Difference between revisions of "Os11g0587000"

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TAA</dnaseqJaponica>|
 
 
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Revision as of 14:41, 7 June 2014

Annotated Information

Function

Please input function information here.

It reports here the molecular genetic characterization of dwarf27(d27), a classic rice mutant exhibiting increased tillers and reduced plant height.dwarf27 encodes a novel iron-containing protein that localizes in chloroplasts and is expressed mainly in vascular cells of shoots and roots. The phenotype of d27 is correlated with enhanced polar auxin transport. D27 is involved in the MAX/RMS/D pathway, in which D27 acts as a new member participating in the biosynthesis of strigolactones.

Expression

In rice (Oryza sativa), the plastid-localized protein DWARF27 (OsD27) is necessary for SL biosynthesis, but the equivalent gene in Arabidopsis has not been identified.And DWARF27 (D27) have been identified with reduced strigolactone levels or strigolactone response.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

1.Wang Y, Li J. Branching in rice[J]. Current opinion in plant biology, 2011, 14(1): 94-99. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21144796 Waters M T, Brewer P B, Bussell J D, et al. The Arabidopsis ortholog of rice DWARF27 acts upstream of MAX1 in the control of plant development by strigolactones[J]. 2.Plant physiology, 2012, 159(3): 1073-1085. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22623516

Structured Information

Gene Name

DWARF27

Description

Putative uncharacterized protein

Version

FJ641055.1 GI:254946545 Gene ID: 3974662

Length

5390 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group DWARF27, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group (Japanese rice) cultivar = Nipponbare

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.

Chromosome = Chromosome 1

Chromosome

{{{Chromosome}}}

Location

Chromosome 11:222..5190

Sequence Coding Region

222..525,2082..2221,2438..2530,2891..2952,3514..3620,4977..5066,5150..5190

Expression

GEO Profiles:DWARF27

Genome Context

<gbrowseImage1> name=JaponicaChromosome11:222..5190 source=RiceJaponica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=JaponicaChromosome11:222..5190 source=RiceJaponica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATTCCCACCACAACCAAGATGCCCTCTCCATGCCATTTGGTCTCTTCTCTCTCCCTCCTTGCAAATTGCATGACCCTCTCTCTCTCTCTCCACTTCTCTCTATAAACCTTCCTCTCTCCCATAACTTCTTTCCATTTTCAACCTACAAATATACTAATCTCTCTCTAGCTAGTCTTCACCTACAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTCATGGAGACCACCACGCTTGTGCTGCTTCTTCCTCATGGCGGCGCCGGCGGCGTACGGCCGGCGGCAGCGGCAACGGCGAAGCGAAGCTACGTGATGAGGAGGTGTTGCTCGACGGTGAGGGCGGTCATGGCGAGGCCGCAAGAGGCGCCGGCGTCGGCGCCGGCCAAGAAGACGGAGACGGCGGCGATGATGTCGACGGTGCAGACGGAGACGGCGGCGGCGCCGCCGGCGACGGTGTACCGGGACAGCTGGTTCGACAAGCTCGCCATTGGTTACCTGTCCAGGAACCTTCAAGAAGCTTCTGGTTCGTGCCTATAATCTACTGAATATATCTGATGTATTGTGTGCATGTACATGCAATCTTTCGGATGAATTAATGAATGATCAAATCAACCATGCATGCATATATGTGTGTATTTATGATGTTTTTGCCATGGCTGATTTGATTTTTTGAGTGGAAGAAATAACATATATATGGTGAATAAACCAATGTTCTTCAGTTATTTTTGTGACAATTAAATTATATGTGTATTCTACGATCATCCTTTTCTTCTTATCGTTTGGTTATTAATACCCTTCTCGTCCATGTGGAACATAAATTCTTTGATTTTTTTTATTACATGTTGCTTTGGCCAGCGTGGGTGTACTTGCAATTGCATGCTTTCTGTCATATTATAATTGAATTAGCTCTTGATTTTTACATGCAAAAGAATAATTTATTTATTGAGTTGCTGATGATCACGTAAGCCTATGCATGTGAGATGTGATGTGTTCTCCGGCCTAATTAAGTATCGACGTACTATATATATGCACGTACATCAAGTACGGCCGTATTTCATAATTTGATTATTGTTACTGTACCAGACAAACCTAGTGCTTAATTATTGACATATACCCAACATCGATTAAAGTCAGTGTGACACAATTGGCAGAAGAAGATAACAAAAATCATAGAAGACATATATACCACAACAGTAAAAATTACAGTGCAAAAAGGGATACCAGAAGCTTCTTAATTAGGTGAATGGTCACATTTAGTAGTAGTAATACACAGTAATAACACATTATTTGACGAATAAATTAAGCGGAAGTGCATGATCAGCAGCATATAAGCAAGCAACTACGAGAGGTCAACCGTTGATCCGTGAAAATGTGAGGTTCACATTCTAGGAATCTTTTAGTGCTTGAATCTAATCCTTTCGTTTGTTTTCCCGTGGACTTTTTACTTTGATCGAATAAACTTATCTGAATAATGCGAAGGTCAAACATCACATGTACGTGCCCGGTTCTTCTTCTAGAAATTCAGCCGCTTACTATAATCGATGCTGGTTTTTGAATTTTTTTAAAGACATTTATTTTGGAACAACTTAAAAAAAGTGCACAAACCAGGGTTTACCAAACCGTTTGAAGTGAGGTTACTGCCACTCCATGGTTTGGCAATTATCACGAGGTGCGTCGTGGTTCCAAAAACTAATAAGGTTATCGTATGTGATAACCGCGATAACTGACGGTTTTGTAAACCCTGCACAGACAACATAATTATATTTACAGGACTGTTTGGACTTCATTAACACTGTAGCATCCACTACATCCGTCACCTCCTTGGCTCTCTTACATGTTTAGCAAAGTCAATCATACAGACAAACCAGAAAAGTTCCCAACAGACACAGAATGCTACTTTTCTAGTATGGGTAATTAAGCATATAAGAGAAACTTGAAAGCATACAGGAAACCGATGTTCACTAGTCCTGAGTTTTTTTTTGGTGTTGTTCAGGTGCAAATTAACTGCAAAGGTTGATTCCCTGAAAGGAACTTGTAGCACTTGCTGACTGACACGAACATGCATGCAATGTAATGCAGGGCTAAAGAATGAAAAGGATGGCTACGAGAGCCTGATAGATGCCGCCCTAGCCATCTCAAGAATCTTCAGTCTGGATAAACAAAGCGAGATTGTGACCCAAGCTCTTGAAAGAGCACTTCCAAGCTACATCCTCACAATGGTAAGTACCATAATCCATGACAATTGGCAATCATGTATGAATTATTGAAATTTAAAAAACCTAAAACTTTTTTTTATTTGAACAGGAAGTAAAATTCAGCATTTATTCTCTCTTTTTTTTTTGAGGAAAATACAGAACTTCTGTAAAGGGAGGAAACTTTAAAAGTTCTCTTCTTTTATTTCTTACCTCAACTTTGATTGAGAATTCTGTCGGCAGATCAAGGTGATGATGCCACCTTCAAGATTTTCCAGGGAGTACTTTGCTGCATTCACCACGATATTTTTTCCTTGGTTGGTTGGGCCGTGTGAGGTATATATTACATACACAGTTCCTCCTTTTGTTACTTCAGTTCAGAAAGGAATAGCTGCCTGATACCTGATTAGTGCGTCTTCACAAGAATGAATTCATGATTGTGCCTCTGCTGAAGGTAGCCCTGCAGAATGAATTGATACGAAGCCACACGTTAATTTGAGAAATATTGCTACAGAAGATCTTAAAATGCTGTTGAATGTAGGTTGCGACATATAATATCTCTTTGTTTTCAGGACATTACATTGTTTAAAGTAGTTGTACGAAGCATTTGTGGTGCAAATATCATATAAAGTATGGAATAAATGCCCTTGTATGGATAACTTGTCTTCTGAGTGATCATTCTGTCATTGAACAAAGGTTATGGAATCTGAAGTTGAAGGAAGGAAAGAGAAAAACGTGGTATATATCCCCAAATGCAGGTAATTCAATCATCATCAAGAAATTGTTTCACAAGTTTGACTAGGAGGAACATTTGTAAAGAAAATTTCTTCAACTGCTGGGTATCACGTAACATATCGGTCAAACGGTTTCCTACTCCCAGCTCTTCATAGGCAGACTACAAAAATTTTCAGGTCTATAAGTAGTAACCTGATGATTTGCAATTAACATATGACTCTGCAGCCATCAATTAGTTCTGAATGAATTGTTGCAGTATGTCAACTCTTACTCAAGTTAATCCACTCATGAAAAACAAATTGAAGAACTATGGCTGGGACACAAGTTGTATTGTCAACGTCGTAATTGTGGCAACTGACAATCCTACTCACACTCCACAAGCTGCTTATTATCAATTCTACCCACGTTAGACAAACTACCATGATTAACACTGGGTTAAGAAAAAAATAGAATTTTAAGTGCAGATATATCAATAAATACTGAAGAACCACCTTAAAAATACATAAATACTGAAGAACAGGATTTCTACTGGTGTTGCTGTTTTTCTTTTCTTTTTTTTTAATCTCCAATCCTATTTGTGGCAGATTTCTGGAAAGTACAAATTGTGTTGGTATGTGCACAAACCTTTGCAAGATTCCATGCCAGAAGTTCATCCAAGATTCACTTGGCATGAAGGTCTACATGTCTCCCAGTAAGCTTCCTCTGCTCTGATTCATCAGGAAAGCCTGAATATCAGTGGGTAAACACAACAACTTAAATATAATTTGGTAGAATAAGGTAAAAATAATCAAACTCCATTCCTTTGCATAAAGTTGGCAAGAAACTAATAATGGATTGTCATATCAACATCATCTCAAAGTTGAAAATTTGGGTTGAAACCTGGTGTGCCTCTAACTTCTCAGGACATTGACCTAATTTTACTATAGCGGATCATTATACGGACTGCCGCTAAAACATAAGTGAACTCAAAATATCAACTTTCGACTTTAAGCAGAATTAGTGAAGTAAAGTTGAATCAATGTAATAGGTCCATAGACCACCAACGGTTTAGAGCTATGAGAAATACAGAACTTAATTTGACATATTAATTTCATGCCACCTCTACCTACCGACAATCTGAGGACTGTGCCCTTTTTGGGTATGGGAACCACTGGCCACCATTCAGGAAACAGAAAGGGCTGAAGTGGGGCCAACATGTTTGCAGGTTACTACCTCCGTTTTTTAATTTATAACGTCGATGACTTTTTAGATATATATGATCATTCGTCTTATTCAAAAAAAAATGCAATTATCATTTATTTTATTGTGACTTAATTTATCATCAAATGTTCTTTAAGCATGACTTAAATTTTTTTTATATTTGCACAATAATTTTGAATAAGATGAATGGTCAAATGTTTGTCAAAAAGTCAACAACGTCATACATTAAAAAACGGAGGGAGTACAAAGCAATCACAAGCAAGTTGTACAGAAGAAGAAAGTGCTAGCCCCTACTTGTCATTCTTAGTGGGAAACGGCAAATTGCATGGACAAGTTGTGGAACAGTAGTGTGAAATCCAGAAATCCACAATGTAGTGCTGTGAAAATACAGTACAAGCACCTTCACATGGCAGTGACGAGCCAGCATGTCTCGATAATCAGAGCAATATGGTTCAATTTCACTTATGAGAAGCACTAGTTTTGAATGTTAGTCTTCTATGGTGATACACTGAATATTTCAACATCAATCATTTTTTCTAGGTCAAAAGATACTGATATTTTATGACATCACCCCACAGAATCAGATATCAACCTCTGTTGGAATTTGCAAGGCTCTCTTTCCTTTTTATCCTGTCGAGTGGTTAGATCTAGGAGTAAGCAATGAATGTTATTTACTGCCAGTGCTACTAAATAGTCCTATACAGCTTATTTCCAATTAAGCAAGAAGGTTTTTTCCAATACTAGGTCAATAAAAACGAGAATAAAGCAGAGTCCCTAAAGATAATAGTGAATGTATCAAGAGAAATGTAACATAATTACTTACATCAACTATATATTTATTCTTCAGATTTTGAAGACATGA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Protein Sequence

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Gene Sequence

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External Link(s)

NCBI Gene:DWARF27, [1]