttgatgccatggctggcatccaagatgatctgaaagatgaaccagtatcagttccccttatggttgttgagaatggatgtggcagtccgtgtattgatttccggcaggttagctcagaacttgctgctgcagcgaaagatgcagatttgttaatcttagagggcatggggcgatctctgcataccaacctcaatgcccgttttaagtgcgatactctgaagctggcgatggtcaagaatcagagattggcagaaaaacttttcaatggaaatatatatgactgcatctgtaaatttgaacctgttccttga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>CLDFISSKQLHRGGVDSPSWRSGAQPDNIVIKATGGGAFKYADL FKERLGVSLEKEDEMDCLVAGANFLLKSIRHEAFTHMDGQKEYVQIDQNDLFPFLLVN VGSGVSIIKVDGHGKFQRVSGTNVGGGTYWGLGRLMTKCKSFDELLELSQRGDNSTID MLVGDIYGGLDYSKIGLSASTIASSFGKTISDDKELSDYRPEDISLSLLRMISYNIGQ ISYLNALRYGLKRIFFGGFFIRGHAYTMDTISFAVNFWSKGEAKAMFLRHEGFLGALG AFMSYEKHGLDDLRIHHLVERFPMGAPYVGGKIHGPPLGDLNEKISWMEKFVQKGTQI TAPVPVGFPVTTGMGGFERPTAKGDILRSDASAALNVGVLHLVPTLDVFPLLEDPKMY EPNTIDLDLNEYKYWFKILSDHLPDLVDKAVASEGGTDDAKRRGDAFAHAFSAHLARL MEEPAAYGKFGLANLLELREECLREFQFVDAYVSIKQRENEASLAVLPDLLMELDSMN EEARLLALIEGVLAANIFDWGSRACVDLYHKGTIIEIYRMSRKKMQRPWRIDDFDMFK KRMLADKKGQPYKRALLFVDNSGADVVLGMIPLARELLRNGTEVVLVANSLPALNDVT ANELPGIVAEAAKHCGILRKAAEAGGLIFDAMAGIQDDLKDEPVSVPLMVVENGCGSP CIDFRQVSSELAAAAKDADLLILEGMGRSLHTNLNARFKCDTLKLAMVKNQRLAEKLF NGNIYDCICKFEPVP</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..40#538..593#1183..1299#1467..1586#1676..1770#1858..1951#2172..2303#2956..3068#3189..3379#3714..3927#4546..4587#4668..4716#5209..5291#5452..5568#5659..5722#5823..5968#6099..6252#6809..6892#6973..7167#7273..7344#8228..8317#tgtttagacttcatttcttccaaacaactacatcgtggcggtatgcaaccatttctttgtattgttaaaaatcgaaatcatttatgttttggggtttggattgtccacaaattttgtgtactaatgttattttaatactgcaaattgctttggtggtcatagattgatgtttaccacattatgaacagggatttgagaatatgtagatagttgctagagttactaatttacttttatcacatgcatttatattagcaatttcaagttggccattatcttctgtgtttggctgaattgtgccctgaatatctttattatgatggcatacttgagtttgttcatttcatgttttttcacattcttcattgtcctgtccattctggaagtttaccagctgtctaatttgctagagtttggctgaatttgatacttaaactgtgatcatcacatttttgtccacatggtttcctaaggttttgttagtctaggccgttggcctgcactttcttagcattgagtagaacttttttgctgcaggggttgattcaccttcgtggcgctcaggagctcagcctgacaacattgtaatcaaggtgacaaataatgagacagcaccctttaggtttatgaaagtttgtttggtcaatgtttcgattaatgtttgttattgttcattagcacttgaatatttggatagcaatccattattctcaatctaccttgtgttgttggtgtagatgatttcaacctatggttttggtgaataacaatcataacgctgtagaacaacttgtagtaaaccatgacaagaataccttccttcccatttccccaagattagctcttgtatagcacttgaatatttggctagcaatccattattctcaatcctaccttgtaggtgttgttgtagatggtttccacctatgattttggtgaataacagtcattacactatagaccaacctgtagtaaacagacaagaatgtcttccttcccatttcccaagattaactcttgtgtcataatgactgtatctcatagaagcaaagtctttttcccccacttatcaggaacagactgcgtactgatgttttcatgtacaaaatactgactgagttatcattatcttgatggcattaaagttatatattttagttgactatgatattttgtggaaaggcaacaggtggtggagcattcaaatatgctgatctcttcaaggagagattgggagtcagtcttgaaaaggaagatgaaatggactgccttgtagctggagcaaattttttgctgaaggtttctatctctgagttaccctaccctatttaggttgagactattcagttttatattctatatgatctatgtaatggactaaggcagtaagtcatatttcaaatttatctgaagattgttcacattcaaaaaattaaattacattagtaagacttatgtgttttcagtctatacgccatgaagcctttacgcacatggatggccaaaaggaatacgtgcagattgaccagaatgatctgtttccattccttcttgttaatgtggggtctggtgttagcataatcaaggtaccttgcagtttttttttttaaatatcttttttggattggacttctttttttggtttgctggattttgttggtcgtcgtttttgaaggttgatgggcatggaaagtttcaacgagtaagtggaacaaatgttggtggtggtacatactggggtttggggaggttaatgacaaagtgcaagaggtatttcttcttctgctcatggacatcatacatttctgttgagatctgagaagtttgagaactcctaaaagtatgattttctttcagtttcgatgagttactagagctgagccagcgtggagacaacagcacaatcgacatgcttgttggagatatatatggtggtctggactactccaaggtaatagcaccgatgatggaaaccgtcttgttaacatttcatgttccataaagttatcacacaatgtagacctatgtttgaaactataaattgttaaaatctgctagtcagacttggtacttgcacaactcacgatgtgtcagaaacttcagaatagaggtccttcaagtgcccaattcttctttcttactaattgctgcgtgcttcttctttatggcagattggcctttcagcatcaacaattgcctctagttttgggaagacaatttcagatgacaaggaactgtcagattatagaccagaggatatttcactctctctgctgcggatgatttcttataacattggtcaggtatgacaaataatgataactatttgatacaagtggcccaatcttcatcagaatttttccatagagatgcacatttaccatttcttttataaatttggaagtttgaaaaagtggtccaaatattgtagcggtgagtctaattccacacaaacaacagtaatcttatctgaaaaagaaaatcaatagaagaacataatttttttacttgtattttgttatgttgtgttctttaatggaaaaaaaaggtggtataggtgtcagtagggttggaaaaaatgagtctgggtagtaatactgccaaagatgatattagatgacaattctaaacaatgggttttggtgttaagggtctattatcacttcctatggctcaaggtagtgatttaggataatgtgtgttgttacctattgtaggatgtaggctaatagcataatgtgctcaaagctggtgttaatttgtcttccatgttccgggttgagtttatggtgtactgatttttcaaaaatatatttagccaaaggatttacaggcccattgaattttatcagtggctgtatcaattgtgatgttaattctctcgtttattttactgctttttccaacttttttgcctctttccattgaagctaattcaattgttttggtttgtagatttcctatcttaacgcactccgatatggacttaagaggatattttttggtggattcttcattcgtggtcatgcctacactatggacacaatttctttcgctgtaaatttttggtaaaacttccatataggttcttgtttttatgttgctcgacagtagcttagcttattttgaaaacagtttcctccacaagttctgttcaagaaaccaacgtatgctatatatttgtaaaggtcaaaaggagaggcaaaagccatgtttctgcgtcacgagggttttctaggagcacttggtgcatttatgagttatgagaagcatggtcttgatgacttgagaatacatcacttggttgaacgcttcccaatgggtgctccatatgttggtggaaaaattcatgggcctcctcttggggatctcaatgagaaggcaagtacatctactcttgatcatggtaaccttaatggttttgttggtcattggggttttagttgttttagaacaaatttattgcttgaaagaagtccacattgaaatggaaaccacactcatccaactaaaatgaacacatgaactgaaacgcacactcttggacttctttttcccccctataaacagctgctgggatgagttgaaatcttttccacctgttgttactcttggctcgtggttaacattctctggctccctgttattctgtttgatctattcatcatgtatggctgctagattaataatcatgtggaactgtacttcttcccagatatcatggatggagaagtttgtgcagaagggtactcagattacagcacccgtacctgttggatttcctgtgacaacaggtatgggaggttttgagaggcctaccgccaagggagacattttgcggtcagatgcaagtgcagctctgaatgttggtgttctccatcttgtacccacattggatgtatttccgctgttagaagatccaaagatgtaagccacagtcatccagttctctataacaattattgcaattttgaaatataagggtacctgcagtaaattcattatggaagctggaggcacacttttggtactgtaaaaggtccaaaaggttgggtgaataatgggtaatttgcctcaaaaagctaaagaaagcatcaaagtcatcacttctcaaaacatttttaggcagaagtaattgagatactttagcatattatctaaatatttgaaattgcagtctccattttttttaatataaagagctgcactgcaccccagccaaacagaggtcttgatttgaacttaagaatcatcttgtgttagctcagggttaagaaatatgagctctttcaccgaatcacctaagcagctcttactgtatttaccaattaaaacaatagtagtctatctatagttctataccttttttctgacattgtggatcaacttatttaaagcatttttatcctacatatacatgccaaaattgcttgaggacaagtggttttattgtgcataagcttgctgatggtctgatggaacaattgccatgtgcagctcaattttagatcatgcgtaagttgtaatatattatctgtattgcaggtatgaaccaaacacgattgatctcgacctgaatgagtacaagtattatttctgcttcccctatttctagatatcttgtaggaattgaatcatttgatgatatctgagatgtacaatgccaggtactggttcaagattttgtcagaccatttgcctgaccttgtggacaaggtatggtgtacttcttgcaataaccttgtataacttacgagataag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