Difference between revisions of "Os11g0242100"
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Revision as of 21:17, 22 July 2012
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Evolution
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Labs working on this gene
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os11g0242100 |
|---|---|
| Description |
Protein of unknown function DUF608 domain containing protein |
| Version |
NM_001074120.1 GI:115484888 GeneID:4350171 |
| Length |
11462 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0242100, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:7597229..7608690 |
| Sequence Coding Region |
7599119..7599196,7599560..7599664,7599942..7599998,7600119..7600189,7600695..7600794 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggtagagaatggtgttctggagcaaccaaagggggtgtctcgaaataggccacgtgctcagtcgaatgatcatccagttgatcctggatacctcccagagttgacatgggaacacaagcttagcaatattggctatgatttgccatccttcagacttacatggagagagacattccagttggctggccttggtcttcgtcttggccgacacatccttgaagaaacatcaaaaggacgtgctgctgtgattgatcccatgaagaagcgcattgcaaaatctggtcagggtgttccacttggcggcattggttcaggaagtattggaaggagctacaaaggcgagtttcaacgctggcaattgttcccgggaacttgtgaagagagacctgtactggcaaatcaattttctgcgttcatttcccgcaaagatggtagaaactattcctcagtgctgcatcctgggaaaccagatttgccaaaaggaagtaacatttcaggaattggatcctgggactggaatatgagtggacaaaactctacgtaccacgctctttaccctaggtcctggacgatatacaatggagaacctgacccagatgtcaacatagtgtgtcgtcagatttctccaattattccacataattatcaacagagcagctatccagtttctgtattcactttcacagtaactaactcaggcaatacggctgctgatgtaactttgctttttacatgggctaactctgttggtgggaaatctgaactaactggatatcactccaattcccctatgatagaaaaggatggtgtgcatggcattctgttacatcacagaacagctaatggacaaccaccagttacttttgccatagctgcacaagagaaagaagatattcatatctcggaatgcccttactttataatatctggaagttctgatgcattttcagcaaaagacatgtggaattatgtgaaagagaatggatcttttgataaccttgatctcaccaaaacatcgatgtgctcaaaacctggattatcaataggggcagctattgcagcttctgttaagctgcctccccagacaacccagaatgtatcatttgcacttgcctgggcttgtcctgaagtgaaattctccagtggaaaaacctaccataggcgttatacgaaatttcatggcacggataatgatgcagcagcaagccttgctcatgatgccattctagaacataattcttgggaaaggcaaattgaggagtggcagaatcctattttgcaagatgagaggtttcctgactggtacccggtcacacttttcaatgagttatactaccttaatgctggaggaactatatggactgatggattgccaccaattcaaagcttgacaggtattggtgaaaagaagttttctctggacatgcaaaatggggacgctgatgatgccaatgggataatcccacggaataatactgccagcgacatccttaatcaaatggcatcagtactcgagagaattcatgcatctatggaatcaaattctgccataggaacaactttacttcagggtgaagagaatattggccaattcctctaccttgagggcattgagtattatatgtggaacacatatgatgttcatttctatgcatcattctctctgatcatgctgtttccaaaactccagctcagcattcagagagatttcgctgctgctgttttgatgcatgatcctgaaaagctcaggatgttacatgatggaaaatgggttgcgagaaaagttcttggtgctgttcctcatgatcttgggctatatgacccctggttcaaagttaatgcatatacgctctataacacagatcgatggaaggacttgaacccaaagtttgttctgcaagtttatagagatgtggttgccacaggtgacaaatcctttgctcgtgctgtttggccatctgtttatatggcaatggcatatatggagcaatttgacagggataaagatgggatgattgaaaatgaggactttccagatcagacttatgatgtgtggtcaatggctggtataagtgcgtactgtggtggactttgggtggccgctcttcaagctgcgtcagccttggcacacgaagttggtgacaaagcgtctgaaaaacttttctgggacaagtatgagaaggctaagtctgtttatggcaagttgtggaatggttcttacttcaattatgatgatggcgacaacataatgagtgcatccatccatgcggatcaattggctggacaatggtatgccaaagcttgcggtctcttcccaattgttgacaaggataaggcggaaagtgcactagaaaagatatattctttcaatgtgatgaaattcaaggatggtaaaaggggagcaatgaatgggatgtggccagatggcacagtggacatgtccgcaatgcaatctcgggagatatggccaggtgtgacatatgcacttgctgcaaccatgattcaagaaggcatggttgagaaggggttcaaaacagctgaggggatttatcatgctgcctggtctccagaaggacttgggtactcatttcaaacccctgaagcttggaacaatgacgatgaataccgatcgttgtgctacatgcgccctcttgcaatatgggccatacagtgggcactatcaaacccaaaactccacaagcagactgcagatatcccacaggactctttcccaaagaaccagttctcgtatgctcggattgcgaagttgctgcatttacctgaagacgaatcgccgaagagtttccttcgagtgatttatgagattgttcgtaacaggtataggtcctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MVENGVLEQPKGVSRNRPRAQSNDHPVDPGYLPELTWEHKLSNI GYDLPSFRLTWRETFQLAGLGLRLGRHILEETSKGRAAVIDPMKKRIAKSGQGVPLGG IGSGSIGRSYKGEFQRWQLFPGTCEERPVLANQFSAFISRKDGRNYSSVLHPGKPDLP KGSNISGIGSWDWNMSGQNSTYHALYPRSWTIYNGEPDPDVNIVCRQISPIIPHNYQQ SSYPVSVFTFTVTNSGNTAADVTLLFTWANSVGGKSELTGYHSNSPMIEKDGVHGILL HHRTANGQPPVTFAIAAQEKEDIHISECPYFIISGSSDAFSAKDMWNYVKENGSFDNL DLTKTSMCSKPGLSIGAAIAASVKLPPQTTQNVSFALAWACPEVKFSSGKTYHRRYTK FHGTDNDAAASLAHDAILEHNSWERQIEEWQNPILQDERFPDWYPVTLFNELYYLNAG GTIWTDGLPPIQSLTGIGEKKFSLDMQNGDADDANGIIPRNNTASDILNQMASVLERI HASMESNSAIGTTLLQGEENIGQFLYLEGIEYYMWNTYDVHFYASFSLIMLFPKLQLS IQRDFAAAVLMHDPEKLRMLHDGKWVARKVLGAVPHDLGLYDPWFKVNAYTLYNTDRW KDLNPKFVLQVYRDVVATGDKSFARAVWPSVYMAMAYMEQFDRDKDGMIENEDFPDQT YDVWSMAGISAYCGGLWVAALQAASALAHEVGDKASEKLFWDKYEKAKSVYGKLWNGS YFNYDDGDNIMSASIHADQLAGQWYAKACGLFPIVDKDKAESALEKIYSFNVMKFKDG KRGAMNGMWPDGTVDMSAMQSREIWPGVTYALAATMIQEGMVEKGFKTAEGIYHAAWS PEGLGYSFQTPEAWNNDDEYRSLCYMRPLAIWAIQWALSNPKLHKQTADIPQDSFPKN QFSYARIAKLLHLPEDESPKSFLRVIYEIVRNRYRS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1891..1968#2332..2436#2714..2770#2891..2961#3467..3566#4503..4573#4706..4806#4888..4991#5105..5158#5294..5349#5445..5483#5599..5743#6616..6797#6887..6954#8306..8378#8468..8529#8613..9537#10301..10591#11059..11329#gaacttttctgaacttctgaactttccgcgtcttcttcgtcttcgtcttcgtcctcctcctcccaccaccactataatctcctccactcccattccctccatctcccccccacgctcgcgagcttcgcggagtcgggagatcgaccgccgcctcccccaccacacatccgcccgcggcggcgggttgcgcctgcgccggccttctcggagtcccgcctctccactccggctcactctctccggtatgccgtggtttggtttcgagtttcccacgctcttcgatctcgcttgtatccgagatagagttagactccacgatggcggcgatggcgagggcgtctgctccattggcactgtagcgcagggggcggattgtgttgaattacgccagacaaaaatcctttctctcttttttttaatctttttgggttgaaaacgagatggactcgtctgcgtgaatttcgtgtatgctgctgatacgaaagtccagtttttttttaaataaataaattattttgtgatgttgtgcgcattctggtatatgatgatccaatcggaggcttcctgaaatcgtggaggaaatggtcttctcgaaatagttgatcagatagtgtgtagatccatctgaggagttgtgaacttgatcggttgattcttctcttgctaagggaacccggcccagattgctgccctggatcgttctttcttgtgagttgagttcgtcttctttgctgtggttgatggctgtgagcaatcgaattcagctctttcttggattatctcccatccagttaattgagggctcggttgctgcgtgctacttgttcgatccatctgtgttcatgtgttgttgattatgatttcctcttcagtgcgcaagattgactcggttgatccctggattggtttcttcaggccaagtttgatttctgaaatttctcggggttagttactgttgtataataggatttctccggcattggccgtttggctcatcaatgaactgcacaacgccgtgtcaaatttgatacttcagttgcttgagttttctggcttgtattttgttgtttgataacttatttgttaatcaagccattcagattttacctataaacttgttagatcgatcgcttgttgcaagggatgaaaccttgacttgtcatcttggacaagattttctaatagaattattgatatagcaccctatctttagttctctcgccactaacaaatttgcatgttgctattcataattaaccatgatagtctcatcactatcttcttatccaatatacaatatttcttatcactgctgctctaactctgtttgcagtcatgtcatctagaatttagtaagagaaacattttctgttcaatttgacatttcataatacgtgatagtgatttgtgagaatcaaagtcaaccatgcaaaactctacattgtaagctgaatattcttgttctcacatgatgtttgagagtcttacttattatctgaccattattaatgagctctgaacctggtctcataagaattgctgagttcgttttgaaactgcctctcataagaatagaggtatatactttcattgtatctgcactgcactgaaaatgccataagtttgattatgtttggacatgtagttccaacatacttccatattagatgtgtctttctatatctctatctatgcctggtatatgagttttgaatggtaaatggaaaattggaaatagaaggtgttaatatctttatgttgtttggaccattttttttacgcttctatgttttttacacagtttattaatgtatattttgagataaattgaggaagcataaagctttggacatttcaatctgttcacagggctagcccaaaggatttaaaatggtagagaatggtgttctggagcaaccaaagggggtgtctcgaaataggccacgtgctcagtcgaatgatcatccagtgagttctttcttccaagatgcttatggaaacttcttcatgatttaactcctaccaccttgattttataaattattccggaaattgtaatgttgtattgaatcactgtttaccactattttttttattaacaagcaaatatttgtagcatgaagtccaaaaaatttcaaactgataattaaccatttcacattcatttataagttggagctaccatagttagcagtcttaattactaatttggtgggttggattatctttttttggaacagaagaggaaaactaattgcgtcctgtgagtacaatttgtcttttttttttaactactaattcttgttggacattctgacttgttatggaaaggttgatcctggatacctcccagagttgacatgggaacacaagcttagcaatattggctatgatttgccatccttcagacttacatggagagagacattccagttggtaattcttctactttatatacattttagcctttttcctgctgaaattcattgtgggagaactatattatacagtttggcagttcagaaattaccaatgatgttagttttaatctactgaattctttggttatgcattcctctgttgttattttagttctaactgattcattcaatggcttactgaaggttggatacttgtaaattttctaggcacaatgacattgaggtacctattacaattttcccttgcattaaaattcatttcgtcattgcaggctggccttggtcttcgtcttggccgacacatccttgaagaaacatcaaaaggacgtgtatgttttacattttactgtgtagctaatcatcatttgggatgttaacaattccacatgttcctttctaataatttatctggatattatgtaaatgctttctttgttagttttatacaggctgctgtgattgatcccatgaagaagcgcattgcaaaatctggtcagggtgttccacttggcggcattgggtataccttcttcttcctgtgtaacatgtgtttctaatctacaaaagtgttaaaagcgaacaagttcgttgtgtccagtgaataatttttaatagtgctcgcttcttgacactacagaagtgcttgcttgattatgagaatccactctattctgctcttgtttatcatatatgttactataagataattctacttgccatcatgcaatgaatttagtttgttgtattcaatctcagatgtatttatttgtttagaaagtaatcaaaagtacatacagatcaagttcagttgtcatcttgattgttgatgttatgcaaataaatgaagctcgcacttacacttcccagcatgacagcatctaattgttaattatgggtgaaaatttctctttgtttctaactgatatattcactaaatggttgtcatggctcaatttaacaatgtcctgttcgataaagcttcaattcactggattctgtatcttctaattattagaaaactgtagttcaggaagtattggaaggagctacaaaggcgagtttcaacgctggcaattgttcccgggaacttgtgaagagagacctgtactggcaaatcaattttctgtaagtcttctattacaggccagttccttttggtaattactttttctttttaaaacaataattccatgacatgtttttagatgaggaccctactggataatatgtaatttaaaaaagaaaattatgttcaacaaaagtgaagaagagaaacaaaataagaagcagaaccaacatatacaaactagccagaccagctggacagaatttgattaacagagcagctcttgctttctgtaattttgagccagtttagagaagcctcatccatctatgcttttttagggtttgagtcttttttcttgagaaacatatgtcagcttcatagactaatttgttcattaacaggatcgatatttagcaacagtcaacgtattgacagtatccagggattatacccaagtaaatcttgatcaaatttcttcattcctggctaaatttacatcaatgatgagatggaaccattcccctgaatatttttcacacagagcacacaatggacagaaccaaacaccaattcatcatacagcatacgtccactgtatatttctccattataaagaacccacaagaacactacaatactacatagaccacatgttacatgttgcaagttttttgcaaccattcatgattggacatttgactctttggaagatgaatatgctactactgatccatctgatacttactgctcaagcgtacctgataaaaaaaactgtaattcatgtgcctggatcagtttgatttaccagaaatgagaacttcaatagttacatgaatatgtattgagtggtgtgttaaaatgctctctataactctttattgtgtgctgtagccatgcattatttgttaagatcaagcagagaatgaaatatcaatatgtttctttctgtatgatagtagtgttttagtacattttatctttgtaatttataggcgttcatttcccgcaaagatggtagaaactattcctcagtgctgcatcctgggaaaccagatttgccaaagtaagtttattgatgtttttcagcttttgatttcgacattagttgcacaatttcccttatataatatgcaataacattttacaattcaattctttcgtacatgaaaaattccttagagctttttaaatgcagaggaagtaacatttcaggaattggatcctgggactggaatatgagtggacaaaactctacgtaccacg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