Difference between revisions of "Os09g0286400"
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Revision as of 12:50, 10 January 2015
OsNHX5(Os09g0286400), is a Na+and H+exchanger in rice (Oryza sativa)[1][2].
Contents
Annotated Information
Function
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Expression
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Evolution
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You can also add sub-section(s) at will.
Knowledge Extension
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
| Gene Name |
Os09g0286400 |
|---|---|
| Description |
Sodium/hydrogen exchanger subfamily protein |
| Version |
NM_001069315.1 GI:115478369 GeneID:4346626 |
| Length |
9242 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os09g0286400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 9:6940039..6949280 |
| Sequence Coding Region |
6940462..6940505,6940711..6940793,6940877..6940974,6941284..6941361,6941791..6941900 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008402:6940039..6949280 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008402:6940039..6949280 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcgctggagctgagcctggtgtccgcttcgccccctggtgggctggcggcgagcccgcccccgcccgccgccatcccggggaaggagcagcaggtggccggggtggggatcctgctgcagatctccatgctcgtgctctccttcgtgctcggccacgtcctccgccgccaccggttctactacctccccgaggccagcgcgtctctcctcatcggtctagttgtcggtgggcttgctaatatttcaaatacagagaccaacactaggatgtggttcaacttccatgacgaatttttcttcttgttcttattgcctccaataatattccaatcaggattcagtctatccccaaaaccattctttgcaaattttggggctattgtaacttttgccatccttgggacattcattgcttctgttgtaacaggagttctcgtctatcttggtgggttgacatttctaatgtacaaacttccatttgttgagtgcctcatgttcggtgctcttatatctgcaactgatcctgtcactgtgttatcaatattccaggagctgggcactgatgttaacttgtatgctcttgtgtttggagaatctgttctaaatgatgcgatggcgatttcgctttacaggacaatgtcattggtcagaagtcaagcagcagctggggagaacttctttatgatggttttccagttccttgagacctttgttggttcattgtcatcaggtgttggagttggatttatctctgctcttctgtttaagtatgctggactggatattgacaatcttcaaaacttggagtgctgcctttttgttctcttcccatacttctcgtatatgttagcagaaggacttgggttgtcaggaattgtttccatactattcacaggaatggttatgaagcactatacattttccaatctctcaaacaactctcagcgcttcgtttctgccttctttcacttgctgtcatctttagcagaaacatttgtgttcatttatatgggctttgatattgccatggaagaacatagctggtctcatgtgggcttcatattcttctcaattatatttataatcattgcaagggcagtaaatgtcttttcttgtgcatatttggttaacatgtcacggccagaacatcgacgcatacctctaaagcatcagaaagcactttggtttagtgggcttagaggggccatggcttttgcacttgctctccaatctgccaatgaacttcctggaggacatggaaaaacaatattcacaaccaccacagctattgttgttttaacggtacttcttatcggaggatcgacgggcaccatgctggaagctttggatgtaattggtgatgaaaacagatcaatagaaaattatgacgacaacaatggttacatccccccaacgtatgaggaaggttcatcatctggaggaggattaagaatgaaactgaaggaattccacaaaagcacgacatcgttcactgcccttgacaggaactatctgactccatttttcaccagtcaaactgatgaggatgatgatgtcttcggtgaacaaccccaaaaccagagacgcggattctatgaccaatag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MALELSLVSASPPGGLAASPPPPAAIPGKEQQVAGVGILLQISM LVLSFVLGHVLRRHRFYYLPEASASLLIGLVVGGLANISNTETNTRMWFNFHDEFFFL FLLPPIIFQSGFSLSPKPFFANFGAIVTFAILGTFIASVVTGVLVYLGGLTFLMYKLP FVECLMFGALISATDPVTVLSIFQELGTDVNLYALVFGESVLNDAMAISLYRTMSLVR SQAAAGENFFMMVFQFLETFVGSLSSGVGVGFISALLFKYAGLDIDNLQNLECCLFVL FPYFSYMLAEGLGLSGIVSILFTGMVMKHYTFSNLSNNSQRFVSAFFHLLSSLAETFV FIYMGFDIAMEEHSWSHVGFIFFSIIFIIIARAVNVFSCAYLVNMSRPEHRRIPLKHQ KALWFSGLRGAMAFALALQSANELPGGHGKTIFTTTTAIVVLTVLLIGGSTGTMLEAL DVIGDENRSIENYDDNNGYIPPTYEEGSSSGGGLRMKLKEFHKSTTSFTALDRNYLTP FFTSQTDEDDDVFGEQPQNQRRGFYDQ</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>8776..8819#8488..8570#8307..8404#7920..7997#7381..7490#7201..7298#6441..6460#6268..6343#6085..6182#5918..5978#5796..5843#5662..5693#5175..5203#4594..4691#4502..4521#4352..4414#2749..2860#2585..2670#2485..2509#2329..2388#2088..2139#131..347#gctttcccccccgcgagccttctggaagaagcacgcatcgattgaccgcgaccgacctcgccgccggcgaccgtacggattccgcccctccccgccgcggcggcggcaccaccggggcgcgcgcgccgggatggcgctggagctgagcctggtgtccgcttcgccccctggtgggctggcggcgagcccgcccccgcccgccgccatcccggggaaggagcagcaggtggccggggtggggatcctgctgcagatctccatgctcgtgctctccttcgtgctcggccacgtcctccgccgccaccggttctactacctccccgaggccagcgcgtctctcctcatcggtacgtacgcgcgctacgaattgatcgtgcgagtcgcaaaccctagctgtcaaggatcgtttcgtttatagagtttggattagtttgttgaggtgattattggtttgtgggatttagaaattagaagtgggatgttcagatggagatggtatggggattgatgcatgtttccgatgccctgcaaatactgtgaagggttggaattcagtgccattctaggtgaaatgcgaaaatgagccgggatcatgctaataatgtagataattcattttgtctgcctttgcctctgtggtagcttttctacaagaaacttaattctagatgaaattttcagcgaaatgagaagggatcatactattaatgcagatgattcatttaggagatgctgcatggtagcacttaatttgtctacctttgtaccccatttattgggatacacaattctttcgagccatggcatcataatattaggtcccgtttgtttccactacaaagagtggataaagttttggatattcgtggcacgcttttcaaactgctaaacggtgcgtttcgtgcgaaaactttctatatgaaggttgctctaaaatattagattaatatatttttcaagtttgtaataattaaaacttaattaatcatacgttaataccacctcgttttgggtaaaatacttagtcttcatctttatctttatcttgaggagaaaagaacaccaccttactaaagttaacactaactagctagattctatggcatagggcgtcacagcatgagtaattttttaaagaaaaagatcaccgataatatgttctgagtttatcacagaaacaagttgatgatatgataattttatattaaaaaatagagctgtatcaatgagaccgtggaaagatagaacctcaagtaaaaagggaacgtaaagaatggatcaacaccatttccttgtatggtcataagctggtagaaggaatagaagaaatggataaatcatacgtttcgactagaataatggcagttttttgttggcttatttctgttttttggttgagtttaatgccatttaagtaatgccatgaatgggaatgcaaattatatataaaaaataaaaatcaatacatagatttaaggacctcccctcaaatgtacatggcgctgtaagttttcctttgcttgatttttttatgtagttaatttggggtaggaactagttccatggtttctgttttaccttgttcccctcatatggagaaattgcatgacctgtcatccatttgtgttaccctgcaagtttcaagtctggaaaagagaaatttaaatgaaaatttgttgaattttcttattccgcttgccttgttgttactcatgggaaactcaacagtagggtcaatattaaagtcataaatgatacatgagtaaaaacatatgttcttaataacaaaccattttcaagtataaatgctcgatttgcatgccttgattagtagtagctatcctttgatcaaggtgaacaactacaatccatgttctgcttgcatagaagctgagctgatgcaaatcaagctcagttacatgagtaaaaacttcatcatgaaaataagttgagttctctagttcttttgtattttcttaaatttgtcatatgatttcctttatgacagactcgcgatatcaatatcattttgatcatgcatattgtggacaccctttatgtatggaactttaatgattctgttacaggtctagttgtcggtgggcttgctaatatttcaaatacagagaccaacactaggtttgtgttgttttattaacatttatacacaatgcaagagtatttttcacatgatgtagacatatgctatgcaagatttgggagttatttcattcccgtatcatgcttattattatcaggaattcaggatcttatgcatgctgtatgtatgctttccattgattctatcttgtttccttcaatgtgcaggatgtggttcaacttccatgacgaatttttcttcttgttcttattgcctccaataatattatatccttttgattttcaaattcaaacttaatttcttatactgttctaaaagatgcttcataatatctgaatacgttttccttgacttcatagaacccaatcaggattcagtctatccccagtaagtacctcatgatggcaataattcaaattgtctagacttctttccttgaaataataatatatttttttacagaaaccattctttgcaaattttggggctattgtaacttttgccatccttgggacattcattgcttctgttgtaacaggagttctcgtgtaagaatttcacaaactttttgttctaattctgtctgaagtattttatcttactagtcaacctctatcatactgcagctatcttggtgggttgacatttctaatgtacaaacttccatttgttgagtgcctcatgttcggtgctcttatatctgcaactgatcctgtcactgtgttatcaatattccaggtgcttatttttttcacgtatctcgttcttggacatgtgtacttataattcacgtaactgccttgcatggctagaaggtgattaggatatcatatagatatagattgggaagaaaactttgtatgagatgcttaaatttttcatgcacgaaactgcacacatacacatacacactttaccaatatgagtaaacctcttatctcaggaaacctatcctaaaccatgtactacatctatagggaaacatgcctaactagcaagatgactaaggtaccgtttgaattagcaaatccatcatttgattttcagcttataataagccactgctaaatttgatttttaaaacttaattttggagttgattttggggtttcttcatcatgttttatttttgagcattggcttttaaactacgaataacacagatataaacggtttacacataatttcttttgggttgcttctatgccgttttatggcttatcagatataggccaaacaataagactgtagatgattggtggatgaaagctgctggatgatttacttgaatatagggataaaataaatattatatatcgtaaactgaacaaatagcttataacaagtggtccaaggaagcaatgcagtagaagattttttttttttttgagaaaacatagttttagaagcgtggagcaaataatccggtggatagtctgaaaagaacagggcctaagtattaatgcaccagcagggctaggaaacagcacatattgatacactcttgtgaacagatttttgtttgaacttcgctgttgcattatgatttctatattacatgatgttgtctaatacaaaaagaaaattttaatgaggttgtaagcagtcaataaatcagaagttgtctctgttgtttgatgttttaaaattgttgtgttctcattcttgaaagacgcatcatcttcatttctttatattgctactagtgaagcataccatagactctcagtactatacatggaaccccacttttagaggcaaatgattgtttatgtaagtaaatgtaaaatagaaacctggttgcaatgctaaatgaatatgaaacattctgaaagcaaatattatcctaatgcccaggtaattgataaaaaatgtgctaaactcgtaacactgttttgttgtagtttcagtgttgtaccatatttttggtagcatttggcttgaacttgaaaacagatcattactactagattttgatgcaccatcagaatttacaacagaagtttgtggtggtaaagttactgtatatttagtgtaacatactgaatcagtgcatgcagccattattattattttttatgtactttgatatatgtccttagccaatgttttttttaaagatgttccattgtttaaatatggcatattaaaaaatgttggaggattagtggccatatggatgttgggaatctgaactaatgatgcatctcctgaaattattccatgcaggagctgggcactgatgttaacttgtatgctcttgtgtttggagaatctgttctaaatgatgcggtttgtttttacttctttcgagtgcatgcaatagtagtaattacttttgtttatgactaacatgcatatcttatttggatagtgcagatggcgatttcgctttacaggtctgtctctttcaattacatataattcttttgacatatgcatttcttgcttatatctatccttttgttcaggacaatgtcattggtcagaagtcaagcagcagctggggagaacttctttatgatggttttccagttccttgagacctttgttggttcattgtcatcaggttgcatcacagctcagaatattctcaactatttcaaagggacctttggcattgt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