|
|
| (One intermediate revision by one other user not shown) |
| Line 1: |
Line 1: |
| − | {{JaponicaGene|
| + | Please input one-sentence summary here. |
| − | GeneName = Os04g0151800|
| |
| − | Description = Argonaute and Dicer protein, PAZ domain containing protein|
| |
| − | Version = NM_001058650.2 GI:297602120 GeneID:4335025|
| |
| − | Length = 7501 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os04g0151800, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| | | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| + | ==Annotated Information== |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| + | ===Function=== |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| + | Please input function information here. |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| + | |
| − | |
| + | ===Expression=== |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 4|Chromosome 4]]|
| + | Please input expression information here. |
| − | AP = Chromosome 4:3546999..3554499|
| + | |
| − | CDS = 3547322..3547497,3547595..3547626,3547710..3547804,3547904..3547977,3548078..3548189<br>,3548427..3548490,3548619..3548684,3548787..3548914,3549046..3549183<br>,3549268..3549380,3549452..3549617,3549689..3549802,3549886..3549948<br>,3550038..3550145,3550249..3550365,3550461..3550626,3550783..3550880<br>,3550977..3551074,3551219..3551355,3551495..3551719,3551812..3552017<br>,3552127..3552366|
| + | ===Evolution=== |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| + | Please input evolution information here. |
| − | name=NC_008397:3546999..3554499
| + | |
| − | source=RiceChromosome04
| + | You can also add sub-section(s) at will. |
| − | preset=GeneLocation
| + | |
| − | </gbrowseImage1>|
| + | ==Labs working on this gene== |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| + | Please input related labs here. |
| − | name=NC_008397:3546999..3554499
| + | |
| − | source=RiceChromosome04
| + | ==References== |
| − | preset=GeneLocation
| + | Please input cited references here. |
| − | </gbrowseImage2>|
| + | |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggacgctcatgatggtgaggccgatgagttgccgccgcctcctcccgtacctgcaaatgtggtgcctattaaagctgatgacgttgagagcgaggtgccagcaaacaaaccagcaaaacctaagcggtttccaatggccaggcctggtttagggagaaaaggacagccaatccagctcttggcgaatcattacaaagtttctgtgaagagtagtgaagaatatttcttccactacaatgttattctgaagtatgaggatgatcgaccggttgatgggaaaggggtaggtcgaaaggtgattgataaactgcagcaaacctaccgttctgagctttcaagcaaggactttgcctatgatggtgaaaagagcctgtttacaattggtgctcttccacaagtaactaatgagttcacagtggtgttggaggatgtttcaactggaaagactgctgccaatggaagccctggaggtaatgacagccctggaggtagtgacaggaagagagttaggagaccataccagaccaagactttcaaagtggagctgtgctttgcagcaaagatccctatgaatgcaattgctcaggccataaaaggtcaagaatcagagaactcccaagaagctctcagagttcttgatataatattaaggcagcactctgctaaacagggctgccttttagtacgccagtcatttttccacaacaatcctaataactttgttgacctgggtggtggtgtgatgggctgtcgaggattccattcaagtttccgtggcacacagagtggactttctctgaatatcgatgtttcgacaactatgattgttaaacctggtcctgttatcgattttcttcttgccaaccagaaagttgatcaccctgacagaattgattggcaaaaggccaagcgtgctctcaagaacttgaggataagaaccacccctgtgaattcagaattcaagatcattggtttgagtgacagaaattgcaacgaacagatgttttcgttgaggcagaggaatgggaacaatggggatgttgatgaagttgaagttacagtctatgattactttgtgaaaaacaaaggcatagagctgcgctattctggcaatcttccttgcataaatgtggggaaaccaaagcgtccaacttattttccaatagagctatgctctcttattccactacaaagatacaccaaagctttgtcaacactgcaaaggtcctcccttgttgagaaatccagacagaagccccaggaaagaatgtcagtccttaatgatgcacttcgacatagtaattatgattctgatcccatgttgagggcatctggcatttcaattgcccaaaattttactcaagttgaaggaagggtcctgcaacccccaaagctgaaagctggcaatggtgaagatatattcccacgcaatggtcggtggaacttcaacaataagaaactgattcagacctgttctgtcgataagtgggcagtagttaatttctctgcacgctgtgatgtgcgaaatcttatccgggacctcataagaaatgcatctgcgaaggggattcaaatggccgaaccttttgatgtgtttgaagagagcccctcattgaggcgagcacctgtatcaagaagagtagatgatatgtttgaacagataaaatcgaaacttcctggagctccgaaattcctcttgtgccttcttcctgagaggaaaaattgtgaagtttatggtccttggaagaggaagtgtcttgctgaattcggtattgtcacacaatgccttgctccacaaagagtcaatgatcagtacctactcaatttgctattgaagataaatgccaagcttggtggaataaactcattgctgcaaattgaagcatccccttcaatacctcttgtatcgaagacacctaccatcatcttaggtatggatgtgtcacacggtcaaccaggacaatctgatagaccttccattgctgcggtggttagctctcgccaatggcctctcatctctaaatacagagcatcggtgcacactcagtcacctaagctagaaatgatgtcttccttgtttaagccacgaggaactgaagatgatggcctcattcgggaatcgctgattgacttctacactagttctggaaaacggaaaccggatcatgttatcgttttcagggatggagttagtgaaagccagtttactcaggtcattaacattgagcttgatcagatcattgaggcatgcaaatttctcgatgagaagtggtcaccaaagttcacagtgattgttgctcagaagaatcatcataccaaattttttcagtctggatctccagataatgttccgccaggtactgttgtggacaaacaagtgtgccatccaaggaattatgacttctacatgtgtgctcatgctggaatgattggaacgacgaggccaacacattatcatgttctgcacgatgagataggtttctcccctgatgatctgcaggagctagtgcactcactctcttatgtgtatcagagaagcacaacagccatatcagttgttgctccgatttgctatgcccatcttgctgctgctcaggtgggcacattcctcaagttcgaagatatgtcggacgcgtcgtccagccaaggaggtcatacgtctgtcggaagtgtaccggtgcctgagctgcctcgcctccatgagaaagtgaggagctccatgtttttctgctga</cdnaseq>|
| + | ==Structured Information== |
| − | AA = <aaseq>MDAHDGEADELPPPPPVPANVVPIKADDVESEVPANKPAKPKRF PMARPGLGRKGQPIQLLANHYKVSVKSSEEYFFHYNVILKYEDDRPVDGKGVGRKVID KLQQTYRSELSSKDFAYDGEKSLFTIGALPQVTNEFTVVLEDVSTGKTAANGSPGGND SPGGSDRKRVRRPYQTKTFKVELCFAAKIPMNAIAQAIKGQESENSQEALRVLDIILR QHSAKQGCLLVRQSFFHNNPNNFVDLGGGVMGCRGFHSSFRGTQSGLSLNIDVSTTMI VKPGPVIDFLLANQKVDHPDRIDWQKAKRALKNLRIRTTPVNSEFKIIGLSDRNCNEQ MFSLRQRNGNNGDVDEVEVTVYDYFVKNKGIELRYSGNLPCINVGKPKRPTYFPIELC SLIPLQRYTKALSTLQRSSLVEKSRQKPQERMSVLNDALRHSNYDSDPMLRASGISIA QNFTQVEGRVLQPPKLKAGNGEDIFPRNGRWNFNNKKLIQTCSVDKWAVVNFSARCDV RNLIRDLIRNASAKGIQMAEPFDVFEESPSLRRAPVSRRVDDMFEQIKSKLPGAPKFL LCLLPERKNCEVYGPWKRKCLAEFGIVTQCLAPQRVNDQYLLNLLLKINAKLGGINSL LQIEASPSIPLVSKTPTIILGMDVSHGQPGQSDRPSIAAVVSSRQWPLISKYRASVHT QSPKLEMMSSLFKPRGTEDDGLIRESLIDFYTSSGKRKPDHVIVFRDGVSESQFTQVI NIELDQIIEACKFLDEKWSPKFTVIVAQKNHHTKFFQSGSPDNVPPGTVVDKQVCHPR NYDFYMCAHAGMIGTTRPTHYHVLHDEIGFSPDDLQELVHSLSYVYQRSTTAISVVAP ICYAHLAAAQVGTFLKFEDMSDASSSQGGHTSVGSVPVPELPRLHEKVRSSMFFC</aaseq>|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 4]] |
| − | DNA = <dnaseqindica>7003..7178#6874..6905#6696..6790#6523..6596#6311..6422#6010..6073#5816..5881#5586..5713#5317..5454#5120..5232#4883..5048#4698..4811#4552..4614#4355..4462#4135..4251#3874..4039#3620..3717#3426..3523#3145..3281#2781..3005#2483..2688#2134..2373#agtatctccccattcctcctcgcgtaaaagaaaatctcccgtctcgtcgtctccgttccttgcgccatctcgcggctgaacaggggtcgcgagcagagcaggggatcctggtgagcatccgcatcctctttctgattcatctctctctctcccaccgggactacttttttctggaatttgcttgcgttcgtcaatcctagcttctcttctaaatcttggaagaagctcttctcttcttttcagcgccataaccttaatacaagtaacaatctgtttgttccccaaaaagtttgagggtttaactgaacccctatgtctcaagttggatccgctcctgtaacgtttcccccttaaaaattttttttgggggttcaactaaaccctaggtttattggtatctggtgagtagtatgtacttgcatgatatagatctatatatgtattggtttcttgcaaccagtttgtgaatacgctcttgtatccgcttcttgcaatatcccatctcttcccgtaacaatggtgcattcgccttcttgctcaaatatggggttttgtttcttttgtttttttttatccccaaatgtagttggttgtcgatgcttcttgtggggggcatgccttttaatctgtttggtttgatttaaaatttctccctgaagggtcaatgtgctgtgcttaagtttcttggttcaaaaggtcatggggggcatgccttttagtctgtttggtttgatttaaaatttctccctggagggtcaatatgctgtgcttaagtttcttggttcaaaaggtcatgtttttaactccactgttgtgtacaagttcttcagtttgctactcgatggagagttaatgtgctgagcttaggtttcttggtttataagttcgtctttttaattcacctattgtatacaatacaagaccttcaggttgctactccctggggggtttgaaccaagaaatgccgtacggcacattgacttttcaaggagtagaaagccgaagggttttcatacaatagttgaattaaaaagatgaacttttgaaacaagaaacctaaggacaacacaagttcttcagtttcttggttcaaaatagttccatccttttaattcaactatattgtatacatgcccttcaggttgctattagtactccctgaagggtcaatgtgctgttcttataggtttcttggttcaaaagttcgactttttaattcaactattgtataaaagcccttcagcttgctactctctgagaagtcaatgtgctgtactgcatttcttggataaaaaaaaatcgatagtttgtctttttaactcaaatgttgtatacaagctcttcagtttgctatgtcctggagggccaatttgccgtgcttaaggctcttggttcaaaagtttgtcttttaactcaaatgttgtatacaagcgcttcaagttggtctgatttgaaatttctttttgaaaagaagtgtgatttagaccataggctcccccttctcagctgataggcatgaaaacaacaatgaaaagaattcttgtggaggcctgcttttattccgattgctgtgattcaaatttatccctagagggttaaatggttaatgcgcttgcttagtttgtttggttcaaaagtcctttctttttaactcaagtgctgtatacaagcttttattctggtacgatttaaaatttcttttcagtaagtgtgatttagaccgaaggctaccccttttcagctgatacatgcattaaaacaacaaaagattaacttctcaaggcagtaatcactacaatacatgcaactaataacaatagggtggattcggttggagaatgagccaaactttcttaaaaaggaattgccgtaatacaggttttgcgcttaaaagcttttaatctgctgctgcaagcaattatatctggctggtttgttaatgattacaattgttttgttacctcccttttttatttattcagcaacaaaactttccgtattgatgcaactgtcattgcattattgaattcaacatgttgaatataatgtgtttatcacattgatgtcaattcctcaaaggggtaatctcccctattgtaacattgattaatccccctatttgcagctcatagaatggacgctcatgatggtgaggccgatgagttgccgccgcctcctcccgtacctgcaaatgtggtgcctattaaagctgatgacgttgagagcgaggtgccagcaaacaaaccagcaaaacctaagcggtttccaatggccaggcctggtttagggagaaaaggacagccaatccagctcttggcgaatcattacaaagtttctgtgaagagtagtgaagaatatttcttccactacaatgtaggtttctattctaatttattatcttatattcaatttatgggaattcataaccataatcaacatatgtacctggctgatttctagttctgtggtactttattaataggttattctgaagtatgaggatgatcgaccggttgatgggaaaggggtaggtcgaaaggtgattgataaactgcagcaaacctaccgttctgagctttcaagcaaggactttgcctatgatggtgaaaagagcctgtttacaattggtgctcttccacaagtaactaatgagttcacagtggtgttggaggatgtttcaactggaaagttagtttatccttgatttgtttttttgctgtttgtgctttcctaatattatgtttggtattatgtcttgtttaactatttcttgtttataggactgctgccaatggaagccctggaggtaatgacagccctggaggtagtgacaggaagagagttaggagaccataccagaccaagactttcaaagtggagctgtgctttgcagcaaagatccctatgaatgcaattgctcaggccataaaaggtcaagaatcagagaactcccaagaagctctcagagttcttgatataatattaaggcagcactctgctaaacagtatgtttctccacaagtgcattatccctgtgatttaaaagtgctctgctgtatttgggtttttgtatgctctataccaccgtgtcaaccacaagtgtatcacctcatgactgcattaattttttttcactatctacaggggctgccttttagtacgccagtcatttttccacaacaatcctaataactttgttgacctgggtggtggtgtgatgggctgtcgaggattccattcaagtttccgtggcacacagagtggactttctctgaatatcggtttgtattttgtcctgacatatcgttgtgcaattgcattgtttatcggtttgtattttgtcctgacatatcgttgtgcaattgcattgtttatttgtggtccttacataatcctatatttaagtaatcttcctgaattttcagatgtttcgacaactatgattgttaaacctggtcctgttatcgattttcttcttgccaaccagaaagttgatcaccctgacagaattgattggcaaaaggtgagctttttatttaatatcattgatgtttatgtgttagtaatcatccaaccatattggtacattcttacttggatgttttcttgctcaatacaggccaagcgtgctctcaagaacttgaggataagaaccacccctgtgaattcagaattcaagatcattggtttgagtgacagaaattgcaacgaacagatgtgagagcatattcttccttgctattttattcatctaaagcaattcttaaattaatattttggaaaaggcacccaattgttttgagcttgtattgcagtttttttcctaatcattctgctattatcgattgctttctgattggcatgcttgactaggttttcgttgaggcagaggaatgggaacaatggggatgttgatgaagttgaagttacagtctatgattactttgtgaaaaacaaaggcatagagctgcgctattctggcaatcttccttgcataaatgtggggaaaccaaagcgtccaacttattttccaatagaggtctgtttaatttttgctattctacatgtttaaaaaagtttactagaattatttattatttcaaactcctgttgtgaatattcttgtattaccagctatgctctcttattccactacaaagatacaccaaagctttgtcaacactgcaaaggtcctcccttgttgagaaatccagacagaagccccaggaaagaatgtcagtccttaatgatgtgagttactattcttgattctaacctgctacaatcatatagaaatggttggaattgtcaacatgactggtaagtgacgattcatgtttaccctaaatgcaaggcacttcgacatagtaattatgattctgatcccatgttgagggcatctggcatttcaattgcccaaaattttactcaagttgaaggaagggtcctgcaacccccaaaggttggtgaggattctctgaattcgtatgttttcacatgctccatgttctattcaacgtaccgcgtctaagtatatattgtatcatgtagctgaaagctggcaatggtgaagatatattcccacgcaatggtcggtggaacttcaacaataaggtcagaatgattttctttatcatatctttattcttggtatggaggaggtcgaggaacattctgatttctttcccttttttcagaaactgattcagacctgttctgtcgataagtgggcagtagttaatttctctgcacgctgtgatgtgcgaaatcttatccgggacctcataagaaatgcatctgcgaaggggattgtatgttttagctttttatcacatattttacgcctgatatttctttgcactgaactttgttaactttgcagcaaatggccgaaccttttgatgtgtttgaagagagcccctcattgaggcgagcacctgtatcaagaagagtagatgatatgtttgaacagataaaatcgaaacttcctggagctccgaaattcctcttgtgccttcttcctgagaggaaaaattgtgaagtttatggttcgtcattgtttccactccctaaagtcattcactcccttgcaaaatttacattgttttgtttcaaccaggtccttggaagaggaagtgtcttgctgaattcggtattgtcacacaatgccttgctccacaaagagtcaatgatcagtacctactcaatttgctattgaagataaatgccaaggtatttaacgtaaccttgtcttttcttactgcattatccatttatgtaagcttatggacttgctcttcccctgttactaaccagcttggtggaataaactcattgctgcaaattgaagcatccccttcaatacctcttgtatcgaagacacctaccatcatcttaggtatggatgtgtcacacggtcaaccaggacaatctgatagaccttccattgctgcggtaagagggatatacttttactctcataactccacacactgaactgttgtagctcatgtcatatgcatggatttctcaatttctaagttggggtgcttaattggttattgtatacctttggagttgtttaggtggttagctctcgccaatggcctctcatctctaaatacagagcatcggtgcacactcagtcacctaagctagaaatgatgtcttccttgtttaagccacgaggaactgaagatgatggcctcattcggtaagagatattatttgataaaccattgttgccaatgtatactatgattgctcacaagtatcctttctatagatgcttatctttgcatttgggatttttcagggaatcgctgattgacttctacactagttctggaaaacggaaaccggatcatgttatcgttttcaggtttcgagttcaaaaattgttgtctgtgaatctctctgaattctgtagtaatatcttagatgttcatttactcaaattgttaactgaagctgtcccagcaactgatgtaaatactttctattttttagggatggagttagtgaaagccagtttactcaggtcattaacattgagcttgatcagatcattgaggtgtgtgtttatttcattagccctcccatacctgctactgcacgtccaacttctgtactcaccaagtagtagctatgccctattgctcatttttctttaaatgtaacctattgcccatcgctttcattgttttgcttttaattgatgcagctcatcaagtagtaattatgcctaggactcatctgaaaaatatcacatattgtgcatcactgtttctttggcttttaatcaatgcaggcatgcaaatttctcgatgagaagtggtcaccaaagttcacagtgattgttgctcagaagaatcatcataccaaattttttcagtctggatctccagataatgttccgccaggtaactctttaggcagttttctctgatacctatgttatatcattttactgtgatgaaatcatggcgaggctaaagataaatggtaaacggccttctgtaggtactgttgtggacaaacaagtgtgccatccaaggaattatgacttctacatgtgtgctcatgctggaatgattgtaagctatctctggtttccacctgcagtgcacttattgtgagctcattgctttgtatgctctccgttgcttgtgtttataagatgtttgttgtttcagggaacgacgaggccaacacattatcatgttctgcacgatgagataggtttctcccctgatgatctgcaggagctagtgcactcactctcttatgtgtatgttgaaaactgcactggcatttcatccctgcgatctgttagctagttctgttctgatttgctgcctgtgtccatttcaggtatcagagaagcacaacagccatatcagttggtatgtagcttgtaaattgtaatgccatttctagttctcttcgggtaagatcactgtactgtcctgttggtgcctgaccttgcgcatttgtgtgcagttgctccgatttgctatgcccatcttgctgctgctcaggtgggcacattcctcaagttcgaagatatgtcggacgcgtcgtccagccaaggaggtcatacgtctgtcggaagtgtaccggtgcctgagctgcctcgcctccatgagaaagtgaggagctccatgtttttctgctgatcgtgccgcctctcgatcaaatgctcgccgacgttgagaaatccggtgatcggcctgggggaactactagtacttttgcttctcataattaggaacatgtatggaacctatgtacctgcccttggcatgctgcctgtgtcatggattatctgctggtaggagtatcctttaaccaaacccttttagcttttaagttaggtttaatggactgctgtttagtatgtggtgtggtgttagtaagtttccagacttcgacattgtgcagctatgcctattgctggttatggtcccttcccttctatgtagcatgtgccgtttccctt</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001058650.2 RefSeq:Os04g0151800]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]]
| |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 4]] | |
| − | [[Category:Chromosome 4]]
| |
