Difference between revisions of "Os11g0217500"
(Created page with "{{JaponicaGene|
GeneName = Os11g0217500|
Description = The start codon is not identified.|
Version = NM_001074045.1 GI:115484738 GeneID:4350086|
Length = 12772 bp|
Defini...") |
|||
| Line 1: | Line 1: | ||
| + | Please input one-sentence summary here. | ||
| + | |||
| + | ==Annotated Information== | ||
| + | ===Function=== | ||
| + | Please input function information here. | ||
| + | |||
| + | ===Expression=== | ||
| + | Please input expression information here. | ||
| + | |||
| + | ===Evolution=== | ||
| + | Please input evolution information here. | ||
| + | |||
| + | You can also add sub-section(s) at will. | ||
| + | |||
| + | ==Labs working on this gene== | ||
| + | Please input related labs here. | ||
| + | |||
| + | ==References== | ||
| + | Please input cited references here. | ||
| + | |||
| + | ==Structured Information== | ||
{{JaponicaGene| | {{JaponicaGene| | ||
GeneName = Os11g0217500| | GeneName = Os11g0217500| | ||
Revision as of 21:17, 22 July 2012
Please input one-sentence summary here.
Contents
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os11g0217500 |
|---|---|
| Description |
The start codon is not identified. |
| Version |
NM_001074045.1 GI:115484738 GeneID:4350086 |
| Length |
12772 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0217500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:6097725..6110496 |
| Sequence Coding Region |
6098121..6098255,6098638..6098765,6099085..6099169,6099271..6099360,6100761..6100859 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008404:6097725..6110496 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008404:6097725..6110496 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ctatgttcttgttctaaattcctttttacgctccgcagtgagaatttgcaactactcagacagcgatactactttgctacatggaaagctgatggaacccgatatatgatgcttataatgagggatggctgtttcttgattgatcggaatttttgcttcagaagagttcaaatgcgctttccccataggaatcttaatgaaggactacatgagatgactttgattgatggagaaatgattatagacacagtaccagattcaggattgaagaggaggtatttagcatatgatctgatggcacttgatgccgtgtcaaaaaccaagttgccattttctgaaagatggaggctgcttgaagatgaaataattcgtccacgttattatgaaaaaaaacagtttgagagtggcgttaagagcaacccaatgtacaaatatgatatggaactattttcggtcaggagaaaggatttttggcttctttctacagtaacgaagctacttaaggagtttattccatcactttcacatgatgctgatggtcttatttttcagggctgggatgatccatatgtaactcgtacccatgaaggtcttctcaagtggaaatacccttcaatgaattctgttgactttttgtttgaggttgggggtgacaatcgtcagcttgttttcctttatgagagaggcaaaaagaaacttatggatggttcccgcatagcatttccaaatgaagatccatcctctatctcagggaggattgtagagtgctcttggaataaggaagagggctgctgggtctgcatgcgtattagatctgataaatcaactccaaatgatatcaacacataccgcaaggtaatgaggagcatcacagataatatcaccgaagagaagcttctagaagagatccatgagatcacgcgcctcccgatgtatgcggataggataaagcaggctcaggcaaagatggcccaacatcgacgaagatga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>LCSCSKFLFTLRSENLQLLRQRYYFATWKADGTRYMMLIMRDGC FLIDRNFCFRRVQMRFPHRNLNEGLHEMTLIDGEMIIDTVPDSGLKRRYLAYDLMALD AVSKTKLPFSERWRLLEDEIIRPRYYEKKQFESGVKSNPMYKYDMELFSVRRKDFWLL STVTKLLKEFIPSLSHDADGLIFQGWDDPYVTRTHEGLLKWKYPSMNSVDFLFEVGGD NRQLVFLYERGKKKLMDGSRIAFPNEDPSSISGRIVECSWNKEEGCWVCMRIRSDKST PNDINTYRKVMRSITDNITEEKLLEEIHEITRLPMYADRIKQAQAKMAQHRRR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>12242..12376#11732..11859#11328..11412#11137..11226#9638..9736#9416..9544#8288..8410#8002..8202#gtttccactccatcccatggctccccccaaaccctaaccaccctcgtccgcagatcccccaccaccacaacccccgcccaaacccccctcccttctccgccgctcgccggcgacgccgccgtcccgcacgcgcccctccctcggcgggaggagggagggacgacagcgccccctccctgaccaccaccaccaccgcacccccccgctccggcgcgaggtacgccacgccaaccccccccccctcccccttcctcctcccccaattcgctgcggtccttggctcgcgctcgctcccacggcggtctggtttcaccccctgcgcgcgtgcgtggcggggggcgcgggctgggaagtgggaattgggggccgcggcggcacgggtcgtacgggccgggcgacgtgcgtgtatggtctcgggatggggggttcgtgtgttggtgtgctcgcggtaatccccctagcaagcggtttggccggcgtttcaccccgtttttgggagaaccctagctagctgtttagctattgctgtaactggtagtagcggtggtgtgagctgtccttgttttttttttagctcgaatttcatcttttgtgtcgtgggcttgtggcttggggcgggttttcagatgacaccaggacatttttttcccattttcgcttggtcactccattcttgacattaattctgtggaggtatgaacctccgtcatttttaggtggtaatatagctgcaagaaacctacatgcacccttttttctccttgaaagtaccatgtcgtctgtcactgcatgaattatgttacctctttatgctgctattgtgctggggaaattaaatgccccaaaatgaacatttattgttgctatcttggtttcatggacttcaacatttgaatttctcttcagttgataacttaaagttgcaaggtgctaggaaaaatgcactttttcggtgccatggacttgaatatttgcatatctcttcagtacattacttaatagttgcaaaatgggtgaggaaagaatgcagatattttaatgtctggtgtgcaattaacaagtcaaataataactttagagttgctagccaagtcaaatgcgttgcaacggatattataagagagaaaagcaaaagcaaaacttacaagtttatagcatagttagtcgattaggcatataatgtcatcttcataggcaaccatgctgaaatatgctgctagatcacctccttttatcttcttcatctatttctataagccatacggttggataataatactgtaattcatttgtgggtggcaggtgaatttgaagattttgtatgtaaccccttaaaatttctagaattagcaattctagggccattcatgtgttgtggggactttatgcttatggccccacatgtcagtttatgcttatggccccacatgtcactgaaacccatgcaaataaatgggcagtttctcagtctgatattgcagtctgccacagaacttaccttgtatggaggtgatactgttttatgtaacaatggaccctcaaaatcacaaaattattgtaaaaccaccttatatttgcgagaaaaattctttttaagtgacaatcaatattaccatgtttccttattcgccactgagagttggcttatcccttatatgccactagttcagcccccccgccctctctatatcttgggatgcagccatgcagggctgcccatacccatatgtacttgtcttgtatgatagtccattcactggattcacccagtagatgtgggttggggctgaggtcgagcaccttgagggtggcagagaatgcagaatggaggttggtctccattccagctgtgcccagattcctatctctgccttaactggctattcacacttggatacctatctgctctgctattccatgtctaaatgatgagtcttgatgagcatgataagttattattattaattcgcttgaagcaacgatgaattagataagctgagaagcgaagtgcgtgaaaaatatatactaaaaggttggggctgacctgatttcatgcgtctacgaaaacatgccagaaacctgctgttatcaggtgtcaggtagtggaggttttttaggtgagccagaggagtagctggtttcgccttcttgcctgcgccatgtgctgccggtgttacctacctcggtgtgagcaagcaacgactgatggaaccaaagggggggggcagagaagaaaaagcaaaagatagatagaaagagcatgttgaatagtgagcctgggacaatgacatgttgactaggggcaaaattgccatttttgtattttagtgactaaggtcgaaagaaggtttgaaattaatgaacctcagtgatgggattttaaagtatgattacgtcgatggcaaataagggacgcagaatttcattcgatagtgtataagagatgagccatttatcaggaattaaggaaaaatgatagcatttgatggaaaatgaagaatgttctcgtttatttatttaccagaggcatagctggtgcaagccacaagacctgtaatatccaaaaatcttgaagttgtgcaagtgtttgtcaagtaatcttccaccatacagagattttcagtttcaagtttgggtctgttctatataagaaagttaatataagatgaattgttacaataaaatgaagggaaaaaataaaattattgtccacagaaagtttgccattattggttatcttactattgattgagtctcccttccaaattttcagtcttggtatgtcaccatttttgttcttttcaaactttgcgctgacttgatgcctgaactgagggtttagtgatgctagcactaattttcctgtgaactagatttccccccttggttataaatttatatacttctacatatactggcaggatttgaaatactggtaaaatggtaatcattagtatgcgtagtctttatgatttcgtttccattgttcatatcttgtgtgcctatccttcatcttaaatttgagtctagtattgtgtaaggttttaagtcaggggcatctgaactgacactcaatctcgtttgaaatttacaaacatgttcttgtgggctttatggccatgcatgttcattgtcaacttcctgttatttgttgaattgtaggtgtcacaatatgaaatatttactgttgtgctgttttcatgttcaagctggtagcatagctgtaagagttgttctttttaaaatctgcagtgcataggacatcgcatgctttatacaggaatagatactaggctacactgtttgcaactttgcaaccaacactgttattagtgcctatgtgatgcaagattttcgtcagtagtttgtattataaaggatgtggtttgtttctttgggggtgtggaatgcttgtcaatgaagctgtccctcagtcctctttccttaagcttgtataggttgaaacttgtgctgtcttttcaataatcgtgttaatgccttccgctcacttttaatgattttgagattttgataatatttgtttctccatgtgtgatcatctaagtatatacttgttcttaggtgcaaatctcaaaacgttattgaggatatatgaagtagtggatgttgaatgaccttctcaatggatttaaatgcctcaccattgcctgaggaagatgaacagccttatgaacaacaggtcgaggttgattttgcacaggaggagcatgttgagtctgctgttgctacaatgcgaagggtactacatgacactcatcctgcatttaccttttggttccatctagaaggttcctaatgatagctgattatttattactgaaatgcaaactgtacattttatcttcagcaagttctcttagttaatatcgttagatgatgggaaacaacttggaagttgttaatgttggtttacatatgttccttttcctagttttactggtatgtcgcttcctttgtttgcatagcatccaaattttctgccttttgttttggtcatgcttcagataatctattttgaggattggaaagtggtgattgtctgtttcagtttttcttaatggcaagcatgcaaacttgcatgccacctttttatgttaatcttgccattgttgcaggagcgtgaagagagacgcaaaaaattaaagagagagcaacaagatgaaggctcaagattacattctcagcagattaggaacgattatgcaccttataacagagctggtagaggtcgaataaaagaggcacctgatggtatgaaatgttggaaaatgtttctaactgttatcaactttatatggcaatttctagctatgagcatgcgcaaaatggattttgactattcttgcttttgtctatgttacttcaggttggatgaattgtccagcatttggtgagccaatagacaaaatcataccttccaaggttcctcttgatgaaacattcaatgacttggtgcctcctgggaaaagatattcttccaaacaagtagttaataaacaaagaaaagctggtcgtgaagtaagtattgacttgttgattatttttatagtttgtagttgtactacgtacttatttcccttttgttaattgcgaagatgatgctgttttcaattgatattattgtataaataaaagattgcaattctgaaattcttttgtgaaacatgtgcacttactgctcctcctcttgttcgaaatgttcatattattggcatggtacggattatctcgtatgcgtacattcctagtcagcccccttttgctaacagaactataccgattttttcctatcccttttcagataggtttggtgattgatttgacaaatactactcgatattactcacctgcagaatggacaaggcaaggtattaagcatgtcaaggtgagagaacttaagcttatctgcatccttgaaatcaaaagggcctttcctatgttaacacatttctgttttagattccatgcaagggaagagatgctgtacctgataatgaatctgttaattggtttgtctatgaggtaacacctatatttggctacatgttttgtatcagcagtatatttgattctggtgtttatttgtccaagtaggagtctgttgcttaattctttcacatttttaaagtatttcatttgttttcctatcccattgtgtttgcaatttgtttcttgtgagctgttttctttttgttcctcaagtgtttgagcttattctctaagggcatgttcagttaatccccatgaggaagtgattggaggggattgagatttgaaagatgtggaattaatcccctccaatcctcttgggaagggattaactgaaccaaggcctaaaaagtagttttaccttttaattaggagctacatgtttttaacttcatgtgatattgattaagttgtgcaatgtgtcaatatatacctattatgatgttttggtctgcacatgttaaaggtgccatgacagtttagttattaaatggttatgaactgcagattttggctttgcatgtaactaccgtgtgtcgtcttggaacacgtgaagccaaaattttggaattttttacctttattattatttctaaaaataaatgtatttgccgcatgtaattgtaaatttgatagctctcttttgtatttttttgaaacatacatacaactataaaaaaaagtgatggtcaatgtgtccatcggagactctctgtcaatacccgtggcggagctaggttctcaaccctgtgcgttcaaaatgcataaatatgtaactatgtggggtcaatccatacaaattttcattgttttatgtatttcttcactatttttcacatgatcaaggtgtatgatgcaaccccacagttttaacgtggctccgccactggtcaatacatataacgaattacagtttgcatcagagggagtacttatttcttcgcacggtagtttatacctactttgtaacttaaaaggtgtttgcactttggcatctttcattatcaaagatcctgttacctgtatgcatatttctttggatcatcagttcatgggaatggtgtatagtggttaaatgatctaggtttttctgcaacaacaatttgggctcaccaaattcaatgatatacgcgttgaagtatataaaccattatatatatattttctgttacattatttttaatgacttatttcctcatctgcaaccaatgattttctttattattttgtaccatagaacaatagattcagatgtatgtagttagcaaccatatgtacagacagcattcaatgtatatttatggaatgatttttttctgttatttcaggtgatgatgtttcttgaccgacagaagcagtcaaagaatcctaaatatattcttgttcactgtacccatggtcataatcgtactggtttcatgattatccattaccttatgcgaacacaagtatcctgcgtcgctgaggtatgccaactagattctcaatgttgtttgtttgacttagttctactgttcttcttgacctcattttcattctaggcgataaacatatttgcaaaaaggagaccgcctggtatatataagagggactacattgaagcactgtattcattttatcatgaggttcctgagcatatgataacatgcccttcaacaccagaatggaaaaggtcatccgatcttgatttaaatggtgaagccaagcaagatgatgatgatgagaatggtgatcttgcaccagtacatgtaagcattttcagatattcaaatctgaaattacttccaagtaatttggtagagaattaagtgcctgattccttgtaattctcgaaaggtttttcatttatggacataaaggtagagttttgagttcatacgacctactttattatttgattggatttttggactttactttggatgtaatttactatatctcctggctcatattgttttttttaattgtcatgaagcaaacttgcttggaatattcaaagctattttcttgcttttgagcccttgtatcttgcagaatgaggtggaagataaagttatcactaatgatgatgtgctaggagatgctgtaccatatgatcagcaagatgctctgcgtgtcgtatgttatcgcttgctggaaatgccccctgtaagtataaattttatatggtcaattgaacatccatatgtgcacatacaaattatgttgtctgttcatctagtctcctttttagctgttataatgcttgtgctattttcaactggtacttatgttctgtaactttaatagtttctgcatatgttgccaaccacaacttgtgtttcttacacgctgctataatagcatttgttttgttacaggtgagagggcatgcacagtttcctggatcacatcctgtctctcttaacaggtggctaacagtaatctggacttcatgcattgtttgtaatactagtaacttattagtatctgtgttaagtccattatctcttacatgttatctgtgcgttttgatttctgatgttctttggggctttgcagaaagcaaaactgtagaaagtagtttatgaaaaatttaaatctctgcctctaatataaggttggtaggtaaaatttgtgcacttgatgggttggaaatatgcacccaaccccttctcttagaaagctccatttcacatatgaacaacagatttctgattgcagaaagcctttcttttatgtcattaatttcttcagatcttttcatgtaacttgtcccaaatttttttatgtacacatattaaaacttaaatgcgactctttttttatcagttaagccttgaaactatgagatcgcgcctgctatgctgaagaaaattattgttctttcaggggaggaaagaaatgcccggttttgatttagaggtttttttttgtagcgtcctttttctcgtatgaaactattttgtttcaaatggtccttatttagtattcatttgattcccactctaactatgttcttgttctaaattcctttttacgctccgcagtgagaatttgcaactactcagacagcgatactactttgctacatggaaagctgatggaacccgatatatgatgcttataatgagggatggctgtttcttgattgatcggaatttttgcttcagaagagttcaaatgcgctttccccataggaatcttaatgaagtaagatcccattattgttctggagaaaaggtcgtactgcatttcgttttgcaaaaagttaaccttatttcttttccaatccaagggactacatgagatgactttgattgatggagaaatgattatagacacagtaccagattcaggattgaagaggaggtatttagcatatgatctgatggcacttgatgccgtgtcaaaaaccaaggtagaataattttttatccaggttatgttctgttatttgaattgacttatttctgtccaactgttgtactctgtatttatcagattcagtgtacttttagttggggtatattgtatttgtagtgaacaactcaacctgttacctaactagtcagacgtgctagcatctcagtgatccctggttgaattgttacagcctatactggaaacaagctttgctatccactatctatgttactactccatcccgttccgtattataacatgttttgggtttgtcctaagtcaaacttcttcaagtttgaccaagcttatagaaaaacatagcaacatctacagcatctaattagtttcattaagtccattgaatatatttttatattatatttgttttgtgttggaaatactgctgaacttttctattaagtttgtcaaacatggagaagtttggcttaggacaaacccatgatgccttataaagttataatatgaaacggaggaagtactagacaaactattattttacttttgatttatctctctgccatgatttatttagtccatttttgtgtcagaatataatcacgagcgattacagattttctgttgtcacacattttgctaacaataatcgaaatgttgtttcataataccatcctattttatttggaaccaatttcacagcgctgagctacctttgtcaaaaccatcaaacaacaattcttgtgagtgacatttgcagagaaacacactattcgcattatgtttcagaaaactaaacttgtactgctttcatttgatctttgcaatgggggcaaacatgtcatccttccatctcacatgcctgttttgtttagtatgtctgtctattagggctcacactttatacatattttccaatataactttccgctatcttagtgacatatttttgcttacagtttgctcttattgatgtagatatatgtctgaatattgttctaaattttcatgtttatgcttgcagttgccattttctgaaagatggaggctgcttgaagatgaaataattcgtccacgttattatgaaaaaaaacagtttgagagtggcgttaagagcaacccaatgtacaaatatgatatggaactattttcggtacctaaatcgacaccggctgaaatttcttgttctatctacgtatattctggaaaatacattttcttactctatcttctgattccttaccaggtcaggagaaaggatttttggcttctttctacagtaacgaagctacttaaggagtttattccatcactttcacatgatgctgatggtcttatttttcaggtaggtttgccttctatccaagggaatggctgtatagtgattggtgaagttagaatgcattgaggattttctattcaagttgatgcagtacttatatttttgaaataaagcatgttatatctatgaattttattgtatatttgaaagccagatattgggacataaaattgagctggtaaacaatcattttcactctttgatttgcaatttgcattctaccttgacttttgatgtatgtagagcagacctattgcttttgtttaggatagggcatactttttgttgcaatgcatgtgatcactgatatgcaactatgcagttctgtgttaagtaaaatcactaatatgcatttatagattgctggtgcttcacatctcattgctccatctttttttcccccataatgtccttgttgagattgcatttttgggaactgaagcatgaagtgctgattgtacatgaagcaccatgttgcaagtttgggagacctatatgcttcatttgacttgtcagtaactcagtatgtgaattattgagagcacctaaattattttctttacttaacttctcaatatatgattaactgagaacaaggatatgagatcctctaacttccctcttaacttgtgtcactgacatgtgggccccttacctagcgggcccacatgtcagtgactcagtcagagtgaagtaagtcagaagatcctcttacgagaacaagtcatgtaattgatatgtgacttggttgcatgtttgttaacaaatgggaagagaaatgtaaattgagagcgaattcatataacttttttcctgatcccctatgggggggggggtttaagattgtaagctaattcacattaatgtctcgtcagagcatgaaggtggtgttaatcaataaggccccttgctttctgttttggcaatctgaacttatcttttagcaggccccttggaatttgtttttcatttgtcttgctgttgacacaaatcgttatatattatgcttcaaaagtgttctttcaactcatctgtgaatttctttaaaatagttttgaggtgaggtttcaactgtactaggaggggtggaatggtgtaagtaatttctactgtgctttgtagactggacgtaaatagtttcagcaggctatttttttcctcattattatattatagctggatgtttgatgtggagttgtagaattgtgtttaaatttgtaaatacagtattatatgtttgaatatgtgtaaaggctttcccgcacatgtgaattcaaccatcttcttggatttatcatgtgccattgacattcatattgtgaatttgtggttgttaacagttaatatctattcaaaactataatttgtttgtgttggatgaatcacttctgttattcatgtagggctgggatgatccatatgtaactcgtacccatgaaggtcttctcaagtggaaatacccttcaatgaattctgttgactttttgtttgaggtttgtataagttttgtgaaccaatgttgttgcttcaaatggtttgccatgtggaagaaatttttttgatggttaggttcattatacatatatcgttacaggttgggggtgacaatcgtcagcttgttttcctttatgagagaggcaaaaagaaacttatggatggttcccgcatagcatttccaagtaagcatgtcatctgatgttcatttcatcctgtacacagttttttttattctaatgattggcataagataatatttggatatgtggcgaagcattttactcttttatagtattagatctgactgattaaagcatatattataatttgaatgattttggatccattattattttttagcgtgcaaactttctgatgctagcatgtaattagtttcctgttttggaataaccaagtaaaatcagccatcgagtgtttactgttttttgtttatgtgctatgtgctaaataatttgtgctaatgttctgaaacttgtgcagatgaagatccatcctctatctcagggaggattgtagagtgctcttggaataaggaagagggctgctgggtctgcatgcgtattagatctgataaatcaactccaaatgatatcaacacataccgcaaggttggctttcctatacaatctgttttcttatactatcttctgtgttacaatattttctaatttaactgtgcataatggctgcatctgaatatggtcggtactctgtaacattatgatttgatatttcttttatttgaactaatgcgaaaaggattattccagaatcagttgttttttctttatcttatgttaatatggcttacctgctaaagtcctatataataccataagtctgtattttgatgttttattgtcgatgttctctgggcgcaatgtaggctaaagataattttaatagaatatgatatgcttacagcttactgatgatgataaaggctcaaatagtgctatgctctgaccatttcattctatttatgtaaaggtaatgaggagcatcacagataatatcaccgaagagaagcttctagaagagatccatgagatcacgcgcctcccgatgtatgcggataggataaagcaggctcaggcaaagatggcccaacatcgacgaagatgaggatggatgccatcaacatcgtcagtatttggtagtgttagtcttgttgctatagtgctagagcgctgctaccgtctatggcaagcggcgggttcgcgtagattgtgtaaattagtaggggttgttgtaggatcttattataatgatggctggttaagccaactaattctttgtacctctcaagtctcaccaatcccctgtatagtcagtcagtcgtctgcagagtagcccttgtaaatcgtgtattgtgtttctgcattctctcctatggttttattttcatgggtgtagaatagcttttaacaagaggagggagggtttgtgttcaagtatgcccagtagcattattgtcttcctgtgctctagagtaataaatggcgcgtgaactgtgttggc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
