Difference between revisions of "Os10g0495600"

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Revision as of 21:10, 22 July 2012

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os10g0495600

Description

Similar to DNA-directed RNA polymerase I polypeptide 2 (EC 2.7.7.6) (RNA polymerase I subunit 2)

Version

NM_001189294.1 GI:297727718 GeneID:9270457

Length

11639 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os10g0495600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 10

Location

Chromosome 10:19314990..19326628

Sequence Coding Region

19325805..19325842,19325956..19326029,19326415..19326626

Expression

GEO Profiles:Os10g0495600

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008403:19314990..19326628 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008403:19314990..19326628 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>cctccctccccctctcccccccgcacgggcggccatggcggccgggaagagctcgtcggcctccaaggaggaccagtacgcggcgctgcgggagctgtaccggccgcacatcgactcgttcgactacttcatcgacgaggggctcgacaagatgcttcagtccatccgccccgtggagatcaccgtccccaactcccccaccaccctcagaatatccttggagaaaggtcatctgttcccaccaaagagggatggtcggttggatgcaccgctctacccccagcagtgcaggcaggcacggacgacgtatcatggggaatttaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>PPSPSPPRTGGHGGREELVGLQGGPVRGAAGAVPAAHRLVRLLH RRGARQDASVHPPRGDHRPQLPHHPQNILGERSSVPTKEGWSVGCTALPPAVQAGTDD VSWGI</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>787..824#600..673#3..214#tccctccctccccctctcccccccgcacgggcggccatggcggccgggaagagctcgtcggcctccaaggaggaccagtacgcggcgctgcgggagctgtaccggccgcacatcgactcgttcgactacttcatcgacgaggggctcgacaagatgcttcagtccatccgccccgtggagatcaccgtccccaactcccccaccaccctcagaaatatccttcctgcttttttttttttttaccttttgctcgtcgcttacagttcagtggaccagttttttgtgtgctagtacgaatttaccagtttttccccacccagcatccaaaattcaattcttatgtgctacgaatttaccttaagacagctctcgtgctttccgaacttagctgacaagttgttaataaagccaacacccagtagttccaacatagagttactaaggcgcaggtttgaattcgttttcactctcttacgaggacaccaatagatgaggtttggaaggactgctatatttgtggatgctaattgtttgtgtacggaatgaactatggaagtaacttggttatcatctcattttcccttaaccgtcgtctatactatccttggagaaaggtcatctgttcccaccaaagagggatggtcggttggatgcaccgctctacccccagcaggttttgctatatggacttatcaaatccctttacatatcattttcattttaaacacaagacatttgtttaatctattgaaaactttggacgttctttcctgtttggatgagcagtgcaggcaggcacggacgacgtatcatggggaatttaaagtggatactttcatccaatgtaatgacggaccagctgtcaggcaaaccttcaattttggttacttgcctattatgttaatggttgttaccccttctttgttgtacttcttatcacatttttttcgtaagaacttctctaggtggattttggaacttgaatgagcggctgacagcttagttgagtagtagcatccacatatgagtgcagcttgttatctgcttttaggatctagcttgtgtttctacaattttacattagtctggcaccccaataagtcttggttaagttcacctgtctctttggtacaaaagctacttctgcttcttcaagtcaaaaaatgaaaactaagctatctaatatgatatagttacctggaaaaaaaagagacttttctctatcagttgggtggaaagaatcaaacattatgcactttattagtgtcatgatgttttgtcagtttatagctttataataggccaaaaatctaaattaataagcatgattatgcagtttttgcggttcagtgctgctttacaattctgacactaaaatgataaataatagctgctttgaataatttataatcagttgttcgtgaaagctgatctgcaattctgcatgcatcatactatgctgcaattctgtagagttaggaacacccaaagcatcgatattaaaaaaagtgcagatacatcacattttggtggtagccatagacaactattattgtttcttccttctggaagctatgcaggattcatttcacgttccacttctctctacaccaccttatttgttcttatttgaccgatggttttgatttaattagtgtgaattgtattctattcttgtttatgattttatgctcatgcaattccagtcaaagctttgccatctaagaggtgcagattctgaaaaattgattttccatggtgaagaggcaacagaaatgggcgggtgagtatgttatgaacttgtttatttgtttacattctcttaattatgtcatcttcttccctttctatcatttcttagtacaccgatcatttagtctagtcattcaacttgttaagactacctgtggatcttattgatcgattcattgtgttatgattatatcacattcactcttgattcttctactgttactgaacaaattttttgacactgtttcctatgttagtgtattcattctgatgcattttgtaaaattttctttcaggtacttcatatgtggtgggatggagagacttgtacggattcttattttacaaaaacgtaactatgtaagattactcagcttttcttttagatttatgttgcaaggctaatattagaaaaaaaaaacccagagaacattatggcaatgaatggtttggtgtgaattttttcagcctatgggcctgatccgtggctctttcgttaatcgtggtgctgggtacactgacaaagcagtgatcataaggtgccatatacttgtctatagctgcttatgttactgagtttttttgctgttgcaagtatacttgtctgtgtatctagttgtaccttttttatgttataatccatatctagttttttttgacagatgtgtccaagatgatcagtccagtgtgacaataaagctgtattacctcctaaatggcagtgcaaggcttgggttctggtaagttctgcactggcaaattgtgagtggaaatgcttgagtttctttttagtttttggaacttgattcttgaatttgtgcaaaattcaggttgggaggcagagaatttctccttcctgttgggattgttctcaaggtatatatttccttcatggggcttattgttttctaactggaaattgagttaataagctttctttgtgcatgatcaagttttacaaatcattgctactatatattgttggatgatgatgcaatctacagtgacgacctcaagccctttcttgaaatattccatatttttcatttattgagtaattaagctgtattttacaaactttttttttgttctaagcgtttcattaatctttcctctttctgtagtttattctgttaccttaccagataatttgatttatactctcactattttatttaaaaagtaatattttgattgtgcttctattctttgatatttagtgtaggttggcagtattcttaatgtaactttaacagtacattgacctgattgtgaatttacaaatgataggccctaattgatactagtgaccgggaaatatttacaagcttgacatgctgctacagtgatcattatgaaagaggaaagggagttgtcagcactcaacttattggtgaaagggcacaaataattcttgacgaagtcagagacctgtctctttttactcgcacagaatgcttgttgcatcttggtatctgagagtttaatttgttctatttgcacaaatttttgaatccttcttagtcactgacatcgataattatctttgaaatgcaggaaagtacttccgatctgtgatggaaggatttgagaaagatgattttgaaactgtaatattggatgtttaatctgcatttgtctttgcatgttgttgaaatttggatcgcttcactttggtcattccacattgtgtaggttgctgaggcagttcttaaggactatatttttgttcacctgcaaaacaaccatgacaaatttaatttattgatgtaagttgaagttttattgctcttttctgtgaatttctatccttttgaacctctttaatgatgtgtatctcttattacttttcacttcttagatttatgctgcagaaactttatgcgattgtagatcaaactgcgtcacctgataaagctgatgctctacagtaccaggaagttctcttgcctggccacctgataacagtttttctaaaggtcactaaaccctctgccgtcaagctcatgaccttttttttttcctttttgaaaatcaactccatagtactacaaaaatggcattcaatgttatgtgcttagtaaaaacaatactataacataaaatagcataagttttttgtcttaacctttctacccttgttcaattctctgcctctaccttctctgttacatatttgcatggactgctggaccatgaccaattgaccagtgttagttacaagatggatgtttttaaactgcttggagctggtgctgatgtgttccttcaagcataggtgctaaggtagaacaggtcatccagcacatactatgttgatagcttgagctagtagtcctttgcgttcatattgactactacctccgtcccaaaatataagggattttggaatcccttatactttggaacggaggtagtacttatttcacgctcctagtatggtacagaagatctaggttattaacagtgtaggcatggtagtggttacaggtagtacgaagatgtttttcacccaattttgctaaggtagtgagttaagtcatattttgcttcgcacttttgctgtgcctttgagcttatttttttattctatttgtttcatctttgttccctgtgagcatcgcttgacgctggttctttgatgtcctattttatggctgagattttgttggtgttgcttttgatttcttttctgacatccagttctgttttcctaactcttgtttttctttcctatcatctccaggatagacttcaagattggttgagaaagtccaaacggttaattgttgaagaggctacaaaaaataaaagctttgatctcaatgactgtatgtttactctatccatgtttttatacaggaaccctttttagttgacctgtgtttctgaagtatactacatcgatactagaatccactaatgatccatcagcgagtgaatgctagtgatctttgcattcatatgatccaacaagtcttcatatggccagagacccagagttgtttatgggttccaacatctggtgtactctttataggagtggacgaggggtagcctactatcaccactgttgttattgtcttaggaaccaaggtctagacatgcttgttgggactaatttccataggaataagatcagtttggttagtatcacctatttccataatattagttactccctttgtcccaaaatatagcaacctagt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External Link(s)

NCBI Gene:Os10g0495600, RefSeq:Os10g0495600