Difference between revisions of "Os11g0545300"
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Revision as of 21:21, 22 July 2012
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
Os11g0545300 |
|---|---|
| Description |
Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2 family protein |
| Version |
NM_001074590.1 GI:115485828 GeneID:4350688 |
| Length |
11021 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os11g0545300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:21932287..21943307 |
| Sequence Coding Region |
21940220..21940249,21940326..21940486,21940593..21940689,21940765..21940956,21941043..21941104 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MFGGKFRRSKVCSKCGMLSNSEEDFTLLMFNIPHREQVVAATLE DCLDHIVEENVHDSLSRCESCMNDQKSTSKCTFHETRDVVIVLQRFEPLTLGGYRKIG ELINFPTELDISPYMSGVVTDKHIYELFGIIVHEGGVIGGHYRSYVKTNCWYEVSDRD VKRVNENFVLGAQAYILFYNRKEEAKSFDEVLAFAATAMSSSDAVPTSTSKDYTERTL SPEVSSAALSCWIDAARVLEPKSYSDQDILEKYIICMDRDSSDVSERIRNAMRNCNES RQEYHFNLPTTDGPFYDDNLGQYCLLRGARFRTISTSSNVEAKRDRAVRMHFLLSEIL KLLQLKKVIDVGAIGYLEKFKFGNYSRSALLRRINDACMLLGTNRLSLNISVMSRGSI IGPVLFKVGEDVMIDASLRAVQIPHDIHLVDHIKLKKPVSFVLVVEKLSIFNMLVNLN FHVTHNCIIITGCGKPDMATRGAVFKLNYCLPVKVYILADLDLDGLQIYL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>7934..7963#8040..8200#8307..8403#8479..8670#8757..8818#8887..9033#9361..10174#atacgcgacacagaacacgggcttccctccatgaactcctcctcctttgtcgaagaatatcttccagcaggtgagacattggatctgtccctgtcaatagctacgagcaagatttatcgatgcagcgttggtcaggggcctctccgtctatctgttcctatggaacctgccggccgggggctgcttccatgggagagaaaaaaaatagtctggcggtggttcgttccatagaagcacggcggaagtagtctggctgcggttcgtcccattgaaccggatctgacctggtacgttactgttctttttttcagttttcgagtatgttttttaatgttaccacaacggccggcgatatccatggatctctttctgctgtcaatagcaatgggtgagatcgatgccgcagttacccgccacaggccagatcgatctaccggcgtcagtgatatcgccgtcgaacagttcccatgttcgagatcgagatgaactaacggcggtcgggcgagatcgatctaccggcgtcagtgatatcaccggcggacggggttctgatctccaaggggagtaaagtctgtcctgtctggtggtgttttttacgatattgtatagaacaacggcgacggcaatgatatcgatgaaaataatttgtcgccctgtttctattcttcagatagatcgtcgccatgatctctccaaggagggggtaagttactatttcttgttcagtcagttttccttaactccgttttctagcatttaattacctatagcggcagtttgcgtgcagtggcttcctacactgtacgattttgactggagattgtgctctgcatcttcaatacagattgggtggttagcatcgtcgaatccaggataaaaattgagggtaggctggactgaaagtcttaagtctaagttaacaatgctaatatgaggcatacaccattatcaagtcaaatgttacacttacatgattaaatagaaaaacatagttataaaagaagtaacttgacttaccagtaagttgctaattttcttagatcttagcaaagagttaagtgagaagcctcctggatatataaatgagcaaagttagtaatgcataaatggtagaagtaaacaaatattaactaaagaaagcaacatactgctaagttgttgcattttgttcacgaggcaaggatactttacaggatactttacaggttttcagggcttggaatcgcttcatgattacattatcattgatacttttaaatatctctattacaaatctaccaacaaatcaaatattaggaaatgtaaatgataaatcccctcacttgccacgagttagtactcactaacaagtagtaacaaataacaatgaagtaaagaacagtatagcttactcactctgtcacttagagactcactggaagcagccaagtagcaagccgagcagtagcaggcaagcaactccggcggcctgctgtgctgctctgcgcttgctgccgcggggccaccagccgtgcgcccgcgccgccgcgcgcaggccccttccccttgcagcttgcgccttgtcggctttgccgcttgcgctgtgcggctgtgccgctgccgcaatcgctcgtcgcccgcagctgccacgcggccgcaatcgcacgccgccgcagcgccacgaaaaatccccacagggcaaaggttagcagccacacggtccaaactccaaaaccctaagccaagacaaaacagacacaatgggccaagtgggcttttgctaaagtgataaatgggccattttacgcgtaccggtttagctacatgacttccatggctcctgttcttcttcctcgccgccagagacggagttcttcgcctcttctcttcttcctgccttctccagctgtttccatggaagagatgctatatacttaaattttttttgcaaaaattggagggtaggctagagcctgatggagcctacatgctagaatcgccactggttagcattgctataatctttctcataatagcacatatactttcacattttattattaaaaaatattagaaacagcaatatgattttaacagcattaggatactgcataacttgaccaatatgattttatatgtctgatatctgattgttaatgtaagtcctatgtccataaagcaaatatcatggatataaaccatggtaggtggaagatcaccattaaatactacataaggtcattatcttcgctatcattaaaaatttaaattattagtggcttctctttgctatctgtagtgatatccttatacctactaaagatgatatgtcatatcttatgttcatatacgggttataaaaagtgttcataacatagtggaacagttataaaatattttatatcgtattttataagttatgaacactttttcattgtcacgttagtatagggttggacaatccattctcatctgttgtagttataattttatacagcttagacaatctagcctttatacaacttattaacacgtgaattcaaagaattttcaattaaaatgaaaacatcgatgtattattaccctctagaattaatgtatcactcctagtaaatcctccaattaatttaagtaagaatatactctactctcaatattatttacctagatttaaaaaagttgtcctcattcatgaactattttccttaaatttaaaatatttttaaattataatacttacttttaatctaattttaaaatacttttaagagtaaattttactttggaccatctttattgaccgaaatttcacattgggctagggctaggctcatgttttcacttaacaccacgtatagttaccgttgtttgcactttggacctggttttatagttaccattacatgagttgttgtctaggtgcttagcattttacaagaaacaatgatatggaaatctttgccatgcaaatatgcttagcacaagaacaatgattgtaaatgttataggatatcctatcatcagattaatgggacttcattactactacatatgaacattcacaacccttatactatagagacaaaattggagaaatattgagtttaagaactatttttctacaaaagatattacatgttttataatacccaactgtagtgttagtacaaattattgaattctaagttttctaacacaaaaaagaaatgagatcagatctacagtcattatattatgtgtaatttgtgaaacttggtccaaagtgcaaatgatggtaactatatatgttaagtgaaaatataagtcttaactctagtccaatgtgaaaatttggtaaataaaggttgaccaaagtgaaatttactctatttttaaattatatactcctacataaacttatttctccactctatttattatagtgaattacgctttgggctacattttattacacaagttttactctggaccacgcttaaacctaccttctcactttgaaccaggtaagtttgtcattgttgcggtttggaccaccccgaatgatttttttcactacacaccaatgaccttaaacacattgcgatctcctccatgtatgtctacatggcgagaaaagttattcagggtagttcaaattgaaaagataggtaaaggtggtccaaagtgaaacttgggtaataaaaggtggcccaaagtgcaatttattctatttattttctagttccaaatttagatatctctaaattgtatttctatgtgcactcttttccttaatagtatttatttttaatctaattttcacatataaatttctttttctacgttgattcttgtctctattattatttttcagtttttaatccaaaatttggatttttccaaaattgtatttctacacgtactattatgtcaatatttactattatttgatccactgcgatgctattattttattatgatatattcttatgtagactcattagtcataatattatttaattttaatccaaatctaaaatatttcaaaattatacttctccatggaatcgcttatctatatatttattttttaattcaaattttagatatgtcaaaattgtattttgacctagactctcttaatattatttttatccaaattttaaatatttctgcatttccacacggactctactcccaatattaattattttttacgatattgtatagaataacggtgatggcaatgatatcgatgaaaataagttgtcgccatgcatccattcttcagatagatcgtcgccatgacctctccaatgaagggggtaagttgctatttcttgttcagtcagttttccttatttgtgttttctaacgtttagctatagtggcagtttgcgtgcaggggcttgggacatctttatgtaggattttggctgggtattgcgctctgcatcatccatgcatcgccgtcctaggtctagaacttataagaaagctgagatgaaatcggctatccctacatgagagggaagtccggttcggggtgtctacaattttccctccacgtcgaaagaacagaacatttggtaattttttatttgttttactcaatttgtcaagttatagtacatagtacttttgagaaacaatacatgtattttcatagatttcagtccattgtggagtcgttccttctaaggatatgaaggtagaatgtttcaaggtttattcacggtctattgcctgtttaatgtgcttgtatgctaatattgtgaatgccgttttttaaccctatttgaattttcttagtacatacaatcctttcttttatggctctaaattttcgaagtacatacaatgtttttttaccttttttaaatctgaattttgaaatgccattttatcaagaacagatatgttattctgacctcacattttttttgtttt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