|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 5]] |
| − | GeneName = Os05g0511300|
| |
| − | Description = N2227-like domain containing protein|
| |
| − | Version = NM_001062549.1 GI:115464828 GeneID:4339287|
| |
| − | Length = 9500 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os05g0511300, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 5|Chromosome 5]]|
| |
| − | AP = Chromosome 5:25382598..25392097|
| |
| − | CDS = 25382972..25383043,25383714..25383767,25384020..25384088,25384202..25384261,25384423..25384520<br>,25385394..25385467,25386019..25386132,25386235..25386301,25386387..25386451<br>,25387051..25387130,25387236..25387280,25387782..25387847,25388293..25388448<br>,25388839..25389063,25389177..25389219,25389544..25389587,25389738..25389810<br>,25391882..25391961|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008398:25382598..25392097
| |
| − | source=RiceChromosome05
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008398:25382598..25392097
| |
| − | source=RiceChromosome05
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggccgaacggcggtacaccgagcaggaggaggcgctcgagatcagctcactccgccgcatcatcgccgcctacgccaactaccacgatgctgcagaaagggatgtcaagagatatgagcgatcattcaaaaggcttcctcctgcccacaaggaacttctttttaaccttggtctgaagtaccaaaggctgagatggtgtatatccatgaatgcatcattcatcatggacatgcttgaggcatttgagcctcctttcgacatgagtcagcatgtagatatggatggtcatgattgcgcagagaacatgcatggacattgtcatgcagattgtgctcattctgtcgataggggtgattgctttagaagttctatctctgtaagcaattccgagttgcatgaaccagacggttgccccaggaaagacgacaagactcatgaactctcaagagaaactgacaacaaggacgaggtagttgacatggaaagttgctcccggccggttggtgacaaattgggggcatctcaggttgaagataaatcatgtaatggtgataaagccatggatgcagcagctaactgtcaagatacagattgtgttgcatgttctgctgatgagaatgtgataccgcagcaattcatggctccatccttgcagttgaatgttcctccaattgatgttgacaaggttagatgcatcataagaaatattgtcagggattgggctcaggagggtcaaaaggaacgtgatgagtgctataagcccatcctggaggagcttaatcgtctatttcctaaccgaagcaaggagaggcctccttcatgcttagttcctggtgctgggcttgggagattggctctggagatatccactctgggttttgtgagccagggaaacgagttctcgtattacatgatgatttgttcaagtttcattctaaaccacacgcaagaaaccaatgagtggactatatatccttggatacacagcaactgcaattctctttcagacaatgatcaacttcgccctgtttcatttcctgatattcacccctcaagctcagggatcacagaaggattttctatgtgtgctggtgattttgtagaggtctacaatgaagaaagccaagaatcttcatgggatgctgttgtaacatgcttcttcttggatacggcacacaatatcgttgaatatatagagatcatatcaaaagttctcaaggatggtggggtctggataaatttgggtccgcttctgtatcacttcgctgactcctatggaccagatgatgatatgtctattgaactgagtttggaagatgtgaaaagagttgcttaccattatggatttgtgatggaggtggagaaaatgatagataccacatacactgcaaatatgaaatcaatgatgcagaatcggtaccgcgcagcattttggacgatgaggaagaatgcatctcgatcaaaagctcaaaaacaccagtga</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MAERRYTEQEEALEISSLRRIIAAYANYHDAAERDVKRYERSFK RLPPAHKELLFNLGLKYQRLRWCISMNASFIMDMLEAFEPPFDMSQHVDMDGHDCAEN MHGHCHADCAHSVDRGDCFRSSISVSNSELHEPDGCPRKDDKTHELSRETDNKDEVVD MESCSRPVGDKLGASQVEDKSCNGDKAMDAAANCQDTDCVACSADENVIPQQFMAPSL QLNVPPIDVDKVRCIIRNIVRDWAQEGQKERDECYKPILEELNRLFPNRSKERPPSCL VPGAGLGRLALEISTLGFVSQGNEFSYYMMICSSFILNHTQETNEWTIYPWIHSNCNS LSDNDQLRPVSFPDIHPSSSGITEGFSMCAGDFVEVYNEESQESSWDAVVTCFFLDTA HNIVEYIEIISKVLKDGGVWINLGPLLYHFADSYGPDDDMSIELSLEDVKRVAYHYGF VMEVEKMIDTTYTANMKSMMQNRYRAAFWTMRKNASRSKAQKHQ</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>9055..9126#8331..8384#8010..8078#7837..7896#7578..7675#6631..6704#5966..6079#5797..5863#5647..5711#4968..5047#4818..4862#4251..4316#3650..3805#3035..3259#2879..2921#2511..2554#2288..2360#137..216#gggctttgcccctgagcataactgaagcaaagacctcccccacgcgacgcgagacgcgacccatcattcggaggcccaccaattcatctggagaaagctgcgctcctccgcctcgccgccgccgccgccggggaggatggccgaacggcggtacaccgagcaggaggaggcgctcgagatcagctcactccgccgcatcatcgccgcctacgccaagtacgtcaacccccatcccgtccccctcccctcccctcccagctcgtctcgtctgccacgccactctccttgctcgccggggcggcggttggttggtcgcgtagaggcgcgtagctccgttctacaggctccccccgctttgttccgaggcttgtgggggtgtgtgtgggttacaacttagttcgagttggtgttgtttctcagttgtagggtttaggagtagtcgccgattcgagggtggtgtgaggttctggatagagttgatctgtggttacggggattacccatccgcgaagggcggtaggcttcgttgggacttggggagttctacactacaaccatgctatgaacgttgttgattggagtgagagaacatttcttttttccccgttgaagtctttacgaaaatcttgataaaccaactcataggcgtgacccttaaaagttactatatgtgatgtgagcaagtgatatctcctggaattgctattttttatttagaaattccataatcaaagtattattgcatcaacacttgtacttttgtcaaatcttgttttcttttcaagttttagcattgatattgcagaagtactccctatgttttacctatcttctttagaacgcttgcagttaacatttgaaaacatttaccactaaggccattcacagtgcacacacgtggcgtatggcaatgttggtccacgtaggcaaatcgcttgtgtggaggagagaggggagtggagactgttccctcaccagcttcgcgtgatcagagttggtcacaagaacctcgcagcaactttgtcagaaaaaatgctcctccacgcgtaacaagaaagtaagagcgagagtgagaaaggagaagaacggtggatgactgaagagtgaagagagaagttcgccggagtaggggcgctcagggagctcgctgccactgcgtgggctcggggatgccgccgccgctgcttgggcttggggtagccgagggaggaggccggagagggaggggagaggtgcccgatgctgtcgagctgcttccaccaccgccttctcccaagcggcgccggcggtgtttggggaatggggagggggagccagatctgtgccgccggtgggagaggagggggtgggggagtcgccgctgtgcgccgccgtgggagaggaggggggcggaggagtcgtcgccgtgcgccgccgtgggagaggacgaagaggagggtgggggtttggcgccatgggagccgattgagggagaggagagagagagagatggggaaggagcggcggaaaatgggaggtgcaagcgatttttctccgaaggaggaaatgacgattttttgtggtggggcctgcctgaaaaaaaattaatggtggaccccatctaaagctatgcgtactgggagagatggagcctcatttactttttccctatgtggatgcttgggctccttgatgagccgggacgcagtgctattgccctagtacactctaaaatagttaggacttggtacatggcaatggtatgggtagatttaccttcaaaacttctaacataaaattgtattttgaaattttcgtccaacatatgaacacaattggaaaaggtgggggccatggggacaaaacaagtgtagcgaagactgtgccagtgttgaaatgacttactccctccgtttcaaaatgtttggcactgttgacttattagtacgtgtttgaccgttcgtcttattaaaaaaatttgtgaaatatgtaaaactatatgtgtacatgaaagtatatttaacaatgaatcaaatgatacgaaaagaataaataattacttaaattttttgaataagacgaatggtcaaacacgtactaaaaagtcaacggtgtcaaacattttgaaacggagggagtataagaaaagaatgcaggcaatacaatggcttctgaatttgaacatttattggtatggaaaatctaaatgtgaaatggtgtatgtggaacatagctacatgggaaccatttaacttatattagtgtttttctaattaaataataatattttgtatggctattgtgatagctaccacgatgctgcagaaagggatgtcaagagatatgagcgatcattcaaaaggcttcctcctgcccacaaggtttgtatttgagtcaccatacccgttttacctttttatattcaaccaccacttcctcttggctaatcacttttggatttcattttgacttgtaataggttatcttactctgtatgttcattcacatatcttatgtcttttcttgtgtaggaacttctttttaaccttggtctgaagtaccaaaggctgagatggtaagtaatgttatgggcttaatgcttgtagtagtggccaatacttattagttccactgcttgtgcttaaatattgtgaaatacagttttgcagtagatctatttgtcatgtttgaaatcatctaaagcattttgtatatctgatgcactgtactttatttatttagtcaacattttttagttctaccaatgatgttctatcttaaattctccgccggatttttctgaaaaatcaatgcatgctgcttaaactagttatggccactccttttgcttactgtgatggactttattattgttttgtaattgtttattacttcacaggtgtatatccatgaatgcatcattcatcatggacatgcttgaggtatgtttgtgttattgtgtatatgtggtttgggttgtcggggtgggaagattgtacgttaggtgaaaactttaatgtacatgatgctatccttaaaaggtatattactgcaggcatttgagcctcctttcgacatgagtcagcatgtagatatggatggtcatgattgcgcagagaacatgcatggacattgtcatgcagattgtgctcattctgtcgataggggtgattgctttagaagttctatctctgtaagcaattccgagttgcatgaaccagacggttgccccaggaaagacgacaagactcatgaactctcaagagaaactgacaacaaggtaggccttatgtcttgtcttgatcctttttgttcaattttaaaaataatggctgcttccatgttgaagccatatacactactccctccgggttgataatacttgtcgttttggacaaggacacggtctccaaaaaacaactttgaccattattttctattataatatgtataaaagtgttaataaatatatgattttattaaagtacttttcaagactaatctatacatgtagtcaccatatttgaaagacaaatattttaaaaatgattcataatcaaagattctaaagtttgacctcacccttatctaaaacgacaagtattatcagcctggagggagtacaaaattggtgatatcacacgttttgactgatgtaagtatcaaacaggacgaggtagttgacatggaaagttgctcccggccggttggtgacaaattgggggcatctcaggttgaagataaatcatgtaatggtgataaagccatggatgcagcagctaactgtcaagatacagattgtgttgcatgttctgctgatgagaatgtaagctccacctgcaagatgtaagctgttgtgtattccttataatttataattgcatgatgcagaacatagtttagctttcatgcttgaattttatcactatgaatctaaaggagtaatacatggatgtggcattcttgttatcttctggttgcaataaatggcagaatgcatttgttcttcgctatctctagctgttcgttcggttatcttctggttgcaataaagggcagaatgcaataagtgttttcttccttcttaatgaaatgaaatgcaaccctcctgtgtttttgagaaaaaaagtacatcacacaatatttacacataattttcagtctaacaagcattgatttttctctgtttatctgttcttctcatacttttaaggagataacgatatgtataaataaatgtgaactatttaattcttgttatcttattttaggtgataccgcagcaattcatggctccatccttgcagttgaatgttcctccaattgatgttgacaaggtaagtgtttctatcaacttctcatttgacacatttcgaacagaaagcatactgcaatgcgtcaagaagatagccaaaggttcatgttggttgaccgccacagttgttaccaaagctgacatcttttctgatatggggatgttactgattttcattatatgctgatttttcttttttccctttaacttcttaatagcaagtgctcaatcatgccatattttgctgatgttgtatgcatgtgtgtagtttcttgcaccttggccttgttaccaaagctggcatctttcctgatatgtggtgttactgatttctatcatatgttaatttttcctgtcatttttttccccttggcctcataatgggaagtgctcaatcatgctatattttgctgatgtagtttcttgcacctttgcctacattttacatgtttttcagcttgcatgtttttggatgctgtctggtttatagcttctataatccattttattctggtttattcaggttagatgcatcataagaaatattgtcagggattgggctcaggaggtattttctgtgcaattttgggttggcttgaagtggaacttctgtctgaaagtaatgatataatccgaaaggaaatattaccttttgttacttaaattgttgtagggtcaaaaggaacgtgatgagtgctataagcccatcctggaggagcttaatcgtctatttcctaaccgaagcaaggagaggtaaacttgacttatccctgtgttatgacaataatttagaactaccatacttttttaccttgttctgggtagtgatcttgttttcaaaatcggggtaattaaagacaagggcattcttctcgcacgagagcgattcacgtgacttcagcatggcgtgtttgatcccgctgttatccacgtcatcctcatttttaccacgtctcactgtggtgtgggccggcgcagctgtttaccacacgctttcctcagctgcagcgactttcctccgctgttcaccactcgcccctgccgtccgaccagtgggcccacctgatgcttcctacctgctgttttcgaacgacttgccttccattccatggctatacacgatgcgaggggctgtgatgaaagaaaaaccgctgcggctatggccgcctgccatgcccatgccctgtgattctgaattggataaatattaggacatctcgtcccctctcacaccacacatttactgtggatagtttatgcaagcatttcctttaacctcatatacaaatggaagttgcttgaagcttcattcttgatcaatcattgacttgtgtatttgttgaacttcataggcctccttcatgcttagttcctggtgctgggcttgggagattggctctggagatatccactctgggtaaaagaaaaaaagctcaaataaattgtgaatgagctgatatcatatattcttgaaaattacccttgttttaactcttgaacaggttttgtgagccagggaaacgagttctcgtattacatgatgatttgttcaagtttcattctaaaccagtaggtcaatctaagctatacatattttttttaaaaaaaaaactagcaccttacattatcaagttgttcatcacacaataatatttggtcatgttttatcagcacgcaagaaaccaatgagtggactatatatccttggatacacagcaactgcaattctctttcagacaatgatcaacttcgccctgtttcatttcctgatattcacccctcaaggtaataaagcaccttgttttttctcataagcaccagtatgcttgcaaatgctgtgttaaaattcatcgctctgtacacttgatagcgtatgaccttagttttgtataatataatgtgcatataggacgtcacggttgatgaaaacataaatatattgattacatttataggtaatttaccatttatgattctatatttacaagagcttcatatgaaatcaacaaaaatggctatgtaagagcatttgattagagaaattgaaacaccctatttaaatctggactatttgcagaacctacaaatattctatgtttggatgttgtaatatttgaatgattagttaattgtgcagtttcgtttgaatcctgaatctaaacttcattcaattctagaattcaagtttgatgcttcagcttgtttcagtcattcagtactatttgtgctgtaggtagaaatgtttacttatgttccttgcaaaaggagagaaactgtccgttatctcttgttatgctacatatttatcttatgtttgccttcttttcttttgacagctcagggatcacagaaggattttctatgtgtgctggtgattttgtagaggtctacaatgaagaaagccaagaatgtaagatgacctggtttccttataaactaatcaaaatgagttaattaattttaacctggcttccttataaagggatatgcatcactcaacttagctctttttgttaaattgtaatattgtagtaccatttgccctttgaatcttgtgtggcccaatgaaagcatgccagaaactggaagcggtgggattaaataacaattcaaaaacacagatacgtttcgaacagattttttgcattggggttagtctaaagcatatataaatagagtgacaattgtacagaaccaattcacaatgagaatggatgtgttctgatggaaccccagaaaaagaggacaattttgtgctggttttgtttctgtcagattgtttcgattttaaatcatggccaacaagggaaaagagttgttcttttgtggtggtcttgtttcttgtcatacatacgaagtacattttttaaggggggatattaattactgttattgttcatttgttagcttgcttggatttattttgtaatgctcattaaataaatcaaggtgagagtattgctttaacgttcgtcaaaaactaaattgcaaacgataggcattttcttagaaatgaagtaggaggcagttgcaagccaggtccttgattttatgtattatggagaaggaatgagctcctcaaattaatattgtaggctattgaggcatgcaatgcaataactctgaaactgatgattattggttgaagtcattttgaagtctaatactttaattctgaccttgatgtgttaatttgttctgcttttagttcagatatgtatgattggtaactacgggttttttgccttcttgacattctcacaatactcatattttgctccagcttcatgggatgctgttgtaacatgcttcttcttggatacggcacacaatatcgttgaatatatagagatcatatcaaaagttctcaaggatggtggggtgagtctctttttataggattaaactctgataaactattcttgatgaatcagtgctaatgtttttttgagtcagtttacggggaaatttataattcggtatatgttgtttatttactgtttcttatctgtcattgataattatgcaatttcaaccaacaggtctggataaatttgggtccgcttctgtatcacttcgctgactcctatggaccagatgatgtaattagttctctccccttattatactagttaaatgaatgaatgctatgctaattgaatccttgaaggtgctactatgtcttgaggaacttaatttatctccttaaacacaggatatgtctattgaactgagtttggaagatgtgaaaagagttgcttaccattatggatttgtgatggaggtgagtgttttgcaaaaaaaaaaaagttttgggctataattgaggaaactccaaactatgcatatgcatatgcatagtgcaccaatacgttggatttgtacacttgtatcttgcaaaaaaaagtgcaatacatgtttattatatatatgcattgttgtaaaaaaaaaagagtgaagggttatgattagacagaaagtgcatcacctcactgcaaaaatatgtgaatggattactttgatttgtggttttcaggtggagaaaatgatagataccacatacactgcaaatatgaaatcaatgatgcaggtaatcttttaatctcaacagtcttcactgtggtttaatcttcaaatatctaggaagtgattgaatttatggcaaatatttagaatggcacagtgaaagcttaaaggtgatagtcctgtttgctgcagttggaaacttggtcatttggacttctagatgtccacttgttcctcaatcccttgtaggctcatatagtgttcaactgttgcatagtaaattcaacaggtgtattaggagtgctaggagactagttgtccaaattcagttgttgaatgtatcagttagtggtggagcgtgagccaaaatacatgaaaggccaatctaaaggatacaatttacagaattactacgacacaggaccagttcaacctgcatctgactattcgagcagttaaatgctcttttttgctaagaaaggggagaccaatgccctctttggtcccagcgagggctctgcctctgcctgactcagtactctcagcggatgttcacaatgctagtatgcaatatttcaaagctgccagcttccaatacttgagatttcagctgtactgaattctgttggacgtctaacatcactagttcaatacccatgaattgtttgtgcattttgccaatcttcttgatatttggtaataatggtcttatttatactgttgttgagttgcagaatcggtaccgcgcagcattttggacgatgaggaagaatgcatctcgatcaaaagctcaaaaacaccagtgaggtggagatactctgtttggaacggttggcacaggcttactggctatagatcaaatttcagtcattctatggtgatgcctatcagatttggagacggacaatacggatgatccaattcacgccaccatttttcaccatgatatgaaactatatggatagattgatagtgcatgcgttccattactgcgataaaaccaatctccgtctgccaaaacatttgaatggcacagggaaaaactgttccagttcgatgtatatcaattggccaatgggagcactaaggtatattaataagttcgatggtacgtgttcgaactgtacaatgacactgaattagtaaacggcaaatcaaagagctcaacttttttggactg</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001062549.1 RefSeq:Os05g0511300]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 5]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 5]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
