Difference between revisions of "Os11g0433200"

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Revision as of 21:19, 22 July 2012

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

Os11g0433200

Description

Similar to Growth-on protein GRO10

Version

NM_001074329.1 GI:115485306 GeneID:4350402

Length

10534 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os11g0433200, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:15820218..15830751

Sequence Coding Region

15824815..15824994,15825629..15825805,15825972..15826006,15826100..15826256,15827062..15827115
,15827209..15827301,15827676..15827815,15828919..15828989,15830142..15830225
,15830340..15830434

Expression

GEO Profiles:Os11g0433200

Genome Context

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Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008404:15820218..15830751 source=RiceChromosome11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>caagaatgttcttttgctgcagtggaggtgcagctatattcaccaaatcgaccagttgtagacctttcagcatgcttcttgtggataatggctataggaaccatagtttgtgcttcactctggactgaatttgttgcatgcgagcaagttgatgagcgttataatcagttgacacggaaggatgggcctaattctggaacaaccaacagagaagataaagaaatcttcgagatcagtgccaagggggctattgtttttattttagtagcttcagttttcctcctcctcctcttctacttcatgtcttcttggttcgtctggctgctaattgtattattctgcattggtggtattgagggtatgcatgtttgcttggtcacacttctcactaggatttgcaaggattgtggacagaagactgtacaactccccttttttggggaggtgttgaccctttctgttctgattgtaccattttgcactatctttgcaattctttgggctgtctatcggcatgcttcttttgcttggataggccaagacatccttggaatctgcctgatgataactgtgcttcaaatggcacgcttaccaaatatcagggttgcatcagctcttcttagtgctgcatttgtgtatgatgttttctgggtgttcatttcacctcttatattccatgaaagtgtcatgattgcagttgctcgtggtgataactctggggaagcaattccgatgctcttaagaatacctcgtttctttgatccatggggtggctatgacatgataggctttggtgacattattttccctggattgctagttgcattcagctacagatttgatagagcaagcaaaaggggcctcttcaatgggtattttctatggctgacggtgggatatgctgttggccttttccttacctatcttgcgctcttcctgatggacgggcatggtcaacctgcgctgctgtaccttgttccatgtacattagggcttattgttatacttggttggtttagaggtgaacttcatgatctatggaattatggtagaagtcaaacagaaaatttagtcgacgaaccatag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>QECSFAAVEVQLYSPNRPVVDLSACFLWIMAIGTIVCASLWTEF VACEQVDERYNQLTRKDGPNSGTTNREDKEIFEISAKGAIVFILVASVFLLLLFYFMS SWFVWLLIVLFCIGGIEGMHVCLVTLLTRICKDCGQKTVQLPFFGEVLTLSVLIVPFC TIFAILWAVYRHASFAWIGQDILGICLMITVLQMARLPNIRVASALLSAAFVYDVFWV FISPLIFHESVMIAVARGDNSGEAIPMLLRIPRFFDPWGGYDMIGFGDIIFPGLLVAF SYRFDRASKRGLFNGYFLWLTVGYAVGLFLTYLALFLMDGHGQPALLYLVPCTLGLIV ILGWFRGELHDLWNYGRSQTENLVDEP</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>4598..4777#5412..5588#5755..5789#5883..6039#6845..6898#6992..7084#7459..7598#8702..8772#9925..10008#10123..10217#gtgttctcctcattcctctctgccactgccgtccgagccacggaaaggcgagcggcgcgacgcggcgacgccctatggcgacccaccacgcccgccgcctccccgccgccgccgccgtcctcctgctcgtcctcctcgccggcggctccgcggccgacgacgcctccagcgacgacgacgcgggcgtcccgccgtcgcccggctgctccaacaagttccagctggtaacgcgcgccccacaccccccccccccgccgcccccaatccgttcccgtttttctcttcctgattttggtcagggtttggtggttggtggtggtagggtgcttagcctgctggttggcttatgggggtgacctagtggggaagggatggggatctctctttggttgtggagggggggatttgtggatctgctgcctccgtgagtgctggttagtaatggcagaggaccttgagaatttggttgagttgttcccagatggattgtgatgctgggtaaggagaggaggaatttccgagctgcacgctttagttgtgtactggaattatggatccagttggactgtgatttcgtttcattatggagttccatttagttcatttctgatagcttgaactaaaaatgatagttgatcatgtgccctgtagagatagcattgatttcttgccactttttggttgacttagctgattatctctagaaatagccactttagaccgaattggtctatttcttttttttcattttatatttttggaaaagcaccaaacgatgtacctgttttgcgcctgctgtccatgacgtatcatgtacttggtccggcttgaaccatcgaacagctgaacccgttcccctcctgcaggaaccattgaacaactttctcaaatgatgagaaaaaaacgaatagattttacaagaagcaaggaagatagtaacagaacatgttaccaggcggacagtggcatgacccatggcaacaacggttatggtggcgaaggatacaaggaggcagtacagaaataacaagcgttgggctgggctgcagtggtgtgtacttgtcctcgctctggtcctccaggcggtcctgcttcgttgacatggtgctgccactgaatcgccttgtagattagagagatgagatgggctcagctgcttgatggtttgagccggacaagcatatgatgcattgtgtctagcaagactgcaagaggataacggatgcaccacctggtgcttagcttagcaaagaaaagggggcaaaatgatgtatttcggattttcggtgaaaagtggcaatgtgttaaaccaactaagaagtggtaagaaaacaattggcctccagagaatggcaaatcctagagtgcaatctctgaacagtggcatatgatcgattatcccaactaaaatgtatttttcagttgcatggtcacttctcacttcaggtggcattggtacagagtaatgcagtggcattgtctggaggcaacacagtgactacatgtggtacacagaagcaggggcaactgctgcatatagacatcttcacatgactagtcgtgaaccatgaaccaagaagataaaacaagatattttcttgaacaatttttgtcaccatagtagttatcttgtcccggtggattgaactgtgtagggcttaccctttaacctttcacccttttcatttaaatgttccacagcgtacttgtgaaatttcaccatgggtcaagctctcagttctattcctggtgtttgcaaacaaagacccaagtaaaatattgaatttaaaaactaacaatatagttcttatttactgttgatgccgttctgtcatataaggctaccaagtgcacatgccaatctctttctagtaatggaattttgataggcttggatagttcaagggtgccatttaggccatctcattgttttgggggtttaagtagacagacaaccaacaatgttgagggagttaaacaatctttttccttctagtgatgtctatggtagtcattttgcatgagactcatatacttgcatgtaccctgttggtgcgcaataaaagttacaaagaaaattacctatacttttagggccccttttatttgaacggaaaatgtaggaattttagaggactccaatcctatgggaaaaaaaaatcctatgaaagcctttgaagtaaaggattgaatcctatcctatcctttaaattttttatggaatgggtagtcctatagagattttggaggaaagttagcaagaggtccaacctcttggaaaaaaaatcctttgagtctaactctctcatctgattcctacgtttttcttgtggttcaatcaaacggtcattcatgtgttttttctattcctctgtttttccattcctgtgattcaaaggggtccttaagtttttccacaagggttctcatccttgagattttatccaggttaaggtgaagaattgggtaaatggaactgaaggtacaattgttgttgggttgagtgcaagatttggagcctccgtgcctcgagatattcatgaagctcagaaaacatttgctgtccttgcaaatccacttgattgttgttccaattcgacatcaaaggtttgattttaacatcaactataataaacttattagcaagtttggttctttgaatgactgctgtaaatattttctaaactaattctcgcttttgcagctaacaaattatattgctatagcacaacgtggagaatgcgctttcactgctaaagcaaagattgcacagactggaggtgcagttggtttactagttatcaatgataatgaaggtatgaaaaggttaatatgaaatatattattatatatatcctgttaatatagtcgtatttatctgttaaacttcattctttcagaactttacaagatggtttgcagtgacaacgatacttccattaatgttacaatacctgttgtaatgataccacagtcagctggaaaaaagatgaagggcctcttggatcagggagcaaggcgtaagtcagttagttacacattcttaattatcctcagtaatgctaagcttcattcatatttcttttttcctgcttatgttgccaattggtagggtttagttacttaaacatctcaagccttttacttccatggttccatctactgtgatggccaattgcatttttcatcaggtatatgttgtctgactaaaaacagaattaatgttggtttgaattcattctaacttatatttttatatttatccagtatggcaaagaaacatgatgcaataaaccatattgtaagaaaatcctcttggcaatacatcaattagagtactgagcgcttaatattccaatattgtactaagttatcaactgtacaaggcaattatctgtgttgactgttgaagttttaatctctcgagcatgccgtcccgtgctctcttgagcgagttagtgcctgcagatgagctgatcttcaggtgtattggaaaaaaaaaaggaaaggaagaaatcggctttaagtagagtttgctgggaccattttgcagattataaatggaagaattttggcatactagttaaatgcctgtgctttactatgtataaaaggaaaaaaaatcataatattgcctaaaataaataaaaacatattttttattaaatatgttgcccacccttttgcttttgggatactcaccttaattttgggtatccatttagatttagttgtcatataatattaagaagttcaaggtgtattatgtaaaaactacaatgggagtaggtggggtagcatattcactgccatcaccattggagtacttttaaaggagtctagagatattcgctcatcaggttcgtgaatcctgaccctggatctttctttgaagttctacttttaatgtcatctaacttatatcccaaacttcaaatatgtcaaaaccaacattttctaaacaaagatcatatgaaaaagaaagacaaattgctgatatgacagcttttcactgataactaaaactgtgtgcatcctgttttgcatttggttctgggttttaaaacctttatccataccaatggagtgaacaatttctgcagtctaatttattgctagtaaaggttgacacctagtatctaggtaggcgagtagcaaacacggaaggagcaatgtggagggatcttgaagcaaagcagcagctggcttgaaatagagcgacctgcttgaagcagaataatcagcattccaacaatatggtggactggcaggcagagctggtggtggagaaactcatggctatgctagatctccaagctggtgacggtgcagcttcctctctagaagtcctggtgccttatttgctctccagaaatcctgcacgctaccttttgagataacaaaatgggcaagcttcccacctggacctgtgtggacacatgcatgcacgctcacacaagcaaagtcgctcagttgactccctgtataaattggaaatctttgtgttgggtgctgtgattgcataaatgttgactagttgaagtgaaattgtacttttgaattagtagtttatggtaatacaaagtatgcatgctaacaagaatgttcttttgctgcagtggaggtgcagctatattcaccaaatcgaccagttgtagacctttcagcatgcttcttgtggataatggctataggaaccatagtttgtgcttcactctggactgaatttgttgcatgcgagcaagttgatgagcgttataatcagttgacacggaaggttttgacttttgtgctttacctttctatccaaattatgtcattttaattttatattttcacacacatatggtagcacattcatacccattttctc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External Link(s)

NCBI Gene:Os11g0433200, RefSeq:Os11g0433200