Difference between revisions of "BGIOSGA000071"
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Expression
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Evolution
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References
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA000071 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA000071, complete gene. |
| LocusTag |
P0401G10.25-2 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA000071-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA000071-PA |
| Length |
11083 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:46413724..46424806 |
| Sequence Coding Region |
46424713..46424806,46424313..46424463,46423804..46423875,46423043..46423186,46422888..46422959 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:46413724..46424806 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:46413724..46424806 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCGGCAGTCTCGACTCTTCTATCTTTGCTCCATTATCTTCATGTTCTACTTGGTGCAAAGAACAGAAGCACAGATCACTGCACCTTGGGAAGTTGATGCTCTGAAAGCTATCAAAGGCAATCTGATAGATCCGCAAGGACGTCTAAACAACTGGAACCGTGGAGATCCGTGCATGGGAAATTGGTCTTATGTTCACTGTTACAATGAAACAGCAAGTGATGGATATCTCCATGTATTAGAATTGCAACTTCTAAAATTGAATTTATCTGGATCTTTAGCTGCTGAGCTTGGTCGGCTATCTCACATGCAAATAATGCTCTTAAATGGAAACCAGCTTACTGGTTCTCTACCAGAGGAGATTGGTTTCCTTCCTAATCTGGATAGGATTCAGATCGACCAGAACTACATATCTGGACCCATACCTAAATCATTTGCTAATCTGAACAAAACAAAGCACTTTCATATGAACAACAATTCATTAAGTGGTCAAATTCCACCTGAACTATCCAGATTACCTTCACTTGTTCACTTATTGTTGGATAACAATAACTTGTCGGGCTATCTTCCTCCAGAGTTATCGAAGTTACCAAAACTACTTATCATCCAGCTTGACAACAATAATTTCTCAGGAACCTCAATTCCTTCATCTTATGGCAATATCACCACACTTCTGAAACTGAGTTTGAGGAACTGCAGCTTGGAAGGACCTGTTCCTGATGTCAGTGGAATACCCCAACTTGGCTATCTAGATCTTTCCCACAATCTTCTAAATGGATCAATTCCTGGAAGTTTCTCTGGCCTTCCCAATCTACAAAGACTGTCATTGGACAATAACAATTTGGATGGTTCTGTTCCATCAGATGTCTGGCGGAATATTGATTTCAGTGGAAATAGAAGTCTTATATTGGATTTCCAGAACAATTCTCTAACCAATCTATCAAATCCTCTTTCACCACCTGCCAATGTTACCATCCTGTTATCTGGAAACCCCATCTGCACATCTCCAAATCAACTGAACATTACTCAGTACTGTCAATCAGTGCCAGTTATTGTGCCTGACGGTTCTGCAAGTAATGCCACAGTTTGTCCGCCATGCTCTACTGACCTTCCGTTTGAAAACATACTGATGTCACCAATACGATGTATATGTGCTATTCCACTTTATGTTGATTACCGGCTAAAGAGTCCTGGATTTTGGGATTTTGTTCCATATGAAGGACAGTTTCAACAGTACTTGTCATCTGGACTTTCATTGTCTTCTTACCAATTAGAAGTTTCTCAATTTATGTGGGAAGAAGGCCCACGGGTGAAGATGAATCTGAAACTGTTTCCAAATAACACTGCTTATTTTAATAAGAGCGAGGTGTTAAGACTGAGAGGAATGTTCACAGGCTGGCTGATTCCAGACTCTGATATATTCGGGCCCTATGAGCTCCTCAACTTCAATCCAGGGTGGTATAACAATTTATTTCCAGATCGTGCAAAGTCCAGCCTAAGTACAGGTGCCATTGTTGGTATTGTCGTGGCAGCGTTTGCTGCAGCAGCATTTCTTTCATCCCTCATTACTCTCATTATACTGAGAAGACGTTCAAGATATTCTTCTTCAAAAAGACGCTCTGCAAAAAGAATTCCAATGAAGATTGATGGTGTAAAAGACTTCAGTTTTCAAGAACTGTCACATGGTACAAACGACTTTAGTGACTCAGCACTAATTGGTCAAGGAGGGTATGGGAAAGTGTACAGAGGTATTCTCTCTGATGGAACAATAGTAGCAATAAAACGTGCGCAGCAGGGATCTCTTCAGGGTTCGAAGGAGTTCTTCACAGAGATAGAATTGCTGTCCAGGCTGCATCACCGGAACCTTGTTTCATTGCTTGGTTATTGTGATGAAGAAGATGAGCAGATGCTGGTATATGAGTTTATGCCTAATGGTACTCTACGTGATCATCTTTCAGCTCGATCAAAAGAGCCCCTAAATTTTCCCACGAGGTTACGAATTGCGCTGGGGTCGTCGCGAGGCATCCTCTATTTACACACAGAAGCAGACCCTCCAATATTTCACCGTGACATCAAAGCAAGCAATATTTTACTGGACTCAAAGTTTGTCGCAAAAGTTGCTGATTTTGGTCTCTCTCGGCTTGCCCCAGAGCCAGAATCAGAGGGGATTGCTCCTGGTCATGTGTCAACTGTTGTAAAGGGTACCCCGGGTTATCTTGATCCGGAGTATTTCCTTACTCATAAGCTGACAGACAAAAGTGACGTGTACAGCCTTGGTGTTGTTTTTCTGGAACTGCTGACAGGGATGCAACCTATTTCTCATGGAAGAAATATAGTTAGAGAGGTTGTTGCGGCCAATCAGAGTGGGATGATATTGTCAGTGGTTGACAGCCGGATGGGATCGTACCCAGCAGAATGCGTGGAGAAGTTTGCTGCACTGGCACTGAGATGCTGCCGAGACGAGACGGACGCAAGGCCGTCCATGGTGGAGGTGATGAGGGAGCTGGAGAAGATATGGCAAATGACACCGGACACCGGGAGCATGTCCTCACTATCCTTGGAACCTAGCAACACAGCCACCCCATCGTCGGGATCCAGGATGATGGTTTCATCGTCATCTGGGGTTGGAAATGATGATCACCATCACTACAACATGTCATCATCCGATGTCTCCGGCAGTAACCTCCTCAGCGGTGTTGTACCTAGCATCAATCCTCGCTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MRQSRLFYLCSIIFMFYLVQRTEAQITAPWEVDALKAIKGNLIDPQGRLNNWNRGDPCMGNWSYVHCYNETASDGYLHVLELQLLKLNLSGSLAAELGRLSHMQIMLLNGNQLTGSLPEEIGFLPNLDRIQIDQNYISGPIPKSFANLNKTKHFHMNNNSLSGQIPPELSRLPSLVHLLLDNNNLSGYLPPELSKLPKLLIIQLDNNNFSGTSIPSSYGNITTLLKLSLRNCSLEGPVPDVSGIPQLGYLDLSHNLLNGSIPGSFSGLPNLQRLSLDNNNLDGSVPSDVWRNIDFSGNRSLILDFQNNSLTNLSNPLSPPANVTILLSGNPICTSPNQLNITQYCQSVPVIVPDGSASNATVCPPCSTDLPFENILMSPIRCICAIPLYVDYRLKSPGFWDFVPYEGQFQQYLSSGLSLSSYQLEVSQFMWEEGPRVKMNLKLFPNNTAYFNKSEVLRLRGMFTGWLIPDSDIFGPYELLNFNPGWYNNLFPDRAKSSLSTGAIVGIVVAAFAAAAFLSSLITLIILRRRSRYSSSKRRSAKRIPMKIDGVKDFSFQELSHGTNDFSDSALIGQGGYGKVYRGILSDGTIVAIKRAQQGSLQGSKEFFTEIELLSRLHHRNLVSLLGYCDEEDEQMLVYEFMPNGTLRDHLSARSKEPLNFPTRLRIALGSSRGILYLHTEADPPIFHRDIKASNILLDSKFVAKVADFGLSRLAPEPESEGIAPGHVSTVVKGTPGYLDPEYFLTHKLTDKSDVYSLGVVFLELLTGMQPISHGRNIVREVVAANQSGMILSVVDSRMGSYPAECVEKFAALALRCCRDETDARPSMVEVMRELEKIWQMTPDTGSMSSLSLEPSNTATPSSGSRMMVSSSSGVGNDDHHHYNMSSSDVSGSNLLSGVVPSINPR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..94#344..494#932..1003#1621..1764#1848..1919#1996..2067#2439..2513#3434..3502#3803..3874#4175..4261#4347..4415#5894..6384#7921..8073#8198..8481#8961..9012#9269..9519#9923..10057#10706..11083#ATGCGGCAGTCTCGACTCTTCTATCTTTGCTCCATTATCTTCATGTTCTACTTGGTGCAAAGAACAGAAGCACAGATCACTGCACCTTGGGAAGGTAATATCCATCATTCTAGCCATACTTTACCTCCACTCCTCTTATTGAGACTGATCTCTACAGTCTACATGCACATATCTCTTTCAATCTTTGTGTCATAAGCGTGGCCTGCTCACTTGAGACGCATAGGAGAGCACAAGCCATGGTTCTAAATATATTAGTTGTTATGGTTACGTTATTGAGTGTTATTGATTTTTACCTTGCATTATGAAGCTAACTAGGTGTAACATCGGTACATTTGGTCTGCAGTTGATGCTCTGAAAGCTATCAAAGGCAATCTGATAGATCCGCAAGGACGTCTAAACAACTGGAACCGTGGAGATCCGTGCATGGGAAATTGGTCTTATGTTCACTGTTACAATGAAACAGCAAGTGATGGATATCTCCATGTATTAGAATTGTATGAGCATAAGTGATCTCCTTGTTAACTGTGTCCTTATTATACCACATTTTTCCGTTGCTTATCTTATGGTTTGCTTTTGGTGTTTAGCTTATGTTAGGCGTGCTTTTGGTGATGAATTTGTTGAATGTCATAACATAATAGATCACATTCCGCCTTCATATATTCTGCATTTTTTCGAGATGTAACCAGATACTTTCCACTGCTGCTGATAGCTTCTCCTTTTTAGAAGTAGAATAATGTTACTGTGTTCTTTATGTTCTTATTTTTTTGCCTTGTGAAAAAAAATGCCATGCTATTTGAATATTGATTGCCTTGATGGGGCAATTAGTGCAGTACAAAAAGATAAACTTTGCTCGAATTTTCTCTCTAAAGATCCCATCTCTTTTTTTTTCCCAAGTGGATCTAATTGCCGTGATGCATTTATGTGATTATAGGCAACTTCTAAAATTGAATTTATCTGGATCTTTAGCTGCTGAGCTTGGTCGGCTATCTCACATGCAAATAATGTAAGTTGGACAAGTAACTGGATCATTGATTTGTTAATGGGTTAGCTTTTAGGTGGTTGGATGCCCACTCACAAGGGCGCTAACTTTTTTTTTTTCTTTTTGTTCTTTCCACTGAAGGGATTTTATGTGGAATAACATCAGTGGCAGCAACCTAAGGAGGTTGGCAACATCACTTCTCTGAAATTACTGTAAGTTGAAACCCGTATTACTTCAATTTCACCAATACGGGTTTCCTTCACATCTTTTTGGTTAGAATTGAGCCTATCTTCTTTCTGGGGCTTCTAGTTCAACTTAGTTTTGTTTGCTATAAAACTGTAGTTTAACTGAATCAGTATCTTCATGTCCTTCTGGTTGGATGGTGATGTTAGCATTTTTCATGAGTTGTTTGTTCAGATTATTTTTTTATGATACAGCTGTAATTGACTGAATATATATGTTTCCATTGTAACATGTCCTTCATAATATATATATTTTTTGAAAACAATTATTTCTTTGAGATAAATTGTTGGTAGGTGAGGTGTGATTGTTGTTGTATCCTCTGTTATCTGGAATGGAATCTGTGTTTTCTTGTCACTTATAGGTAAGTATGTGCGGATGTGCCCATCCTATTTTTGCAGGCTCTTAAATGGAAACCAGCTTACTGGTTCTCTACCAGAGGAGATTGGTTTCCTTCCTAATCTGGATAGGATTCAGATCGACCAGAACTACATATCTGGACCCATACCTAAATCATTTGCTAATCTGAACAAAACAAAGCACTTGTGAGTAGCATCTGGTTTTACATCTATGCCAAGCATCAGGGAATTATTATCCTTACCCTAATAGTTTTCCAATTTTCATCCAGTCATATGAACAACAATTCATTAAGTGGTCAAATTCCACCTGAACTATCCAGATTACCTTCACTTGTTCACTTGTAAGTTTCTGACAACTGCGTCTACCATATCGGTATTCTTTATTTAAACTCTACTTACAATGTAATTAATTTACAGATTGTTGGATAACAATAACTTGTCGGGCTATCTTCCTCCAGAGTTATCGAAGTTACCAAAACTACTTATCATGTACGTAAACTTCTGTGTTGCGATAGCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTGGTTACTTTGGTTGGGTTCAATGTCAGTCTTTAACCAAGAACTAGATTGTGTCTTGTTATTGCATGAAGTTTACAAGCAGACCTTTGCCTATATGTGTTGCTTTACTAAAATTTAACTAGAAATTTAGCAGCTTAGAGAAAGAGTCTTTCGGCTCTTCGCTGTGCTGCTCTCATTTACTGAAAAGTAGCTACTGGTGTGTCTCTTGACCATTGTGATTTTATTCAATCATTTTCTTCACTTTCTTTTAAAGGATAGTCTCTGATATTAGAATTACACACATATACAGCACTCTCTAATAATATCTGTTCAAAATAATTTCAGCCAGCTTGACAACAATAATTTCTCAGGAACCTCAATTCCTTCATCTTATGGCAATATCACCACACTTCTGAAACTGTAAGTATTTTCTTACCTCTATCTGCAATTCCACCTCTCAGTGTAGTTACTTCTTGGCTGTGTGGATCCTAGTCATGCAGAGGCTGAGTGTTCTCAGTGTAATCGTATCATGTAATTGACCGAGTTCAATAAATCTTCTATTATCTAAGAGAAATTACTATACTTCTGAAAGTACGCTTTACCTATGTCTGCGATTCCACATTCTGAGCATAGTGCTGAGATGAACTTTGATGTCAATCTTGGATGTTTACGCATTGTCTGGTCTCTTGAATATTTTTAGGAGAACCGCCCAGGGGTCTTCCGGCTAGCTCCACAAGGTGGTGGGCTAGCCGGGTCTCACCCCTTCTATTTATTTGATATTAGATCATTCCCTAATATTCGCCTTTTTTTTTCTCTTGAATATTTTTAGGTAATGGTTTGGCTAACATTGGTTGACCTGGCTTATTCATAACAAAACATATTTGCAGAAGCAAACCTGTATCAGTGTGCATATTATGGCAGTAGAAAGGTGTTTAAGTATATGTTTTTTTTTTGCCATTTCAATCTACACAAAGGCCAGCTCTGCTGTGCAAAAGTATGACCATGTTAGCATGTTTTTACTTATTTTAGAAATGCATCCAAGTCACTATCATTACTTGATATTATAATTATCCATGGGAACCTGCTCGATAGACACATCCAAAAATAGCTTCCCTTGTTCACAAATGGCTGGCATCTTAGAAAGGTTGCATTTTGAATGCTTTGCAAATCAAGTGGTAAAGTTGCATTTCAAGAATACAGGTTTAATTCAGACTTCTACTCTCTCTGTAATTATGAAAGTTTTTTTTGCCGGAATGACCGAAGGAGGTCATTCAATGAAATTAAGATAGGAAGTAATTATGAAAGTTAGAGACTAATCTATTGGATATGATCTTCATCAGGAGTTTGAGGAACTGCAGCTTGGAAGGACCTGTTCCTGATGTCAGTGGAATACCCCAACTTGGCTATCTGTATGTGTCGAATTCCAACACTGCAACTTCACCTTTTTGGGAACAGAAAATTACCATATTCGTAGTTAGCAAAAATTATATCATGTGTGGCAGCTTTGATCCTTGTCTTATTTGTGTTCAGGGATCTTAGTTGGAATCAGTTAAGGGGTTCAATACCATCTGGCCGACCAGCAAGCAACATAACCACGATGTATAAAAATAGAGCCCTTACTAACAACTTGTCATTTTTGTTTATTCTATTTTACTAAGTATTTGGCAAACAAGCTATCATTTATATGCATGCTCGTACAATTTGTGCAGAGATCTTTCCCACAATCTTCTAAATGGATCAATTCCTGGAAGTTTCTCTGGCCTTCCCAATCTACAAAGACTGTAAGTATGATAGTATATCTTTCTTTATTCTATTTCAAGTTCGGTGAGTACAATAGGTATATGAGTATCATTGGTAGAAGCAGAATAATAGGATAGATCTCTAGAGTAAAAGGGAATAACTTTACAGGGGAGAAAAGACTAGCACTTTTTTACTTCATAACTTTTCAGTAGTGACGATTACAATATTATGATAATTATGCATAATATTAGCCAAACTGATATGACACCCAACAGGTAAAACTTGGTTTCATCTTTCTGTCTTAAACAATAGCTGCGTGATATTGTACCTTCTTTGCTCAGGTCATTGGACAATAACAATTTGGATGGTTCTGTTCCATCAGATGTCTGGCGGAATATTGATTTCAGTGGAAATAGAAGTCTTATATTGTAAGACCATGCATAATCTACCGTTCTTTTCACTTTCTCTGGAATTAGTTAATTGATAATCTAATTCTCTGTCAATATTTTGTAGGGATTTCCAGAACAATTCTCTAACCAATCTATCAAATCCTCTTTCACCACCTGCCAATGTTACCATCCTGTATGTACTTCTATTTCATTAGTTTCCTTGTTAATTAAAATGCAAAGTACCAAATCCATTAATTTCATTATTGGAAATATGCTATGCTGGCAGTCAGAGATTGGTCTGATGATCTTTGTTTAGTAGAGGAAACAAAGGGCCCTGATCTAAGGCCTATCTTTTTTTTTAATTGTAGTTTACCTTCTTCATACTGTTTGGAAAGCACAACTGAAGACTATTCTTGTTTGTATTTGGGAACTTAAAAGTAGACTACCTTGTAACCACAAACCTTAGCTTATTGGATAAATGATCTGTATAACTAAATGAATGCAACAAAGGAATCATCTCCCTGGTTTTCGTTGTGAATATCTTTACTAATGCCATGACTCTTTAGGATTG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|
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