|
|
| (One intermediate revision by one other user not shown) |
| Line 1: |
Line 1: |
| − | {{JaponicaGene|
| + | Please input one-sentence summary here. |
| − | GeneName = Os01g0773600|
| |
| − | Description = Glycoside hydrolase, family 47 protein|
| |
| − | Version = NM_001050936.1 GI:115440242 GeneID:4327149|
| |
| − | Length = 9508 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os01g0773600, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| | | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| + | ==Annotated Information== |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| + | ===Function=== |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| + | Please input function information here. |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| + | |
| − | |
| + | ===Expression=== |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 1|Chromosome 1]]|
| + | Please input expression information here. |
| − | AP = Chromosome 1:34454880..34464387|
| + | |
| − | CDS = 34454909..34455085,34455755..34455874,34455970..34456062,34456785..34456871,34457416..34457506<br>,34458652..34458705,34459139..34459213,34459661..34459770,34460196..34460246<br>,34460742..34460830,34461106..34461187,34461268..34461381,34461603..34461682<br>,34462337..34462472,34462798..34462868,34462951..34463185,34463597..34463986<br>|
| + | ===Evolution=== |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| + | Please input evolution information here. |
| − | name=NC_008394:34454880..34464387
| + | |
| − | source=RiceChromosome01
| + | You can also add sub-section(s) at will. |
| − | preset=GeneLocation
| + | |
| − | </gbrowseImage1>|
| + | ==Labs working on this gene== |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| + | Please input related labs here. |
| − | name=NC_008394:34454880..34464387
| + | |
| − | source=RiceChromosome01
| + | ==References== |
| − | preset=GeneLocation
| + | Please input cited references here. |
| − | </gbrowseImage2>|
| + | |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgcccacctcgggcccggacgcgatgcagccggcgctgcgacggcggcggcggcgccaaggcttcctcctccccttcgcctgcctctccgccgccctcatcgccgctgccctgctccccggcgccgctttcgccgatggcgtcacgccctccgaggcccgccggctccgcgacgaggtcaaagatatgttctatcatgcatttgatgggtacatgcaacatgcttttccacttgatgaattgcggcctttaagttgccaaggagaagattcacttggtggctatgcacttactcttatagactctttggataccttggctttactaggggataaggagagatttgatgctgccgtggagtgggttggtaagaatgtccgctttgatattaataaaactgtctctgtttttgaaaccaacatacgcattcttgggggtctgctatcagctcacctgattgccagtgattatgcaactggaatgagaattcaatcttatgatgatcagttgcttcatttagcggctgacttagctcaaagattgctacctgcatttgacactccaacaggtattccatttggatcagtaaatttattgtatggagtcgatgaaaatgaaagcaagataacttcaacagctggtggtggcactttgacactggaatttggtgtcctgagtcgtttgactaatgatagcgtttatgaacgagttacaaaaaactctgtgcgtggaatatgggcacgcaggtcgaaacttgaccttgttggtgcccatataaatgtatttactggtgaatggacacagaaggatgcaggaattggcacaagcattgactcattctatgagtatcttctaaaggcgtatttattatttggagatgaagaatatttgtatatatttcaggaggcttacaaggctgccatgcattatctccatcatgatccctggtatgtggaggtaaatatgaattctggtgctactgtttggccactattcaacagtctccaggcattctggccaggacttcaggtgttagctggagatgttgatcctgccattcgaactcatgctgccttcttcagtgtatggaaaaaatatggcttcaccccagaagggtttaatcttgctacatccactgttcagaatggacaaaggagctacccgctgcggcctgaattgattgaaagcacatattggctgttcaaggctactagagattataggtaccttgatgttggaagggatatattagcaagccttcaatatggtgctaaatgtccatgtggttactgccatatttcagatgtagaaacccaccagcaggatgaccacatggagagttttttccttgcagaaacagtcaaatatctctggcttctttttgatttagctgcaggccctgataatattgttgaaaatgggccatataaatacatatttagtacagaaggtcatctgttgcctgctactcctcagataaccttgttagatgagcattgcttgtatgctggagcattctgcaatggtactgcaggccatggatatggtaccggtgatagttctaataagcatcaaaatgcaaactctgttccgttcgatgatagtcgaacaccttccgatcaatctttatccaatattttgtctacgacaagagggtacatcaagggagtttgtccaggattaactcatgcccagaaacttggcatatcatactctgccgaggaggataactcaatacagcagaattctggaagtagtgagaatcttgatgaatcacacgtgatcaaatccagtgtccaagctcaatcaagttctgttatattgatatcgcatccagtcgcaagccaaactgaggagcctacgtcgggcagaagtcagtacaatgcaaacattgtggcaactgctgagtctgtagggactgatactgccggcgcctcatcccaccccgaggatcttgttaaggaaactgagagcgtctctgaacagaaagaaatcaatgacaaagagatcgcttctcagggtagtcaaccgaccgaaggaagatacctgacctaa</cdnaseq>|
| + | ==Structured Information== |
| − | AA = <aaseq>MPTSGPDAMQPALRRRRRRQGFLLPFACLSAALIAAALLPGAAF ADGVTPSEARRLRDEVKDMFYHAFDGYMQHAFPLDELRPLSCQGEDSLGGYALTLIDS LDTLALLGDKERFDAAVEWVGKNVRFDINKTVSVFETNIRILGGLLSAHLIASDYATG MRIQSYDDQLLHLAADLAQRLLPAFDTPTGIPFGSVNLLYGVDENESKITSTAGGGTL TLEFGVLSRLTNDSVYERVTKNSVRGIWARRSKLDLVGAHINVFTGEWTQKDAGIGTS IDSFYEYLLKAYLLFGDEEYLYIFQEAYKAAMHYLHHDPWYVEVNMNSGATVWPLFNS LQAFWPGLQVLAGDVDPAIRTHAAFFSVWKKYGFTPEGFNLATSTVQNGQRSYPLRPE LIESTYWLFKATRDYRYLDVGRDILASLQYGAKCPCGYCHISDVETHQQDDHMESFFL AETVKYLWLLFDLAAGPDNIVENGPYKYIFSTEGHLLPATPQITLLDEHCLYAGAFCN GTAGHGYGTGDSSNKHQNANSVPFDDSRTPSDQSLSNILSTTRGYIKGVCPGLTHAQK LGISYSAEEDNSIQQNSGSSENLDESHVIKSSVQAQSSSVILISHPVASQTEEPTSGR SQYNANIVATAESVGTDTAGASSHPEDLVKETESVSEQKEINDKEIASQGSQPTEGRY LT</aaseq>|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 1]] |
| − | DNA = <dnaseqindica>30..206#876..995#1091..1183#1906..1992#2537..2627#3773..3826#4260..4334#4782..4891#5317..5367#5863..5951#6227..6308#6389..6502#6724..6803#7458..7593#7919..7989#8072..8306#8718..9107#gcgtgctctgtatcattattaccatcccgatgcccacctcgggcccggacgcgatgcagccggcgctgcgacggcggcggcggcgccaaggcttcctcctccccttcgcctgcctctccgccgccctcatcgccgctgccctgctccccggcgccgctttcgccgatggcgtcacgccctccgaggcccgccggctccgcgacgaggtagtgcccgcgctcctcagatccgcccgctcctagctccagtttgttgtaagctagtttcgtgatcctgagctgcggcggaggcgttgtctagttcggatgttgcgtgttggtgctaatttgctggtgcataactcttcacgaaccgatttgggctggttttgcaatcgggcggcggcggactcggcgattcgaccggtttagttagtatgcttagttaattatcacatttccggttttgatcatactcaattattcatcgttacacggttactccaggaacgattagctatatacgccaggcattccgactgttagtagttcccactggtgactttgctgaaagcttttgactaaagttcagtgctaggttgattttgaatgtgtgtcacaacgagatatgctgtattataggatttttttagcacaaaacttaccacacttgaatttttggattttgtacaaccgagccaaattgactggtatagtagttatattaggttgctgtaacagaggtaatgcttgtggttctaagttttttttttcctctaattgatggtgagatgccaaacctcattaagagatatcttccacttcaacaagacgccatcttgtttacaattaacatgtgcagaatctagtattcatatggaaatgtcttttatgtaggtcaaagatatgttctatcatgcatttgatgggtacatgcaacatgcttttccacttgatgaattgcggcctttaagttgccaaggagaagattcacttggtggctatgcacttactcttgtaagcaattaaaaaactgcttcctcatgcacatttcctatcagtttttgccttcatgtattatcatgatttgtgaatgcttattcattaaacagatagactctttggataccttggctttactaggggataaggagagatttgatgctgccgtggagtgggttggtaagaatgtccgctttgatattgtaagtaaacaatttacaatttttttcactaattgcatagattaattaatacacaccatggtgacaccataactaattaaccattcaaccattattgacatatgataaatatacagtacttttttgcttgtatttcagtctgtcctatagattgaagcactttataatttaggattagcgtattacgtgaatattgaagcagataatatgccatgttgggtggtttcaactgacgtgccatattcattgattcagaatgaagaaacattatgcttgacagtttagagagattcttatttgtaccatagtccaatagatcagtcttgaagattggttatgttgcaaggctttcaatattgcctttctcagattaatttattatatggtgcttcttacagtatgactcacaatctattatggttggtgatagggatctcaatgcattaaggaataaatgttagtcctgttgcttttttttggtctaataacttttcactgtatgtttttttaacattcctttcgaaataccagttttgcatttgaaatgaacataatcttctagcaccaagtatgttatatgtgttctgtagatacatctatatatttgatctttctatttcttcttagcctacttattttacttgtgcgaagattgacgtgttcgcttacaacttacattcatgattctgtttcttaatcatgtttcctcgctgtatatgcagaataaaactgtctctgtttttgaaaccaacatacgcattcttgggggtctgctatcagctcacctgattgccagtgattatgcaactgtatgtttgtctggtccttttttttgccagtgtttaccacttctcttgttgattttcctgatgatctttgctaaatttctgttaatcttaaacacaaactttttaagtagaacttgaaaaattgtatgcaaaccaaatatactaaagtgggacatgaaaatctgattggagcaaaggaatacctgtgctgtaacacgaaaccacttctgaaagaccatattgataacgtgcaagcttattgacaccatgactgttgtgatgttaatggaggtgtggcatggtagaaaggtgcctttctgcctgttcaacatattgaccataataggttcttttcagaatacggctggttagaataattctttaatatggcacatacgattagttatatcttaaatatgatcatgctgatgtattcagttataacctacattcataagaaagtgcacaataagaagatgtctcaatcttcctaaccttctatgttactttctcaagatttactcaatgaagtgttccgatatttattttagcttcttgttgacagggaatgagaattcaatcttatgatgatcagttgcttcatttagcggctgacttagctcaaagattgctacctgcatttgacactccaacaggtttactacgttgtctattagttactttgtggactcacacatgtttctttgaaacaatggaatatcttaatatgttatgtatcatatcagaaatttgatcccccaatcaccaccgttctcaacccccagcccaccaaaacacacatcgaaccaaactcttctttttcagccaaagctgtttgtgtaacaaacttttccatggtttgggattataactggactactgaacataatgacaaaaatatcatgttccatcgcagtaaatacaccctcacatacaagctaaaacagatatccattaatcatatcttactatatagttgcaacccactaaatcctaaagctcaacatacaaagatgccacatcattctcaactaacaattattacatcttaaacatcatgcaagcatgctatattatctataattctatatttattaaattttagagctttaaaatgcaagaatgttaaatcatcccatataattcacataatatttaaatatatctctccatcattttttataatatctactatatacatatgtagttcatcctcacttagttaatgctatttcgctcttctctcattaagccatatcacatcaattgtttttagcccttagatgattaatctatggtccaaattatctttatcttttttttttctctttaagtcatatcacctcaattatttttagccattagatgattaatctatggtccaaattaactccctccttttcttctctcataaagtcacatcaccttatcatcattctatatactatttaaattactataaaccatatcaacttatgtaagcttatgtcgtctagctatcttacacattatctctacttatttgatgtaaacattatttctacttattgctatcatattaaactcctgcagcaacacgcggggttttacctagtatatgcacatatgcatgtacactagagcgcatgcacgttgcacgcttaataaaatatgccgacatttgagcatttcttttcgatggaaagtatcccatgagttattcaaatggcaaaggagtaatagaagagttttttcatccttttagcatcatgatatgttctttccttcctgttctgcttaacatgtgcagttctcgttgcaggtattccatttggatcagtaaatttattgtatggagtcgatgaaaatgaaagcaaggcaagcttattttgtcctacgttttgttgtttatagagcttgcaatcaggaacaggcccagagtttggactcatgttaattatggtcgatatggagattagcataattccaaattccaagtgtttacgctgttgcttaagtaactttggaatgatttaacttgaaatattctactgcttttgtaaccacataaataatatacgagaggcacacgcgcgtgcgcacacacacacacatttatcagacttctcaattttcttctgttcatttagaacttaaataccaagtactatcccatcaaccatgtctaatttcccatgtttatgcttggttcatcagtacaagcgttgaaagtagaaaattgtacctggctattagatggacataaacattcctgagattaattactgacacagcattttagtaataacagataacttcaacagctggtggtggcactttgacactggaatttggtgtcctgagtcgtttgactaatgatagcggttagtattgacaatatattatattgttgaagatctctatatcatgtattctacattattacacaactacaatagctaccatgtgctagaaaggtgcccctactttttttggtagtttatgttttaaaatctcatatattttttatggaattgaaatattatagttgaatagtctgaaagtatccttactggtacttaacaagtcctttaaggtgctgagtcgtgatgtcaacatctgtgtccattcgttgtgtgttagatgttcagaacaaatttatgcatatctttgaccatgaacttccctagtccccatagagatcatgtttattattattgttctattgtctcatgcttcattagttttggttgtttatcctctgaacactaatttagttcttatcgccagtctgttattctttgttaaactcactgattgtcacgatgcagtttatgaacgagttacaaaaaactctgtgcgtggaatatgggcacgcaggtcgaaacttgaccttgttggtgcccatataaatgtatttactggtgaatggacacagaaggtattaactttcattatctcagtgatagttttgaaactagatgttatatcgcttgcgttgtgttgctgatatgcaaacgtcttgttgtagaatgaactacctcgtgtcatatgtgtaggcatgcaacatactgttagggatatttttttcttctcggcagagcgacctaatagttttgtttattaattgatatatgactgataggttcagttgactggatacatagtcattttgccatgtaccaaagaagctcccttttgcttcttgagtgactatgcttacaatttactaatataattgtcactatatggttggtacataaacaagcaaaatgtgctttcaaattttatgcgatgtttagtttatgagattattgatcaattatcatcatgaagtattttcagtggaattatccctaattgcaggatgcaggaattggcacaagcattgactcattctatgagtatcttctaaaggtaaggaatccactgtattatagcattgcatatttcagaccttgtatatttcagaactgttacatacatgtactataataaacaggtttttttttgtctatatacccatatcttttaaaggtcatgaaaaaaatgaactgtttagctgtctcctcaccttcgtttcaccaatccagtatcatcatcgaccaaataagagagttcatctccctaccccctctcaatatagtgcatgcgctatagcagtgttgtattccattgcataatgtgtataactagctagtcagggattgtattgaaagctattagctattgttagttgtttactgttaatataataaaatgagcatccacaattgacttttcaaattatgcttctattttcctatagcatgcacaaaacttgggtcatcaactacctggttatctcatcatttccctttttttgtgtgttttaaatgtattttaacagttttgtgtgtcaacactcaacaggcgtatttattatttggagatgaagaatatttgtatatatttcaggaggcttacaaggctgccatgcattatctccatcatgatccctggtaaaaatatcctgttaatgcagtgttgaatgaattacaggtgacctgtgattgtttgaggatatttagctagtactcagtgaataaactaatggattaaatctgtctgtatttatgccttcgatatgaaaccttaagaggcataagtacatattttcaatcatgtttttagctgtgggtgatgattgcatagtttaattgtacatgttacactagaggttcttcagctgctttcttgtcaagtttcaaataaaaacctacaattttaattccaggtatgtggaggtaaatatgaattctggtgctactgtttggccactattcaacagtctccaggcattctggccaggacttcaggtttggattactcgtatatcagagataaaaaaaaatgatgcacacattctagatgatttcttattctgcttagatttaaggtgttagctggagatgttgatcctgccattcgaactcatgctgccttcttcagtgtatggaaaaaatatggcttcaccccagaagggtttaatcttgctacatccactgttcaggtagttaactttttactaaaaaaactttgggtaggatcattataagcagtgagcctcatatggaatcattctttttcaagagatttgaaacagaacgatgaaccgttgagcttttggttgaagagttgattataaagtttggggcaccaaaatgttgaagcacaaagtacgtgccacttatttatactatcattaaccccaccatttggtatatttcacagaatggacaaaggagctacccgctgcggcctgaattgattgaaagcacatattggctgttcaaggctactagagattataggtgtgtctttatctacaaggtgaaaatagaagttattcttttttaataatgctcttaggtttttaaatgcaatttccccaatggtgaaaagaaacgagatttgagcgaggttcaatatgtggccatgcaggggacgtttggatctcgagcaatgctgaatttagcctagcccggcaaggtttagtgtttggtagaagataaaaaaaaacctagcttttgatggcaatcaagcccataactacctgaaaaaacttgcctgatgaggagagccgaatcggctcccccccccctccctgcccgacgaacgcagtgcgcgtagtagatctcgtgtaactacccatttgactcagtaaaagctagctaaccaaatgagaggtcttgcttatatcggttatagcccaaaggagctagataaatctagcctggctaggtaaagtaagcgaaggatccaaacgcacccgtattgtttccttatggcatgctgatatggacaaaagtatcaatggtttgaccggattattagttacaaacacaaacagtaacttaaagttgtcatgaataaatgtatatgctttttaactgactctactaagcttttgtgccctctttaatacttttgtgccctggatttaatgttttagctttaatatgcaggtaccttgatgttggaagggatatattagcaagccttcaatatggtgctaaatgtccatgtggttactgccatatttcagatgtagaaacccaccagcaggatgaccacatggagagttttttccttgcagaaacagtgagtttattttctaatataatgtggttacatccatgatttctctcatgaaccagctttacagatatagccagaaacttaggagtaactttgtaacatgcgacattaactagcattccttggcataattactagtatactagcattaaatatttacgcacttattttggaaggtatttagcatcagcaaacacaagggaactgaaacttgcaaatatatttagatctttgcctaaataaccagcaatgcaacaatttactgcatattttcgttgagctattctctattgttggttaaatctaattaattattagcgcattccaggtcaaatatctctggcttctttttgatttagctgcaggccctgataatattgttgaaaatgggccatataagtaagtacgacgccgtagattcaataagttcaattgtttattcagacgcatccttcctgcttactgtaaatcaactttgcagatacatatttagtacagaaggtcatctgttgcctgctactcctcagataaccttgttagatgagcattgcttgtatgctggagcattctgcaatggtactgcaggccatggatatggtaccggtgatagttctaataagcatcaaaatgcaaactctgttccgttcgatgatagtcgaacaccttccgatcaatctttatccaatattttgtctacgacaagagggtacatcaaggtattgtctgttgcatatctgatttgcggttttttttacactgcatttataggcattattgaaagaaaaatggaatcatatggattgcattgtccaagtgatgcatcagatgaaacatataggttggagatgttaacatcaaattgtcaacaaacctttcgttgctgcacagaattgataagatttgcaatgcaacatgaactataagtagttggagtaccgcgctagctagctgatatacttggaaggcctaatttttcgggcattatttgaaatgcttggcttgctaagaggatcttctatgaatgttaccacattgatcatcgtgtaatacataggcaaaagttagatgatgtatccatttttagtagcttagtctttttttctaaccacaatgtttttttgggttagggagtttgtccaggattaactcatgcccagaaacttggcatatcatactctgccgaggaggataactcaatacagcagaattctggaagtagtgagaatcttgatgaatcacacgtgatcaaatccagtgtccaagctcaatcaagttctgttatattgatatcgcatccagtcgcaagccaaactgaggagcctacgtcgggcagaagtcagtacaatgcaaacattgtggcaactgctgagtctgtagggactgatactgccggcgcctcatcccaccccgaggatcttgttaaggaaactgagagcgtctctgaacagaaagaaatcaatgacaaagagatcgcttctcagggtagtcaaccgaccgaaggaagatacctgacctaatgtaggaacgaaaactttcacttaaactggataccatcatttcagggcttaccatattacaagtctgcacgtcaggttacaaaacaacaagtgttgatacaaggcccatagatcagtacctcctgaccacagttgaattatagtgaaaatgaaaaatctcgcaatgggactacccttgagtggatctgtggtctcgatacacaacatttggatttaccacaaggcatcagctgtgttctttctgacaaatttagaacgagcattccttgattcattctgtttgtaactttgtactggtccgatagattcttctgatcaaatagcggctgtatagtattgtacactagagcaatcaacaaactgaatgtccaaatgactcatacatgggccagattccatcc</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001050936.1 RefSeq:Os01g0773600]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]]
| |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 1]] | |
| − | [[Category:Chromosome 1]]
| |
