|
|
| Line 20: |
Line 20: |
| | | | |
| | ==Structured Information== | | ==Structured Information== |
| − | {{JaponicaGene|
| + | [[Category:Genes]][[Category:Oryza Sativa Japonica Group]][[Category:Japonica Chromosome 6]] |
| − | GeneName = Os06g0726400|
| |
| − | Description = Branching enzyme-I precursor (Starch-branching enzyme I) (1,4-alpha- glucan branching enzyme I)|
| |
| − | Version = NM_001065164.1 GI:115470059 GeneID:4342117|
| |
| − | Length = 8426 bp|
| |
| − | Definition = Oryza sativa Japonica Group Os06g0726400, complete gene.|
| |
| − | Source = Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | | |
| − | ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
| |
| − | Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
| |
| − | Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
| |
| − | clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
| |
| − | |
| |
| − | Chromosome = [[:category:Japonica Chromosome 6|Chromosome 6]]|
| |
| − | AP = Chromosome 6:31774380..31782805|
| |
| − | CDS = 31775431..31775634,31775717..31775833,31775951..31776032,31776114..31776181,31776347..31776448<br>,31776918..31777025,31777464..31777526,31777684..31777800,31778113..31779019<br>,31779128..31779397,31779832..31779901,31780017..31780224,31782440..31782502<br>,31782605..31782688|
| |
| − | GCID = <gbrowseImage1>
| |
| − | name=NC_008399:31774380..31782805
| |
| − | source=RiceChromosome06
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage1>|
| |
| − | GSID = <gbrowseImage2>
| |
| − | name=NC_008399:31774380..31782805
| |
| − | source=RiceChromosome06
| |
| − | preset=GeneLocation
| |
| − | </gbrowseImage2>|
| |
| − | CDNA = <cdnaseq>atgctgtgtctcacctcctcttcctcctccgcgcccgctccgctccttccctctctcgctgatcgaccgagcccgggaatcgcgggcgggggtggcaatgttcgcctgagcgtggtttcttcgccgcgccggtcgtggcctggaaaggtcaagaccaatttctcagttcctgcgactgcgcgaaaaaacaaaaccatggtgactgttgtggaggaggtcgaccaccttcctatatatgatctggaccctaagttggaggaattcaaggatcacttcaactataggataaaaagatacctcgaccagaaatgcctgattgaaaaacatgaggggggccttgaagaattttctaaaggctatttgaagtttgggattaatacagttgatggtgccacaatatatcgtgaatgggcgcctgctgcacaagaagcacagctcattggtgagttcaataactggaatggtgcaaaacacaagatggagaaggataaatttggcatttggtcaatcaagatttcacatgtcaatgggaagcctgccatccctcacaattccaaggttaaatttcgctttaggcatgggggtggagcatgggttgatcgtattcccgcatggattcgttatgcaacttttgatgcctctaaatttggagctccatatgatggtgtacactgggatcctccagcctgtgaaaggtacgtgtttaagcatcctcgacctccaaaacctgatgctccacgcatctatgaggctcatgtggggatgagtggtgaagagccagaagtaagcacatacagagaatttgcagacaatgtgttaccacgcatacgggcaaataactacaacacagttcagttaatggcaatcatggaacattcctactatgcttcttttgggtatcacgtgacaaattttttcgcagtcagcagcagatcaggaacaccagaggatctgaaatatcttgttgacaaggcacatagtttaggattacgagttctgatggatgttgtccatagccatgcgagtaataatgtgaccgatggtctaaatggctatgacgttggacaaaacactcatgagtcttattttcatacaggagataggggctaccataaactctgggatagtcgtctgttcaactatgccaattgggaggtcttaagatttcttctttctaatttgagatattggatggacgaattcatgtttgatggcttccgatttgatggggttacatcaatgctataccatcaccatggtatcaataagggatttactggaaactacaaggagtatttcagtttggataccgatgtggatgcaattgtttacatgatgctcgcaaaccatttaatgcataaactcttgccggaagcaactattgttgctgaagatgtttcgggcatgccagtgctttgtcggccagttgatgaaggtggagtagggtttgacttccgcctggcaatggccattcctgatagatggattgactacctgaagaacaaagaggaccgcaaatggtcaatgagtgaaatagtgcaaactttgactaacaggagatatacagaaaaatgcattgcctatgccgagagccatgatcagtccattgttggtgacaagactatagcatttctcttgatggacaaggaaatgtacactggcatgtcagacttgcagcctgcttcacctaccatcaaccgtggcattgcactccaaaagatgattcacttcattacgatggcccttggaggtgatggctacttaaattttatgggcaatgagtttggccatccagaatggattgactttccaagagaaggcaacaactggagctatgataaatgcagacgtcagtggagccttgtcgacactgatcaccttcgatacaagtatatgaatgcatttgatcaagcaatgaatgcactcgaggaggaattttccttcctgtcatcatcaaagcagattgttagcgacatgaacgagaaagataaggttattgtctttgaacgtggagatttggtttttgttttcaattttcatcccaacaaaacttacaagggttacaaagtcggatgtgacttgcccgggaagtacagagtagctctggactctgatgctttggtctttggtggccatggaagagttggccatgatgtggatcacttcacgtctcccgagggaatgccaggagtaccagaaacaaatttcaacaaccgccctaactcattcaaagtcctttccccgccccgtacctgtgtggcttactatcgcgttgatgaagatcgtgaagagctcaggaggggtggagcagttgcttctggaaagattgttacagagtatatcgatgttgaagcaacaagtggggagactatctctggtggctggaagggctccgagaaggacgattgtggcaagaaagggatgaagtttgtgtttcggtcttctgacgaagactgcaaatga</cdnaseq>|
| |
| − | AA = <aaseq>MLCLTSSSSSAPAPLLPSLADRPSPGIAGGGGNVRLSVVSSPRR SWPGKVKTNFSVPATARKNKTMVTVVEEVDHLPIYDLDPKLEEFKDHFNYRIKRYLDQ KCLIEKHEGGLEEFSKGYLKFGINTVDGATIYREWAPAAQEAQLIGEFNNWNGAKHKM EKDKFGIWSIKISHVNGKPAIPHNSKVKFRFRHGGGAWVDRIPAWIRYATFDASKFGA PYDGVHWDPPACERYVFKHPRPPKPDAPRIYEAHVGMSGEEPEVSTYREFADNVLPRI RANNYNTVQLMAIMEHSYYASFGYHVTNFFAVSSRSGTPEDLKYLVDKAHSLGLRVLM DVVHSHASNNVTDGLNGYDVGQNTHESYFHTGDRGYHKLWDSRLFNYANWEVLRFLLS NLRYWMDEFMFDGFRFDGVTSMLYHHHGINKGFTGNYKEYFSLDTDVDAIVYMMLANH LMHKLLPEATIVAEDVSGMPVLCRPVDEGGVGFDFRLAMAIPDRWIDYLKNKEDRKWS MSEIVQTLTNRRYTEKCIAYAESHDQSIVGDKTIAFLLMDKEMYTGMSDLQPASPTIN RGIALQKMIHFITMALGGDGYLNFMGNEFGHPEWIDFPREGNNWSYDKCRRQWSLVDT DHLRYKYMNAFDQAMNALEEEFSFLSSSKQIVSDMNEKDKVIVFERGDLVFVFNFHPN KTYKGYKVGCDLPGKYRVALDSDALVFGGHGRVGHDVDHFTSPEGMPGVPETNFNNRP NSFKVLSPPRTCVAYYRVDEDREELRRGGAVASGKIVTEYIDVEATSGETISGGWKGS EKDDCGKKGMKFVFRSSDEDCK</aaseq>|
| |
| − | DNA = <dnaseqindica>7172..7375#6973..7089#6774..6855#6625..6692#6358..6459#5781..5888#5280..5342#5006..5122#3787..4693#3409..3678#2905..2974#2582..2789#304..366#118..201#acaagcttttccgtgcttcctcgccgcctccggcctccgctccggcgctataaatcgccgccgatttcgaagctgtggaaatgggagtcgcctccacggccaccgacatccgccgcaatgctgtgtctcacctcctcttcctcctccgcgcccgctccgctccttccctctctcgctgatcgaccgagcccgggaatcgcggtcagtcaatatatagaaacttctatatatgatatgattagttttccctctctctcttgttttgttaggtgtttgggttattgatggtgtggtggtccgcagggcgggggtggcaatgttcgcctgagcgtggtttcttcgccgcgccggtcgtggcctggaaaggtaagatactgttgcaggatatctatcgaattaggaatttgatgatggtgataattaattgtggggaaaacaagtaagtctgaatttctttggccacaggcgacagccccaaaaccccgacaccccaccgccgaccacctcgccgccggcggcaccgctcccctttgccgccgtcggctctacctccttcccactctcccgtccttctcctagcctccctcctctctctctctctctcaatacttttttctacctttcatactaccttccatgttcttgttccgaatctgggttcccaagccgctgatgcgccccttccctgattcttctgatggaactaggggaggctgtgtggccatttttcccgttggagggtttcgtctagatctgtcgggtgtgggacatgcggattgcaggtgctgtcggttgtgttggcggcggcgggtcctgccgggatagttggccgccgacggccgcttggctgttgggttgcacggtgtgtgctggctggtagcgaggatggttttagggtgttgggcgaaagctctgtccgactcatagccggcctgacggcgatgaacgtccttggacatcatgcaatgcccctcctggaggcgtcgtcgcaagagcatctccagtagagaccctaaatacaattcctaaacagtttttaggtgctaaggacaaaaaataaactccagcaaaacccatactacaggtcctaaaataggaaggacctcaaatacccctccgcagtccctaggcctgggggctgtagaccgaggccctatcgccgtttttctacgcgggaggaaatttcctgacgtgtggtgtctgtcttccctcccgcggaatcgctgccacggcgccgatcttcgccagctcgctggttccgccgctcgtggccgacggtgcgaccatccagtacctccaccggccactgcttgtcgtccgcgtgcccgcttgcttgttttttcgtggtccttgatcagttcgcacactgatgcactatatggtagacaagaatgttctgaaattcatgaccatcagaaacatgttctaaacaatcctgctctcgattggtttatggctaactgtggttctaaacgatcatggcataaaaattattgttctgttcctttaaagtttgtggtgcttggtaggttgagacaattaggctgcttgcaattatgcagtagttccttcaaagattattctgcagtgttgttcttttgtgtcagttgtgagttgaagtttaacttcaaggttttttttttctaggaggatttaagctctttctgaagtttctcagatagattagattggaaaaggtatagagttaattttatctattgattatagttcttatttaattgaactacgtagtgtcttgaatacttgccggtaggatttcactcccatgtttgagaattttgaatttgaattatggtatttaaaattatggatttgaatacaattgaattctatacattagaaatattcgtatttgaattattactatgttaaactaggtgtaagcatagagtataatcagaaatacaagagaaaaagaaatgggggctaagaaatagggtctgctggtagagttggaggtaatttttgaattcttagaaaatagggacagccctcattcaacctttgaggactctaaaatagggactactgctggagatgctctaacaccctgttcccccttgctgctgggtgaaaaccctttccagtctcctgtttatgcgatggtggcgtcctttccgacgtcgtcaccttcttcaaggcatcgtttttggagaaaccctgcaaccagtccccctgctttcccatccttctcccctattccatcccctcctcctccccttttcttctgtcaagggctcctatgcttggaaactctcatgtatctcttctctgtaatatattcaggtggggaaatgttggatttttattgattggaatactgtattgggtcatctcggtgacaccaaagctgtactttggtggagtagcaatctttgcccttattgaccggataggattttggttaaatttatctacgtttttgtttgcggttcatcttttttcctaccagtcttatacaagatggtacagtttagcaactgattgttacattgcaatatataaatcgaagtgatagaagccacctcaagtaaatctaactattgttcataattcaaaggtcaagaccaatttctcagttcctgcgactgcgcgaaaaaacaaaaccatggtgactgttgtggaggaggtcgaccaccttcctatatatgatctggaccctaagttggaggaattcaaggatcacttcaactataggataaaaagatacctcgaccagaaatgcctgattgaaaaacatgaggggggccttgaagaattttctaaaggttaagttcactacttcaatttaatgcacaaatactccttcatacaagagtcggcatatgctattttctttgcatcttttaactctttatggttctctcattccatcttttgtaggctatttgaagtttgggattaatacagttgatggtgccacaatatatcgtgaatgggcgcctgctgcacagtaagttctaatgtagtcatccagctattcgctaatgtttatgtgttgtaggaaatatggatcactgatcaagttgtttaagtaccacttcttcattttattttcaatactatgctttgtctggtagcagctagcagaaagttaattttacaacataagatagctcctcaccgccggtaatagagatgttttgagttttcactcatagcacgtcttggctgtttaaggtaagtatcgggggtagaacataatgccatgaagagagaaaattatgttatctgtgtccgattgtagttggttctgaacttgtgaggctgtgatttcttaattgtcgtttttgttaagaccttaccagtatttgcaatatttaatgcatttttttgcggggaaatattcaatgcatttaacttggaggtttttcttcatgcatatagagaagcacagctcattggtgagttcaataactggaatggtgcaaaacacaagatggagaaggataaatttggcatttggtcaatcaagatttcacatgtcaatgggaagcctgccatccctcacaattccaaggttaaatttcgctttaggcatgggggtggagcatgggttgatcgtattcccgcatggattcgttatgcaacttttgatgcctctaaatttggagctccatatgatggtgtacactgggatcctccagcctgtgaaaggtcctctacttgtgccttgaactacaatgtaaacaagcttcaaatatttgggaagcataaagacgcaaagctttgctgacatgatcactgttactgtttaccttacaggtacgtgtttaagcatcctcgacctccaaaacctgatgctccacgcatctatgaggctcatgtggggatgagtggtgaagagccagaagtaagcacatacagagaatttgcagacaatgtgttaccacgcatacgggcaaataactacaacacagttcagttaatggcaatcatggaacattcctactatgcttcttttgggtatcacgtgacaaattttttcgcagtcagcagcagatcaggaacaccagaggatctgaaatatcttgttgacaaggcacatagtttaggattacgagttctgatggatgttgtccatagccatgcgagtaataatgtgaccgatggtctaaatggctatgacgttggacaaaacactcatgagtcttattttcatacaggagataggggctaccataaactctgggatagtcgtctgttcaactatgccaattgggaggtcttaagatttcttctttctaatttgagatattggatggacgaattcatgtttgatggcttccgatttgatggggttacatcaatgctataccatcaccatggtatcaataagggatttactggaaactacaaggagtatttcagtttggataccgatgtggatgcaattgtttacatgatgctcgcaaaccatttaatgcataaactcttgccggaagcaactattgttgctgaagatgtttcgggcatgccagtgctttgtcggccagttgatgaaggtggagtagggtttgacttccgcctggcaatggccattcctgatagatggattgactacctgaagaacaaagaggaccgcaaatggtcaatgagtgaaatagtgcaaactttgactaacaggagatatacagaaaaatgcattgcctatgccgagagccatgatcaggtatagttatccattatctaacagatgatcaggtatagttgggtggtaatacacttgtttgacttggtagacaaatcaacacttagctgatggctctgaatactttgatatcgcataatcctgtaggttatcaaattgctactctattttttgatagctattgacagtaagcaggttccttttttcactatgaatagtaacaatgtataagggccttacaaccattatccaataattagctgcagcatgctgttagcttcatgttcttatgtcgagacagttactgaattgctgattttacacatttttcagtccattgttggtgacaagactatagcatttctcttgatggacaaggaaatgtacactggcatgtcagacttgcagcctgcttcacctaccatcaaccgtggcattgcactccaaaaggttattttccccttaattgttgttgatttcatggtgctagttctagacaattgttgtaatgtccatagatttactaaaatttctggtcgttatttgaatacaatgtgtcctggcctcttttaatattatttggctaattgtgcttcaaatatttcagatgattcacttcattacgatggcccttggaggtgatggctacttaaattttatgggcaatgaggtaatatcttagtaatatgttgaaactcgcttcctgttaatgcgttccttgaatgttgattcctttgcattctctttcctttgtgtgggtaaagtgaggcacataaagggttagcccgctgttcttaagatgcccaagtacttggcagctaatttttaacatacataaactgaagcattgttatctttgtgcatgatgtgttctgttattcctggtcatccactaatccaaatcatacataaactgaaatcacacacatgatttatattgatattttctcttgagtagcacaaacatgatatagtggtattatcaagtcttatgctacatataaaatgagttccttgcacaacatgggctatatgtacggcatagctgctgtgtctggggttcttgtatgtctttccaactcatattgattctgcaatttccttttagtttggccatccagaatggattgactttccaagagaaggcaacaactggagctatgataaatgcagacgtcagtggagccttgtcgacactgatcaccttcgatacaaggttgtgcctaagtatatcaatgtattttacatgttttgtcatggcagcaccttttggttgtttgccatcatcacctcccttttggttcaatgttcttgctatttacagtgggctcctattcactttggaatcgagttcaaatttcctgtgcagcacattatttcaatcctttcctattagcataaaatgtttccttaggctacctacagtttctttgatgttcacacagaattgatgtgggcatgcattttccatgcataaatcggaacggcatgttctgaaaaattattctaaagataaaggacgaatgccaaggaccctgtccatttgttcaaatgtagttctttctctgcataaaacaatttatccttatgaattattcgtattttccccagcattctctgcagtcaagctctgcaatttgtctcacctaacatgtctaatttttaattgcaccaatattgaacagtatatgaatgcatttgatcaagcaatgaatgcactcgaggaggaattttccttcctgtcatcatcaaagcagattgttagcgacatgaacgagaaagataaggtaatggcaattgtaatttagtatgggcccttgttgcttgtatgtcctatgtattcaaatgaggtgagttgttcaggaaagcacggcacgaaattctagctatgtggtgagaacaattaatttcttaaaatacaactgtacaattaactccaagttccttttcaggttattgtctttgaacgtggagatttggtttttgttttcaattttcatcccaacaaaacttacaaggggtaactaattcattttaagctttgccttttgaaaatactctgttcagtacttaatataatctccacttgcaaaatgtgcagttacaaagtcggatgtgacttgcccgggaagtacagagtagctctggactctgatgctttggtctttggtggccatggaagagtaagcagcgacggcaaatgctcaaaatatttttgcactctttctcctaaactattgaggcaccaccaaatttgcatcagataacttatttgcagtattgatcttgttgtaccacaggttggccatgatgtggatcacttcacgtctcccgagggaatgccaggagtaccagaaacaaatttcaacaaccgccctaactcattcaaagtcctttccccgccccgtacctgtgtggtaaagtccattcactgaaattttcataactaatgagccataaccaactgcaatgcaacctcacaaaatgcttcactatcaggcttactatcgcgttgatgaagatcgtgaagagctcaggaggggtggagcagttgcttctggaaagattgttacagagtatatcgatgttgaagcaacaagtggggagactatctctggtggctggaagggctccgagaaggacgattgtggcaagaaagggatgaagtttgtgtttcggtcttctgacgaagactgcaaatgaagcatcagatttcttgatcaggagcaactgttggtgcccttgtaatctggagatcctggcttgccttggacttggttgtggttctttagcagttgctatgtacctatctatgatatgaactttatgtatagttcgccttaaagaaagaataagcagtgatgatgtggccttaaacctgagctgcacaagcctaatgtaaaaataaagtttcaggctttcatccagaataaaacagctgttcatttaccatctctgtttcctgtaacatgatggatacattgaaattgcagaagtttctattggacatataagcatagaccgaagaactgaggaagaaggttcactccctgtttatttttctcatatctcaggagcaggctttgcttttagcttggagatgagcactcacactgactgactcaggtgcatcatggtgtcactgtgatagactgacacacatagtatgtgacatactacatcttttcatgcctcattttttcctccaattcatatgtcagctaacgacttctttttccaggtcttcccaaaaggaaaaatggtatcatcattcagagcactgatgcgcactcacacaatgacacaaaacacaaccacagcctcaagagtcacaatgtgtgcttctcgcaagacttggaccatttcaaagtacaaccatggacagctgctgcttctcttcttcctcttcttcttgtggtgattggtgagagggaggctgcaatgcttgcacaatatgcaattccatggacttgacttgaggagataaacgacgacttgtgtaggattggatttggattggagagcccatcaaagaactggtccaagtgaaatgtaaatgcgtgaaaacctctccttatctctcgttctataccttgttgtatgtgtactgacgctcctttaaaatgttaattcatcctcttgatttttctaactactacggctgtacagcttgtgtctcctagcaccagacaagtaagtacatgcgacttgtcaattgccatagtaccaaaatatattacgtcactctttaatt</dnaseqindica>|
| |
| − | Link = [http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NM_001065164.1 RefSeq:Os06g0726400]|
| |
| − | }}
| |
| − | [[Category:Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica mRNA]]
| |
| − | [[Category:Oryza Sativa Japonica Group]] | |
| − | [[Category:Japonica Genes]] | |
| − | [[Category:Japonica Chromosome 6]]
| |
| − | [[Category:Chromosome 6]]
| |
Please input one-sentence summary here.
Annotated Information
Function
Please input function information here.
Expression
Please input expression information here.
Evolution
Please input evolution information here.
You can also add sub-section(s) at will.
Labs working on this gene
Please input related labs here.
References
Please input cited references here.
Structured Information
