|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 4]] |
| − | GeneName = Os04g0566100|
| |
| − | Description = Similar to Transcriptional activator SRCAP|
| |
| − | Version = NM_001187120.1 GI:297723370 GeneID:9270561|
| |
| − | Length = 8102 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os04g0566100, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 4|Chromosome 4]]|
| |
| − | AP = Chromosome 4:28778168..28786269|
| |
| − | CDS = 28778168..28779052,28779090..28779243,28779941..28779981,28780287..28780537,28780638..28780818<br>,28781365..28781550,28781623..28781796,28782219..28782377,28782651..28782728<br>,28782839..28782975,28783207..28783271,28783342..28783375,28783443..28783599<br>,28784362..28784423,28785268..28785345,28786167..28786269|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008397:28778168..28786269
| |
| − | source=RiceChromosome04
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008397:28778168..28786269
| |
| − | source=RiceChromosome04
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgcggcgaggctacgaggagatcgacgacgacgagtggtcgaaccacagcttcaagccttcgcgcgtcctcaagcgaccaagccgaggcgcccagccggactcgcagcctcccccgcccatcgactccttccgttacaaccccaggccttcctcctcctccgccgccgccgccgccaccgccaccgtcgtcctctccgacgacgacgacgatttcgaacttggtgaggaggagcggttgcgccgcgccgggaagagcacccgcgtgctcaatcgtccgcagcggcagcacagcccccctgggcgggcccttccgccccgcgagtccttccgctacaaccctaaacccgccaaggccgccgccgcggtgtcggtttccgatgacgacgacgacggctttgatctcgaagacgatgatttcgacatcccttcttcgaggacctcgcgtccgcgccgtaccgctggtcggcgcttggcaaccgccgtcgccgacctctcggaggaagacgacgatttagagctcgctgatgatgattttgaccatccagacccaaggccaacgaggccgcgtcgagccaccgctcgccgtttcgtgattaaggacgatgatgacagcgacggggatgtgggtgcgtctgaggtggatggggtagaagcagaggaggatgatggtgtgaactggtcggagttggagaatgaggacgatgaagatggggactatggtgagacgaaggtggaggtggaggagggggatgtagtgggtaaggcattgcgcaagtgcgcgcgcatttcggctgatttgcgacaggagctgtatggctcatcgacaaggaattgtgagagttatgctgagatagatgattccagtgtccgaattgttacccaggtgtggagttttgattcaatggatgtgtcggagcaggatgatgtggatgctgcatgcacaagcgaggagtcggagtttgagcctattctgaagccctaccagcttgtgggggtcaattttcttcttctcttgcaccggaaaaatatcggtggagcaattttggctgatgaaatgggtcttggtaagacagttcaggccgtgacctatcttactctgttgcggcatctatataatgacccaggtccacatctaatagtttgcccagcttctgtgttggaaaattgggaaagggaacttaaaaaatggtgtccttcattttcaatcatcatgtttcatggtgctggaaggactgcctactcaaaggagttgagttcattgggcaaagctggttatccgcctccatttaatgtcctccttgtttgttactctctctttgagcggcggagtgctcagcaaaaggatgatcgcaaagcactcaaaagatggcgatggagttgtgtgttgatggatgaagcacatgtactgaaagataagggtagcttccgatggagaaaccttatggctgtcgcacaacatgcccgccaacggctaatgctgacaggaactcccctccaaaatgatttgcatgagctatggtcattgttggagtttatgatgcctgatatatttgccactggagatattgatctgaagaagctgttaaatgcagaagatcatgagctaatttcacgtataaagtccattttggggccatttattcttagacgtttgaaatcagatgttatgcagcaacttgttccaaagatacaacatgttaatttcgtaacaatggactcagagcagtttcaagcttataactatgccattgatgaataccgtggtgcttgtcaagctcgtagcgcaaaatccacatccaatttttctaataatgttgttgggttgattccaaaacgacaaatatcaaactatttcatgcagttccgtaagattgcgaaccatccattgcttataaggcgcatttacagtgacaaagatgttgatcgaattgcaaagttactgtaccctaaaggtgcattcggttttgaatgttcattggaaagagcaacccaagaacttaggaagtacaatgattttgctatccaccaactattagtttcctatggtgattctggtacaaagggtgcccttacagatgagcatgttcttggatcagcaaagtgtcaggccttagctgagcttttaccttccttagcaaatgatggccacagagttctcatattcagccaatggacgacaatgcttgatatccttgaatggacactggaagtaataggagttacttatagacgtcttgatgggggatggatcggcaagctgaagatcgctgccatcgcattggacaacagaaacctgtcactatctatagattgtgagcatatcaccatattcatatcgacgtggctagtgacaaagggttcggttgatgaaaacatatatgagatagcaaggagaaagttagtattagatgctgcaattctccagtccggagcagagttagaagatagcactgatgtacctgagaaaacaatgggagaaattttggcatctcttctcctgttgcttgatgatacgcttgtgacatgtgaggttctgattggatttccgtctaaggcaagatggaacattccaattgtaatgcttgaagatttcgcacatgatcagcaaaatttaatagcttgcttggaagacagattcgttgtggtttatgggctcagtgctgggccatttgttgctcttcttgcttctgtccgccttcgtcctgatggatgttcctctagctgctccggcctgtttggctag</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MRRGYEEIDDDEWSNHSFKPSRVLKRPSRGAQPDSQPPPPIDSF RYNPRPSSSSAAAAATATVVLSDDDDDFELGEEERLRRAGKSTRVLNRPQRQHSPPGR ALPPRESFRYNPKPAKAAAAVSVSDDDDDGFDLEDDDFDIPSSRTSRPRRTAGRRLAT AVADLSEEDDDLELADDDFDHPDPRPTRPRRATARRFVIKDDDDSDGDVGASEVDGVE AEEDDGVNWSELENEDDEDGDYGETKVEVEEGDVVGKALRKCARISADLRQELYGSST RNCESYAEIDDSSVRIVTQVWSFDSMDVSEQDDVDAACTSEESEFEPILKPYQLVGVN FLLLLHRKNIGGAILADEMGLGKTVQAVTYLTLLRHLYNDPGPHLIVCPASVLENWER ELKKWCPSFSIIMFHGAGRTAYSKELSSLGKAGYPPPFNVLLVCYSLFERRSAQQKDD RKALKRWRWSCVLMDEAHVLKDKGSFRWRNLMAVAQHARQRLMLTGTPLQNDLHELWS LLEFMMPDIFATGDIDLKKLLNAEDHELISRIKSILGPFILRRLKSDVMQQLVPKIQH VNFVTMDSEQFQAYNYAIDEYRGACQARSAKSTSNFSNNVVGLIPKRQISNYFMQFRK IANHPLLIRRIYSDKDVDRIAKLLYPKGAFGFECSLERATQELRKYNDFAIHQLLVSY GDSGTKGALTDEHVLGSAKCQALAELLPSLANDGHRVLIFSQWTTMLDILEWTLEVIG VTYRRLDGGWIGKLKIAAIALDNRNLSLSIDCEHITIFISTWLVTKGSVDENIYEIAR RKLVLDAAILQSGAELEDSTDVPEKTMGEILASLLLLLDDTLVTCEVLIGFPSKARWN IPIVMLEDFAHDQQNLIACLEDRFVVVYGLSAGPFVALLASVRLRPDGCSSSCSGLFG </aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>1..885#923..1076#1774..1814#2120..2370#2471..2651#3198..3383#3456..3629#4052..4210#4484..4561#4672..4808#5040..5104#5175..5208#5276..5432#6195..6256#7101..7178#8000..8102#atgcggcgaggctacgaggagatcgacgacgacgagtggtcgaaccacagcttcaagccttcgcgcgtcctcaagcgaccaagccgaggcgcccagccggactcgcagcctcccccgcccatcgactccttccgttacaaccccaggccttcctcctcctccgccgccgccgccgccaccgccaccgtcgtcctctccgacgacgacgacgatttcgaacttggtgaggaggagcggttgcgccgcgccgggaagagcacccgcgtgctcaatcgtccgcagcggcagcacagcccccctgggcgggcccttccgccccgcgagtccttccgctacaaccctaaacccgccaaggccgccgccgcggtgtcggtttccgatgacgacgacgacggctttgatctcgaagacgatgatttcgacatcccttcttcgaggacctcgcgtccgcgccgtaccgctggtcggcgcttggcaaccgccgtcgccgacctctcggaggaagacgacgatttagagctcgctgatgatgattttgaccatccagacccaaggccaacgaggccgcgtcgagccaccgctcgccgtttcgtgattaaggacgatgatgacagcgacggggatgtgggtgcgtctgaggtggatggggtagaagcagaggaggatgatggtgtgaactggtcggagttggagaatgaggacgatgaagatggggactatggtgagacgaaggtggaggtggaggagggggatgtagtgggtaaggcattgcgcaagtgcgcgcgcatttcggctgatttgcgacaggagctgtatggctcatcgacaaggaattgtgagagttatgctgagatagatgattccagtgtccgaattgttacccaggtatgtacttatctgtttttatgcagtctacttgaaggtgtggagttttgattcaatggatgtgtcggagcaggatgatgtggatgctgcatgcacaagcgaggagtcggagtttgagcctattctgaagccctaccagcttgtgggggtcaattttcttcttctcttgcaccggaaaaatatcggtggaggtgttttttaaactgttgcatttgatcatttatgttgccttagatgatattgtcagtaaagatgcatatgactgagatttttttaagtgcacccacgatgaaataaaattgatctatgcagttcagtaattcacttcactccaccctttagcatgatagcatgaaatttacttgcaagcgtcctgttatttctgccatttttgtcttcggaaacatgctgctatttgttattcctttatactgtttagatttccgttatgtgaaattgcaatcaatcttcaatcaatgaaaatgaactcgatggagaacacatttctagacacctttgattttcttgtaattttatgacaagcagacccaaataatggtagggtatctctgaatatggaacaatgaaaattggtaggtcaacagaaaaaaaaacagcattcctgtattcatgtgattaactaccaggagatccatagtatacaggagccagatccacatgtatttcccatgaaaagcttattctataatgtaccaagggattaaagttgaatgttaaatattttttttctgcaaaatcattgttttgttgtttaagtaatattgagttaataaccatgctagttgctttttcttattatgttttattgtttctgcacgccaaagaatctaaactggtcatattaacctatatgttattttcgtgcagcaattttggctgatgaaatgggtcttggtaagacagttcaggtaagatatcttgcagtatgtggtggaaagggaactaataaataaataaataagtatagtgaaatgacatcttatcaggatgtataagctaggctagttcaaatggggagttatcttttttattatggggacctatgcactattttttaatcaaaatagatttttctgaatttcttttggttcaatataaaatattgtcagaatttaacctcatatggcttattttagatgaactgagttgtttgatcctatacttcagtggcaactcatctattgctgtttgatctttgctcttgtgatgacaggccgtgacctatcttactctgttgcggcatctatataatgacccaggtccacatctaatagtttgcccagcttctgtgttggaaaattgggaaagggaacttaaaaaatggtgtccttcattttcaatcatcatgtttcatggtgctggaaggactgcctactcaaaggagttgagttcattgggcaaagctggttatccgcctccatttaatgtcctccttgtttgttactctctctttgagcggcggaggtttgtggttatttattttgtgtttagcaccaaagttttcagagagccgatgatagttcatgtttgtataagtttaagttcctttttatctgtaatgtagtgctcagcaaaaggatgatcgcaaagcactcaaaagatggcgatggagttgtgtgttgatggatgaagcacatgtactgaaagataagggtagcttccgatggagaaaccttatggctgtcgcacaacatgcccgccaacggctaatgctgacaggaactcccctccaaaatgatttgcatgtaagttttgatgataacttgatgggtggttggtttaagttagtcctgctgcatgtgtcgttctgtggttctttgcaatacttatataccatccacctatttgaaaatttaagacatactactgtctgtaaaaatcaggagtatgttggttaggtttcgcacatgaataatcctgcataaccagagtccacatgttagcaaagggctgaagcacataatcagcatgtcaaccaaagatctataactaacacttgtttttggtagaacgaccacttaagcttctggctttaccaagaccttgtatgccttagccttattacttgaaaccgatattgagttcttttggatatggtgattgcatgtcaggttctcaatgctgtttgctgttcatcagtttttaattactacttacatggaaagccatgaaataaatagcaacagttttcggatagctttctgtctccagttctttggagtatgcgcttcaactacttaagttcagttcatttcatcttaaagtaccacttgttttcaactgatttacaggagctatggtcattgttggagtttatgatgcctgatatatttgccactggagatattgatctgaagaagctgttaaatgcagaagatcatgagctaatttcacgtataaagtccattttggggccatttattcttagacgtttgaaatcagatgttatgcagcaacttgttccaaagatacaacatgtacgtcgacctaaccatcaacatatggttttcgttgtcatggttcaactttacagtgatcttgtgtcacaggttaatttcgtaacaatggactcagagcagtttcaagcttataactatgccattgatgaataccgtggtgcttgtcaagctcgtagcgcaaaatccacatccaatttttctaataatgttgttgggttgattccaaaacgacaaatatcaaactatttcatgcagttccgtaaggtcagcagcatatcacacatgtaaatgaattgcactctgggccacattttattgccaaagtttcacttttgaccaccctttgactgatattttcaccttggaccaggtaacttcacatttgttgcactttggaccaccccaaaccactttcttgagcacatcgactctagcacaacaatgaactgcgcaagccatattttttccagaggagtggttagactagctagagaagaaagttggggtggtccaaagtgcaagaagtgtaaagttacctagtccaaagtgataatatcagtcaaaggctggtccaaagtgaaactttggcaacaaaatgtggcccaaagcgcaattcactcttttaaattcaggaaaatgtttattatacctgttctcaaaagttgttcttttctattgctccacagattgcgaaccatccattgcttataaggcgcatttacagtgacaaagatgttgatcgaattgcaaagttactgtaccctaaaggtgcattcggttttgaatgttcattggaaagagcaacccaagaacttaggaagtacaatgattttgctatccaccaagtattgttcatccctttactgttctacctgatcagttttaatccaccttatattgtttttctgactgaattataccagtgcttgccatctttcagtgttgcattgtttgatcataacttttatcctgcttattgctagtaactttcttttttctttgcaccaaatagtatggatgtgacatgtttcttttttgttgttgacgaacctttcctgtgtccaaaatttagatttttttttcaatcctatctgacaattagtttctcacttcttcagctattagtttcctatggtgattctggtacaaagggtgcccttacagatgagcatgttcttggatcagcaaagtgtcaggtgtggttttcccccattccttaaggattgtatatgtacagtaatatcttcagcagaaattgtctttaggatttaacaattgaattccttcatttctatgttttgttcaggccttagctgagcttttaccttccttagcaaatgatggccacagagttctcatattcagccaatggacgacaatgcttgatatccttgaatggacactggaagtaataggagttacttatagacgtcttgatggggggttagttttttttcagcatttatttttggaattaaaatgtttctcaatcctaagcgatgaagttccttctgtttcagcaccccagtaactgaaaggcagactatagtcgacactttcaataacgaccgatctatatttgcatgtttgctttccacaagagctggaggccagggtctgaatttaataggagctgatacagtgataatacatgacatggatttcaacccccagatggatcggcaagctgaagatcgctgccatcgcattggacaacagaaacctgtcactatctataggtaatatgtgctatgtctaattatgttcatttggatattttatcggttacttatgttttttgtgattcagattgtgagcatatcaccatattcatatcgacgtggtgatgataaattcataaatattgaactctacaacatggtaacagtgatgatttcattttctttcaggctagtgacaaagggttcggttgatgaaaacatatatgagatagcaaggagaaagttagtattagatgctgcaattctccagtccggagcagagttagaagatagcactgatgtacctgagaaaacaatgggagaaattttggcatctcttctcctggtgtgaggttcttgtcatagaatgcttgaaggtacataatttcacctgaggatatgtctgtaactgtcaaccttattcattcttcatttaagcgagacacttttggttggccgttctaatatgcatagctcaatggtgcctattttgcactggattttgatttatcactgtctgcctcatctactggtgattctatgaataagcttctgtcaactgtgcttcagactcatattttgttttgaatgtgattcagcatagtgacatactgtataagcttaacataggtacaaataggtggtagagaactttattgtagaaaatactgaaactagaagattcagaaaaataattatacatctgtactgctgaaatttacaagcttgatattaatgaaatgactttataacttgtaggccacattatgtcggataattgcatcactcgatacctcacttttcattttctgttctctggatgacgtctccactattttgctaacacttccttttctagtgtagttctcatctccttatttctgtaaaaggaaccttagctatatgcactgccatttctgctgcattggttgccatgcaccacacctaatataagattctgctgtgttctgtagtgtagattacaggtgatatttttttatttcctttttgctcctgctagcagtgagatgatttttcactgttttggcaccagtggacgactggccagcttgtagcttcagtatgttatttgataattctttcctagttgcttgatgatacgcttgtgacatgtgaggttctgattggatttccgtctaaggcaagatggtatccattattatatcggctattcatttctgaccttacacctgccacctggattaagttcatttcttcttttcctatgaagaatttttcattgaagatgctccttgcttattaatatcaaatttcttattgaagtgtgttgtcgatgaattggtttaaaccgctactcatattatctgttttctgtcctttcttcccacttaactgaatattatgaatctcttgtagatgtgtagttgctgccaaattcttttctgatatatttcaactgtagtaataacctgtttactagatctcaccagtatttgttcgacatattgtgctgatttgaagaaattatccgtgcacctatctcctttctgtaccttacactaccatgcacattgtacccaagcaggtactagcttgtgtacacctgcgtcgttcgcatccacagatctatggctgtaaatgggtactccacattgccacgtattccttataaccttgtcttggatgtaagaaaatgtttgcaggatcttatggttacacaacttatactactgttagcttcattgctttagtcgtgttctacagtacagccttgatattttgctggccattacaagtgtgcaacatattctgctatgaatgtaccttatctcagttgttagagtcgatagaatacgatatactttggtagctatcctgatgagtttcatgtggtattgttctttgatagcatgcattttatttgctgctccatgtccctcacaatgtaaacgttttggtgtcacggataggcctatgtggagcaggtgttgatcagttttaagattttcatttttttttatttttgctgcaggaacattccaattgtaatgcttgaagatttcgcacatgatcagcaaaatttaatagcttgcttggaagacagattcgtgtgagtgctcttaaccttctcctggccgctcttacaattttgttcgttagagccctaggccttgttaacactgttatgtctggtcaatctttcaagtcttgggggtaatatatgaaaaaagaaaggtgaatggaaatgttgtataacaagagatccattttatagtcgtgcagcatttgttcatgctgtggccctctgttttccgtaagatggatgaatgaatgggaactgaatagccctaccccttggaaatatgctcgtctgtgtcgggttttcactatagaatcactgattcatctgatgtgagtacaagagaatgtgtccatttgaccggactatatgctctacaattagtattagtgaaaaatgcaaatgccagcagcatgtgttttattcatgtaagatgattttactcgctaggtggtctgcatctgcaattccgctattcacctcgtccattattgttttaacatgactcccaacgatactaaagttcagagtagccattctgacagtatactgctcctgattccacacggatgtacggggtactagtgcctggccctactgtatatactacatggtactagctctggcgtgatttgtgatttttgcaaatcaaggaaaaagcctggcgctcccttgctcagcccaggagagtcaggagctactgtatgcttgcgtacgtgatgccaggagagtcaggagctactactgtatgcttgcgtacgtgatggaatgaggaattctccatccccggacgatggaaacgacttctgctggattgatttgatttgtttgtccgtcaatgttgggtaaagtgtggtttatgggctcagtgctgggccatttgttgctcttcttgcttctgtccgccttcgtcctgatggatgttcctctagctgctccggcctgtttggctag</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001187120.1 RefSeq:Os04g0566100]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 4]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 4]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
