|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 3]] |
| − | GeneName = Os03g0239400|
| |
| − | Description = Similar to Transcription factor HBP-1a(C14)|
| |
| − | Version = NM_001056041.1 GI:115451810 GeneID:4332201|
| |
| − | Length = 11523 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os03g0239400, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 3|Chromosome 3]]|
| |
| − | AP = Chromosome 3:7407417..7418939|
| |
| − | CDS = 7407925..7407981,7408248..7408373,7409577..7409654,7409749..7410011,7410532..7410574<br>,7411414..7411465,7411538..7411704,7411968..7412027,7412124..7412207<br>,7412487..7412591,7412673..7412732,7412809..7412865|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008396:7407417..7418939
| |
| − | source=RiceChromosome03
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008396:7407417..7418939
| |
| − | source=RiceChromosome03
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgggaaaaggagaggtagccactaggtccaaatctcaaaaatcatcggcgacacagaatgaacagagtacacccactaatcctcctactgcatatccggactggtctcaatttcaggcatactataatcctgctgggacagctccaatgaccccaccgggctttttccatccaaatgtggctccaagtcctcaggggcacccatatatgtggggtccacagatgatgcctccctatggaacaccgccgccatatgcggcgatgtatgcgcaagggacaccatatcagcaggcacctatgctaccgggttcacacccatacaatccttatcccgggcaatcaccaaatgggacagttcaaactcctacatctgctggcggaacagagacagataagtcaggcaaaagtaagcggaagactcccctgaagagatcgaaaggaagcttaggtaatcttgatgtagttgcaacaaaaaataaaaaggcgcccgcaaaaccttcagcatcctcatccaatgaaggttcttcacacagtgagagcggaagtggaagttcttctgaaggaagcagtacaaattcaaaaagtggttcaaggacaaaggatggttctgagcatggccagggtaatgatgctagcaacaaaggagctactgctcagagttctgcggttgagcccgtacaagcatctactgggccagttgtgcttaaccctatgatgccatactggcctgtccctcctcccatggctggcccagcaactggtgtaaacatgggaatggattactggggtactcctacttcagtacccatgcataataaagttattgcagcaccagcatcagctccttcatcaaactctcgtgatgttgttctcagtgatccagccatacaggatgagcgagaactgaagagacaaaagcggaagcaatcaaatagggaatcagctcgacgttcaagattacgcaagcaggctgaatgggaggaagtagccaatcgagctgatttgctaaagcaggaaaacagctcacttaaggaagaattgaaacaacttcaggagaagtgcaatagcttgacctcagaaaatacaactttacatgaaaagcttaaagagcttgaaggcgagaaatcaaatggaaactggtataaagagtga</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MGKGEVATRSKSQKSSATQNEQSTPTNPPTAYPDWSQFQAYYNP AGTAPMTPPGFFHPNVAPSPQGHPYMWGPQMMPPYGTPPPYAAMYAQGTPYQQAPMLP GSHPYNPYPGQSPNGTVQTPTSAGGTETDKSGKSKRKTPLKRSKGSLGNLDVVATKNK KAPAKPSASSSNEGSSHSESGSGSSSEGSSTNSKSGSRTKDGSEHGQGNDASNKGATA QSSAVEPVQASTGPVVLNPMMPYWPVPPPMAGPATGVNMGMDYWGTPTSVPMHNKVIA APASAPSSNSRDVVLSDPAIQDERELKRQKRKQSNRESARRSRLRKQAEWEEVANRAD LLKQENSSLKEELKQLQEKCNSLTSENTTLHEKLKELEGEKSNGNWYKE</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>10959..11015#10567..10692#9286..9363#8929..9191#8366..8408#7475..7526#7236..7402#6913..6972#6733..6816#6349..6453#6208..6267#6075..6131#gtttttccccttcacaatcagagcgaaatcgagagagagggcggcggcggcgacttcgtgcgcaagagggaggcggcggcgacttcgtgcgcaagagggcgtgccacgggccagcgacgccagtgtcctcccttctccatcctccttcctctcatccctcctcccgccgatccctttcccttctccatcctccttcctctcatccgccgccgcgccggctcgtggctgagctgctcctgcacctcctcctcccagtcccgcgcccgcagctcccgcctctccccccgcttcttccgcctctcccgccctgtcagctccccctcacctccatagccaaggtaaggaaaccctagcagtgtgtaccatctctgatattttgtttataatgctagatctgcgcgattccgtttgcatgatatgaatgtccttgctgtcaacatctgttcaagcacactgcaatattttcgtttatcaattattacacagtagttattttcctgacgtgaacaagtattactatgtgatttgggcaagtattttttgatgagatgatttatgcttgagcatgacatggcaacgtgtttatttttctttgattgttgtattgtagatggataagaggaccaaggttttaatttttgctgcttctgccaatctattgttgtcaatgatggccatgattattcattctaggaaaagaaagatagtttctaggagggaaggtgttaaatatgacccaatggttgaaagggataggatgagaattgagtatctaaacacaaaaatttggaggaacgataacatgcttagacttagaaaagattctttctttcggttttgtaagctctttagaaatcgtggtttgcttgaagataccatccacatgtctattgaggaacaagtaactatgtttctaaatacagcagggcacaatcttagaaatagataagttggcactaattttgataggtccggagaaacagttagttgttatttcaacaagtgcttcatactgttggtgagctgcgagatgaactaatcaggcctccctcattggacaccccaagtaaaattgccgggaaccctaggtgggatccttactttaaggtgtgagattcatctgtgtctcattttcaattttatattttaacaaacctcaatgtcccctgatcttttatggtgttgaatataaaataggattgtatggagctattgatggcacacatattagagcctctgttcagaagaatatcgagccctcttttcgtggtaggaagtctcatgccacgcaaaatgtaatggcaactatagattttgatcttcggttcacttatgtcttggttggttgggagggtatagcacatgatgctgtagttttaagagatgcattggaacgtgaaaatggccttataccccaaggtaatagattaatttagttcatcaatttctccatctcaatagaaatgtgaccaacttgtccatcatatgataggaaaattctacctagttgatgctggatatggagccaaaccaggattcctccctccatttgtccggtaccacttgaatgagtgggggaataatccggtgcaaaatgaggagttgttcaactttaggcactcgtcccttcgtgtcacagttgaacgtgcatttggggcactaaagaggaggttcaaaattctagatgatgccaccccattctttccttgtccaactcaagtagatattgttgtagcttgttgcattattcataattgggtcatgaatgatggaattgatcagtatattacagatccattagatttgataagtgaacccacaaaagagtcatttgggtaggcaacagagccatctacgtttaaaaagtttggctagttgcattcttcgatggtgtctgtcccataaaggatgggtgctaagtttataaattttcttaggcataattaaattcccacaaattggataaattgaagtcatatgtccactgtcacccagacgattaaaccactcaagcattcatacaagtaaaaacaaatattaagtattgtaatgacgacgttttctgaagtgatagtagcatcaaacggatatgcatcaaaagaaaaccaacataagaaagataggaggcacataaaaaatgccaaacccacggatcctccacagcaattccatattctaaatcctcaaatcgcgccacggggacatcgagcagatctacccagaaccctcgccggcttagaattcacgaccggattcggattccaccgcccgcacgagcgaaaaaaaagaccagaaacaaatcgagagcttaagtcacacggtttactgggagggagggaggtcgaggcgctcgcgacggatctccactccacgccaatccagcagaggctgggcggcggcgagaggggaagcgcctcgaggtggcgccgcttgctccagcgggaggctgcccccgggttggggagcacttggatttgcgaaatttgggggaggtgtggcgagggagggagggaggtagaggcgctcgcgatggatcttcactctgcgccaatccaacagaggcggggcgacgacgagaggggaagcgccccgaggcggcgccgcttgctccagcgggaggctgcccccaggttggggagcacttggatttgcgaaatttgggggaggcatggcgcatgagaaagagagaggagaggaaaaaagttggtctaaaggcgtactccaatcacgagttcacgtagtccggaaggtgacctcctgagagagagggcgaataaaaaaacaagaagaagagcagctaagacaagtgtgtggtttgttggttgtgtgtgggcctggagaaaaagaatgcctggcccattacagaccgattccgcttccggctacagtaccatactaccatgtgctccaattggcacaatactaagctttttctttgcaattaaaaaaggacaactttttaaatccaaaattttcacatttaaaaattttggatttacgaatagatctaagtatatattttttagtttactttatcaaacaacgaaagtgatgaacccctacatacccctacaaataattaatttttaaaaaggcatgtttagtttcaagtcacctgaaaatacataaatctcggtcttttttagaccgtcaagatttcatccaaattcatgtggactttttctctcccccttatatcttctcttctatcgaaaggatggatgcacacaagcacggaacttatgtttggtttggggacctggtgggatgggttaggtccattaagggggagagaaaaagtccacatgaatttggatgaaatcttgacggtataaaaaagactgagatttgtgtattttcaagtgacttgaaactaaacatgcctttttaaaaattaataatttgtaggggtatgtaggggttcttcatcactttcgctgttcgcttaagtaaactaataaaaatatacagagctattcgtaaatccaaaatttttaaatgtgaaaattttggttttaaaaagttgtcatttttaattgcaaagagaaagcttctatactgtgccaatcggagcacatggtagtatggtactgtaaccagaagcgggctcgggctttaatgggttgggcatttttttctccaggcccacacaaccaacaaaccacacacttgtcttagccgctcttcttctttttttttattcaccctctctcaggaggtcaccttcccgacgacgtgaactcgtgatttgagtgtgccttcagaccaatttttttcctctctctctttctcatgcgccacgcctcccccgaatttcccaaatccaagcgctccccaacctgggggcagcctcccgctggagcaagcggccgcctcagggcacttcccctctcaccgccgccccgctctgctggattggcgcggagcagagatccatcgtgagcgcctctacctccctccctcccagtaagccgtgtgacttaagcttctagtcttcttttcgcccgcgcgggcggtggaatccgaatccagtcgcgagttctgagccggcgagggtgctgggtagatctactcagtgtccccgtgacgcgatttgaggatttagaatgtggaattgccgtggaggatccgtgggtttggcgcttttttttttgcctcctgtctttcttatgttgtttttttttctgatgcatatctgtttgatgctacatcacttcagaaaacgtcgtcattacaatacttaatatttgtttttccttgtacgaatgcctcagtggtgtaatcacgtgggcgacggtggaaatcaatttatccagtttgtgggaatttaattatgcctgagaaaatttataaactaagcacccatcctttatgggacagacaccatcgaagaatgtaactagccaaactttttaaacgtagatcaccaatacggacacaagtattttgattaccacttaagtttactacggagtaccatgttactggaaaactactgttagagaagtgtgtcggaaaccgtgtcaaaatctgagataccattattcatgcatatggaaaataattatggagtggccaaacccctaatgctggggttcagtcccgtgtcatggctagttggctacacggtcctgtgctcccaccactaaaaactaagcccagttctgctggcatacagatagactcatcctataaactcttaatcaactgaaatatttctacacctggctgcctgaaggttttagtggattgtcgtcaagcatgaaatatctatttcttgataatttgtgtggtgcattaaagcagcacgcattccttacctaaatgcctttttgttgacacaaaagcatccctgattgcaatacgtgaatagccatagcctttttacaacaaaggcactaattatctaattctaatagagtattgtccaactggggcataaagatttaactaagtaataagaatgcttgtgatatgtttttctagcagtctttttttttctttccttttattttctaggaaaaacaggagcataatatgaagcaaaagcattgatccttgtgttaacagctactattaataatagctaatgacaaacaccttaatgcgaggtgcatcttgcctgacgtgttggatgaggatgacgccataagttgctgcttaaaagaacctccatcgtcaattctacccgcatttacttgacatcagcggacagcttgaaattaattaggagtctgattaaaagttaaactactgaagagtttgacaaaatatgctcttaaaattcaccatcttgggggtccttatagaattctgtacctgccaacactcaaggttttaaaagttaaaaagtaaaaatatgtcaaacatggattctcatatcggtaccgtgtgaaacagcccatcgtaattgatggccacgtaattgtgatatgcgcataacgctatcatctgtttgagcactcatggtactatcatatatttgatacacatatctaacttgtctctctcttgtagtcagcttgctgtttagaatattttgattagcattcctttccttgttttattagacaaaagttattaatacaccgtctgatcttcctttgtacttttgttccacagtgctagccaataagaaaattttctgccgcatccatgatacttagagactccactgcttcattgaccaagaaaatatagaagatcaaaggtgtcttgtaggtaggaagcttctgccggttgtttatatattcatcgtttcacctgataattttttttccatgtttgttgggttccgagtgtttttctgcacttgtgtattattctatgctctgataatgattaatagtcatctctcctttcaaaattattttatccatgacacaatttgtttgcttgctgaaatccttttatttttcacttccttaaaggcaaggaagatctaatttaagcgtttcggaaaacattattttaaaaaccattgagacacatgattaatgatcacttcataaatttgtcttattttcagaacttaggtgttaaaaggaatagagtaatctagggaggaataaagcatgggaaaaggagaggtagccactaggtccaaatctcaaaaatcatcggcgacacaggtatgtacaacaatctgaaactacaagactaattactaattagtgaaattctcttaccttgttttgcttgttttagaatgaacagagtacacccactaatcctcctactgcatatccggactggtctcaatttcaggttcataaaatgagttcatcttgcatccatttaactttttccactatattgtttactgtactggttagtatcaatctgtaggcatactataatcctgctgggacagctccaatgaccccaccgggctttttccatccaaatgtggctccaagtcctcaggggcacccatatatgtggggtccacaggtacattcacattaatttcttgctatagatgcagtgttctggtcataccactaccatttctgctgttttatcagaattatgtctagataagtctaagcatgagtgataataagcaaatggtagcatggacctttccgctgcattcatttgagttacccagtccttttaacctttggccttagggttttggtagtttttcttttgtatgaaggatgctgttagctactctgaagctatggaaaatcagttttaacatgtgatgtgaattgctcgtgtcagatgatgcctccctatggaacaccgccgccatatgcggcgatgtatgcgcaagggacaccatatcagcaggcacctatgctaccggtactcactcttacattttacttaatgaaatagtttttgtcatgttatgtgaatagctcttaccaaagaatttcattctaattgtctctataccagggttcacacccatacaatccttatcccgggcaatcaccaaatgggacagttcaaactcctgtaagttcttgggcatcttttatctgctctgtagttgtagaaggcaagaagaatttcatctaatcttttttttttgcttccctgggtcttttagttgtgtccgtttattccagtttcagtgatcttgctgtcaaaattgttgcttatgctatcataatttagctacattttcatgtaaaaattaattggtttgatttgcacctttatttcattacctgtctacttagattagatatgattgtggttgaaaatcatgttgttagacatctgctggcggaacagagacagataagtcaggcaaaagtaagcggaagactcccctgaagagatcgaaaggaagcttaggtaatcttgatgtagttgcaacaaaaaataaaaaggcgcccgcaaaaccttcagcatcctcatccaatgaaggttcttcacacaggtagctccttttcttctgtctctgtgattataatggataaacgctgacttttttttaacatatgatatgcagtgagagcggaagtggaagttcttctgaaggaagcagtacaaattcaaaaagtgtatgtcactctatcataccgctttgttatgttacttcagttacttcatttttctcaccagtacaaattccaaaggcagcatgccttttgttttaccactctggcatcccccccccctactgaaggtcttgtttgtcatgcgcaatatctagagtctaagcctttgtattattgcttacggcacctgtactgaactggtacactatttagaggtgcaagttagttgggtactagggttgcacactggctctgcatattggccatcagaaacccacctagactagttgggttgtacttctcttcaaggttctggatgtttgcaaaataaagatctgcaaagtgcaaatcttgtaataagaggatcccaactgataatgaaacagtctgatttttggtgatactaaaaaaaaatcgaatggtgagcccttctattaaagttcttgaccattcgcatagtcgttagttattagactcgagttgattattctttgctctcgccacatgtgttgtaccctttaataattagtgttgatcgattgttctgaaacccttaggaacttgttttccccaccaaatacttatagtatgtggatcttttttttttttgaaagaatggatcttttttttttgttgcatgcatgtttggtacctttttgtgctgggtgtatccatggttgccactactttcaaaatgcactatagccttctagcctgtgaacaaagtatatggatgcactcaatcctctatgtttttttttttttcctttttgctccttttgcttcatacgatcattttcttgctaacctaagacaaatatgtacaaacaatttgcttgcagggttcaaggacaaaggatggttctgagcatggccagggtaatggtaggattaagaacctctcttttttttatataaaacagtagaattttcaaggaaaatctgtagctcataaaagattctgcaaaaactcatgaatattatagtggtgcaggaggcatgcctgaaaaacattttccgtgttgaaaacacatatggcaaaaatcactgtttagacacaaggtttttaagaaagcaagggcgaggaagtaccatatgcaatcatcatccgttggcatattgggtgtgggtttagatttggattcaaagtggcatatttggtacaagcaaaattttgatgacatattaggaaccgacgaaatttccagtggtatattaggggtttactcctagtatagtactgaacatattctacaacctgccattggtagctttattgaagaataaaattgtgaaactatgcttgtttttgttataagcaattaataaatatattagttaagacaataagaaatttttctcatgtagtaaggattgactgcaatctaattacctttttgtccagatgctagcaacaaaggagctactgctcagagttctgcggttgagcccgtacaagcatctactgggccagttgtgcttaaccctatgatgccatactggcctgtccctcctcccatggctggcccagcaactggtgtaaacatgggaatggattactggggtactcctacttcagtacccatgcataataaagttattgcagcaccagcatcagctccttcatcaaactctcgtgatgttgttctcagtgatccagccatacaggtttattgctgtgcaggatttgtttcttgtttttgctgtgttacaggaaccaaccttgcaatttccttagggctgtattttatttttaatgcaggatgagcgagaactgaagagacaaaagcggaagcaatcaaatagggaatcagctcgacgttcaagattacgcaagcaggtctgtagtttctgcaccagtctgcatggatttggctgtcgtttgctgttcttattatctttgggtagtctgtgtttctgtaaacaactaatccataagaggccaacttggattcaacctaatcagcagtgaattttgataaggttgaacctatttgaattgaccgcagacgggaataatacttaaatatacatagcctgtatggcatgcatgcgcgcatgcacgctatgctagagcccaggatattgatggtgctttaaatgaattttcttttatggatggtttgaccagaatctgaactgaacaatatgtttgaagatattagcttggcagtccattggatcataattcaaagctgattttgaattgtagaggattttcattactcattacccagctctcttttcatgattgctaaagacaagtaaaaaattacccaaattattcttaaaacatcaaactttgaaattcaaactgcttaggattacaacccaattgttgttgaaccagtaccttattagtcgagtgagtataatttaccgcacttcaatgacaatccagtgagtcgcaaaattggcaactacatttttgactggtgtagagagatgttttctaacttcttgagatacatctttaaaatacacactatatttgttttaaaagtcatggatatataagcaagcatgggaaacaacctcccaatacaatattaggttgactgcagatattcttgatcaattctcttttggtgatataagggtggattggttctttttcttcttttttttttttggttctcggcttctcgcatacatatcattgtccatttgttaacttaagaatgtatggttcgtcttagggttctcagcttgttgtatcactagtatactccctccgttttcctatatgatgttgtttcgttcatttttgaactaaccaacagcatataaaaaaaaatggggggagtattttttttgaggagtccattactagtgtactattttatcaaccgtatctccttttactgctatgggtagtcaaactgttgcaggtgctggttacacctagttattccaatgctggatgtatatgaccagggttaaataagcaatgcaatgttatttttgcggtatttttttttataaatttactattaaccttccttttgatgatatatatgttgtaacaaatgaaatactacaggctgaatgggaggaagtagccaatcgagctgatttgctaaagcaggaaaacagctcacttaaggaagaattgaaacaacttcaggagaagtgcaatagcttgacctcagaaaatacaactttacatgtaagatttgtgttcttctgttgtcctacacttcccataatgtgcagtagacaatagttactatttttagtttgctgcaaataagaaagtggatcaagggcaaaacatactaggggattacccaatcctcacaggctgttacttccaacgcattggttcactgataactacccctgaagtcctgaacccatcttcttttagacgtttggagttaacatttcattctttactttgaaatttatttgaggcatttttaatgattgtaggaaaagcttaaagagcttgaaggcgagaaatcaaatggaaactggtataaagagtgaaaagctgtaacttatcactttctgacttctgatgtaaggaataattacttggagctaccattgctattacagagtacatattcttaaaattttgttgtaactttcttgaattttcagataaattggaggcgacatggtaggtccgataattaggaggtattcatgtatgctattagatttttggccgagaggtagaattgtatcataggatttgacatgatggctacagattcttcttccagttgccgcggctgctgtactctatgcttttttttttctgcacttgtgtaagattctacgaagtaccatgtaaaagtccccaagtgatgtttgaaactctgggggttagcttctgagatagttgatgtagagctgctcattgagcgtctttacctgaattgatgtgtgtcacagttatagtttgtgacttatcattcagataattagaggcacaaatttgtataatgtactaacgggtcgtgataaggaaattttgttgcattttgct</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001056041.1 RefSeq:Os03g0239400]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 3]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 3]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
