|
|
| (One intermediate revision by one other user not shown) |
| Line 1: |
Line 1: |
| − | {{JaponicaGene|
| + | Please input one-sentence summary here. |
| − | GeneName = Os03g0143400|
| |
| − | Description = Similar to mitochondrial chaperonin-60 [Oryza sativa (japonica cultivar-group)]|
| |
| − | Version = NM_001055473.1 GI:115450674 GeneID:4331590|
| |
| − | Length = 5700 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os03g0143400, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| | | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| + | ==Annotated Information== |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| + | ===Function=== |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| + | Please input function information here. |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| + | |
| − | |
| + | ===Expression=== |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 3|Chromosome 3]]|
| + | Please input expression information here. |
| − | AP = Chromosome 3:2379350..2385049|
| + | |
| − | CDS = 2379736..2379847,2380155..2380233,2380311..2380416,2380490..2380593,2380690..2380789<br>,2381082..2381177,2381273..2381350,2381904..2381972,2382060..2382140<br>,2382219..2382308,2382408..2382494,2382571..2382675,2383140..2383235<br>,2383345..2383520,2383774..2383933,2384447..2384578,2384785..2384809<br>,2384910..2384947|
| + | ===Evolution=== |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| + | Please input evolution information here. |
| − | name=NC_008396:2379350..2385049
| + | |
| − | source=RiceChromosome03
| + | You can also add sub-section(s) at will. |
| − | preset=GeneLocation
| + | |
| − | </gbrowseImage1>|
| + | ==Labs working on this gene== |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| + | Please input related labs here. |
| − | name=NC_008396:2379350..2385049
| + | |
| − | source=RiceChromosome03
| + | ==References== |
| − | preset=GeneLocation
| + | Please input cited references here. |
| − | </gbrowseImage2>|
| + | |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgtaccgcgcggcggccagcctcgcctccaaggcccgtcaagccgggagcagcgctcgtcagattgggagtaggctcgccttgcatagaaactatgctgccaaggacatcaagtttggtgtcgaggcccgggccttgatgttgaggggtgttgaggagttggctgatgcggtcaaagtgacaatgggtcctaagggacgcactgttgttattgagcaaagctttggtgctcctaaagttacaaaggatggagttactgttgccaagagcattgaattcagtaacagggttaagaatgttggtgcaagccttgtgaagcaggttgctaatgcgactaacgacactgctggggatgggacaacatgtgctactgttcttacaaaagctatattcgctgagggatgcaagtctgtagcagctggaatgaatgcgatggatttgagacgtggtatctcgatggctgttgatgaagtagtgacaaatttaaaaggcatggccagaatgattagcacatcagaggaaatagcacaggttggtactatatcagctaatggggaaagggaaattggtgagctcattgcaaaagctatggagaaggttggcaaagagggagtcatcactattacggatggtaacaccctctacaatgagcttgaagttgtagaaggcatgaaacttgacagaggttatatctctccttacttcattaccaaccaaaagaaccagaaatgtgaactagacgatccactgatcttgatacatgacaagaaagtgtccaaccttcatgctgtggtgaaagtgttggagttagctctgaagaagcaaaggcctctgcttattgttgcagaggatgtagaaagtgaagcattgggtactctgattattaacaagcttcgtgcaggcattaaggtttgtgcagtcaaagctcctgggtttggggagagcaggaaagccaacttacaggacctcgctatccttactgggggagaagtcataactgaagaacttggaatgaaccttgagaattttgagcctcagatgctggggacttgcaagaaggttacagtatctaaggatgacacagtcatccttgatggagctggagataagaaggccattgaagagagagctgagcagctgagatctgcaattgagctaagcacttctgactatgataaagagaagcttcaggagcggttagcaaagctttctggtggtgttgctgttctaaagattggtggagctagtgaagcggaggttggtgagaagaaggatagagtgactgatgcactaaatgctaccaaagctgctgtagaggagggtattgtaccaggtggtggagttgcccttctgtatgcatcaaaagacctggataaattgcagactgcgaactttgaccaaaagattggtgtccagatcattcaaaatgctttgaagaccccagtgcacacaattgcttcgaatgcgggtgtagaaggatctgtcattattggcaagcttttggaacaggataatactgatctaggttatgatgctgctaaaggtgaatacgttgacatggtgaagtctggtatcattgacccactaaaagttatcagaacagctctggtggatgctgcaagtgtgtcctctctaatgactaccacagaatctattattgttgagatccccaaggaagaggaggcagcagccgcagcacccgcaatgggtggcatgggcgggatgggtttctag</cdnaseq>|
| + | ==Structured Information== |
| − | AA = <aaseq>MYRAAASLASKARQAGSSARQIGSRLALHRNYAAKDIKFGVEAR ALMLRGVEELADAVKVTMGPKGRTVVIEQSFGAPKVTKDGVTVAKSIEFSNRVKNVGA SLVKQVANATNDTAGDGTTCATVLTKAIFAEGCKSVAAGMNAMDLRRGISMAVDEVVT NLKGMARMISTSEEIAQVGTISANGEREIGELIAKAMEKVGKEGVITITDGNTLYNEL EVVEGMKLDRGYISPYFITNQKNQKCELDDPLILIHDKKVSNLHAVVKVLELALKKQR PLLIVAEDVESEALGTLIINKLRAGIKVCAVKAPGFGESRKANLQDLAILTGGEVITE ELGMNLENFEPQMLGTCKKVTVSKDDTVILDGAGDKKAIEERAEQLRSAIELSTSDYD KEKLQERLAKLSGGVAVLKIGGASEAEVGEKKDRVTDALNATKAAVEEGIVPGGGVAL LYASKDLDKLQTANFDQKIGVQIIQNALKTPVHTIASNAGVEGSVIIGKLLEQDNTDL GYDAAKGEYVDMVKSGIIDPLKVIRTALVDAASVSSLMTTTESIIVEIPKEEEAAAAA PAMGGMGGMGF</aaseq>|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 3]] |
| − | DNA = <dnaseqindica>5203..5314#4817..4895#4634..4739#4457..4560#4261..4360#3873..3968#3700..3777#3078..3146#2910..2990#2742..2831#2556..2642#2375..2479#1815..1910#1530..1705#1117..1276#472..603#241..265#103..140#gcgtttctttccccctccacaagtagctctctccccgccggtctccgggtagccgcctccgaacccagccgagagctcgaagcctttccttactctcttgccatgtaccgcgcggcggccagcctcgcctccaaggcccggtgagttagccgatccatggcgctcgctctccaatctccattgccgcactggggttttgtgttaatcatgtcgctaaattgtgtgttttgctttgtgcagtcaagccgggagcagcgctcgtcaggtgagcggggttcgtttggaaagtgatgcgttagcgtggagctgtttgctcctactctattgctgattggagtgctaatctagattctagcattgtgatggattgggcactcttatttccatacacacttgtgtggtttggatttaatttctgattgaacttatatggtaatctgcgtgcttgcttttcgtttgggtgctgagcagattgggagtaggctcgccttgcatagaaactatgctgccaaggacatcaagtttggtgtcgaggcccgggccttgatgttgaggggtgttgaggagttggctgatgcggtcaaagtgacaatgggtcctaaggtataaactctggtcctgtcttcgagcaggtttgatttcatggtttgagagtctgattgcagtggagattgtgcatgtataattgatattaggtttgggcgagatgcatgcttctttgttgcaattgcttgtgcatatacggaccacaacataaccacatgcattagattattaaaaaggtgtaatgttgtgggccttgtggcatgtatagaacatcatatataggctgtgacagtgaaaatgatgaagggcatgtatggaggcataactgttgttgcttgtagcagtaaaataataataattaaaactagtaatttcatatttcgtaaccgttgtactcagatatctgataattgattggactaaaatttgatgattattgtagtccccttttagcgggttatagaatttttgttatgtgagattgcttttttagttttttatggatctttaacagtacattttgggagttatcatgcaaacaatgttgagctcaatataactatgttgcagggacgcactgttgttattgagcaaagctttggtgctcctaaagttacaaaggatggagttactgttgccaagagcattgaattcagtaacagggttaagaatgttggtgcaagccttgtgaagcaggttgctaatgcgactaacgacactgctggggatggtatggcttaactcttctcatatgctcatatattgcccatcaatcttcttttctggacttgtattaggtttgatgatggattggaattgatctaagtcaccctcatgctgtcttgattaatcatattaatattttccttaattctattgctttgctgatgatgctttgcagagaacattgactacgaggaatgaattatggtatatgctattggttccatttaagcagatgctgattttcacacatttttcagggacaacatgtgctactgttcttacaaaagctatattcgctgagggatgcaagtctgtagcagctggaatgaatgcgatggatttgagacgtggtatctcgatggctgttgatgaagtagtgacaaatttaaaaggcatggccagaatgattagcacatcagaggaaatagcacaggtaactgctgatctgcaatgagttagaaagctgtgtcatgttttttcctctcttctcagttctctctaagacactccatgctttatatattcattattctcttttataggttggtactatatcagctaatggggaaagggaaattggtgagctcattgcaaaagctatggagaaggttggcaaagagggagtcatcactattacggtgagtcaaacactctggacaacttggcatttttgcagcacagttatcccatcaattatacatattgaccacctattttcatcttgaaaagaattggctgaagtttaaatctgtcatagctatgaattagcacttctatactgggtgttatgccatattgctattacacatgtttttttacttttagttttacatatcgagaaacttgtcttttttggttcatacagcacctgtttctttagtcgttcactcatgatatatttgtgttgtctatacaccatgaggaattcctattccttctggcggctagtttctagcatgactagctgtgatggaatacttgctttattttgttgtctcctccgggcatctaatggaatactcttaagtcttttagcaagctctatcaagctatgtatggatgccatgatattttgatctaagattcatgaaatatttgataggatggtaacaccctctacaatgagcttgaagttgtagaaggcatgaaacttgacagaggttatatctctccttacttcattaccaaccaaaagaaccagaaatgtgtaagtatttctgctgatgttaatatacttctttaacagaaattatcttggttgtaatatatttcatctgttacaggaactagacgatccactgatcttgatacatgacaagaaagtgtccaaccttcatgctgtggtgaaagtgttggagttagctctgaaggtattttttattagtgtagctgatattttgttgttatgacctcattttgcaatctaatattctatgcaatctgatggcccataatttctgctaaaacagaagcaaaggcctctgcttattgttgcagaggatgtagaaagtgaagcattgggtactctgattattaacaagcttcgtgcaggcattaaggttggtactgtccctcctttttctttgtgacccccgttgttaatatattatttggtctcattgtgtgtgaaaatgcaggtttgtgcagtcaaagctcctgggtttggggagagcaggaaagccaacttacaggacctcgctatccttactgggggagaagtaagccaatcttttttcctttgcccatttcacatttttgaatcatcatatccagtttgctgaattttgcaccttctattgaactaggtcataactgaagaacttggaatgaaccttgagaattttgagcctcagatgctggggacttgcaagaaggtaaaataatttgtctattgatgaatcactacaaaatataatcatctggcactagaaatgtataaaaaaaacaaaaggtgttataaagtgtacgtgtcaatcttttttaatctgcttaaagttgattgaacatttgaacccatgtttataaactggtaggtttttgggggatttttttttactttttagacttttttatgttttaattttattaatagaccattcccaaaagtatttccaaatctgaaccttttggccacgccagcccgcctggcgtggccaaataactctatcacgccacacgtagcctcttgtcacgccaccactgctgccacgccagcccgtggccaaaaggttcagttttcggaaatatttttttgaaaggtctattaataaaattaaaacataaacaagtctaaaaactaaaaaaaaaattttttttggggctggtggctcaattacaagcatcaccttaaatatgtgcttagttggttgcgtgttgcgttagtcttcttaacttaaaagaactgtaacacgagtgtacaaaatacaggttacagtatctaaggatgacacagtcatccttgatggagctggagataagaaggccattgaagagagagctgagcaggttcattctatgctagtttacttttacatgaagccacgtgtgtctcactaaatttttctaatggtgacaccactgtaaaattctttttccaacagctgagatctgcaattgagctaagcacttctgactatgataaagagaagcttcaggagcggttagcaaagctttctggtggtgttgctgttctaaaggtgaaccttattatctgtacttgaaatttgttattctagaatgccaatgttgtgtcagtggaagtcttgctaatctgaaattgcagtctatttattaattttcaatatttagttaaatgtgtaaaccgggagattgaagtagaagtctttggtaattgcttcgtatttaggttatgtattgatgacaagaaaagtggcggaacattctattactattactgattctagtgactgtcctgagttgtgagcatgggtattatttttttttaaaaaaattggatctttcctttagattggtggagctagtgaagcggaggttggtgagaagaaggatagagtgactgatgcactaaatgctaccaaagctgctgtagaggagggtattgtaccaggtactgtatgtcatcgctgctattttattttctgcagtttactattagcagcatatcaccattgcagagcatcatatctgattctaatttacgtaggtggtggagttgcccttctgtatgcatcaaaagacctggataaattgcagactgcgaactttgaccaaaagattggtgtccagatcattcaaaatgctttgaaggtttacaaatcccattttgttttcaattgttcctctcttgcttgctccatctaatggctggataatgctgcagaccccagtgcacacaattgcttcgaatgcgggtgtagaaggatctgtcattattggcaagcttttggaacaggataatactgatctaggttatgatgctgctaaaggtagtgtcacagagttcatccattcttttgctctgtgggttactaggatctatctaaatcctgttttgctaacccaggtgaatacgttgacatggtgaagtctggtatcattgacccactaaaagttatcagaacagctctggtggatgctgcaaggtactcttcctaatattcattcttatacatcaacatcactcccctctctagggagtaacatgccacacaaatatcgatagtgaaaatgcagctgaagtatctgaaccaaaactattcttcctttaaatttcctgtggcttggtctgcattgtggaaatatcagctttgtcattgtagaatgaacattaaagtcgtagcttccgaagcctattatgttatgattttagttctttcaatactctgatgatgtgcaactccagcttttcttgtatgagacaacatttttactgtctgttctctattgcagtgtgtcctctctaatgactaccacagaatctattattgttgagatccccaaggaagaggaggcagcagccgcagcacccgcaatgggtggcatgggcgggatgggtttctagcttactctccggctcatgcaaagttattgtgtgataaatttattcactagattagattatttttgcggtgcggacatctttaactgatgaggtggctgtcagattttgattctgctgcaagagaattgtaacttgaagtagtagaattgaactttggaatttgggatgcataaaatccttctatataggtggtgcaagttggattttgtgatttgctctgggtttgcctattttcgcttttgctcgagcaatccaagaacagtactacttcgataaatgtgcgagttccctgtgactggtccgtttagaattagtttaatcttaactttcagccacttctaactcaaagcaaagaatgaagctactgtggcaatttttccggattt</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001055473.1 RefSeq:Os03g0143400]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]]
| |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 3]] | |
| − | [[Category:Chromosome 3]]
| |
