Difference between revisions of "Os11g0104900"

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Revision as of 21:13, 22 July 2012

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os11g0104900

Description

Clathrin heavy chain, linker domain containing protein

Version

NM_001072062.2 GI:297611034 GeneID:4349546

Length

10290 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os11g0104900, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:233174..243463

Sequence Coding Region

236574..236723

Expression

GEO Profiles:Os11g0104900

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008404:233174..243463 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>tgctttatattgcaggttgtgcaaaggtttcaagaattgtttgcacaaacaaaatacaaggaagcagctgagttggctgcagaatctcctcaaggtcttctccgaactcctgagactgttgcaaaatttcaggtgcatttctgctcttga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>CFILQVVQRFQELFAQTKYKEAAELAAESPQGLLRTPETVAKFQ VHFCS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>3401..3550#gatctctcttctcattctcttctcttggtttggggtgtcacgactcacgacctgccgccttcttcctccccgtcgctctagaggggatctcaccgccggccgtctctcgccatggcggcggccaacgcccccatcgccatgcgcgaggccctcacggtatcttcttctcttcttactcctacccactcctcccgcgagatctcccccgtaaccaaggcggagctaatggcgcctgactcgtctctcttctcctcgctcgatgcagctcaccagcctggggatcgcgccccagttcgtcaccttcacccacgtcaccatggagtcggagaaatacatctgcgtccgcgagacctccccgcagaacagcgtcgtcatcgtcgacatggccatgcccgcgcagcccctccgcaggcccatcaccgccgactccgccctcatgaaccccaacacccgcatcctcgccctcaaaggttccttcctacctagatctacctgctatctactctttctgatctcacttatttcctagcgatctactcttctactccctaatatttccactatttgcttaattcaaggagccacccaagtttagattgggatctagtacttcctagcacattcattttgccatccatcctaccatagctggaaaccatactgttattcttaccatttgcttcatcttgttcaattcgtcagaaatgtgtatgctaatggtggtttacctctataattttgcgcacatgtataatttccagtaacgatatgttaaggactgacaaattatttagcttcatgacaaattatttatctaaaaattcacgatgaatctcgatcaattgtgcattttacaacttcaagaatacttactccatagtaaaccaacagttttcatattctcatgctgctcattcctagtcacagtttccatgcccttgctagttgctactgactaggagtcgactatcatttcggttttcgcttatatttgtaaccatggccacaacatcaacttattctcccataactccataagttaagcttagttttaacctcggattgggcttacatggatatttctacgctgttcttcctaattgaatacatgacgtacagatcatctggtcttgcacttgatgtttataatatatcctctccaggcaattgttcacttgttatactgtttcataccattgtcacgatttgttcatgcttcatgcttttgtatgtctagttttaggttgcttcagattggattcatactggcaataaacttttctaatgtttaccatcaccagtgtttgtctgacattcaacattcaatttaaaatgcctagtttatacattgacatcatggtgtctggctagcttactaattgcttacgtagaagcagaatgatatgtctttacttttgcaacctaccagctgtttaacttttttttgttgctggaatttgcagctcaaatacctgggacaacacaggatcacctgcaaatcttcaacattgaggctaaaacaaaaattaagtcccaccagatgcctgagcaggtacaaaatttgaagttttgccaaagtatgcgtaaccactttgtttaaattgtatcctataatcttaatgtattctttgcatattttattttcttttcacaatcacaggttgtgttttggaaatggatcaccccaaagttgttgggtttggtaacacaaacatcagtttatcactggtcaattgagggtattgaactattgatctgaacttttgtccaattattattcgctgctttgcattatttggatcatatccatacaaaccaatgattttttttgcatgtatttgttgtaatttttgcatgtatttgttgtaatacaggagattctgaaccggccaagatgttcgataggacggctaatttggccaacaatcaaattatcaactatcgatgtgatccatctgagaagtggcttgtgcttattggaattgcacctggtgctccagaggtatgtttgttaataagtgccgatatgacaggctgcaatggtgtaaagatcaaaatccttttgggcatagtgtaaaagactacatatattttcgaaagttgtaggaaatatgctacacctatgctggaacagtttttaaaagtttattacgtaatgctttgttctatatcatcctaacattgatgtgctctctttttcacccatcagaggccacaactggtgaagggaaatatgcaacttttttctgtggatcagcaacgtagtcaggcacttgaagcccatgcagcatcctttgcatcatttaaggtaatgtccggtactccagttatatttgtgctggttacatattctttgttctactatttgccaaattttccttttatttttcctccacaggtcgtgggcaacgagaacccttcaactctcatctgctttgcctcaaagacaactaatgctgggcagatcacttctaagttgcatgttattgaattgggtgcccagccaggtttgtctctggaaattttcaagatttgttttgtttctattttcaagtttctagcagagtaagaaataagtagaatgccttttatcaaacacacatttgtcatttagtgtagtcagtgctattctgcaaatggttctatattccaccccattcttctccttgtaggccattaacagtgaataaatgttcatggataaatcattcctctgttcactcgttcttcctatcatttatttcagggaaaccagggttttccaagaagcaagctgatcttttcttccccccagattttcaggatgattttcctgtggccatgcaggtgaatatcttgcactctaaaggaagtataccatgttagataccgcatagatcttattttttttaattttctgtcaattacagatctctcagaagtatggccttatctatgtaattacgaagcttggccttttatttgtatatgacttggaaacagctgcagcggtctatagaaatagaattagtccagatcctatattcttgacagcagagtcttctgcaagtggtggtttttatgccatcaataggagaggacaggttttacatgccacagttaatgatgcaaccattgtgccttttgtcagcagtcaagtatgttctcctgctcttaaattacttggcttatgtgcttgctattatcgtttttaacacattttgttttatgcagttaaataaccttgaactagctgtaaatcttgccaaaagagctaatcttcctggggcagagaacttagtaagttccattacttctatgcttttgttgtgatgctgttacaatcgcaatttacgcttgttacctatgctggttttatcagtggcatatattttcctgcaagatatgatagcgagtttaatgctttatattgcaggttgtgcaaaggtttcaagaattgtttgcacaaacaaaatacaaggaagcagctgagttggctgcagaatctcctcaaggtcttctccgaactcctgagactgttgcaaaatttcaggtgcatttctgctcttgattacagagctattaacacttctttacctccattttacagctatttttcacattctgtactgttaaaagcttaaaattatgtgaactgatggatgatgcagcatgtttactatgctggccctagattatagagattagtgtgactcttaccatagcaatttcagcaatgcgactactatggtgacttctttataaaatcattgggctttatgaataaaaaaaatgttcctaatggaaacacctggtaactacttaccgttactttcttgaggttttatttgataaatgcttcaaacatagtgaatgcattaccattattattttcatttactttcctgtgttgggactgtacaactaatcttaatgcttatgctcttctgcttgacttagctttttcgtttctgtgcttttaaatgcagagtgttcctgttcaagctgggcaaacgcctccactcttgcagtactttggcacattgctaactcgggggaagctcaatgcttacgagtctcttgagctatctcgacttgttgtcaatcagaacaaaaagaaccttttggaaaactggttggctgaagacaaattggagtgcagtgaagaacttggagatcttgtcaaggtaaaatgggtgttaagttgtttgttgattgcacatatcgattttgttacactgtgtcctgtttgactgtctggattgttcattaattgatacctgcactctttggtgtagactgtggacaatgatcttgctctgaaaatatacataaaggctagggcaacccctaaagttgttgccgcttttgctgaaagaagggaatttgacaagatccttatatattcaaagcaggtatatttgttcagtattgatgaatcctcattttcagctgtaagagttcagctttgatgtaaactgttggcctaatacatttgctgtttcaggttggatacacccctgactacctcttcctcctccagaccattttacgtacggatccacaggtaatgtattggttaagctattttgggctagggtgaaatactctgctttgttctgtgggttgttgatttttatttgcaaaattaattatttactgtatatctcttttaccagggagctgtcaactttgcgctcatgatgtcacaaatggaggggggctgtccagttgattacaatactataactgatctcttccttcaggtatccttttaattcatttcaatgcatagtcggtatgtaatacctttgcttttttaccatgaaattcagttgtgtcttgccttaccatgcccattttttaacagagaaacatgatacgtgaggcaacagctttcctgctggatgttttaaagccaaacttgccggagcatgcttttcttcaaaccaaggttagcagttttttcccaataagttaggccttttgcctttgc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External Link(s)

NCBI Gene:Os11g0104900, RefSeq:Os11g0104900