Difference between revisions of "Os03g0624000"

From RiceWiki
Jump to: navigation, search
(Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os03g0624000| Description = Similar to CDPK substrate protein 1| Version = NM_001186618.1 GI:297722366 GeneID:9269134| Length = 10368 bp| Defin...")
 
 
(One intermediate revision by one other user not shown)
Line 1: Line 1:
{{JaponicaGene|
+
Please input one-sentence summary here.
GeneName = Os03g0624000|
 
Description = Similar to CDPK substrate protein 1|
 
Version = NM_001186618.1 GI:297722366 GeneID:9269134|
 
Length = 10368 bp|
 
Definition = Oryza sativa Japonica Group Os03g0624000, complete gene.|
 
Source = Oryza sativa Japonica Group
 
  
  ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
+
==Annotated Information==
            Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
+
===Function===
            Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
+
Please input function information here.
            clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
+
 
|
+
===Expression===
Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 3|Chromosome 3]]|
+
Please input expression information here.
AP = Chromosome 3:24454699..24465066|
+
 
CDS = 24454699..24455113,24455686..24455766,24456011..24456079,24456408..24456513,24462918..24463083<br>,24464227..24464765,24465051..24465066|
+
===Evolution===
GCID = <gbrowseImage1>
+
Please input evolution information here.
name=NC_008396:24454699..24465066
+
 
source=RiceChromosome03
+
You can also add sub-section(s) at will.
preset=GeneLocation
+
 
</gbrowseImage1>|
+
==Labs working on this gene==
GSID = <gbrowseImage2>
+
Please input related labs here.
name=NC_008396:24454699..24465066
+
 
source=RiceChromosome03
+
==References==
preset=GeneLocation
+
Please input cited references here.
</gbrowseImage2>|
+
 
CDNA = <cdnaseq>atggcgactactgctgccaccgcgccggatctgtcactccacataagcccgccttcgccgccggacatggccgccggcggcgagacgatggagcagttggctgagccaaagctgtgcctagggtttggcacggcggcggcggcggcggcggagcagtacaacaatggcggctgcaacctccagcagcagcagcggctgcaccaacctagccagatccagagattcaagaagagcgccagcggcggcagccctgtgtgctccggcggcgccaccggcaccggcggcgttgcggcggcgagatccgggaatggcggtggaggtgggaagaggagctctagggcgccgaggatgcgatggacgacggctctccatgcgcactttgtgcaagccgtcgagcttcttggaggccatgaaagagcgacaccaaagtcagtattggagttgatgaacgtgaaagatctcacgctggctcatgtgaagagtcacctgcaggcaacttatttgcttgacctggtgcagatgtatagaacagtgaagggaaccacagacagaacatgtgctgaaggccatgggcagatgagagatatgggctttctgaggagaggaggtggtggagtggatggctttgacgtgcttggtaacacctcttcaattgcaatcgccaatattagaaggcaggcagcagggtcgccgggtgagcatcatcaagagacgatgatgagcagcgcctggtgccagccgcagttcgcccagcagcaaaccactgcttgtgggctgccgctgccttgcccctacatcgtgtccactcaccactacctcatcaaacaaaaccagctgggaggttggaggggatcatcagggcagcagctggcggtacagcaagatgctgcagcccatagcagcctagggatcaagaacatgggacaacaacgtctgcctgctgctgctgctgcggctgcaggcaaccatgatgatgagattgtagtagtcgccagcaggattggacgacgatcgtcgggtactgcaggctttgctaggtcgtcgcctcctgcagcttcaggctgctggacgccgacgacgacgacgtggtcgccgccgccgccgctgacaccgcagaccacgtcgacgacgacgacgatgaggggcagcagcgtcgtcgtcgccgcagcagcgcaggcgtgcatgaagcagcagcagcagcagcagacgccatcgagggtgccaagcctggagatcagcctcgggaggcaggggtggcaaagcggcagcagcttggagcagcagcagcagcatcagcagcgtcatcatcagcagcagcagcggcagcgcagcgtggagtcctcggcgtccaaagaactaacgctactaaagtgctttgcatgcatggcttga</cdnaseq>|
+
==Structured Information==
AA = <aaseq>MATTAATAPDLSLHISPPSPPDMAAGGETMEQLAEPKLCLGFGT                    AAAAAAEQYNNGGCNLQQQQRLHQPSQIQRFKKSASGGSPVCSGGATGTGGVAAARSG                    NGGGGGKRSSRAPRMRWTTALHAHFVQAVELLGGHERATPKSVLELMNVKDLTLAHVK                    SHLQATYLLDLVQMYRTVKGTTDRTCAEGHGQMRDMGFLRRGGGGVDGFDVLGNTSSI                    AIANIRRQAAGSPGEHHQETMMSSAWCQPQFAQQQTTACGLPLPCPYIVSTHHYLIKQ                    NQLGGWRGSSGQQLAVQQDAAAHSSLGIKNMGQQRLPAAAAAAAGNHDDEIVVVASRI                    GRRSSGTAGFARSSPPAASGCWTPTTTTWSPPPPLTPQTTSTTTTMRGSSVVVAAAAQ                    ACMKQQQQQQTPSRVPSLEISLGRQGWQSGSSLEQQQQHQQRHHQQQQRQRSVESSAS                    KELTLLKCFACMA</aaseq>|
+
    [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 3]]
DNA = <dnaseqindica>1..415#988..1068#1313..1381#1710..1815#8220..8385#9529..10067#10353..10368#atggcgactactgctgccaccgcgccggatctgtcactccacataagcccgccttcgccgccggacatggccgccggcggcgagacgatggagcagttggctgagccaaagctgtgcctagggtttggcacggcggcggcggcggcggcggagcagtacaacaatggcggctgcaacctccagcagcagcagcggctgcaccaacctagccagatccagagattcaagaagagcgccagcggcggcagccctgtgtgctccggcggcgccaccggcaccggcggcgttgcggcggcgagatccgggaatggcggtggaggtgggaagaggagctctagggcgccgaggatgcgatggacgacggctctccatgcgcactttgtgcaagccgtcgagcttcttggaggccatgaaagtaggttcatatgcatgcatatatactatgcacatacagatcatacagccttggatgtaattaattagttaattaatgctttgcttgcttcttcttcttgttcgattgttccttttgctgtttgacctttttcaattcacatgactgttcttggactagttgaagtttttgcacaatcacatgagacaagggaattgtgtctattcaatatatacacctgcaacttgagtttctcgcgtgttcttgtattaactttcttttttgttcttgtatgaatttcagaggagtcaaattgactttttccccccttagctgttccaatataatgcatcgattgtttgcaatcttgtgactccatttgtagttttcccgtttactttttgaaagcattgttgttcgaagagttttttttttctaatccaatccagtatttgctatcatggtttccttgttgttttgaaattttctcttattcatgtgtaccatatactacggatttaacaagttcgatcgttcattatgaaaaaaaaaatgttgtaaaatgaagctattaattttcactatgtttctaggagcgacaccaaagtcagtattggagttgatgaacgtgaaagatctcacgctggctcatgtgaagagtcacctgcaggcaagtagatctctcactctagtccatatcaacattcaagagaataaaacaatgtaactaaagtatgtataattgtataataataaatttttttatcgattagctctcttttcttttttatttttggtctctctcgctataacattttgcatcttaagacacactagtatgattaactgcaaaagtaaaccaaatggaacacgcgcgaggtctagtctattctctctttttgcctttgttttacttagcttatttgcttgacctggtgcagatgtatagaacagtgaagggaaccacagacagaacatgtgctgaaggtaaaacaaggcctagaaaataataacttcttcttttccagagacatattttcttgcctgagttgatcattcagtaaggtcaaatcacataatgctagctgaattattggcatgggatgtgtgtatggttttgctaggaatgtcccataaagctagcaaagcatgcagtctagctagcactgtatatattgggtagtaccgtttatatatatgattttagtggaggcatatatatatcatatactgaactgttccatccataaccaaaaacacataatttttgcatatgaattagttggtcagacatgcatctatgtggtgcctgcaggccatgggcagatgagagatatgggctttctgaggagaggaggtggtggagtggatggctttgacgtgcttggtaacacctcttcaattgcaatcgccaatattaggttagtatactccacattatatctggtcgattaattaattattgtagcacactaatattgcgcaatgaatgaaataaaagtatcagctagggtttcccttttcttttacacatcagggttgtttctaaccttaatttgattcttccttttttttttgcataatcggcatttgtattataaaaaaattatattgtacgttgtggctgcaaatctctgcgtcttccatttttctccatttgatgcatgttttgttggatttgagcatcttctgtgcatgcaattaaacagatatgtctttatatacatcaatgcatgcttgcaagtatgtggggcagttaaattgcatggcagaaaattttggagctatttgaatgtacatcataattaaactcatgtgccggatctattagatcgactcataattgtctttcgatactaatttgtacaatgctcatgttaactttctctatatcaaattaattatgtgaaggggtacggtttgcatgaaacgacgttttaatttccatttatggtttatggttatacatataattaattgataacatttaattaatagggccttcaatctcaaggatgcaaatatataagtcacattaattaaaaaatcaatattattaatatgtttcgatgttcacatattgtcagaatgtgcaagtttaacagttatattgtcttactatttggcatcgttacttaattaaacttgatattcgacactacattagcaattcccttttcattaacatgaccagggatgcatctaaaatattaataagactgcagccggtttgtgtcgcagaagtactcctgttttgatatgattgttattaattaaatatcctcagtagcgcatttagagagtagatctagtactcctacttgattttcagacacttaacgcatcatttcaatcaggttttgtcctgtgtagaagtacaagttaacaaattatcattaaacgttcagagaatgtacgacagattcaaattaatggatttttagtacaaattaacaacggtccgttcatatatactccagaaaattaggaatgcaaaaaatgaggggatcatcatatcaaacattgtgtgtaatgcatattatccacaaatacacatggtatttgtcatatggatatttgtatggatgaattaagtagatgggagtgattctgaaggattttataattaagaagctgatctgagaaagctacgaacaggaaaattgtgtatattatatatcattattaatatgttccataaagtataaacatattaaattgtattttacattttaaattttttaaaagaacttggggtcgaataattaacaaatattttctgcaagaatcttatgtattttatctaaaggaaggaattctcatatatttatatattgattttttccaaaaaaaacctgttattttggaggaaaaacaagtttcctaaaacaattagtttttacccatgtttttcaaaagcttgttttctcaagaactaccacatgagatgtttgctagcattttacccacgggaaataattattaacaacattattacaaaattaaatatcggttacgtgcaggggcggagctacatgtgcatggggtgcaggaacctagctcagacatttttttagctataatttatctattttcactatatatgcaccttctaaattaaaacttacatactcgttccagtctaaacttgatcttgtcccaatatatagagggtaaagcaagcgattgaaaccctctccatttgattctagcttcacatctggttatgtgtatatcgatctaggatacttaatttcacgcctagaatatacatcaggctggtgaacatttatcaaatacttcaattgacctactatatatgttatatctaggatgactggctgtgaacttaattacagtaacttacttaggcatatgtaaaaaataagtgaagtattcgtgtattattgtgcagattaagatattggtcaaattcatgaatctatatttatttacacatgataaaactttttcctcccattattagtttgggtagtgtgaggttttgagaggatttgctatgacgtgtaactgtatctacaagccttaatttcatacctatgatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatagacacacacacacaagggttgtactttaataaactaaagtttaaaaaaaacacacttttataacccttgtataattgtacgtgtatgatcttagaataactgtactacttaggcctatgtaatagaataaatgaattttatcgcattattattcatatttaagacattactttttgagcaattttacagtccttgaggggtaacatgaggcaccattttttctattgcaaatttggtatctctttatatctagatactatgaggtactaaattttatactaaatttttagtatcttatggtacatccttaaggaccgtagaatgctcttactttttaggtatggtttcatgggttatcactcatttgatggtttcctcgcatactattcccctttcttatatataataacaacttattttctctcattagttttgtgtggtgcggtgtgataggttttggaagggtgcggttgcagtagtgtaccccattgtcaatcctaggatttgatccctggaccaatatttggttatcggtcgtccttttcgacacaatgggaattgagtgctaacaacttctattggctgtcatgcatatttcccttcacttatgcatgaatacatatatctcccagagaacaaggtggctagctatagctaagggtgacaaatcctgcatactgtctgatgtagtagtactactactacagccatgcatatactgtccttctctcgtgattcaaactctcatgcatgacacatcctctggtgtatgctcagcatgcacacagggatagagccatctatcagacgactattatcacatatgctacccagggtggacatggcctgggctgggggacattgattaatgtctttaaaggaaaagtaatgcctactagtagctatcattaatgtttgcaaaaaagaaataaaaattgtactggctgctggaagaaaggtcatgatgcatggcaagactttcttctggcctccccctcttctccttgcttgcagtactgcagttttgttgcagctacagtagctgatctattctctctgaggtcccaatattaagcatgcacagagctactccctttataaaaaaaactcaatttagaagagattatattggctctcaattgagtttttcctgaacggaaggagcagaagtctagccaccataccacgtacggaccgggagtgtagctagctagggtttctctctatatatttttttctctcgctcacttgccgagaaagggggcgcgtttggtcttgtgtgtttctccgtctcttttttgttaatccgcattgcattgcatcttgccgttgtataaatctggtccatacattctgtctgtctagacccgtgttttcttctaggttaagttttttttttatggatggagtagaagtatagcagctgtaggtacgtagcagtggcagcagggatatatgcagcagatagctgagagagggctgcatatatgccttagttgttgctcttgtgatgattcattgatttccatggccagatccatatcaattgtccccctgcacccatgcatcagggctagtggtggccggaatcttggcgtaaaacaagtagaagatgacaagccgctgctgcagctcagcttgcttgcttgcttctgcgccctgcgatcgactacatttccatccatccatccatccatcccttgccttgaccgagcagcccagaaagcctgccatgcacacagcgacctctaattagcgcatgtagtactaagaaaatatttttaaaattttctctaggaaaattaaggggctgttatgtggctcaaaatttgatggccacgcttgtggcaaactttgactaagaaaagggtttatgactagtgggaccaaaagagtagaaagtgtggcataccaaagttatagaaacaaaccaaacactagccacatttggtcaaactaacatacctcaagtgtggcaaaatgtggcaccaaccaaacaggcctaagaagatcggttagttatgagataattaattagttgtgtgattggtaagaaaagaaaacggatgtagaaattaagtcagagatgattacagtttagttagttatatttgaaataaattttaaacgctacaagttactcctctatggccatgtttagttctttggctaaaaactttttaaagtatacggacacatatttaaaatattaaacgtaacaaaataaattacagattccacctgtaaactgcgagatgaatttattaaacctaattaatctatcattagcaaatatatactgtagcatcatatcgttatgatatcatggcgtaattaggctcaaaatattcgtctcgcaatttacatgcaaactgtgcatttggtttttttttcgtctacatttaatactccatgcatgtgtcaaacatttgatatgatatttttaccaaaattttttttatctaattaaacactccctatatatattttgtggccatgtaggagatctattacttaggccctgtttagttcacaccaaacttcctccagctcccaactttccatcacatcacatcacatccaaaactttcctacacacataaactcttaacttttttttttcaaaataccaactttctctaaacttctccctaatttcagaaactaaacttcttcctaattttagatactaaacacagctttagctagtggcgagcatggacaagccaacttggcagcagctagctagctgtagctagcaaacattgcattaacagcacaacgacgacactgtcactgctgctgctaatgccgggctctttgtgcctttgctctcgtgtctctcgatctctgacgatgatgcgttgattgcgtacacaagcgacgacaatgtatgagagcgagcgagatcctctctctgggctctggcctagcttgccaggcgagacggagttaattccttctgtgccgctgtgtacgtacagtatgtacgtacgtgtgagtgtgctagctagctagctgctgctgcatgcatctttgtttgtgtgatgagttgtaatctctgatggttttaactgtttctctgcacgttgtattcattgtgtctgctgctcttgtctgacccccggcctgcgtacgtgtacgtatgtatatacagtatgtatgtatctacgattctacgtcacgtgatccgctacgtatatatctctgtacatgcatatgtactacagtacgtatatcttgctatcatcagatgtacactgcagtctgcaggcatattttctcgtctagttcttttaattccagctgcttcttttgcgcacacacacacacacacacatatatatatatatatatatatatatatatgctagtactacctccggtcatttttaatttattgtcgttttggacatatgtcttagcttgttttctttctaatttggttgtcctaaatattaattcttaattaatacaaagcacaccccaagtcttctgttgtgtagttattagccaaaaaaaaatacgctacatgcagaatgctcccaccatccaaatttatgaaagttttaactaataattaaactataacaatatgcatgtttactgttacgcatgtgatattaagatatattcgtacatattcgagttttatttatattacgtaaattttgtagttgctgataatatattatagaaaaataatacaatgtagtccatgtaaaacaaattttacgtcctatattttagagacggaagtagtgttacagatgtgtaaaaggaaaaaactagctgggagtgtggagcgctagatcgatggggtgtgtggggtcaggctgtgttcgagaggaggggaacgcaaaataaagctcgtattattgcataattagttaagtattaactattttttaaaaaaatagattaatatgtttttaaaagttttttttttgcataaattgtaccgtttagcagtttgaaaaacgtgcgcacaaaaaacgagagaggtgggttgggaaaatgggggaaggaacacagccgcctagctaccgagctgtctgttagaattcctaattaacaaatttaatttgattgatgaaatgtatcacctgttagcgaagaaaattaactgagagccggagtatgatgcaatattaatttatttgtgttgttttattgcagaaggcaggcagcagggtcgccgggtgagcatcatcaagagacgatgatgagcagcgcctggtgccagccgcagttcgcccagcagcaaaccactgcttgtgggctgccgctgccttgcccctacatcgtgtccactcaccactacctcatcaaacaaaaccagctggtatatgcatataattgatcatacattcacatccgtgcttgccgttggtctctacgtatatacagctatataaaggccggttagattgatttagattatcagaaaagtaatgcatatttaatttgcccattatctaagctaaccaccacaaaatataagtaggtttactttatcactgctattttattaatttggtgaaaacaggtgattcaataatcaataattcatactttcataggggtgtctggtttactaccaaatttgtcaaactccgttagcctattattgtttgtttcgttgccacagttaaatcaggccatagtacgttttattttaatctagaggcccacacgtcatacactctttttttaaaaaaattcacatcttgtctaaggtattgccatcaattagcaacacatttgggtggcaatcatgtctggcaatttctggggtgaaataaacatgaccttaaactctagcttaattcctggctttcctccttttgaccttttttttattttctctttcctgtattttggatcatatttttcaatcaatctttaaattaccacacttccagatcccccttatgttttccccttaaaaataattaactaaaactcaataggagtgttattctcattgatgtgtccccacaaaactaaaaattaagtgcatgatggtcacatgcatttatatggatcacatcctgcacattaatgggttttctctgtatacagcgctaggtgtggggatatagaggtttaattaggggagtaattgatatttgcagtgttggggactacaaacagcatattttcaatgtccctgcaggctgtacgtaccttactccagctagctagcactgtaccctctgccatatatacgtgccaaatatttttgcctttggaccggttaattactgtactcgctcctgattgaatgcatgtccaaacagtagtatatactgtatattgcagagcttgtcctgcctcgatgataaatcggccaggtcttcagatgtgtacagtttaatgccgttaattactactcatcatcgatctgcattacatgttgacatggatatgtgtatatatattaattgtgagttttaattaattaatcatgtaaaagatgatgcagggaggttggaggggatcatcagggcagcagctggcggtacagcaagatgctgcagcccatagcagcctagggatcaagaacatgggacaacaacgtctgcctgctgctgctgctgcggctgcaggcaaccatgatgatgagattgtagtagtcgccagcaggattggacgacgatcgtcgggtactgcaggctttgctaggtcgtcgcctcctgcagcttcaggctgctggacgccgacgacgacgacgtggtcgccgccgccgccgctgacaccgcagaccacgtcgacgacgacgacgatgaggggcagcagcgtcgtcgtcgccgcagcagcgcaggcgtgcatgaagcagcagcagcagcagcagacgccatcgagggtgccaagcctggagatcagcctcgggaggcaggggtggcaaagcggcagcagcttggagcagcagcagcagcatcagcagcgtcatcatcagcagcagcagcggcagcgcagcgtggagtcctcggcgtccaaagaactaacgctactaaagtgcttgtgagataattaattaagtaaattgagtttatagtagagtatgtttagcaagtagtagtagtttaagtagtggttaattagttattaatctcaacaagcagaattaatcgaagtgtaacaaaaattaatggccgatccccaagcctgctgctggctagcttaatttcaacaaatatgagggcggatgctagctagattaattcttggctagcttaattaatgtttttgttctgtcttctctgctggttgcttttcatattttccaactttattttttctttctagtgcatgcatggcttga</dnaseqindica>|
 
Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001186618.1 RefSeq:Os03g0624000]|
 
}}
 
[[Category:Genes]]
 
[[Category:Japonica mRNA]]
 
[[Category:Oryza Sativa Japonica Group]]
 
[[Category:Japonica Genes]]
 
[[Category:Japonica Chromosome 3]]
 
[[Category:Chromosome 3]]
 

Latest revision as of 07:24, 14 May 2015

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information