Difference between revisions of "Os10g0477000"
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Revision as of 21:10, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os10g0477000 |
|---|---|
| Description |
Armadillo-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001071388.1 GI:115482519 GeneID:4348897 |
| Length |
14822 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0477000, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:18235714..18250535 |
| Sequence Coding Region |
18235869..18235955,18236969..18237056,18237857..18237965,18238050..18238148,18238763..18238805 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcaggggttccccggcggcgcccccgatccgcagcagctgcagtccaccatgctggccatcgagcaggcctgctccctcatccagatgcacatgagtccagctgatgcggaaaaagttataagttcactgcattcatctccaatgccttatcaagcatgcagatttattcttgagacatcccacatgccaaatgcgagattccaagctgctggagcaattggtgatgcagcaataagggagtggggaatcctttcagatgacaacaaaaaaagcctaatagtatattgcttgaactatgttatggagcatgcaagttccccggaaggttatgtgcaagcaaaagtttctgccgtggcagctagactactcaaaagaggctgggttgagttttcagaccaagaaaaagctgccatcttctttgagattgagcaatgcgtacgaggcatccatggacctaatcgacaatttgctaccatcaatttcttagaagccttggtttcggagttttcccctgggactgcttctgctatgtgcctgcctaaggaattccatgagcaatgccaatggtcacttgaagtgaagtttctgaaggacttctattgctgggcacaagctgctgtgttcaattctgcagacaggatattgaatgtaaatgcaagtgtagcagaggagaaagcatgctcagcagcatttcgccttatgttccagatattaagctggagtttcaagcacaatgtggagcatgcaaattcagaagctaagataaattctggtttgaggagtgatgccataaatctgaagaaatttgagcgttcgctggtgaagccagggtctgtgtggagtgatgttctaatatcaagtgggcatgttcagtgggttttgaacttttatactgctgcccgccagaagttctcatatgatacgctatgggttgattctcctattgctacctcctgcagacagctcatagtgcagctatgctcgttgacaggctctgtgtttcctaatgataacgcagatggacagattcaataccttgtgcgcatattatctgctgttgtacattggattgaacctcctgatgtcattgctgcatcaattcgaagtggagcaagtgaaagtgagtttgtagatggatgccatgcccttctttcaatggcgtctttgactacttgttcgctttttgacaacctcctgaagtcaacgaggaactatggcacaatcaacctactttctgctttgacatccgaagctgtcaagtcttttctggataaccagaatgaagaagaaacctggggctcggagtctcttgatatattgttagaaacatggaatgttattctgggggatgttgattccgagaaaagtcctatgtcagttgatggagcaattgctgcttcaagtttgtttaagatcatcgtggagtcacatttgaaggctgctgctgattctgcattcgaggatactgatgatgccgaatactttcatgtttctgtttcaaagcgtgatgagcagctggccttgtatgctcagattgcacgttcagctgctgacacaactataccctttcttgcacaattgttttcagagcgatttgcacggctgagtcagagaaatggtgaaaatgatcctactcagactttagaagagttgtactggctgttgctgataaccagtcatgtcctaacagattcaggcgaaggagaaacactgcttataccagaagcattgcaggttggattcccctatgtagttgaagtagcacagcatcctgtagttgcactctcatggtccataataaatttttctcgacagtgtctagatccaggaatcagggcaaggtacttcagtccgcgactcatggaggctgtgatttggttcttggccagatgggtcgcaacctatttagtaccacttgatgtgagtagggggcaagtaaacagagcagaaattgacagtgtggataaacacatgctccaacattctagaaaaatgctaaacagttttgcttgggagaataaccaaggagagcgtgttcttgattttgttgttcttatttcaatggtagcacttactacatatcagggagaaattgagctgcagacacttacatgccagaagctacttgctacagttgttcgacggaagcacacatgtacttatgttgttcagttggactcgtggcgtgatcttacaagagcttttgcaagtggacgttctttattttcattaactggacgcttacagagatctctagcagaaacacttgcctgtgcagcttcctgcatcaaagatcctgaagcatctgtgcagtatttgagggacctcatgggaccggttgctggatgcctagtagagaatgctaacaggagtgatctcaaatctgtggcacagcaagcagatgttgtttatatggtctgttgtctattggaacgactaagaggagctgctagagctacccagcctcgcactcaaaaggttctatttgagatgggtcacactgtgatgaactcgctcttgactcttctggaggtgtacaaaaatcagtctgcagtcatatacatgatactcaagttcgtcgttgattttgttgatggtcaagctgtgtttttggatgctaaggaaacatcagttttggtgagcttttgcctgaaactactccaaatatactcctctcataatattggaaaggtaatgctctcactttcttcaagtttgcgcagtgagtcacaagctgaaaaatataaggatctacgtgctttgcttcgtcttctgactaatatatgctcaaaggatttggttggtttcctatctgatagtagcattgaaggttcacaagatattgctgaggtcatctatgttggagttgatattgtgactcccttgatatctttggaccttctgaagtaccctaaactcagtcgtgattattttgctcttatctctcatttgctggaagtgtacccggagaaggttgctaacttaaataaggttgcctttgcaagaattattggaagtcttgagtttggcctgcgtaatcaggattgcgacattgtcgacaggtgccttacagcaataaatgctctcgcttcttaccatttcaaagagagacttggaggtaggggaggacttagctcacagcttatggaatcagaaggatcaaatggcaaacttcaggaaagcatatcaagtcactttttgaggctgcttctgcaattgcttctgttcgaagatttcagaatggaactagcaggttctgctgcagatgctttgcttcctttgattttatgtgaacaaccgttatatcagaggctgctgcaggagttagttgagaaacaacagaatccaacagtgaaatcaaggctgggaatggcatttcataacctcacaagctccaacaatctctccaactcgctcgaccgcccaaataggcagagattcaggaaaaacctccgcactttcttgggcgatgtctcgggcttcatgcagataaaatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MQGFPGGAPDPQQLQSTMLAIEQACSLIQMHMSPADAEKVISSL HSSPMPYQACRFILETSHMPNARFQAAGAIGDAAIREWGILSDDNKKSLIVYCLNYVM EHASSPEGYVQAKVSAVAARLLKRGWVEFSDQEKAAIFFEIEQCVRGIHGPNRQFATI NFLEALVSEFSPGTASAMCLPKEFHEQCQWSLEVKFLKDFYCWAQAAVFNSADRILNV NASVAEEKACSAAFRLMFQILSWSFKHNVEHANSEAKINSGLRSDAINLKKFERSLVK PGSVWSDVLISSGHVQWVLNFYTAARQKFSYDTLWVDSPIATSCRQLIVQLCSLTGSV FPNDNADGQIQYLVRILSAVVHWIEPPDVIAASIRSGASESEFVDGCHALLSMASLTT CSLFDNLLKSTRNYGTINLLSALTSEAVKSFLDNQNEEETWGSESLDILLETWNVILG DVDSEKSPMSVDGAIAASSLFKIIVESHLKAAADSAFEDTDDAEYFHVSVSKRDEQLA LYAQIARSAADTTIPFLAQLFSERFARLSQRNGENDPTQTLEELYWLLLITSHVLTDS GEGETLLIPEALQVGFPYVVEVAQHPVVALSWSIINFSRQCLDPGIRARYFSPRLMEA VIWFLARWVATYLVPLDVSRGQVNRAEIDSVDKHMLQHSRKMLNSFAWENNQGERVLD FVVLISMVALTTYQGEIELQTLTCQKLLATVVRRKHTCTYVVQLDSWRDLTRAFASGR SLFSLTGRLQRSLAETLACAASCIKDPEASVQYLRDLMGPVAGCLVENANRSDLKSVA QQADVVYMVCCLLERLRGAARATQPRTQKVLFEMGHTVMNSLLTLLEVYKNQSAVIYM ILKFVVDFVDGQAVFLDAKETSVLVSFCLKLLQIYSSHNIGKVMLSLSSSLRSESQAE KYKDLRALLRLLTNICSKDLVGFLSDSSIEGSQDIAEVIYVGVDIVTPLISLDLLKYP KLSRDYFALISHLLEVYPEKVANLNKVAFARIIGSLEFGLRNQDCDIVDRCLTAINAL ASYHFKERLGGRGGLSSQLMESEGSNGKLQESISSHFLRLLLQLLLFEDFRMELAGSA ADALLPLILCEQPLYQRLLQELVEKQQNPTVKSRLGMAFHNLTSSNNLSNSLDRPNRQ RFRKNLRTFLGDVSGFMQIK</aaseq> |
| Gene Sequence |
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