|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 6]] |
| − | GeneName = Os06g0649500|
| |
| − | Description = WD40-like domain containing protein|
| |
| − | Version = NM_001064752.1 GI:115469235 GeneID:4341679|
| |
| − | Length = 8716 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os06g0649500, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 6|Chromosome 6]]|
| |
| − | AP = Chromosome 6:27406308..27415023|
| |
| − | CDS = 27406401..27406534,27407395..27407476,27408004..27408082,27408182..27408279,27408407..27408463<br>,27409047..27409134,27409244..27409353,27409536..27409637,27409892..27410043<br>,27410844..27410954,27411030..27411097,27411188..27411229,27411643..27411807<br>,27411909..27411985,27413305..27413421,27413560..27413825,27414345..27414440<br>,27414524..27414590,27414683..27414736|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008399:27406308..27415023
| |
| − | source=RiceChromosome06
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008399:27406308..27415023
| |
| − | source=RiceChromosome06
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atggaggacgaggagatggagaagaaggtgcagcagtacctgcagcggaaggggttccgcctcaccgagctcgcgttgcaggaggagcgcaaccgcatctccacctcctccgtctccgacgtcgcgctcgccaggtcggaaaatgatccggcaagatactatgatggttatagtaaactaagaacatgggcatacagttctctcgatcagtacaagcatgaattactccgtgtcctttacccagtgtttatccattccttcatggatctagtggcagagggacatacacaggaagctcggtcctttttccacacgttccatgaagaccatgaactgatgcattctagggatctccagaaactggaaggcattctttctccttcacatttggaggaaatggaactggccagatctttaaggaaaaatcaattcagaattaagttatgtgagtattcatatgagttactcctccagtatctccagaaaacacaagctcttgtggttcttggaataataaatgaacgcacaacttttgacgtatcccctggtcagccatctttaatctctgatgacacggatgttgttgctctagttggaacaaagaaggatttggcaaaacaaataaatctgaaggaggtgcattgggggttgcttgaagattcagttgaagagcgcatggagaaaacacttttagaatcagataaaactgaagcagaaagcaaggatgcagatgccgaagataacaataagagaaaatcttcggaaggtggaaagcagggaggttctgttaaaaaggtcaaaaaagataagattgcaggagccacagggaaaaccaataaatctgaaacaagcatagtttcggtggcacctcgtgtgaaaccagagcttacacttccagtgattcctgttgaagtcgagcagtcaattcttgaggatttgcgaaaccgtgcacagttgaatagcctggcattgccatctgttagcttctacacattccttaatactcataatgggctaaattgctcatcaatttcacatgacggctctttggttgtgggtggattctctgactcatcagtgaaggtttgggatatgtcaaagattggccaaccgccgaaaacatctagtccacaaggagagaatggactttcccagggtgagcgcacatcagcatcagattatggaaaaagaccttatacattattccaaggtcattctggaccagtttattccgctgcatttagcccattcggagattttctcttgtcatcatcctcagactcaacaattcgactatggagtaccaagttgaatgctaatcttgtttgctacaaaggacacaactaccctgtttgggatgtacaatttagcccagttggtcattattttgctagcgcttctcatgacaggactgctagaatttggtcaatggataaaatccagcctttgcggataatggctggacatctctctgatgttgattgtgtgcagtggcatgttaactgtaactacattgccaccggctctagtgacaaaactgtaagattatgggatgttcaaactggtgaatgtatacggatgttcattggccataggagtatggttttatcattggctatgtctcctgatgggcgatacatggcctccggagatgaagatggaaccatcatgatgtgggatctctcttctggtcggtgcgtttcaccacttgggggacacagctcttgtgtgtggtcacttgcttacagttgtgaaggggcattgcttgcatctggatcagccgactgcactgtgaaactctgggatgttgcctccagcacgaaggtccttaagacagatgatacctcaactaaccggctgaggatgctcaaaactctccgtacaaaatcaactcctgtttatactctgcggttttctcggcgaaatcttttatttgcggctggtgctctctcacttggctcctaa</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MEDEEMEKKVQQYLQRKGFRLTELALQEERNRISTSSVSDVALA RSENDPARYYDGYSKLRTWAYSSLDQYKHELLRVLYPVFIHSFMDLVAEGHTQEARSF FHTFHEDHELMHSRDLQKLEGILSPSHLEEMELARSLRKNQFRIKLCEYSYELLLQYL QKTQALVVLGIINERTTFDVSPGQPSLISDDTDVVALVGTKKDLAKQINLKEVHWGLL EDSVEERMEKTLLESDKTEAESKDADAEDNNKRKSSEGGKQGGSVKKVKKDKIAGATG KTNKSETSIVSVAPRVKPELTLPVIPVEVEQSILEDLRNRAQLNSLALPSVSFYTFLN THNGLNCSSISHDGSLVVGGFSDSSVKVWDMSKIGQPPKTSSPQGENGLSQGERTSAS DYGKRPYTLFQGHSGPVYSAAFSPFGDFLLSSSSDSTIRLWSTKLNANLVCYKGHNYP VWDVQFSPVGHYFASASHDRTARIWSMDKIQPLRIMAGHLSDVDCVQWHVNCNYIATG SSDKTVRLWDVQTGECIRMFIGHRSMVLSLAMSPDGRYMASGDEDGTIMMWDLSSGRC VSPLGGHSSCVWSLAYSCEGALLASGSADCTVKLWDVASSTKVLKTDDTSTNRLRMLK TLRTKSTPVYTLRFSRRNLLFAAGALSLGS</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>94..227#1088..1169#1697..1775#1875..1972#2100..2156#2740..2827#2937..3046#3229..3330#3585..3736#4537..4647#4723..4790#4881..4922#5336..5500#5602..5678#6998..7114#7253..7518#8038..8133#8217..8283#8376..8429#gtctcgctgctctgagtcgcgtcgcgtctccctcccgcgcgacggatccgagagccctaaaccctagaactccctcgccctcgcgtcggcgccatggaggacgaggagatggagaagaaggtgcagcagtacctgcagcggaaggggttccgcctcaccgagctcgcgttgcaggaggagcgcaaccgcatctccacctcctccgtctccgacgtcgcgctcgccaggtacacctgctcgccgccgggccctttccaatctcctctcctctcctccgccagctagctgggcgagcccccctaactctgccccgttgcgactcggacctctcggatcgaggaaacctaggtagtggattttgtgcaattttgtccagctcgcttttgggcatcgaggtgccatatcacacgtgcccgtgattgggttgcgggtgcgagtttttccgcacgaggaaatagtttgcggcatttttggagagctaaaagttgcttgattgagggttgggaattgctttgtggacgtagcaatgagtaacaccaattttgaacgatgaactctctactggtaattcccatgatgataaggacatttcagggcagtatgcagcttatgcttgataatgggttaagtagtgtccgtagatggttctactgcacttatatctagattgtagttaatacctcaagtgattaaactgatttttgggtcactaagatgccactttataaccttttttttccagattacaataattaaaactaaattttcttgtcatatactgagaaaactttaatattatggaagtatgctttgttgataaatttagtcatactattttcatatattgaagaccagatatactagagaatatctctgttcataagtaatgtggtttgactgtatgtattatgcgacgtcaccttttgttttgattggagagagtaattcttccatcttttctgtctttttttgtcagcttccaatagttgtggcatccattatttcacaataattctggctatggtttatttttcttataatcctaccgactaatgccttttggttgcattatcttctgcaatgataggtcggaaaatgatccggcaagatactatgatggttatagtaaactaagaacatgggcatacagttctctcgatcagtacaaggtgtgctacacatacatagattggacttcaccttttgatcttgcagtacattttattgtgcttcacaatcaaacatcgttagctaaaattatgagtgatttctaactgtccatttgttacatagtctttctttaatgagtgatttcatgttatttatggataattactttcatgtttgcatgctagcttcagatggaacacttttaggattatattgtcataaaccaaagcttctagaattatactttattgcctgcatgctaacttctgatggagtactttcctagcaactctttgtgttctctgcatgcattcacaatatgggccattttacaaagctaaagtacctgtccagattcataactaaaatttgctatattttgggacagagtactatatcataaacactgaatatatttttgcctccgacggacatgttaatattagatttcaatttgtgcatatttctgttcttaaatttggttatatgtatactatgtttctgaattttcatcccttttttgtagcatgaattactccgtgtcctttacccagtgtttatccattccttcatggatctagtggcagagggacatacacaggaaggtattgttagttggcagatagattagataaaccctctttgtcatgtcatgttttcttttagtttattctgggcaatttctttccttgcgggccctgcagctcggtcctttttccacacgttccatgaagaccatgaactgatgcattctagggatctccagaaactggaaggcattctttctccttcacatttggaggtcaacacttttagttctcttacattgtaacattctgttcttattgaagatcttcatttatttatttggttgtatcttctcatgattcatacactgcgcttatcattctgcatgctgtatatttcaggaaatggaactggccagatctttaaggaaaaatcaattcagaattaagttatgtgaggttgtatccacataataatttgctgtatttccatttatctctttgaactttgattctgagttgacccttttaataatttaaccaatttatgaagacaaaacgttttgacagcttaatatttgttgttttgatgatatatccaggtgtttttgtttttttaccacccttttcaatttattggcttagcaatgttagagaccgagcacaaaattggcaccatttagtcagttagtcattacttactgttactcattgatcctgataggcagctaatgtcaaataaaaatatgattattttgatttgtattgactggaactagtggaccttttcttttcttttcgtttttgaactatccttgttataaggttacagcaagatcaagtttaatgttcttcctgagttaaagttttcacatttgatgttcttccaccatttgagataaaaaagtttaatgactttcctgagataaagctttcatattttgtctcccagatagcttttataatttcaaatttcttgtctgctgcaatgttatttaaaaaaaaacacatctcgtgatccaattattgaatttggttgcagtattcatatgagttactcctccagtatctccagaaaacacaagctcttgtggttcttggaataataaatgaacgcacaacttttgacggtaacattccccaatatcattcagattaataccctaatttctgtcatgcattttctcgtttacacttctcttgtctactgtgccacttatccctgttcaatattggcagtatcccctggtcagccatctttaatctctgatgacacggatgttgttgctctagttggaacaaagaaggatttggcaaaacaaataaatctgaaggaggtgcattggggggtatggtctgcatcagtcttgttgaccgctattgcctgttctatctatttgttgatgatttggattcaacagatcgaaacaatccacaccaatcagttatttgatgggattctatcattttcattgaacttttaactatgctcaggcattttatttttgtaaaattaaattctggtatgcagttgcttgaagattcagttgaagagcgcatggagaaaacacttttagaatcagataaaactgaagcagaaagcaaggatgcagatgccgaagataacaataaggtactctttatcgtatcgaagatttgttaagtttactacctatatcctcagccactgatagaagagccatctatttctttttgtttgggccaggctattagcagcttgttgtcttatacttccttaagcagtccatagaaaatatgcattgcttagctccactctgcatgttcctgtgcttcccagttttgagtccaaattgatgtttcttagtattttagcttcatatttttatcttcttatttttgctgcagagaaaatcttcggaaggtggaaagcagggaggttctgttaaaaaggtcaaaaaagataagattgcaggagccacagggaaaaccaataaatctgaaacaagcatagtttcggtggcacctcgtgtgaaaccagagcttacacttccagtgatgtacacttaaatcccttcatatctctcttaggaaaaatctagtttggtcgtttgactttgatatctagcctggtctctaacctaaagtttttaaaattctccatcctgtggatttttcaggacataataagttattttaaatggattcgtcattccaacttaggacaattttaattttaattttattttcttttttttttgcccgttgcgttttcctatctgtgatattctgattatgtttcccatttttatgccagtccatattaaccatgttttgcttcaattcatgcacctactattccatttgttttctttatgaatttctaatccaggacaaggccagaacttattcaaagctgtcctgtacatacactatggaccaacatatattgttcaacacaacatgcttcattacacatgctgctcaatgtttgttctgctagttttttctctctctaaaattacctggttaagccaactcaaatagtatggaaggtggaattgtatccaccggccaatttttattcgttagattgttgatgacgattatgtggacctgactctttgccagtttgcttaactgcagtacatttcaacacttcaaaattactttttgtaagacactgaacaaaggcatgttgccttttttgcttttcaagaaatcaacaaaattgaccatccaatcctcttagtcatgcaacttatttctaggtggctcatctatctacatttttatctgggaagaagtatttcaaccttgggttgtaagaatctgagatatatttatccttttatttcagtcctgttgaagtcgagcagtcaattcttgaggatttgcgaaaccgtgcacagttgaatagcctggcattgccatctgttagcttctacacattccttaatactcataatgggtaaatttctttgtggcttaatatctgacactgccaatttgcatccttttctctgatcattatctgtggacataggctaaattgctcatcaatttcacatgacggctctttggttgtgggtggattctctgactcatcagtgaaggctagtcctttttgtccctttttggtactttgttcttatatatgtgatttctgtattatttttgtaacaataaaactttgtgttcaccaggtttgggatatgtcaaagattggccaaccgccgaaaacatgttagttgttcttcactacttaatgttgtttgattccaccttgtgttatgctgaaatacttccattatgtgctgaaatgttttgataattgccttaagtttacagaacaacatagttttattcatttcatttagttgatgttacaacttacaagtactgaaatattttttccatattaatgcttgtgtggatctgtcattcaaaaatgtcttctcgacctaccgacatataatgattttttgtcatactagtgcactaagttatgacatagcagtatacttgattccataacctgttcaggaatcaggactcttgaatagtcttagcatgtcaattatcctaagtcctaacatgagagtgttttgttttatataatggtggtatttgctgattgaagaaactttaattttcagctagtccacaaggagagaatggactttcccagggtgagcgcacatcagcatcagattatggaaaaagaccttatacattattccaaggtcattctggaccagtttattccgctgcatttagcccattcggagattttctcttgtcatcatcctcagactcaacaagtaaaacatccttacattttgcttattttcatatagtttgttttccttttcgtttttcaactgaacatatcgttttcatatatattttttattccttacagttcgactatggagtaccaagttgaatgctaatcttgtttgctacaaaggacacaactaccctgtttgggatgtacaagtatgtgattaaccttttttttttgtgtcacatgtgcaagtgcaacatatctgtggtgcttttactttcatgaactgtttaaacgccttgtgtttgtattgaaaagaaaaatgattgtgtgattcgcataacttaaatcagaattgagctgatctatggaagctagtgtactgatctcttaggcattacaaccagtttttgaattactggttgcagcttttgagacagactatgtacaactattctgagcttcaaacacagatcatgtcataaaataagcttttgccatttgagtctgttgtttcatcttggtatgttggccattgctgttaaataatgagaccttattaaggatcccactgccttcagttttcaatatgtaaataaaaaattaggtggcaatggatgcctccagattatattgttcaatcaatatgcattgcctgctattgcatcagtgcttattttggtgcatgaggtgtgaatatattacatgaacttgcgaggtggttgcattataatacacaaacttgtaaaacattcgttccggtgcacaaacttgaggtttgtgtgaaccaaggtcaaaagggcaaaatatggctaatcttgctgagttgagtgttgattaggatgccatgtaagcatgcatgttaggactatgccatatacatatgcatgtactgagtaaaacatagaacaagacatactgattgaacaaagaaagacatatagcaaaccgataaaggatgcaagggatacaaaggaaggacaaagtggaaaccaagtacaaggttatttgcaaatataacatgtatcatgccctcctcacatgtgcacgccatgtcctaatgagcatccaacttggtaataagttgccatgcccttttggccttggttcacacgcaccagacaagttcatgcaccaaaatgaacgtttaataagtttatgtgccctcctcacatgtgcacgccatgtcctaatgagcatccaacttggtaataagttgccatgcccttttggccttggttcacacgcaccagacaagttcatgcaccaaaatgaacgtttaataagtttatgtgctgcacccccttgacaggttcgtgtacccccttgtgctctccctttttgtaatgtatccctagccagtttttcattttcaatgttctgcatgatggagtagttttatggggttatgcaccctgttaaaaagcttatgatcaatttttactgtcccaactgccaagttttctgattctgttgttgtaaacattgtgctatgatacatgttgatacatttgcttttttcttttgtcagtttagcccagttggtcattattttgctagcgcttctcatgacaggactgctagaatttggtcaatggataaaatccagcctttgcggataatggctggacatctctctgatgttgatgtaagtgtatttctggttcaaatcatttgcttatattggagcacttgatgctggatagatgcttattctttaatgctttgtgctgatgcctgcatattcttactgagctttatctactacataatatttggctgacagtgtgtgcagtggcatgttaactgtaactacattgccaccggctctagtgacaaaactgtaagattatgggatgttcaaactggtgaatgtatacggatgttcattggccataggagtatggttttatcattggctatgtctcctgatgggcgatacatggcctccggagatgaagatggaaccatcatgatgtgggatctctcttctggtcggtgcgtttcaccacttgggggacacagctcttgtgtgtggtcacttgcttacaggtaatcattgtttgttgctgcgggtaaataatagctttaatccacattgtttacatataagaatcggcttaaccgattcttttatccttgttgagagaaatttgaagggctatcttgtgagaccttttgacagtgacagtttgttatccccttgaatatctggtttgaatttttattcttgaaaaaaactaagaatatcagtacatatttcagagagttattgcataggcatgtcaaccttgcagcccactcagttgttggtttcaattagtttcttatgaaacctattgtttgaatgagcctgtaaatgtgtattatgccttgcttcctaagctacttaagggctgcattttgatgccgcctttattcggaggacgctttccataaatggtgtatacacattcctggactctgtttatgtatgttcatttgttattcctttcagcgagaagttataatatgctgtcctgtgatgtcatgcagagctctcttatttaacttgttctgccactgttgtagttgtgaaggggcattgcttgcatctggatcagccgactgcactgtgaaactctgggatgttgcctccagcacgaaggtccttaagacagatgatacgtgagttagttttgaactgctcataaagatgctttatacatataaatcattgccttactcttgtttgtaaaatatacttacagctcaactaaccggctgaggatgctcaaaactctccgtacaaaatcaactcctgtttatactctgcgggtgagaatctctcggtccatgcattatgttgcataagttaaggctgttatactgtatgcaatttaaatgaaactgctttcttgatgttgtagttttctcggcgaaatcttttatttgcggctggtgctctctcacttggctcctaagcttctgtatgttctgtagaatacaactaccaaacattctttcagttttatctcaagtgaagttagtgcctagtgagtagtgagcctgcttttaaggttaatctgtagcacgcgcgtattgtaattcgttccaatgtttgttgtcttgtgactttgtaagttgtaacaatcgccttatttaaatcatgtaattctttttctggcggtgaaaaaccaaaaggaggtgatgggtactgctggaaggaagaattataaagaggtaaacaacgtggctaattttttttgtc</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001064752.1 RefSeq:Os06g0649500]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 6]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 6]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information